MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017524	ATCGGC	2	12	573231	573242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997256
14002	NC_017524	GTT	2	6	573273	573278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997256
14003	NC_017524	GC	3	6	573302	573307	0 %	0 %	50 %	50 %	385997256
14004	NC_017524	CGG	2	6	573323	573328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997256
14005	NC_017524	CGT	2	6	573329	573334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997256
14006	NC_017524	CCG	2	6	573361	573366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997256
14007	NC_017524	GTC	2	6	573514	573519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997256
14008	NC_017524	TAA	2	6	573533	573538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_017524	GT	3	6	573555	573560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_017524	ACG	2	6	573581	573586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_017524	GTT	2	6	573612	573617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_017524	GCC	2	6	573618	573623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_017524	CAG	2	6	573652	573657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_017524	GAA	2	6	573693	573698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_017524	GCC	2	6	573787	573792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997257
14016	NC_017524	CGTC	2	8	573822	573829	0 %	25 %	25 %	50 %	385997257
14017	NC_017524	CGGT	2	8	573855	573862	0 %	25 %	50 %	25 %	385997257
14018	NC_017524	CTG	2	6	573926	573931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14019	NC_017524	CCT	2	6	573940	573945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997257
14020	NC_017524	GCGG	2	8	573952	573959	0 %	0 %	75 %	25 %	385997257
14021	NC_017524	ACC	2	6	574055	574060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997257
14022	NC_017524	GACCCC	2	12	574108	574119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385997257
14023	NC_017524	GGCGCC	2	12	574185	574196	0 %	0 %	50 %	50 %	385997257
14024	NC_017524	TGG	2	6	574222	574227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997257
14025	NC_017524	GCG	2	6	574381	574386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
14026	NC_017524	TCG	2	6	574400	574405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14027	NC_017524	TGA	2	6	574449	574454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997257
14028	NC_017524	CGG	2	6	574528	574533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
14029	NC_017524	CGA	2	6	574561	574566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14030	NC_017524	GCT	2	6	574577	574582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14031	NC_017524	CCG	2	6	574585	574590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997257
14032	NC_017524	ATC	2	6	574598	574603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997257
14033	NC_017524	TGC	2	6	574659	574664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14034	NC_017524	GCT	2	6	574699	574704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14035	NC_017524	GCT	2	6	574741	574746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14036	NC_017524	CGA	2	6	574765	574770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997257
14037	NC_017524	GTG	3	9	574772	574780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997257
14038	NC_017524	GGC	2	6	574828	574833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
14039	NC_017524	AGG	2	6	574899	574904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997257
14040	NC_017524	GGCA	2	8	574909	574916	25 %	0 %	50 %	25 %	385997257
14041	NC_017524	GCG	2	6	574960	574965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
14042	NC_017524	GC	3	6	574971	574976	0 %	0 %	50 %	50 %	385997257
14043	NC_017524	CG	3	6	575040	575045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14044	NC_017524	GTCCG	2	10	575117	575126	0 %	20 %	40 %	40 %	385997258
14045	NC_017524	CG	3	6	575147	575152	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
14046	NC_017524	GCA	2	6	575185	575190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14047	NC_017524	GAC	2	6	575191	575196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14048	NC_017524	GCT	2	6	575211	575216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14049	NC_017524	CGG	2	6	575262	575267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997258
14050	NC_017524	TGC	2	6	575282	575287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
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14052	NC_017524	GTG	2	6	575401	575406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997258
14053	NC_017524	CCCA	2	8	575443	575450	25 %	0 %	0 %	75 %	385997258
14054	NC_017524	CGC	2	6	575463	575468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997258
14055	NC_017524	TGC	2	6	575474	575479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14056	NC_017524	GC	3	6	575478	575483	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
14057	NC_017524	TAC	2	6	575506	575511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997258
14058	NC_017524	ACT	2	6	575528	575533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997258
14059	NC_017524	GGCT	2	8	575551	575558	0 %	25 %	50 %	25 %	385997258
14060	NC_017524	GC	3	6	575560	575565	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
14061	NC_017524	CA	3	6	575597	575602	50 %	0 %	0 %	50 %	385997258
14062	NC_017524	GCC	2	6	575608	575613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997258
14063	NC_017524	GAA	2	6	575616	575621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385997258
