MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017524	GTC	2	6	551350	551355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997230
13502	NC_017524	CGA	2	6	551361	551366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997230
13503	NC_017524	CGG	2	6	551401	551406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997230
13504	NC_017524	TGGT	2	8	551473	551480	0 %	50 %	50 %	0 %	385997231
13505	NC_017524	TCCG	2	8	551536	551543	0 %	25 %	25 %	50 %	385997231
13506	NC_017524	GCT	2	6	551588	551593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997231
13507	NC_017524	TTGGT	2	10	551663	551672	0 %	60 %	40 %	0 %	385997231
13508	NC_017524	GGCC	2	8	551793	551800	0 %	0 %	50 %	50 %	385997232
13509	NC_017524	AGG	2	6	551849	551854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997232
13510	NC_017524	GCCG	2	8	551904	551911	0 %	0 %	50 %	50 %	385997232
13511	NC_017524	TACC	2	8	551949	551956	25 %	25 %	0 %	50 %	385997232
13512	NC_017524	GTG	2	6	551961	551966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997232
13513	NC_017524	GTTC	2	8	551970	551977	0 %	50 %	25 %	25 %	385997232
13514	NC_017524	TGG	2	6	552034	552039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997232
13515	NC_017524	CA	3	6	552043	552048	50 %	0 %	0 %	50 %	385997232
13516	NC_017524	GCC	2	6	552061	552066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997232
13517	NC_017524	TCG	2	6	552071	552076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997232
13518	NC_017524	CGT	2	6	552087	552092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997232
13519	NC_017524	CGC	3	9	552192	552200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997232
13520	NC_017524	CTA	3	9	552216	552224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997232
13521	NC_017524	CGA	2	6	552303	552308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_017524	TAGGG	2	10	552321	552330	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_017524	CGT	3	9	552348	552356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997233
13524	NC_017524	CGG	2	6	552372	552377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997233
13525	NC_017524	CGC	2	6	552396	552401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997233
13526	NC_017524	TCG	2	6	552425	552430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997233
13527	NC_017524	GCG	2	6	552548	552553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997233
13528	NC_017524	TGA	2	6	552632	552637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997233
13529	NC_017524	AGA	2	6	552638	552643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385997233
13530	NC_017524	GTT	2	6	552693	552698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997233
13531	NC_017524	ACG	2	6	552710	552715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997233
13532	NC_017524	CAT	2	6	552747	552752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997233
13533	NC_017524	ATT	2	6	552856	552861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385997233
13534	NC_017524	GAA	2	6	552903	552908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385997233
13535	NC_017524	TTCC	2	8	552937	552944	0 %	50 %	0 %	50 %	385997233
13536	NC_017524	AGGC	2	8	553172	553179	25 %	0 %	50 %	25 %	385997233
13537	NC_017524	GACC	2	8	553188	553195	25 %	0 %	25 %	50 %	385997233
13538	NC_017524	CGA	2	6	553212	553217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997233
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13540	NC_017524	CG	4	8	553370	553377	0 %	0 %	50 %	50 %	385997233
13541	NC_017524	AGC	2	6	553418	553423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997233
13542	NC_017524	ACG	2	6	553442	553447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997233
13543	NC_017524	TGG	3	9	553448	553456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997233
13544	NC_017524	TGG	2	6	553523	553528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997233
13545	NC_017524	TGGG	2	8	553553	553560	0 %	25 %	75 %	0 %	385997233
13546	NC_017524	ACG	2	6	553574	553579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997233
13547	NC_017524	GCT	2	6	553587	553592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997233
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13549	NC_017524	GC	3	6	553744	553749	0 %	0 %	50 %	50 %	385997234
13550	NC_017524	C	6	6	553761	553766	0 %	0 %	0 %	100 %	385997234
13551	NC_017524	ATC	2	6	553769	553774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997234
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13553	NC_017524	CTGG	2	8	553813	553820	0 %	25 %	50 %	25 %	385997234
13554	NC_017524	GAC	2	6	553846	553851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997234
13555	NC_017524	GTG	2	6	553871	553876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997234
13556	NC_017524	TGG	2	6	553893	553898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997234
13557	NC_017524	GCG	2	6	553905	553910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997234
13558	NC_017524	CGG	2	6	553911	553916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997234
13559	NC_017524	TCC	2	6	553981	553986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997234
13560	NC_017524	GTG	2	6	553988	553993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997234
13561	NC_017524	CGG	2	6	554048	554053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997235
13562	NC_017524	GCG	2	6	554076	554081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997235
13563	NC_017524	CGT	2	6	554086	554091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997235
13564	NC_017524	AGC	2	6	554208	554213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997235
13565	NC_017524	GGCG	2	8	554221	554228	0 %	0 %	75 %	25 %	385997235
13566	NC_017524	GC	3	6	554315	554320	0 %	0 %	50 %	50 %	385997235
13567	NC_017524	GAT	2	6	554329	554334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997235
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13569	NC_017524	AGT	2	6	554418	554423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997235
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13573	NC_017524	GTT	2	6	554607	554612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997236
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13577	NC_017524	CAGCC	2	10	554810	554819	20 %	0 %	20 %	60 %	385997236
13578	NC_017524	GGC	2	6	554854	554859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997236
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13580	NC_017524	GCC	2	6	554980	554985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997236
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13587	NC_017524	CTG	2	6	555371	555376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997236
13588	NC_017524	GCA	2	6	555411	555416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997236
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13591	NC_017524	GTG	2	6	555502	555507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997236
