MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_017527	TAC	2	6	1926431	1926436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002468
51002	NC_017527	GCCCTC	2	12	1926503	1926514	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386002468
51003	NC_017527	AGGA	2	8	1926572	1926579	50 %	0 %	50 %	0 %	386002468
51004	NC_017527	ATC	2	6	1926661	1926666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51005	NC_017527	TAA	2	6	1926732	1926737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51006	NC_017527	CCG	2	6	1926765	1926770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51007	NC_017527	AGA	2	6	1926771	1926776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51008	NC_017527	GAAGAT	2	12	1926861	1926872	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_017527	AGGG	2	8	1926913	1926920	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51010	NC_017527	TCAA	2	8	1926960	1926967	50 %	25 %	0 %	25 %	386002469
51011	NC_017527	CTG	2	6	1926988	1926993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002469
51012	NC_017527	TTC	2	6	1927010	1927015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002469
51013	NC_017527	TTC	2	6	1927018	1927023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002469
51014	NC_017527	GA	3	6	1927055	1927060	50 %	0 %	50 %	0 %	386002469
51015	NC_017527	ATC	2	6	1927096	1927101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002469
51016	NC_017527	GA	3	6	1927118	1927123	50 %	0 %	50 %	0 %	386002469
51017	NC_017527	TCC	2	6	1927124	1927129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002469
51018	NC_017527	ATC	2	6	1927186	1927191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002469
51019	NC_017527	GGT	2	6	1927203	1927208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002469
51020	NC_017527	GAG	2	6	1927246	1927251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51021	NC_017527	GAA	3	9	1927281	1927289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002469
51022	NC_017527	C	6	6	1927361	1927366	0 %	0 %	0 %	100 %	386002469
51023	NC_017527	CTC	2	6	1927383	1927388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002469
51024	NC_017527	CTA	2	6	1927506	1927511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002469
51025	NC_017527	CGGA	2	8	1927589	1927596	25 %	0 %	50 %	25 %	386002469
51026	NC_017527	TCG	2	6	1927613	1927618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002469
51027	NC_017527	CGC	2	6	1927656	1927661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002469
51028	NC_017527	CCTCT	2	10	1927670	1927679	0 %	40 %	0 %	60 %	386002469
51029	NC_017527	TGATTA	2	12	1927689	1927700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386002469
51030	NC_017527	TCC	2	6	1927904	1927909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002469
51031	NC_017527	G	8	8	1927911	1927918	0 %	0 %	100 %	0 %	386002469
51032	NC_017527	GAT	2	6	1928010	1928015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002469
51033	NC_017527	GCCT	2	8	1928035	1928042	0 %	25 %	25 %	50 %	386002469
51034	NC_017527	GGT	2	6	1928104	1928109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002469
51035	NC_017527	CGG	2	6	1928265	1928270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002469
51036	NC_017527	CGA	2	6	1928298	1928303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002469
51037	NC_017527	ACA	2	6	1928333	1928338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386002469
51038	NC_017527	CGATCG	2	12	1928379	1928390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386002469
51039	NC_017527	GCC	2	6	1928504	1928509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002469
51040	NC_017527	CTT	2	6	1928526	1928531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002469
51041	NC_017527	AGG	2	6	1928680	1928685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51042	NC_017527	GAC	2	6	1928688	1928693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002469
51043	NC_017527	ACC	2	6	1928714	1928719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002469
51044	NC_017527	AGG	2	6	1928786	1928791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51045	NC_017527	ACC	2	6	1928815	1928820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002469
51046	NC_017527	CCT	2	6	1928859	1928864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002469
51047	NC_017527	ACC	2	6	1928888	1928893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002469
51048	NC_017527	GTC	2	6	1928980	1928985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002469
51049	NC_017527	GTTG	2	8	1929027	1929034	0 %	50 %	50 %	0 %	386002469
51050	NC_017527	GCG	2	6	1929080	1929085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002469
51051	NC_017527	GCG	2	6	1929118	1929123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002469
51052	NC_017527	GGTA	2	8	1929127	1929134	25 %	25 %	50 %	0 %	386002469
51053	NC_017527	AGG	2	6	1929161	1929166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51054	NC_017527	GAG	2	6	1929169	1929174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51055	NC_017527	CTGA	2	8	1929175	1929182	25 %	25 %	25 %	25 %	386002469
51056	NC_017527	GGT	2	6	1929201	1929206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002469
51057	NC_017527	TCC	2	6	1929233	1929238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002469
51058	NC_017527	TGG	2	6	1929239	1929244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002469
51059	NC_017527	GCC	2	6	1929292	1929297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002469
51060	NC_017527	CCGG	2	8	1929324	1929331	0 %	0 %	50 %	50 %	386002469
51061	NC_017527	GAGC	2	8	1929339	1929346	25 %	0 %	50 %	25 %	386002469
51062	NC_017527	TC	3	6	1929348	1929353	0 %	50 %	0 %	50 %	386002469
51063	NC_017527	CAC	2	6	1929390	1929395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002469
51064	NC_017527	CGG	2	6	1929612	1929617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002469
