MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017524	CG	3	6	447767	447772	0 %	0 %	50 %	50 %	385997142
11003	NC_017524	CGGCG	2	10	447796	447805	0 %	0 %	60 %	40 %	385997142
11004	NC_017524	GTGC	2	8	447820	447827	0 %	25 %	50 %	25 %	385997142
11005	NC_017524	GAT	2	6	447869	447874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997142
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11007	NC_017524	CGC	2	6	447883	447888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997142
11008	NC_017524	GCG	2	6	447904	447909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997142
11009	NC_017524	CAG	2	6	447914	447919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997142
11010	NC_017524	GGC	2	6	447920	447925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997142
11011	NC_017524	CCG	2	6	447948	447953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997142
11012	NC_017524	CGGT	2	8	447957	447964	0 %	25 %	50 %	25 %	385997142
11013	NC_017524	GCA	2	6	448081	448086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997142
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11015	NC_017524	AGAT	2	8	448107	448114	50 %	25 %	25 %	0 %	385997142
11016	NC_017524	GGC	2	6	448115	448120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997142
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11018	NC_017524	CCAG	2	8	448211	448218	25 %	0 %	25 %	50 %	385997142
11019	NC_017524	TCG	2	6	448237	448242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997142
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11022	NC_017524	GC	3	6	448307	448312	0 %	0 %	50 %	50 %	385997142
11023	NC_017524	CCAG	2	8	448324	448331	25 %	0 %	25 %	50 %	385997142
11024	NC_017524	TCG	2	6	448350	448355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997142
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11026	NC_017524	AGCG	2	8	448461	448468	25 %	0 %	50 %	25 %	385997142
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11031	NC_017524	CG	3	6	448677	448682	0 %	0 %	50 %	50 %	385997142
11032	NC_017524	GCC	2	6	448695	448700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997142
11033	NC_017524	CTG	2	6	448718	448723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997142
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11044	NC_017524	CTG	2	6	449074	449079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997143
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11047	NC_017524	CCT	2	6	449211	449216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997143
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11054	NC_017524	GTGCA	2	10	449674	449683	20 %	20 %	40 %	20 %	385997144
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11101	NC_017524	CGC	2	6	451524	451529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997146
11102	NC_017524	GC	3	6	451547	451552	0 %	0 %	50 %	50 %	385997146
11103	NC_017524	GCC	2	6	451557	451562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997146
11104	NC_017524	CGGG	2	8	451611	451618	0 %	0 %	75 %	25 %	385997146
11105	NC_017524	GCT	2	6	451628	451633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997146
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11112	NC_017524	CCA	2	6	451826	451831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997147
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11118	NC_017524	ATGCCG	2	12	452035	452046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11119	NC_017524	CGA	2	6	452048	452053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11120	NC_017524	GCC	2	6	452055	452060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997147
11121	NC_017524	GAT	2	6	452076	452081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997147
11122	NC_017524	ATC	2	6	452106	452111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997147
11123	NC_017524	CAC	2	6	452136	452141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997147
11124	NC_017524	CA	3	6	452166	452171	50 %	0 %	0 %	50 %	385997147
11125	NC_017524	GCCC	2	8	452231	452238	0 %	0 %	25 %	75 %	385997147
11126	NC_017524	GC	4	8	452270	452277	0 %	0 %	50 %	50 %	385997147
11127	NC_017524	GAT	2	6	452385	452390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997147
11128	NC_017524	CAC	2	6	452432	452437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997147
11129	NC_017524	CAC	2	6	452505	452510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997147
11130	NC_017524	GTC	2	6	452517	452522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11131	NC_017524	CTC	2	6	452538	452543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997147
11132	NC_017524	CGA	2	6	452546	452551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11133	NC_017524	CGT	2	6	452562	452567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11134	NC_017524	TGGCCC	2	12	452572	452583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385997147
11135	NC_017524	GCA	2	6	452603	452608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11136	NC_017524	ATGTCC	2	12	452668	452679	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385997147
11137	NC_017524	CGC	2	6	452738	452743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997147
11138	NC_017524	GC	3	6	452742	452747	0 %	0 %	50 %	50 %	385997147
11139	NC_017524	CGC	2	6	452749	452754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997147
11140	NC_017524	CCA	2	6	452939	452944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997147
11141	NC_017524	CGA	2	6	452951	452956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11142	NC_017524	GAAC	2	8	452979	452986	50 %	0 %	25 %	25 %	385997147
11143	NC_017524	CCG	2	6	453001	453006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997147
11144	NC_017524	TTG	2	6	453013	453018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997147
11145	NC_017524	GGC	2	6	453045	453050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997147
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11147	NC_017524	GGC	2	6	453183	453188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997147
11148	NC_017524	ATG	2	6	453202	453207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997147
11149	NC_017524	TCC	2	6	453250	453255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997147
11150	NC_017524	CAG	3	9	453276	453284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11151	NC_017524	TTG	2	6	453328	453333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997147
11152	NC_017524	GCC	3	9	453339	453347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997147
11153	NC_017524	CCA	2	6	453392	453397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997147
11154	NC_017524	GCG	2	6	453422	453427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997147
11155	NC_017524	CTGG	2	8	453429	453436	0 %	25 %	50 %	25 %	385997147
11156	NC_017524	CTG	2	6	453534	453539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11157	NC_017524	ACG	2	6	453544	453549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11158	NC_017524	CGC	3	9	453576	453584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997147
11159	NC_017524	ACG	2	6	453682	453687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11160	NC_017524	GTCGAC	2	12	453705	453716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11161	NC_017524	GCAT	2	8	453723	453730	25 %	25 %	25 %	25 %	385997147
