MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017524	GCC	2	6	531627	531632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997212
13002	NC_017524	GCC	2	6	531687	531692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997212
13003	NC_017524	CAT	2	6	531728	531733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997212
13004	NC_017524	CGC	3	9	531734	531742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997212
13005	NC_017524	GGAC	2	8	531743	531750	25 %	0 %	50 %	25 %	385997212
13006	NC_017524	CCAG	2	8	531751	531758	25 %	0 %	25 %	50 %	385997212
13007	NC_017524	TTC	2	6	531815	531820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997212
13008	NC_017524	GCA	2	6	531846	531851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997212
13009	NC_017524	GGC	2	6	531903	531908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997212
13010	NC_017524	GGC	2	6	532064	532069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_017524	CGC	2	6	532130	532135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997213
13012	NC_017524	CGA	2	6	532184	532189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997213
13013	NC_017524	GCT	2	6	532259	532264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997213
13014	NC_017524	CTG	2	6	532434	532439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997213
13015	NC_017524	TAC	2	6	532446	532451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997213
13016	NC_017524	GTG	2	6	532515	532520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997213
13017	NC_017524	CCG	2	6	532536	532541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997213
13018	NC_017524	TCG	2	6	532570	532575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997213
13019	NC_017524	GCC	2	6	532602	532607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997213
13020	NC_017524	CCG	2	6	532641	532646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_017524	GCC	2	6	532718	532723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_017524	TCG	2	6	532743	532748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_017524	CGT	2	6	532922	532927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997214
13024	NC_017524	CCG	2	6	532939	532944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997214
13025	NC_017524	CCG	2	6	532960	532965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997214
13026	NC_017524	CAG	2	6	532988	532993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997214
13027	NC_017524	TGG	2	6	533021	533026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997214
13028	NC_017524	TCA	2	6	533038	533043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997214
13029	NC_017524	CAG	2	6	533045	533050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997214
13030	NC_017524	ACC	2	6	533076	533081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997214
13031	NC_017524	GA	3	6	533107	533112	50 %	0 %	50 %	0 %	385997214
13032	NC_017524	CCGT	2	8	533113	533120	0 %	25 %	25 %	50 %	385997214
13033	NC_017524	G	6	6	533156	533161	0 %	0 %	100 %	0 %	385997214
13034	NC_017524	CGC	2	6	533216	533221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997214
13035	NC_017524	GGC	2	6	533310	533315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997214
13036	NC_017524	CGG	2	6	533317	533322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997214
13037	NC_017524	TGG	2	6	533323	533328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997214
13038	NC_017524	CCG	2	6	533329	533334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997214
13039	NC_017524	GAC	2	6	533336	533341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997214
13040	NC_017524	TCG	2	6	533370	533375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997214
13041	NC_017524	GCG	2	6	533403	533408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997214
13042	NC_017524	GTCG	2	8	533416	533423	0 %	25 %	50 %	25 %	385997214
13043	NC_017524	TCG	2	6	533439	533444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997214
13044	NC_017524	AGC	2	6	533481	533486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997214
13045	NC_017524	TCGCT	2	10	533531	533540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13046	NC_017524	CGGC	2	8	533541	533548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_017524	CCG	2	6	533634	533639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997215
13048	NC_017524	GTA	2	6	533667	533672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997215
13049	NC_017524	TCA	2	6	533740	533745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997215
13050	NC_017524	CGA	2	6	533765	533770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997215
13051	NC_017524	GC	3	6	533854	533859	0 %	0 %	50 %	50 %	385997215
13052	NC_017524	AGAT	2	8	533938	533945	50 %	25 %	25 %	0 %	385997215
13053	NC_017524	GGT	2	6	533952	533957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997215
13054	NC_017524	TTC	2	6	533958	533963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997215
13055	NC_017524	GCA	2	6	533981	533986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997215
13056	NC_017524	GCT	2	6	534090	534095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997215
13057	NC_017524	CGGTC	2	10	534105	534114	0 %	20 %	40 %	40 %	385997215
13058	NC_017524	TCA	2	6	534162	534167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_017524	TC	3	6	534252	534257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13060	NC_017524	CCA	2	6	534281	534286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_017524	AGGT	2	8	534289	534296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_017524	CAG	2	6	534300	534305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_017524	GCG	2	6	534326	534331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_017524	CCA	2	6	534363	534368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_017524	AGT	2	6	534386	534391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13068	NC_017524	AGG	2	6	534607	534612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997216
13069	NC_017524	GCA	2	6	534662	534667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997216
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13071	NC_017524	TAG	2	6	534756	534761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997216
13072	NC_017524	CGG	2	6	534800	534805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997216
