MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_017527	ATC	2	6	2115058	2115063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002638
56002	NC_017527	AGG	2	6	2115077	2115082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002638
56003	NC_017527	CATC	2	8	2115092	2115099	25 %	25 %	0 %	50 %	386002638
56004	NC_017527	TGGG	2	8	2115179	2115186	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56005	NC_017527	GGC	2	6	2115191	2115196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56006	NC_017527	ATT	2	6	2115235	2115240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56007	NC_017527	ATT	2	6	2115242	2115247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56008	NC_017527	GGA	2	6	2115303	2115308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56009	NC_017527	GA	3	6	2115314	2115319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56010	NC_017527	CCG	2	6	2115374	2115379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56011	NC_017527	TTA	2	6	2115411	2115416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56012	NC_017527	TCC	2	6	2115422	2115427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56013	NC_017527	T	7	7	2115434	2115440	0 %	100 %	0 %	0 %	386002639
56014	NC_017527	T	6	6	2115521	2115526	0 %	100 %	0 %	0 %	386002639
56015	NC_017527	TTA	2	6	2115551	2115556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386002639
56016	NC_017527	TAA	2	6	2115570	2115575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002639
56017	NC_017527	AAT	2	6	2115604	2115609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002639
56018	NC_017527	GGC	2	6	2115652	2115657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002639
56019	NC_017527	GTA	2	6	2115658	2115663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002639
56020	NC_017527	CTG	2	6	2115668	2115673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002639
56021	NC_017527	CTT	2	6	2115693	2115698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002639
56022	NC_017527	GCT	2	6	2115706	2115711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002639
56023	NC_017527	CAATT	2	10	2115712	2115721	40 %	40 %	0 %	20 %	386002639
56024	NC_017527	TTC	2	6	2115792	2115797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002640
56025	NC_017527	AAT	2	6	2115929	2115934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002640
56026	NC_017527	T	6	6	2115997	2116002	0 %	100 %	0 %	0 %	386002640
56027	NC_017527	AT	3	6	2116022	2116027	50 %	50 %	0 %	0 %	386002640
56028	NC_017527	GGT	2	6	2116086	2116091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002640
56029	NC_017527	CGA	2	6	2116188	2116193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002640
56030	NC_017527	ATA	2	6	2116209	2116214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002640
56031	NC_017527	TCA	2	6	2116244	2116249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002640
56032	NC_017527	CCA	2	6	2116252	2116257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56033	NC_017527	CTG	2	6	2116315	2116320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002641
56034	NC_017527	TCA	2	6	2116360	2116365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002641
56035	NC_017527	GCT	2	6	2116409	2116414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002641
56036	NC_017527	AGG	2	6	2116418	2116423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002641
56037	NC_017527	ACG	3	9	2116436	2116444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002641
56038	NC_017527	TCC	2	6	2116483	2116488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002641
56039	NC_017527	ATT	2	6	2116588	2116593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386002641
56040	NC_017527	GT	3	6	2116599	2116604	0 %	50 %	50 %	0 %	386002641
56041	NC_017527	CTT	2	6	2116709	2116714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002641
56042	NC_017527	TA	3	6	2116785	2116790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56043	NC_017527	AGA	2	6	2116810	2116815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56044	NC_017527	CTC	2	6	2116838	2116843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002642
56045	NC_017527	GGC	2	6	2116873	2116878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002642
56046	NC_017527	GCT	2	6	2116933	2116938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56047	NC_017527	CT	3	6	2116937	2116942	0 %	50 %	0 %	50 %	386002642
56048	NC_017527	GCG	2	6	2117037	2117042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002642
56049	NC_017527	CTC	2	6	2117048	2117053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002642
56050	NC_017527	TCG	2	6	2117056	2117061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56051	NC_017527	CGA	2	6	2117089	2117094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56052	NC_017527	G	7	7	2117096	2117102	0 %	0 %	100 %	0 %	386002642
56053	NC_017527	CCT	2	6	2117122	2117127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002642
56054	NC_017527	CTG	2	6	2117163	2117168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56055	NC_017527	GTG	2	6	2117169	2117174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002642
56056	NC_017527	GTC	2	6	2117189	2117194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56057	NC_017527	ATG	2	6	2117199	2117204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002642
56058	NC_017527	ATG	2	6	2117283	2117288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002642
56059	NC_017527	TCC	2	6	2117293	2117298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002642
56060	NC_017527	TTC	2	6	2117310	2117315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002642
56061	NC_017527	TGG	2	6	2117349	2117354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002642
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56063	NC_017527	CGT	2	6	2117455	2117460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002642
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56065	NC_017527	GGGC	2	8	2117490	2117497	0 %	0 %	75 %	25 %	386002642
56066	NC_017527	CGA	2	6	2117578	2117583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56067	NC_017527	CGA	2	6	2117653	2117658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56068	NC_017527	TC	3	6	2117709	2117714	0 %	50 %	0 %	50 %	386002642
56069	NC_017527	GCG	2	6	2117715	2117720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002642