11162	NC_017524	CGT	2	6	453818	453823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997147
11163	NC_017524	GGC	2	6	453855	453860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997147
11164	NC_017524	CAC	2	6	453876	453881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997147
11165	NC_017524	CGT	2	6	453992	453997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997147
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11168	NC_017524	GCC	2	6	454155	454160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997148
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11170	NC_017524	TCG	2	6	454239	454244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997148
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11173	NC_017524	CCA	2	6	454456	454461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997148
11174	NC_017524	CAG	2	6	454538	454543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997148
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11177	NC_017524	GCC	2	6	454631	454636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997149
11178	NC_017524	GC	3	6	454638	454643	0 %	0 %	50 %	50 %	385997149
11179	NC_017524	CGG	3	9	454656	454664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997149
11180	NC_017524	GCGCG	2	10	454752	454761	0 %	0 %	60 %	40 %	385997149
11181	NC_017524	ACCC	2	8	454861	454868	25 %	0 %	0 %	75 %	385997149
11182	NC_017524	GCG	2	6	454871	454876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997149
11183	NC_017524	CCG	2	6	454939	454944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997149
11184	NC_017524	GTC	2	6	455050	455055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997149
11185	NC_017524	ACC	2	6	455186	455191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997149
11186	NC_017524	CCG	2	6	455235	455240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997149
11187	NC_017524	TC	3	6	455262	455267	0 %	50 %	0 %	50 %	385997149
11188	NC_017524	TTG	2	6	455306	455311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997149
11189	NC_017524	CCG	2	6	455315	455320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997149
11190	NC_017524	ACG	2	6	455324	455329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997149
11191	NC_017524	TCA	2	6	455394	455399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997149
11192	NC_017524	GCA	2	6	455403	455408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997149
11193	NC_017524	CCG	2	6	455417	455422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997149
11194	NC_017524	ACC	2	6	455426	455431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997149
11195	NC_017524	CTCC	2	8	455436	455443	0 %	25 %	0 %	75 %	385997149
11196	NC_017524	CAA	2	6	455455	455460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385997149
11197	NC_017524	TGG	2	6	455481	455486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11198	NC_017524	GCC	2	6	455535	455540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11199	NC_017524	CAT	2	6	455598	455603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11200	NC_017524	TCCG	2	8	455610	455617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11201	NC_017524	GAT	2	6	455662	455667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11202	NC_017524	GT	3	6	455699	455704	0 %	50 %	50 %	0 %	385997150
11203	NC_017524	CAT	2	6	455718	455723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997150
11204	NC_017524	GGC	3	9	455751	455759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997150
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11206	NC_017524	CGG	2	6	456042	456047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997151
11207	NC_017524	CCG	2	6	456102	456107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997151
11208	NC_017524	CGT	2	6	456120	456125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997151
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11211	NC_017524	CCA	2	6	456222	456227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997151
11212	NC_017524	CGC	2	6	456244	456249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997151
11213	NC_017524	CAG	2	6	456256	456261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997151
11214	NC_017524	GGT	2	6	456265	456270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997151
11215	NC_017524	GTG	2	6	456277	456282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997151
11216	NC_017524	CGGT	2	8	456299	456306	0 %	25 %	50 %	25 %	385997151
11217	NC_017524	GCGCC	2	10	456314	456323	0 %	0 %	40 %	60 %	385997151
11218	NC_017524	CCG	2	6	456331	456336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997151
11219	NC_017524	CGA	2	6	456342	456347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997151
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11221	NC_017524	GAT	2	6	456466	456471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997151
11222	NC_017524	CGA	2	6	456501	456506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997151
11223	NC_017524	CAA	2	6	456529	456534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385997151
11224	NC_017524	GTC	2	6	456553	456558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11225	NC_017524	CGC	2	6	456585	456590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11226	NC_017524	GC	3	6	456597	456602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11227	NC_017524	AGGA	2	8	456759	456766	50 %	0 %	50 %	0 %	385997152
11228	NC_017524	GCG	2	6	456829	456834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997152
11229	NC_017524	AGC	2	6	456835	456840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997152
11230	NC_017524	CCG	2	6	456850	456855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997152
11231	NC_017524	GTC	2	6	456867	456872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997152
11232	NC_017524	CAG	2	6	456909	456914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997152
11233	NC_017524	GC	3	6	456982	456987	0 %	0 %	50 %	50 %	385997152
11234	NC_017524	TGG	2	6	457001	457006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997152
11235	NC_017524	ACC	2	6	457012	457017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997152
11236	NC_017524	CGT	2	6	457025	457030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997152
11237	NC_017524	GCA	2	6	457043	457048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997152
11238	NC_017524	CGC	2	6	457121	457126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997152
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11240	NC_017524	GCG	2	6	457196	457201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997152
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11477	NC_017524	CGC	2	6	466456	466461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997158
11478	NC_017524	GGC	2	6	466481	466486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997158
11479	NC_017524	CGG	2	6	466518	466523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997158
11480	NC_017524	CCG	2	6	466524	466529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997158
11481	NC_017524	CTG	2	6	466546	466551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997158
11482	NC_017524	GGC	2	6	466552	466557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997158
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