MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017524	GAC	2	6	63714	63719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996830
1502	NC_017524	GCC	2	6	63733	63738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996830
1503	NC_017524	GCC	2	6	63741	63746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996830
1504	NC_017524	GT	3	6	63792	63797	0 %	50 %	50 %	0 %	385996830
1505	NC_017524	TCA	2	6	63868	63873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996830
1506	NC_017524	TAC	2	6	63885	63890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996830
1507	NC_017524	AAGG	2	8	63892	63899	50 %	0 %	50 %	0 %	385996830
1508	NC_017524	AGG	3	9	63897	63905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017524	CCT	2	6	63933	63938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996831
1510	NC_017524	CGC	2	6	64018	64023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996831
1511	NC_017524	TCG	3	9	64091	64099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996831
1512	NC_017524	CAT	2	6	64128	64133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996831
1513	NC_017524	CCA	2	6	64142	64147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996831
1514	NC_017524	CAG	2	6	64318	64323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996831
1515	NC_017524	C	6	6	64350	64355	0 %	0 %	0 %	100 %	385996831
1516	NC_017524	GC	3	6	64410	64415	0 %	0 %	50 %	50 %	385996831
1517	NC_017524	GCG	2	6	64434	64439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996831
1518	NC_017524	CAG	2	6	64447	64452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996831
1519	NC_017524	CGC	2	6	64453	64458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996831
1520	NC_017524	CCGATC	2	12	64535	64546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385996831
1521	NC_017524	AACC	2	8	64669	64676	50 %	0 %	0 %	50 %	385996831
1522	NC_017524	ACT	2	6	64687	64692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996831
1523	NC_017524	GCT	2	6	64812	64817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996831
1524	NC_017524	CGA	2	6	64920	64925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996831
1525	NC_017524	TCG	2	6	64980	64985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017524	GCT	2	6	65027	65032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996832
1527	NC_017524	CGGA	2	8	65033	65040	25 %	0 %	50 %	25 %	385996832
1528	NC_017524	ACC	2	6	65055	65060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996832
1529	NC_017524	GGC	2	6	65065	65070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996832
1530	NC_017524	CCG	2	6	65089	65094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996832
1531	NC_017524	ACTTCA	2	12	65339	65350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996832
1532	NC_017524	CGG	2	6	65381	65386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996832
1533	NC_017524	TGCCG	2	10	65482	65491	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1534	NC_017524	GCC	2	6	65534	65539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_017524	GTC	2	6	65632	65637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996833
1536	NC_017524	ATT	2	6	65665	65670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385996833
1537	NC_017524	TCA	2	6	65685	65690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996833
1538	NC_017524	CG	3	6	65705	65710	0 %	0 %	50 %	50 %	385996833
1539	NC_017524	CCT	2	6	65723	65728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996833
1540	NC_017524	CGG	2	6	65857	65862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996833
1541	NC_017524	CGC	2	6	65870	65875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996833
1542	NC_017524	GC	3	6	65874	65879	0 %	0 %	50 %	50 %	385996833
1543	NC_017524	CCG	2	6	65889	65894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996833
1544	NC_017524	CCG	2	6	65955	65960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996833
1545	NC_017524	CGG	2	6	65969	65974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996833
1546	NC_017524	GCG	2	6	65997	66002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996833
1547	NC_017524	GGC	2	6	66005	66010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996833
1548	NC_017524	CGA	2	6	66148	66153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996833
1549	NC_017524	TCG	2	6	66157	66162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996833
1550	NC_017524	GCTG	2	8	66298	66305	0 %	25 %	50 %	25 %	385996833
1551	NC_017524	GCC	2	6	66321	66326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996833
1552	NC_017524	CG	5	10	66351	66360	0 %	0 %	50 %	50 %	385996833
1553	NC_017524	ACC	2	6	66390	66395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996833
1554	NC_017524	GGCGA	2	10	66414	66423	20 %	0 %	60 %	20 %	385996833
1555	NC_017524	CAC	2	6	66545	66550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996833
1556	NC_017524	GC	3	6	66562	66567	0 %	0 %	50 %	50 %	385996833
1557	NC_017524	CGGA	2	8	66607	66614	25 %	0 %	50 %	25 %	385996833
1558	NC_017524	CGTCGG	2	12	66737	66748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017524	GGT	2	6	66822	66827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017524	TGC	2	6	66860	66865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017524	GCC	2	6	66963	66968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996834
1562	NC_017524	GCC	2	6	66978	66983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996834
1563	NC_017524	CTGG	2	8	67030	67037	0 %	25 %	50 %	25 %	385996834
1564	NC_017524	TTC	2	6	67046	67051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996834
1565	NC_017524	GAC	2	6	67080	67085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996834
1566	NC_017524	CGG	2	6	67144	67149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996834
1567	NC_017524	AAC	2	6	67209	67214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996834
1568	NC_017524	ACG	2	6	67318	67323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996834
1569	NC_017524	CCA	2	6	67324	67329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996834