13592	NC_017524	AGT	2	6	555579	555584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997236
13593	NC_017524	CTC	2	6	555643	555648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997236
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13599	NC_017524	CGT	2	6	555903	555908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997236
13600	NC_017524	TGC	2	6	556080	556085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13601	NC_017524	GAG	2	6	556155	556160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_017524	A	6	6	556190	556195	100 %	0 %	0 %	0 %	385997237
13603	NC_017524	TGCCCG	2	12	556200	556211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385997237
13604	NC_017524	CG	3	6	556268	556273	0 %	0 %	50 %	50 %	385997237
13605	NC_017524	CGGCTG	2	12	556277	556288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385997237
13606	NC_017524	GAG	2	6	556349	556354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997237
13607	NC_017524	ACCC	2	8	556355	556362	25 %	0 %	0 %	75 %	385997237
13608	NC_017524	TGG	2	6	556386	556391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997237
13609	NC_017524	TGC	2	6	556422	556427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997237
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13611	NC_017524	GGC	2	6	556499	556504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997237
13612	NC_017524	CGA	2	6	556570	556575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997237
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13614	NC_017524	AAC	2	6	556718	556723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385997237
13615	NC_017524	GCT	2	6	556771	556776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997237
13616	NC_017524	ATC	2	6	556841	556846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997237
13617	NC_017524	CGA	2	6	556933	556938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997237
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13740	NC_017524	CCG	2	6	562510	562515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997244
13741	NC_017524	CGA	2	6	562520	562525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997244
13742	NC_017524	GTGG	2	8	562608	562615	0 %	25 %	75 %	0 %	385997244
13743	NC_017524	CGC	2	6	562625	562630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997244
13744	NC_017524	CCG	2	6	562660	562665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997244
13745	NC_017524	CTT	2	6	562679	562684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997244
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13748	NC_017524	GCC	2	6	562804	562809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997244
13749	NC_017524	GAT	2	6	562830	562835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997244
13750	NC_017524	CCAT	2	8	562855	562862	25 %	25 %	0 %	50 %	385997244
13751	NC_017524	CAGCG	2	10	562872	562881	20 %	0 %	40 %	40 %	385997244
13752	NC_017524	GGT	2	6	562899	562904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997244
13753	NC_017524	CAT	2	6	562917	562922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997244
13754	NC_017524	CGG	2	6	562925	562930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997244
13755	NC_017524	CGA	2	6	562949	562954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997244
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13758	NC_017524	TCACGG	2	12	563117	563128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997244
13759	NC_017524	TAC	2	6	563181	563186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13760	NC_017524	CTG	2	6	563202	563207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13761	NC_017524	CG	5	10	563218	563227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13762	NC_017524	GTC	2	6	563244	563249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13763	NC_017524	GAT	2	6	563275	563280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13767	NC_017524	CCT	2	6	563372	563377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997245
13768	NC_017524	CGC	2	6	563391	563396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997245
13769	NC_017524	GCC	2	6	563416	563421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997245
13770	NC_017524	CGG	2	6	563422	563427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997245
13771	NC_017524	GTG	2	6	563449	563454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997245
13772	NC_017524	GCG	2	6	563554	563559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997245
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13792	NC_017524	CGG	2	6	564293	564298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997245
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13799	NC_017524	TGG	2	6	564700	564705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13800	NC_017524	GTC	2	6	564743	564748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997246
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13813	NC_017524	CCGAC	2	10	565359	565368	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13814	NC_017524	TCC	2	6	565426	565431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13815	NC_017524	GGA	2	6	565434	565439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13816	NC_017524	TGA	2	6	565537	565542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997247
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13844	NC_017524	CGG	2	6	566518	566523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997249
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13847	NC_017524	C	6	6	566609	566614	0 %	0 %	0 %	100 %	385997249
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13982	NC_017524	CGT	2	6	572344	572349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13983	NC_017524	GCC	2	6	572387	572392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997255
13984	NC_017524	CAA	2	6	572434	572439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385997255
13985	NC_017524	TAC	2	6	572540	572545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997255
13986	NC_017524	CGG	2	6	572676	572681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997255
13987	NC_017524	CGG	2	6	572688	572693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997255
13988	NC_017524	ACT	2	6	572762	572767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997255
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13991	NC_017524	CTA	2	6	572894	572899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997256
13992	NC_017524	CG	3	6	572928	572933	0 %	0 %	50 %	50 %	385997256
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13996	NC_017524	GCC	2	6	573084	573089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997256
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13999	NC_017524	GC	3	6	573167	573172	0 %	0 %	50 %	50 %	385997256
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