MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 68071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_017527	CGG	2	6	1890005	1890010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002437
50003	NC_017527	CGG	2	6	1890026	1890031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002437
50004	NC_017527	ACCTGG	2	12	1890047	1890058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386002437
50005	NC_017527	CGGG	2	8	1890147	1890154	0 %	0 %	75 %	25 %	386002437
50006	NC_017527	AGG	2	6	1890206	1890211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002437
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50008	NC_017527	GAA	2	6	1890301	1890306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002437
50009	NC_017527	AGG	3	9	1890312	1890320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002437
50010	NC_017527	GAC	2	6	1890341	1890346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50011	NC_017527	GGC	2	6	1890353	1890358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50012	NC_017527	C	6	6	1890403	1890408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50013	NC_017527	G	6	6	1890437	1890442	0 %	0 %	100 %	0 %	386002438
50014	NC_017527	GCC	3	9	1890479	1890487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002438
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50016	NC_017527	CGA	2	6	1890592	1890597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002438
50017	NC_017527	TCA	2	6	1890609	1890614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002438
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50019	NC_017527	A	6	6	1890685	1890690	100 %	0 %	0 %	0 %	386002438
50020	NC_017527	CTCGC	2	10	1890740	1890749	0 %	20 %	20 %	60 %	386002438
50021	NC_017527	TGG	2	6	1890765	1890770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002438
50022	NC_017527	AGG	2	6	1890792	1890797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002438
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50027	NC_017527	G	6	6	1890956	1890961	0 %	0 %	100 %	0 %	386002438
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50035	NC_017527	GAGACG	2	12	1891266	1891277	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386002438
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50041	NC_017527	GAGG	2	8	1891464	1891471	25 %	0 %	75 %	0 %	386002439
50042	NC_017527	CGT	4	12	1891527	1891538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002439
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50044	NC_017527	CGA	2	6	1891620	1891625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002439
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50051	NC_017527	GAG	2	6	1891984	1891989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002440
50052	NC_017527	AG	4	8	1891988	1891995	50 %	0 %	50 %	0 %	386002440
50053	NC_017527	ATAG	2	8	1892000	1892007	50 %	25 %	25 %	0 %	386002440
50054	NC_017527	GGA	2	6	1892113	1892118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002440
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50059	NC_017527	AT	3	6	1892435	1892440	50 %	50 %	0 %	0 %	386002440
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50070	NC_017527	ACGT	2	8	1893202	1893209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50071	NC_017527	TTGA	2	8	1893210	1893217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50072	NC_017527	AC	3	6	1893265	1893270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50073	NC_017527	ATCAA	2	10	1893358	1893367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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50104	NC_017527	GCCGC	2	10	1894769	1894778	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50105	NC_017527	GCC	2	6	1894788	1894793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50106	NC_017527	TCT	2	6	1894840	1894845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002442
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50109	NC_017527	CGC	2	6	1894927	1894932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002442
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50113	NC_017527	CGA	2	6	1895110	1895115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002442
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50115	NC_017527	C	7	7	1895135	1895141	0 %	0 %	0 %	100 %	386002442
50116	NC_017527	GGC	2	6	1895165	1895170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002442
50117	NC_017527	GAT	2	6	1895228	1895233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002442
50118	NC_017527	GAC	2	6	1895243	1895248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002442
50119	NC_017527	CGAT	2	8	1895266	1895273	25 %	25 %	25 %	25 %	386002442
50120	NC_017527	CGA	2	6	1895308	1895313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002442
50121	NC_017527	TCTCCC	2	12	1895335	1895346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002442
50122	NC_017527	AGA	2	6	1895365	1895370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386002442
50123	NC_017527	TCG	2	6	1895383	1895388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002442
50124	NC_017527	GGA	3	9	1895392	1895400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002442
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50126	NC_017527	TCA	2	6	1895461	1895466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002442
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50129	NC_017527	CGG	2	6	1895619	1895624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50130	NC_017527	CGT	2	6	1895707	1895712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002443
50131	NC_017527	CGA	2	6	1895806	1895811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002443
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50136	NC_017527	TCC	2	6	1895998	1896003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002443
50137	NC_017527	TGA	2	6	1896010	1896015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386002443
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50158	NC_017527	TTA	2	6	1896810	1896815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50161	NC_017527	CCT	2	6	1896940	1896945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50162	NC_017527	ATT	2	6	1896970	1896975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50163	NC_017527	AAT	2	6	1897057	1897062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50164	NC_017527	TAC	2	6	1897067	1897072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50166	NC_017527	ATA	2	6	1897129	1897134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386002444
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50187	NC_017527	GAG	2	6	1898230	1898235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50226	NC_017527	GGA	2	6	1899735	1899740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002446
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50230	NC_017527	CGC	2	6	1899786	1899791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002446
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50233	NC_017527	CGT	2	6	1899899	1899904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002446
50234	NC_017527	CCG	2	6	1899911	1899916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002446
50235	NC_017527	TCC	2	6	1899919	1899924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002446
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50351	NC_017527	GGC	2	6	1903760	1903765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002448
50352	NC_017527	CGT	2	6	1903766	1903771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002448
50353	NC_017527	TCC	2	6	1903926	1903931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002448
50354	NC_017527	ACG	2	6	1903933	1903938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002448
50355	NC_017527	ACC	2	6	1903963	1903968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386002448
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50363	NC_017527	CGG	3	9	1904100	1904108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386002448
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50369	NC_017527	CAG	2	6	1904238	1904243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002448
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50384	NC_017527	CCT	2	6	1904630	1904635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002448
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50400	NC_017527	TCC	2	6	1905177	1905182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002449
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50422	NC_017527	GGA	2	6	1905837	1905842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002449
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50430	NC_017527	GAG	2	6	1906060	1906065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386002449
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50432	NC_017527	GAT	2	6	1906167	1906172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50434	NC_017527	CTT	2	6	1906255	1906260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386002450
50435	NC_017527	CTC	2	6	1906351	1906356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002450
50436	NC_017527	CAT	2	6	1906392	1906397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002450
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50450	NC_017527	CGC	2	6	1906753	1906758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50451	NC_017527	ATC	2	6	1906784	1906789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50452	NC_017527	AAT	2	6	1906853	1906858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50453	NC_017527	GGAGAC	3	18	1907007	1907024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386002451
50454	NC_017527	TCG	2	6	1907099	1907104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386002451
50455	NC_017527	TGG	2	6	1907108	1907113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002451
50456	NC_017527	CGA	2	6	1907283	1907288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386002451
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50458	NC_017527	CCGG	2	8	1907342	1907349	0 %	0 %	50 %	50 %	386002451
50459	NC_017527	CAT	2	6	1907358	1907363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386002451
50460	NC_017527	GCC	2	6	1907428	1907433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002451
50461	NC_017527	CCG	2	6	1907453	1907458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386002451
50462	NC_017527	CGATA	2	10	1907463	1907472	40 %	20 %	20 %	20 %	386002451
50463	NC_017527	CTC	3	9	1907536	1907544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386002451
50464	NC_017527	TGG	2	6	1907561	1907566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386002451
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