14064	NC_017524	CGACGG	2	12	575634	575645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385997258
14065	NC_017524	GCC	2	6	575652	575657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997258
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14067	NC_017524	GTC	2	6	575683	575688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14068	NC_017524	CGA	2	6	575718	575723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14069	NC_017524	GC	3	6	575823	575828	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
14070	NC_017524	GTG	2	6	575866	575871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997258
14071	NC_017524	TCG	2	6	575876	575881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14072	NC_017524	TGC	2	6	575915	575920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
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14077	NC_017524	CGA	2	6	576015	576020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
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14080	NC_017524	GGT	2	6	576171	576176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997258
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14082	NC_017524	GGGC	2	8	576189	576196	0 %	0 %	75 %	25 %	385997258
14083	NC_017524	GGTC	2	8	576249	576256	0 %	25 %	50 %	25 %	385997258
14084	NC_017524	CTG	2	6	576280	576285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
14085	NC_017524	TG	3	6	576290	576295	0 %	50 %	50 %	0 %	385997258
14086	NC_017524	TGA	2	6	576314	576319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997258
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14088	NC_017524	GCACG	2	10	576331	576340	20 %	0 %	40 %	40 %	385997258
14089	NC_017524	ACC	2	6	576364	576369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997258
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14091	NC_017524	GCG	2	6	576434	576439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997258
14092	NC_017524	CGC	2	6	576485	576490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997258
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14095	NC_017524	CGGG	2	8	576592	576599	0 %	0 %	75 %	25 %	385997259
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14099	NC_017524	CTG	2	6	576744	576749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997259
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14104	NC_017524	GTT	2	6	576905	576910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997259
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14109	NC_017524	CGA	3	9	577067	577075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14110	NC_017524	GC	3	6	577082	577087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14111	NC_017524	CGCC	2	8	577123	577130	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14112	NC_017524	TGG	2	6	577141	577146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_017524	GCAT	2	8	577206	577213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14116	NC_017524	CGCTG	2	10	577408	577417	0 %	20 %	40 %	40 %	385997260
14117	NC_017524	GGC	2	6	577457	577462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997260
14118	NC_017524	CG	3	6	577495	577500	0 %	0 %	50 %	50 %	385997260
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14120	NC_017524	TGG	2	6	577578	577583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997260
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14242	NC_017524	GCC	2	6	582069	582074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997264
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14319	NC_017524	CGG	2	6	584921	584926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997267
14320	NC_017524	TGCGC	2	10	584964	584973	0 %	20 %	40 %	40 %	385997267
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14342	NC_017524	AC	3	6	585650	585655	50 %	0 %	0 %	50 %	385997268
14343	NC_017524	CCAC	2	8	585726	585733	25 %	0 %	0 %	75 %	385997268
14344	NC_017524	CTT	2	6	585756	585761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997268
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14347	NC_017524	GTTT	2	8	585916	585923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14348	NC_017524	CTG	2	6	585968	585973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14352	NC_017524	CGA	2	6	586105	586110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997269
14353	NC_017524	CGG	2	6	586167	586172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997269
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14355	NC_017524	CGA	2	6	586286	586291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997269
14356	NC_017524	CGG	3	9	586333	586341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997269
14357	NC_017524	GAG	2	6	586370	586375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997269
14358	NC_017524	CGA	2	6	586435	586440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997269
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14481	NC_017524	CGG	2	6	592035	592040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997276
14482	NC_017524	CCGGTG	2	12	592053	592064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385997276
14483	NC_017524	GCGA	2	8	592100	592107	25 %	0 %	50 %	25 %	385997276
14484	NC_017524	ACC	2	6	592170	592175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997276
14485	NC_017524	GAC	2	6	592211	592216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997276
14486	NC_017524	CGCGGC	2	12	592242	592253	0 %	0 %	50 %	50 %	385997276
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14489	NC_017524	GGCG	2	8	592382	592389	0 %	0 %	75 %	25 %	385997277
14490	NC_017524	CA	3	6	592416	592421	50 %	0 %	0 %	50 %	385997277
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