MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017524	TGC	2	6	646818	646823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997330
16003	NC_017524	CAC	2	6	646918	646923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997330
16004	NC_017524	GC	3	6	646926	646931	0 %	0 %	50 %	50 %	385997330
16005	NC_017524	GCG	2	6	646958	646963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997330
16006	NC_017524	CGG	2	6	646983	646988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997330
16007	NC_017524	ACC	2	6	647018	647023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997330
16008	NC_017524	CGG	3	9	647037	647045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997330
16009	NC_017524	GGC	2	6	647200	647205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997330
16010	NC_017524	CCCCG	2	10	647250	647259	0 %	0 %	20 %	80 %	385997330
16011	NC_017524	CCGA	2	8	647321	647328	25 %	0 %	25 %	50 %	385997330
16012	NC_017524	GTG	2	6	647354	647359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997330
16013	NC_017524	CGG	3	9	647371	647379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997330
16014	NC_017524	ACG	2	6	647451	647456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997330
16015	NC_017524	CGA	2	6	647512	647517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997330
16016	NC_017524	GACC	2	8	647523	647530	25 %	0 %	25 %	50 %	385997330
16017	NC_017524	GTC	2	6	647581	647586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997330
16018	NC_017524	CGC	2	6	647602	647607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997330
16019	NC_017524	GGC	2	6	647614	647619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997330
16020	NC_017524	CTG	2	6	647641	647646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997331
16021	NC_017524	TGA	2	6	647670	647675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997331
16022	NC_017524	TGC	2	6	647702	647707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997331
16023	NC_017524	TGG	2	6	647768	647773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997331
16024	NC_017524	CGA	2	6	647858	647863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997331
16025	NC_017524	CGGAT	2	10	647879	647888	20 %	20 %	40 %	20 %	385997331
16026	NC_017524	TCCG	2	8	647919	647926	0 %	25 %	25 %	50 %	385997331
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16028	NC_017524	GCA	2	6	647991	647996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997331
16029	NC_017524	ATC	2	6	648016	648021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997331
16030	NC_017524	CCGG	2	8	648022	648029	0 %	0 %	50 %	50 %	385997331
16031	NC_017524	GGT	2	6	648039	648044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997331
16032	NC_017524	CGC	4	12	648057	648068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997331
16033	NC_017524	CGT	2	6	648106	648111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997331
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16036	NC_017524	TCG	2	6	648222	648227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997332
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16039	NC_017524	CGC	2	6	648333	648338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997332
16040	NC_017524	ACG	2	6	648366	648371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997332
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16042	NC_017524	CGG	2	6	648536	648541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997332
16043	NC_017524	GCG	2	6	648623	648628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997332
16044	NC_017524	GGT	2	6	648798	648803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997332
16045	NC_017524	TCG	2	6	648822	648827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997332
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16050	NC_017524	GCT	2	6	649147	649152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997332
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16052	NC_017524	GGT	2	6	649267	649272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997332
16053	NC_017524	GCT	2	6	649282	649287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997332
16054	NC_017524	CGC	2	6	649361	649366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997333
16055	NC_017524	TGACC	2	10	649424	649433	20 %	20 %	20 %	40 %	385997333
16056	NC_017524	GGC	2	6	649468	649473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997333
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16061	NC_017524	TCGG	2	8	649596	649603	0 %	25 %	50 %	25 %	385997333
16062	NC_017524	GCG	2	6	649611	649616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997333
16063	NC_017524	GC	3	6	649623	649628	0 %	0 %	50 %	50 %	385997333
16064	NC_017524	GAC	2	6	649674	649679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997333
16065	NC_017524	GCG	2	6	649734	649739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997333
16066	NC_017524	CGGG	2	8	649768	649775	0 %	0 %	75 %	25 %	385997333
16067	NC_017524	CTA	2	6	649779	649784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997333
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16071	NC_017524	GGT	2	6	649969	649974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997333
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16078	NC_017524	GTTGC	2	10	650179	650188	0 %	40 %	40 %	20 %	385997334
16079	NC_017524	CAAGC	2	10	650256	650265	40 %	0 %	20 %	40 %	385997334
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16082	NC_017524	GTC	2	6	650329	650334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997334
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16087	NC_017524	GCCG	2	8	650536	650543	0 %	0 %	50 %	50 %	385997335
16088	NC_017524	CG	3	6	650561	650566	0 %	0 %	50 %	50 %	385997335
16089	NC_017524	GAT	2	6	650581	650586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997335
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16091	NC_017524	CG	3	6	650605	650610	0 %	0 %	50 %	50 %	385997335
16092	NC_017524	CGC	2	6	650653	650658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997335
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16101	NC_017524	GGC	2	6	651004	651009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997335
16102	NC_017524	CTCC	2	8	651051	651058	0 %	25 %	0 %	75 %	385997335
16103	NC_017524	AT	4	8	651127	651134	50 %	50 %	0 %	0 %	385997335
16104	NC_017524	AT	3	6	651146	651151	50 %	50 %	0 %	0 %	385997335
16105	NC_017524	GCCG	2	8	651185	651192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16106	NC_017524	CGG	2	6	651202	651207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997336
16107	NC_017524	TCG	2	6	651208	651213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997336
16108	NC_017524	CGA	2	6	651216	651221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997336
16109	NC_017524	GTC	3	9	651271	651279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997336
16110	NC_017524	TCA	2	6	651315	651320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997336
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16120	NC_017524	GTA	2	6	651673	651678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997336
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16122	NC_017524	ACC	2	6	652004	652009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997336
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16124	NC_017524	GTC	2	6	652096	652101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997336
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16135	NC_017524	CG	3	6	652512	652517	0 %	0 %	50 %	50 %	385997337
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16149	NC_017524	GGT	2	6	652965	652970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997337
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16151	NC_017524	TGGG	2	8	653012	653019	0 %	25 %	75 %	0 %	385997337
16152	NC_017524	CGA	2	6	653037	653042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997337
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16192	NC_017524	GCG	2	6	654493	654498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16193	NC_017524	TGA	2	6	654671	654676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997339
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16225	NC_017524	AGT	2	6	655906	655911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997340
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16233	NC_017524	GCA	2	6	656507	656512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997340
16234	NC_017524	CGGT	2	8	656530	656537	0 %	25 %	50 %	25 %	385997340
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16238	NC_017524	GTA	2	6	656697	656702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997340
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16339	NC_017524	CTGG	2	8	660687	660694	0 %	25 %	50 %	25 %	385997344
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16351	NC_017524	CG	3	6	661021	661026	0 %	0 %	50 %	50 %	385997345
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16357	NC_017524	GGC	2	6	661291	661296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997345
16358	NC_017524	CTG	2	6	661322	661327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997345
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16360	NC_017524	GCCG	3	12	661341	661352	0 %	0 %	50 %	50 %	385997345
16361	NC_017524	GC	3	6	661382	661387	0 %	0 %	50 %	50 %	385997345
16362	NC_017524	CGG	2	6	661395	661400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997345
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