1570	NC_017524	CGGG	2	8	67331	67338	0 %	0 %	75 %	25 %	385996834
1571	NC_017524	CGCC	2	8	67348	67355	0 %	0 %	25 %	75 %	385996834
1572	NC_017524	CGGC	2	8	67390	67397	0 %	0 %	50 %	50 %	385996834
1573	NC_017524	CGGT	2	8	67426	67433	0 %	25 %	50 %	25 %	385996834
1574	NC_017524	GCG	2	6	67453	67458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996834
1575	NC_017524	CGTCGG	2	12	67507	67518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996834
1576	NC_017524	TGC	2	6	67522	67527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996834
1577	NC_017524	ACC	2	6	67561	67566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996834
1578	NC_017524	GCGGTG	2	12	67588	67599	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385996834
1579	NC_017524	CGT	2	6	67661	67666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996834
1580	NC_017524	CCG	2	6	67732	67737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996834
1581	NC_017524	CCGG	2	8	67812	67819	0 %	0 %	50 %	50 %	385996834
1582	NC_017524	GGC	2	6	67824	67829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996834
1583	NC_017524	GGC	2	6	67835	67840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996834
1584	NC_017524	ACCG	2	8	67868	67875	25 %	0 %	25 %	50 %	385996834
1585	NC_017524	CGC	2	6	67945	67950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996834
1586	NC_017524	CGG	2	6	67961	67966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996834
1587	NC_017524	ACG	2	6	67980	67985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996834
1588	NC_017524	CGG	2	6	68017	68022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996834
1589	NC_017524	GC	3	6	68080	68085	0 %	0 %	50 %	50 %	385996834
1590	NC_017524	GGC	2	6	68232	68237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996834
1591	NC_017524	CCG	2	6	68265	68270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996834
1592	NC_017524	AGC	2	6	68362	68367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996834
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1594	NC_017524	CTG	2	6	68486	68491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017524	GCC	3	9	68510	68518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_017524	GCC	2	6	68533	68538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_017524	TCG	2	6	68586	68591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017524	AGG	2	6	68610	68615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017524	CTG	2	6	68672	68677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996835
1600	NC_017524	GGCA	2	8	68683	68690	25 %	0 %	50 %	25 %	385996835
1601	NC_017524	TGC	2	6	68706	68711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996835
1602	NC_017524	CTG	2	6	68795	68800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996835
1603	NC_017524	TGG	2	6	68835	68840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996835
1604	NC_017524	TGCT	2	8	68850	68857	0 %	50 %	25 %	25 %	385996835
1605	NC_017524	CTG	2	6	68864	68869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996835
1606	NC_017524	TCGC	2	8	68875	68882	0 %	25 %	25 %	50 %	385996835
1607	NC_017524	CGA	2	6	68899	68904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996835
1608	NC_017524	GCCG	2	8	68949	68956	0 %	0 %	50 %	50 %	385996835
1609	NC_017524	GGTGT	2	10	68990	68999	0 %	40 %	60 %	0 %	385996835
1610	NC_017524	TTCG	2	8	69013	69020	0 %	50 %	25 %	25 %	385996835
1611	NC_017524	GTT	2	6	69037	69042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996835
1612	NC_017524	CGGT	2	8	69125	69132	0 %	25 %	50 %	25 %	385996835
1613	NC_017524	CGG	2	6	69199	69204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996835
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1615	NC_017524	TGT	2	6	69324	69329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996835
1616	NC_017524	TGG	2	6	69408	69413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996835
1617	NC_017524	TG	3	6	69426	69431	0 %	50 %	50 %	0 %	385996835
1618	NC_017524	GCC	2	6	69485	69490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996835
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1622	NC_017524	AT	3	6	69589	69594	50 %	50 %	0 %	0 %	385996835
1623	NC_017524	ATCGG	2	10	69627	69636	20 %	20 %	40 %	20 %	385996835
1624	NC_017524	CG	3	6	69687	69692	0 %	0 %	50 %	50 %	385996835
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1879	NC_017524	TCG	2	6	80819	80824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996843
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1884	NC_017524	GC	4	8	81107	81114	0 %	0 %	50 %	50 %	385996843
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1984	NC_017524	CAGA	2	8	85296	85303	50 %	0 %	25 %	25 %	385996847
1985	NC_017524	TTC	2	6	85404	85409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996847
1986	NC_017524	CGG	3	9	85412	85420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996847
1987	NC_017524	CGG	2	6	85452	85457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996847
1988	NC_017524	CG	3	6	85474	85479	0 %	0 %	50 %	50 %	385996847
1989	NC_017524	GCC	2	6	85493	85498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996847
1990	NC_017524	CTTC	2	8	85551	85558	0 %	50 %	0 %	50 %	385996847
1991	NC_017524	C	6	6	85565	85570	0 %	0 %	0 %	100 %	385996847
1992	NC_017524	GTC	2	6	85585	85590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996847
1993	NC_017524	CTT	2	6	85640	85645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1994	NC_017524	CCA	2	6	85718	85723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996848
1995	NC_017524	GC	3	6	85762	85767	0 %	0 %	50 %	50 %	385996848
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1997	NC_017524	CCG	2	6	85820	85825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996848
1998	NC_017524	GCG	2	6	85867	85872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996848
1999	NC_017524	GGT	2	6	85878	85883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996848
2000	NC_017524	TGT	2	6	85982	85987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996848

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