MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_017524	CCGCG	2	10	4217388	4217397	0 %	0 %	40 %	60 %	386000576
105002	NC_017524	CG	3	6	4217437	4217442	0 %	0 %	50 %	50 %	386000576
105003	NC_017524	CGT	2	6	4217457	4217462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000576
105004	NC_017524	AAGG	2	8	4217632	4217639	50 %	0 %	50 %	0 %	386000576
105005	NC_017524	GGC	3	9	4217697	4217705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000576
105006	NC_017524	CGTC	2	8	4217757	4217764	0 %	25 %	25 %	50 %	386000576
105007	NC_017524	GC	3	6	4217807	4217812	0 %	0 %	50 %	50 %	386000576
105008	NC_017524	TCG	2	6	4218002	4218007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000576
105009	NC_017524	ATCG	2	8	4218142	4218149	25 %	25 %	25 %	25 %	386000576
105010	NC_017524	CGC	2	6	4218235	4218240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105011	NC_017524	GC	3	6	4218403	4218408	0 %	0 %	50 %	50 %	386000577
105012	NC_017524	ATG	2	6	4218409	4218414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000577
105013	NC_017524	CGG	2	6	4218440	4218445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000577
105014	NC_017524	GC	4	8	4218522	4218529	0 %	0 %	50 %	50 %	386000577
105015	NC_017524	GCA	2	6	4218534	4218539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105016	NC_017524	CGGTG	2	10	4218559	4218568	0 %	20 %	60 %	20 %	386000577
105017	NC_017524	CGG	2	6	4218578	4218583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000577
105018	NC_017524	AAG	2	6	4218624	4218629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000577
105019	NC_017524	TCG	2	6	4218640	4218645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105020	NC_017524	GCA	2	6	4218653	4218658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000577
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105022	NC_017524	CGC	3	9	4218803	4218811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000577
105023	NC_017524	TGC	2	6	4218823	4218828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105024	NC_017524	CGCGGT	2	12	4218842	4218853	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386000577
105025	NC_017524	GCAC	2	8	4218867	4218874	25 %	0 %	25 %	50 %	386000577
105026	NC_017524	GCGGT	2	10	4218933	4218942	0 %	20 %	60 %	20 %	386000577
105027	NC_017524	GAC	2	6	4218957	4218962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105028	NC_017524	CGC	2	6	4218995	4219000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000577
105029	NC_017524	CTG	2	6	4219032	4219037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105030	NC_017524	CAG	2	6	4219061	4219066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105031	NC_017524	CA	3	6	4219102	4219107	50 %	0 %	0 %	50 %	386000577
105032	NC_017524	ACG	2	6	4219246	4219251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105033	NC_017524	CAA	2	6	4219269	4219274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000577
105034	NC_017524	GCT	2	6	4219286	4219291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000577
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105036	NC_017524	CGA	2	6	4219306	4219311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105037	NC_017524	CTG	2	6	4219329	4219334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000577
105038	NC_017524	CGG	2	6	4219374	4219379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000577
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105040	NC_017524	GGC	2	6	4219439	4219444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000578
105041	NC_017524	TGCG	2	8	4219499	4219506	0 %	25 %	50 %	25 %	386000578
105042	NC_017524	GGC	2	6	4219599	4219604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000578
105043	NC_017524	TCG	2	6	4219682	4219687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000578
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105045	NC_017524	CG	4	8	4219798	4219805	0 %	0 %	50 %	50 %	386000578
105046	NC_017524	GCC	2	6	4219824	4219829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000578
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105050	NC_017524	ACA	2	6	4219917	4219922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000578
105051	NC_017524	GGCC	2	8	4220080	4220087	0 %	0 %	50 %	50 %	386000578
105052	NC_017524	GCC	2	6	4220110	4220115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000578
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105054	NC_017524	ATC	2	6	4220203	4220208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000578
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105057	NC_017524	CAT	2	6	4220314	4220319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000578
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105105	NC_017524	CGG	2	6	4222380	4222385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000581
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105112	NC_017524	CGGG	2	8	4222746	4222753	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105113	NC_017524	GAT	2	6	4222866	4222871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000582
105114	NC_017524	G	6	6	4222902	4222907	0 %	0 %	100 %	0 %	386000582
105115	NC_017524	CG	4	8	4222923	4222930	0 %	0 %	50 %	50 %	386000582
105116	NC_017524	CGG	2	6	4222965	4222970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000582
105117	NC_017524	CGC	2	6	4222991	4222996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000582
105118	NC_017524	TGA	2	6	4223069	4223074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000582
105119	NC_017524	GCC	2	6	4223077	4223082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000582