51065	NC_017527	CGAG	2	8	1929644	1929651	25 %	0 %	50 %	25 %	386002469
51066	NC_017527	G	6	6	1929707	1929712	0 %	0 %	100 %	0 %	386002469
51067	NC_017527	GGGT	2	8	1929719	1929726	0 %	25 %	75 %	0 %	386002469
51068	NC_017527	GTC	2	6	1929742	1929747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002469
51069	NC_017527	GAG	2	6	1929804	1929809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51070	NC_017527	AAT	2	6	1929871	1929876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002469
51071	NC_017527	GGA	2	6	1929885	1929890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51072	NC_017527	C	6	6	1929896	1929901	0 %	0 %	0 %	100 %	386002469
51073	NC_017527	GAG	3	9	1929903	1929911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002469
51074	NC_017527	GGC	2	6	1929913	1929918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002469
51075	NC_017527	CTG	2	6	1930119	1930124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002470
51076	NC_017527	GGC	2	6	1930132	1930137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002470
51077	NC_017527	GCC	2	6	1930163	1930168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002470
51078	NC_017527	GCA	2	6	1930200	1930205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002470
51079	NC_017527	GCA	2	6	1930223	1930228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002470
51080	NC_017527	TCG	2	6	1930281	1930286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002470
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51082	NC_017527	GAAG	2	8	1930322	1930329	50 %	0 %	50 %	0 %	386002470
51083	NC_017527	GTAG	2	8	1930352	1930359	25 %	25 %	50 %	0 %	386002470
51084	NC_017527	CTC	2	6	1930367	1930372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002470
51085	NC_017527	GCC	2	6	1930373	1930378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002470
51086	NC_017527	GTC	2	6	1930544	1930549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002470
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51088	NC_017527	GGATCT	2	12	1930566	1930577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386002470
51089	NC_017527	AGC	3	9	1930589	1930597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002470
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51091	NC_017527	GAA	2	6	1930653	1930658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002470
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51099	NC_017527	CCT	2	6	1930864	1930869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51100	NC_017527	GAT	2	6	1930957	1930962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51101	NC_017527	CGG	2	6	1930995	1931000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002471
51102	NC_017527	GAG	2	6	1931020	1931025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002471
51103	NC_017527	CGG	2	6	1931031	1931036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002471
51104	NC_017527	CTC	3	9	1931060	1931068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002471
51105	NC_017527	GAT	2	6	1931098	1931103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002471
51106	NC_017527	GAT	2	6	1931119	1931124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002471
51107	NC_017527	CAT	2	6	1931153	1931158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002471
51108	NC_017527	C	8	8	1931239	1931246	0 %	0 %	0 %	100 %	386002471
51109	NC_017527	GGT	2	6	1931257	1931262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002471
51110	NC_017527	CTA	2	6	1931284	1931289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002471
51111	NC_017527	CTGGAG	2	12	1931315	1931326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386002471
51112	NC_017527	GAG	2	6	1931341	1931346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002471
51113	NC_017527	GGA	2	6	1931413	1931418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002471
51114	NC_017527	C	6	6	1931468	1931473	0 %	0 %	0 %	100 %	386002471
51115	NC_017527	CT	3	6	1931478	1931483	0 %	50 %	0 %	50 %	386002471
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51350	NC_017527	TCCGC	2	10	1940555	1940564	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51351	NC_017527	CTC	2	6	1940567	1940572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51352	NC_017527	AGG	2	6	1940674	1940679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51353	NC_017527	GCT	2	6	1940713	1940718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51354	NC_017527	AGA	2	6	1940737	1940742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002481
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51472	NC_017527	CCT	2	6	1944779	1944784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002484
51473	NC_017527	GAC	2	6	1944819	1944824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002484
51474	NC_017527	TTG	2	6	1944826	1944831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386002484
51475	NC_017527	GGCG	2	8	1944869	1944876	0 %	0 %	75 %	25 %	386002484
51476	NC_017527	CTC	2	6	1944900	1944905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002484
51477	NC_017527	CGA	2	6	1944914	1944919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002484
51478	NC_017527	TCCC	2	8	1944946	1944953	0 %	25 %	0 %	75 %	386002484
51479	NC_017527	TCG	2	6	1944958	1944963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002484
51480	NC_017527	GTA	2	6	1944972	1944977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002484
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51483	NC_017527	GTCG	2	8	1945056	1945063	0 %	25 %	50 %	25 %	386002484
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51497	NC_017527	GAC	2	6	1945580	1945585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002485
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51499	NC_017527	TCA	2	6	1945624	1945629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002485
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