MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_017527	GTT	2	6	2002466	2002471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002532
53002	NC_017527	TCC	3	9	2002557	2002565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002532
53003	NC_017527	GCCAT	2	10	2002614	2002623	20 %	20 %	20 %	40 %	386002532
53004	NC_017527	CTG	2	6	2002691	2002696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002532
53005	NC_017527	GGCT	2	8	2002699	2002706	0 %	25 %	50 %	25 %	386002532
53006	NC_017527	TCG	2	6	2002713	2002718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002532
53007	NC_017527	CGAGGT	2	12	2002727	2002738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386002532
53008	NC_017527	TTA	2	6	2002855	2002860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53009	NC_017527	AAG	2	6	2002897	2002902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53010	NC_017527	AAG	2	6	2002941	2002946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002533
53011	NC_017527	CTT	2	6	2003018	2003023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002533
53012	NC_017527	AAG	2	6	2003031	2003036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002533
53013	NC_017527	CGA	2	6	2003069	2003074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002533
53014	NC_017527	AGA	2	6	2003113	2003118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002533
53015	NC_017527	G	6	6	2003144	2003149	0 %	0 %	100 %	0 %	386002533
53016	NC_017527	TTC	2	6	2003175	2003180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002533
53017	NC_017527	TCGAGG	2	12	2003191	2003202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386002533
53018	NC_017527	TCC	2	6	2003257	2003262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002533
53019	NC_017527	CGA	3	9	2003264	2003272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002533
53020	NC_017527	TTC	2	6	2003283	2003288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002533
53021	NC_017527	ACG	2	6	2003341	2003346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002533
53022	NC_017527	CGG	2	6	2003366	2003371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002533
53023	NC_017527	TGA	2	6	2003389	2003394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002533
53024	NC_017527	TCC	2	6	2003407	2003412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002533
53025	NC_017527	CGC	2	6	2003453	2003458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002533
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53027	NC_017527	GA	3	6	2003541	2003546	50 %	0 %	50 %	0 %	386002533
53028	NC_017527	ACCG	2	8	2003583	2003590	25 %	0 %	25 %	50 %	386002533
53029	NC_017527	CGA	2	6	2003636	2003641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002533
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53032	NC_017527	AGC	2	6	2003869	2003874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002533
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53034	NC_017527	GAGGT	2	10	2003928	2003937	20 %	20 %	60 %	0 %	386002533
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53038	NC_017527	TGCGG	2	10	2004076	2004085	0 %	20 %	60 %	20 %	386002533
53039	NC_017527	CAT	2	6	2004101	2004106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002533
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53042	NC_017527	AAG	2	6	2004201	2004206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002533
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53045	NC_017527	GCCT	2	8	2004332	2004339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53046	NC_017527	TCG	2	6	2004384	2004389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53047	NC_017527	GCC	2	6	2004414	2004419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53048	NC_017527	GCC	2	6	2004431	2004436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53049	NC_017527	ATT	2	6	2004473	2004478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53050	NC_017527	TA	3	6	2004517	2004522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53051	NC_017527	AT	3	6	2004526	2004531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53052	NC_017527	ATA	2	6	2004675	2004680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002534
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53057	NC_017527	TCG	2	6	2005030	2005035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002534
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53059	NC_017527	ATCGA	2	10	2005133	2005142	40 %	20 %	20 %	20 %	386002534
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53064	NC_017527	ACG	2	6	2005388	2005393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002534
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53067	NC_017527	TCT	2	6	2005680	2005685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53101	NC_017527	AT	3	6	2007106	2007111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53102	NC_017527	ATAAAA	2	12	2007123	2007134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53104	NC_017527	C	6	6	2007155	2007160	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53105	NC_017527	TCC	3	9	2007168	2007176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53106	NC_017527	GAT	2	6	2007218	2007223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53109	NC_017527	GAG	2	6	2007324	2007329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002536
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53117	NC_017527	GATC	2	8	2007548	2007555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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53119	NC_017527	GGA	3	9	2007626	2007634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53223	NC_017527	ATAA	2	8	2013180	2013187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53224	NC_017527	GCA	2	6	2013191	2013196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53228	NC_017527	GAG	2	6	2013331	2013336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53230	NC_017527	CTA	2	6	2013345	2013350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53231	NC_017527	A	7	7	2013350	2013356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53232	NC_017527	CTG	2	6	2013457	2013462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53233	NC_017527	GTTCG	2	10	2013468	2013477	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53234	NC_017527	GCC	3	9	2013771	2013779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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53236	NC_017527	GATCCA	2	12	2013842	2013853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53237	NC_017527	GGA	2	6	2013902	2013907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53238	NC_017527	AGC	2	6	2013946	2013951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002540
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53240	NC_017527	GCA	2	6	2014100	2014105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002540
53241	NC_017527	GAAG	2	8	2014112	2014119	50 %	0 %	50 %	0 %	386002540
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53340	NC_017527	GAG	2	6	2018192	2018197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53341	NC_017527	CT	3	6	2018212	2018217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53342	NC_017527	CGG	2	6	2018349	2018354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53344	NC_017527	G	6	6	2018448	2018453	0 %	0 %	100 %	0 %	386002543
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53354	NC_017527	GGC	2	6	2018935	2018940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002543
53355	NC_017527	GAT	2	6	2018959	2018964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002543
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53375	NC_017527	AGG	2	6	2019604	2019609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002544
53376	NC_017527	C	7	7	2019618	2019624	0 %	0 %	0 %	100 %	386002544
53377	NC_017527	TC	3	6	2019684	2019689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53378	NC_017527	GA	3	6	2019691	2019696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53379	NC_017527	AG	4	8	2019735	2019742	50 %	0 %	50 %	0 %	386002545
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53440	NC_017527	AGGG	2	8	2021691	2021698	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53441	NC_017527	GATT	2	8	2021700	2021707	25 %	50 %	25 %	0 %	386002547
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53449	NC_017527	CCTCGG	2	12	2022019	2022030	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386002547
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53452	NC_017527	TCC	3	9	2022222	2022230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002547
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53462	NC_017527	CGA	2	6	2022520	2022525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002547
53463	NC_017527	CCA	2	6	2022541	2022546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002547
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53466	NC_017527	ACCTTC	2	12	2022647	2022658	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386002547
53467	NC_017527	C	6	6	2022658	2022663	0 %	0 %	0 %	100 %	386002547
53468	NC_017527	GCC	2	6	2022692	2022697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002547
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53470	NC_017527	GGA	2	6	2022801	2022806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002547
53471	NC_017527	CTCGG	2	10	2022818	2022827	0 %	20 %	40 %	40 %	386002547
53472	NC_017527	GGCG	2	8	2022850	2022857	0 %	0 %	75 %	25 %	386002547
53473	NC_017527	G	7	7	2022877	2022883	0 %	0 %	100 %	0 %	386002547
53474	NC_017527	TCG	2	6	2022894	2022899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002547
53475	NC_017527	CTC	2	6	2022968	2022973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002547
53476	NC_017527	TCC	2	6	2022993	2022998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002547
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53480	NC_017527	CG	3	6	2023195	2023200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53481	NC_017527	CGCC	2	8	2023320	2023327	0 %	0 %	25 %	75 %	386002548
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