105120	NC_017524	TGC	2	6	4223108	4223113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000582
105121	NC_017524	CGG	2	6	4223136	4223141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000582
105122	NC_017524	GCA	2	6	4223207	4223212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000582
105123	NC_017524	CTG	2	6	4223218	4223223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000582
105124	NC_017524	CCG	2	6	4223225	4223230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000582
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105130	NC_017524	GCC	2	6	4223510	4223515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000582
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105134	NC_017524	ATC	2	6	4223815	4223820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000582
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105143	NC_017524	CGG	2	6	4224251	4224256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000583
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105339	NC_017524	GGC	2	6	4231255	4231260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000586
105340	NC_017524	CCGGGC	2	12	4231266	4231277	0 %	0 %	50 %	50 %	386000586
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105343	NC_017524	CAT	2	6	4231454	4231459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000586
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105351	NC_017524	TGC	3	9	4231822	4231830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000586
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105353	NC_017524	CGG	2	6	4231888	4231893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000586
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105452	NC_017524	CG	3	6	4235600	4235605	0 %	0 %	50 %	50 %	386000587
105453	NC_017524	GAC	2	6	4235608	4235613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000587
105454	NC_017524	GGC	2	6	4235644	4235649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000587
105455	NC_017524	TCG	2	6	4235655	4235660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000587
105456	NC_017524	TGG	2	6	4235667	4235672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000587
105457	NC_017524	CGG	2	6	4235734	4235739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000587
105458	NC_017524	CGA	2	6	4235752	4235757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000587
105459	NC_017524	TCG	2	6	4235763	4235768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000587
105460	NC_017524	AC	3	6	4235887	4235892	50 %	0 %	0 %	50 %	386000587
105461	NC_017524	TGA	2	6	4235910	4235915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000587
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105464	NC_017524	ACC	2	6	4236047	4236052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000587
105465	NC_017524	GAC	2	6	4236107	4236112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000587
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105468	NC_017524	TGC	2	6	4236165	4236170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000587
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105470	NC_017524	CGA	2	6	4236256	4236261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000587
105471	NC_017524	AGC	2	6	4236273	4236278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000587
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105476	NC_017524	TGC	2	6	4236453	4236458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000587
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105479	NC_017524	TGC	2	6	4236501	4236506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000587
105480	NC_017524	ACT	2	6	4236552	4236557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000587
105481	NC_017524	AAG	2	6	4236563	4236568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000587
105482	NC_017524	CGG	2	6	4236601	4236606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000587
105483	NC_017524	TGC	2	6	4236630	4236635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000587
105484	NC_017524	ACCT	2	8	4236653	4236660	25 %	25 %	0 %	50 %	386000587
105485	NC_017524	CCT	2	6	4236861	4236866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105486	NC_017524	TGC	2	6	4236868	4236873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000588
105487	NC_017524	GGCC	2	8	4236887	4236894	0 %	0 %	50 %	50 %	386000588
105488	NC_017524	CA	3	6	4236902	4236907	50 %	0 %	0 %	50 %	386000588
105489	NC_017524	GC	3	6	4236914	4236919	0 %	0 %	50 %	50 %	386000588
105490	NC_017524	CGT	2	6	4236962	4236967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000588
105491	NC_017524	CAT	2	6	4237021	4237026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000588
105492	NC_017524	GCC	2	6	4237068	4237073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000588
105493	NC_017524	CGC	2	6	4237078	4237083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000588
105494	NC_017524	CAG	2	6	4237091	4237096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000588
105495	NC_017524	TCG	2	6	4237107	4237112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000588
105496	NC_017524	CGA	2	6	4237196	4237201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000588
105497	NC_017524	TCG	2	6	4237243	4237248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000588
105498	NC_017524	ACT	2	6	4237249	4237254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000588
105499	NC_017524	CTT	2	6	4237259	4237264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000588
105500	NC_017524	TC	3	6	4237265	4237270	0 %	50 %	0 %	50 %	386000588

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