MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017524	TG	3	6	166133	166138	0 %	50 %	50 %	0 %	385996911
4002	NC_017524	TCCC	2	8	166165	166172	0 %	25 %	0 %	75 %	385996911
4003	NC_017524	CAG	2	6	166255	166260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996911
4004	NC_017524	GTC	2	6	166275	166280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996911
4005	NC_017524	GAA	2	6	166301	166306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996911
4006	NC_017524	GGC	2	6	166354	166359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996911
4007	NC_017524	TGC	2	6	166371	166376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996911
4008	NC_017524	ACG	2	6	166386	166391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996911
4009	NC_017524	CCG	2	6	166401	166406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996911
4010	NC_017524	TG	4	8	166413	166420	0 %	50 %	50 %	0 %	385996911
4011	NC_017524	CGG	3	9	166432	166440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996911
4012	NC_017524	GGTG	2	8	166531	166538	0 %	25 %	75 %	0 %	385996911
4013	NC_017524	CGA	2	6	166540	166545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996911
4014	NC_017524	TGC	2	6	166546	166551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996911
4015	NC_017524	GGC	2	6	166567	166572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996911
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4017	NC_017524	AAG	2	6	166629	166634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996911
4018	NC_017524	CGC	2	6	166645	166650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996911
4019	NC_017524	CGC	2	6	166668	166673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996911
4020	NC_017524	CGGTGC	2	12	166689	166700	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996911
4021	NC_017524	ATG	2	6	166781	166786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996911
4022	NC_017524	GTTGG	2	10	166828	166837	0 %	40 %	60 %	0 %	385996911
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4028	NC_017524	TCG	2	6	167256	167261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996912
4029	NC_017524	ACG	2	6	167262	167267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996912
4030	NC_017524	CGG	2	6	167295	167300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996912
4031	NC_017524	GCG	2	6	167303	167308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996912
4032	NC_017524	GAT	2	6	167427	167432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996913
4033	NC_017524	TCT	2	6	167609	167614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996913
4034	NC_017524	AGC	2	6	167665	167670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996913
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4044	NC_017524	CGC	2	6	167983	167988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996914
4045	NC_017524	GCGTG	2	10	167994	168003	0 %	20 %	60 %	20 %	385996914
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4056	NC_017524	GTG	2	6	168362	168367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996914
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4058	NC_017524	GCGG	2	8	168379	168386	0 %	0 %	75 %	25 %	385996914
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4063	NC_017524	GAT	2	6	168541	168546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996914
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4065	NC_017524	CGA	2	6	168574	168579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996914
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4068	NC_017524	GCCGC	2	10	168667	168676	0 %	0 %	40 %	60 %	385996914
4069	NC_017524	CGG	2	6	168823	168828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996915
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4102	NC_017524	CG	3	6	169956	169961	0 %	0 %	50 %	50 %	385996915
4103	NC_017524	GCC	2	6	169982	169987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996915
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4108	NC_017524	CAG	2	6	170290	170295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017524	CCG	2	6	170331	170336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_017524	GCG	2	6	170341	170346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017524	CGC	3	9	170396	170404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996916
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4113	NC_017524	GGTA	2	8	170526	170533	25 %	25 %	50 %	0 %	385996916
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4121	NC_017524	GGC	2	6	170849	170854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996916
4122	NC_017524	GTC	2	6	170860	170865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996916
4123	NC_017524	CCA	2	6	170921	170926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996916
4124	NC_017524	ATG	2	6	171017	171022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996916
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4130	NC_017524	CA	3	6	171244	171249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_017524	ACTT	2	8	171268	171275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_017524	GCATG	2	10	171281	171290	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4133	NC_017524	CGA	2	6	171304	171309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996917
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4135	NC_017524	GTC	2	6	171466	171471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996917
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4140	NC_017524	TGGC	2	8	171786	171793	0 %	25 %	50 %	25 %	385996918
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4159	NC_017524	TACC	2	8	172537	172544	25 %	25 %	0 %	50 %	385996919
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4163	NC_017524	AGCG	2	8	172898	172905	25 %	0 %	50 %	25 %	385996919
4164	NC_017524	TA	3	6	172920	172925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_017524	AT	3	6	172931	172936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_017524	CGC	2	6	173019	173024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996920
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4204	NC_017524	GAG	2	6	174579	174584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_017524	CTG	3	9	175585	175593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996922
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4239	NC_017524	GCC	2	6	175915	175920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996922
4240	NC_017524	TCGCT	2	10	175994	176003	0 %	40 %	20 %	40 %	385996922
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4242	NC_017524	GGGCT	2	10	176034	176043	0 %	20 %	60 %	20 %	385996922
4243	NC_017524	CAG	2	6	176044	176049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996922
4244	NC_017524	TCG	3	9	176084	176092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996922
4245	NC_017524	CGG	2	6	176100	176105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996922
4246	NC_017524	CGA	2	6	176115	176120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996922
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4262	NC_017524	CCA	2	6	177151	177156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_017524	CAG	2	6	177181	177186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4334	NC_017524	TAG	2	6	179809	179814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996925
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4336	NC_017524	CGT	2	6	179932	179937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996925
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4338	NC_017524	TTCAT	2	10	180057	180066	20 %	60 %	0 %	20 %	385996925
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4346	NC_017524	ATC	2	6	180435	180440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996925
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4350	NC_017524	GGC	2	6	180506	180511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996925
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4353	NC_017524	TGG	2	6	180552	180557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996925
4354	NC_017524	GAGC	2	8	180584	180591	25 %	0 %	50 %	25 %	385996925
4355	NC_017524	GGC	2	6	180636	180641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996925
4356	NC_017524	GCCG	2	8	180654	180661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4357	NC_017524	GCCGCG	2	12	180688	180699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4358	NC_017524	CGG	3	9	180737	180745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4359	NC_017524	CCG	2	6	180746	180751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4360	NC_017524	TGG	2	6	180866	180871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_017524	CG	3	6	180892	180897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4362	NC_017524	AGC	2	6	180918	180923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996926
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4364	NC_017524	GCG	2	6	181017	181022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996926
4365	NC_017524	CG	3	6	181034	181039	0 %	0 %	50 %	50 %	385996926
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4484	NC_017524	TGC	2	6	185325	185330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4485	NC_017524	TGGCCG	3	18	185331	185348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996930
4486	NC_017524	CCG	3	9	185346	185354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996930
4487	NC_017524	TGG	2	6	185402	185407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996930
4488	NC_017524	CGC	2	6	185425	185430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996930
4489	NC_017524	TGG	2	6	185448	185453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996930
4490	NC_017524	GGT	2	6	185482	185487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996930
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