13073	NC_017524	CGACGG	2	12	534806	534817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385997216
13074	NC_017524	CGA	2	6	534818	534823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997216
13075	NC_017524	CGA	2	6	534845	534850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997216
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13078	NC_017524	ACG	2	6	534934	534939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997216
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13080	NC_017524	TCG	2	6	535053	535058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997217
13081	NC_017524	CGC	2	6	535083	535088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997217
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13087	NC_017524	ATC	2	6	535383	535388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997217
13088	NC_017524	ACT	2	6	535398	535403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997217
13089	NC_017524	GCCG	2	8	535466	535473	0 %	0 %	50 %	50 %	385997217
13090	NC_017524	AGCC	2	8	535490	535497	25 %	0 %	25 %	50 %	385997217
13091	NC_017524	TGC	2	6	535500	535505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997217
13092	NC_017524	C	6	6	535537	535542	0 %	0 %	0 %	100 %	385997217
13093	NC_017524	CG	3	6	535550	535555	0 %	0 %	50 %	50 %	385997217
13094	NC_017524	CTG	2	6	535604	535609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997217
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13100	NC_017524	CGA	2	6	535925	535930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997217
13101	NC_017524	GATG	2	8	536008	536015	25 %	25 %	50 %	0 %	385997217
13102	NC_017524	GC	3	6	536028	536033	0 %	0 %	50 %	50 %	385997217
13103	NC_017524	CGG	2	6	536038	536043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997217
13104	NC_017524	AGTG	2	8	536086	536093	25 %	25 %	50 %	0 %	385997217
13105	NC_017524	AGC	2	6	536106	536111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997217
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13107	NC_017524	CG	3	6	536149	536154	0 %	0 %	50 %	50 %	385997217
13108	NC_017524	TGC	2	6	536192	536197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997217
13109	NC_017524	CTGG	2	8	536207	536214	0 %	25 %	50 %	25 %	385997217
13110	NC_017524	CAC	2	6	536233	536238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997218
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13112	NC_017524	CCA	3	9	536289	536297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997218
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13118	NC_017524	TGA	2	6	536480	536485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997218
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13120	NC_017524	CGGC	2	8	536529	536536	0 %	0 %	50 %	50 %	385997218
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13229	NC_017524	TAT	2	6	540939	540944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385997220
13230	NC_017524	CCTT	2	8	540970	540977	0 %	50 %	0 %	50 %	385997220
13231	NC_017524	ACG	2	6	541010	541015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997220
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13233	NC_017524	GCCA	3	12	541102	541113	25 %	0 %	25 %	50 %	385997220
13234	NC_017524	GAT	2	6	541116	541121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997220
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13237	NC_017524	CCG	2	6	541342	541347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997221
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13239	NC_017524	G	6	6	541448	541453	0 %	0 %	100 %	0 %	385997221
13240	NC_017524	ACG	2	6	541522	541527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997221
13241	NC_017524	GAA	2	6	541544	541549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385997221
13242	NC_017524	CGA	2	6	541579	541584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997221
13243	NC_017524	ACC	3	9	541587	541595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997221
13244	NC_017524	CGG	2	6	541671	541676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13245	NC_017524	AGCCT	2	10	541731	541740	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13246	NC_017524	GC	3	6	541900	541905	0 %	0 %	50 %	50 %	385997222
13247	NC_017524	GCG	3	9	541934	541942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997222
13248	NC_017524	TGG	2	6	541944	541949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997222
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13250	NC_017524	CGCTGG	2	12	541962	541973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385997222
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13269	NC_017524	GC	4	8	542808	542815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13270	NC_017524	TG	3	6	542844	542849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13271	NC_017524	ATGG	2	8	542911	542918	25 %	25 %	50 %	0 %	385997223
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13347	NC_017524	ATC	2	6	545414	545419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997225
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13350	NC_017524	GTCT	2	8	545599	545606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13351	NC_017524	TGA	2	6	545629	545634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997226
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13353	NC_017524	GGGTC	2	10	545643	545652	0 %	20 %	60 %	20 %	385997226
13354	NC_017524	GCC	2	6	545789	545794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997226
13355	NC_017524	CAG	2	6	545795	545800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997226
13356	NC_017524	AGGCC	2	10	545809	545818	20 %	0 %	40 %	40 %	385997226
13357	NC_017524	CGG	2	6	545959	545964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997226
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13480	NC_017524	CGGGC	2	10	550727	550736	0 %	0 %	60 %	40 %	385997229
13481	NC_017524	GGCC	2	8	550747	550754	0 %	0 %	50 %	50 %	385997229
13482	NC_017524	ACC	2	6	550773	550778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997229
13483	NC_017524	CGG	2	6	550801	550806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997229
13484	NC_017524	CCA	2	6	550837	550842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997229
13485	NC_017524	GAT	2	6	550843	550848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997229
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