56070	NC_017527	CGG	2	6	2117794	2117799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002642
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56072	NC_017527	CAT	2	6	2117813	2117818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002642
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56075	NC_017527	GGCT	2	8	2117973	2117980	0 %	25 %	50 %	25 %	386002642
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56078	NC_017527	GTT	2	6	2118062	2118067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002642
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56081	NC_017527	CGT	2	6	2118118	2118123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56082	NC_017527	GCCG	2	8	2118134	2118141	0 %	0 %	50 %	50 %	386002642
56083	NC_017527	TGC	2	6	2118156	2118161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002642
56084	NC_017527	GTA	2	6	2118176	2118181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002642
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56087	NC_017527	CCG	2	6	2118272	2118277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002643
56088	NC_017527	TGC	2	6	2118282	2118287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002643
56089	NC_017527	CGA	2	6	2118386	2118391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002643
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56093	NC_017527	C	6	6	2118589	2118594	0 %	0 %	0 %	100 %	386002644
56094	NC_017527	CT	3	6	2118681	2118686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56095	NC_017527	CAC	2	6	2118779	2118784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002645
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56098	NC_017527	GAAGG	2	10	2118910	2118919	40 %	0 %	60 %	0 %	386002645
56099	NC_017527	ATG	2	6	2118929	2118934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002645
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56101	NC_017527	CTT	2	6	2118949	2118954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002645
56102	NC_017527	GGA	2	6	2118987	2118992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002645
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56106	NC_017527	CTC	2	6	2119151	2119156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002645
56107	NC_017527	GGTC	2	8	2119194	2119201	0 %	25 %	50 %	25 %	386002645
56108	NC_017527	CGA	2	6	2119213	2119218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002645
56109	NC_017527	A	6	6	2119250	2119255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56110	NC_017527	CTGG	2	8	2119279	2119286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56111	NC_017527	CGA	3	9	2119301	2119309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56112	NC_017527	CTC	2	6	2119355	2119360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002646
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56115	NC_017527	ATC	2	6	2119583	2119588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002646
56116	NC_017527	CTT	2	6	2119624	2119629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002646
56117	NC_017527	ACC	2	6	2119679	2119684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002646
56118	NC_017527	AGG	2	6	2119709	2119714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002646
56119	NC_017527	GTC	2	6	2119742	2119747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002646
56120	NC_017527	ATG	2	6	2119748	2119753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002646
56121	NC_017527	GTC	2	6	2119754	2119759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002646
56122	NC_017527	TCG	2	6	2119764	2119769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002646
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56125	NC_017527	TCA	2	6	2119884	2119889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002646
56126	NC_017527	ATCC	2	8	2119891	2119898	25 %	25 %	0 %	50 %	386002646
56127	NC_017527	GTC	2	6	2119925	2119930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002646
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56147	NC_017527	AGG	2	6	2120548	2120553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002648
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56153	NC_017527	CAGGTC	2	12	2120685	2120696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386002648
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56188	NC_017527	TAAA	2	8	2121742	2121749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56189	NC_017527	C	7	7	2121770	2121776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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56195	NC_017527	GCG	2	6	2122055	2122060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002649
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56217	NC_017527	CGG	2	6	2122698	2122703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002650
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56222	NC_017527	G	7	7	2122849	2122855	0 %	0 %	100 %	0 %	386002650
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56230	NC_017527	GAG	2	6	2123227	2123232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002650
56231	NC_017527	CCG	2	6	2123257	2123262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002650
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56233	NC_017527	CTC	3	9	2123293	2123301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002650
56234	NC_017527	CCT	2	6	2123319	2123324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002650
56235	NC_017527	GGCC	2	8	2123360	2123367	0 %	0 %	50 %	50 %	386002650
56236	NC_017527	CAT	2	6	2123427	2123432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002650
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56238	NC_017527	G	6	6	2123540	2123545	0 %	0 %	100 %	0 %	386002650
56239	NC_017527	GGT	2	6	2123547	2123552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002650
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56242	NC_017527	TGG	2	6	2123716	2123721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002651
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56245	NC_017527	G	9	9	2123817	2123825	0 %	0 %	100 %	0 %	386002651
56246	NC_017527	CGT	2	6	2123837	2123842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002651
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56249	NC_017527	GGA	2	6	2123918	2123923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002651
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56253	NC_017527	TCG	2	6	2124094	2124099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002651
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56291	NC_017527	TAT	2	6	2125443	2125448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56292	NC_017527	CCCTG	2	10	2125550	2125559	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56293	NC_017527	GA	3	6	2125597	2125602	50 %	0 %	50 %	0 %	386002653
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56333	NC_017527	GAG	2	6	2127023	2127028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002653
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56338	NC_017527	GGA	2	6	2127317	2127322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56339	NC_017527	C	6	6	2127341	2127346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56340	NC_017527	GAGG	2	8	2127353	2127360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56341	NC_017527	GAGGGC	2	12	2127369	2127380	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56342	NC_017527	CGGC	2	8	2127392	2127399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56343	NC_017527	AGG	2	6	2127438	2127443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002654
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56346	NC_017527	TCT	2	6	2127507	2127512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002654
56347	NC_017527	TCG	2	6	2127561	2127566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002654
56348	NC_017527	GACG	2	8	2127574	2127581	25 %	0 %	50 %	25 %	386002654
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56350	NC_017527	GGC	2	6	2127608	2127613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002654
56351	NC_017527	GGGC	2	8	2127616	2127623	0 %	0 %	75 %	25 %	386002654
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56451	NC_017527	GAGGC	2	10	2131274	2131283	20 %	0 %	60 %	20 %	386002657
56452	NC_017527	GCCTC	2	10	2131299	2131308	0 %	20 %	20 %	60 %	386002657
56453	NC_017527	CCAG	2	8	2131361	2131368	25 %	0 %	25 %	50 %	386002658
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56455	NC_017527	GTC	2	6	2131477	2131482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002658
56456	NC_017527	GGGGC	2	10	2131496	2131505	0 %	0 %	80 %	20 %	386002658
56457	NC_017527	AG	3	6	2131522	2131527	50 %	0 %	50 %	0 %	386002658
56458	NC_017527	GCC	2	6	2131536	2131541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002658
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56460	NC_017527	GCC	2	6	2131635	2131640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002658
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56462	NC_017527	TCA	2	6	2131706	2131711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002658
56463	NC_017527	GGCCC	2	10	2131749	2131758	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56464	NC_017527	CGA	2	6	2131860	2131865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56465	NC_017527	CGC	2	6	2131947	2131952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002659
56466	NC_017527	CGA	2	6	2132000	2132005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56467	NC_017527	CCCCGC	2	12	2132007	2132018	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386002659
56468	NC_017527	GAC	2	6	2132022	2132027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56469	NC_017527	GAC	2	6	2132046	2132051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56470	NC_017527	GATGGC	2	12	2132058	2132069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386002659
56471	NC_017527	CGG	2	6	2132075	2132080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002659
56472	NC_017527	GGA	2	6	2132088	2132093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002659
56473	NC_017527	CGC	3	9	2132105	2132113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002659
56474	NC_017527	GTC	2	6	2132142	2132147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56475	NC_017527	GAT	2	6	2132148	2132153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002659
56476	NC_017527	GCG	2	6	2132212	2132217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002659
56477	NC_017527	TCCC	2	8	2132232	2132239	0 %	25 %	0 %	75 %	386002659
56478	NC_017527	CGT	2	6	2132256	2132261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56479	NC_017527	GGA	2	6	2132288	2132293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002659
56480	NC_017527	TCC	2	6	2132305	2132310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002659
56481	NC_017527	CGGAC	2	10	2132336	2132345	20 %	0 %	40 %	40 %	386002659
56482	NC_017527	TCC	2	6	2132398	2132403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002659
56483	NC_017527	CGC	2	6	2132412	2132417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002659
56484	NC_017527	GAG	2	6	2132418	2132423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002659
56485	NC_017527	GTC	2	6	2132424	2132429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56486	NC_017527	CTC	2	6	2132430	2132435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002659
56487	NC_017527	GTC	2	6	2132476	2132481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56488	NC_017527	CCA	2	6	2132525	2132530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002659
56489	NC_017527	TGTAGG	2	12	2132555	2132566	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386002659
56490	NC_017527	TCC	2	6	2132636	2132641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002659
56491	NC_017527	ACC	2	6	2132650	2132655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002659
56492	NC_017527	CTC	2	6	2132703	2132708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002659
56493	NC_017527	CCTG	2	8	2132755	2132762	0 %	25 %	25 %	50 %	386002659
56494	NC_017527	AGGTCC	2	12	2132773	2132784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56495	NC_017527	GAG	2	6	2132835	2132840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002659
56496	NC_017527	G	6	6	2132840	2132845	0 %	0 %	100 %	0 %	386002659
56497	NC_017527	GGT	2	6	2132873	2132878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002659
56498	NC_017527	CGAT	2	8	2132941	2132948	25 %	25 %	25 %	25 %	386002659
56499	NC_017527	CGA	2	6	2132957	2132962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002659
56500	NC_017527	CCG	2	6	2132989	2132994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002659

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