MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101002	NC_017524	CCG	2	6	4054554	4054559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000415
101003	NC_017524	CCA	2	6	4054582	4054587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000415
101004	NC_017524	TCA	2	6	4054591	4054596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000415
101005	NC_017524	CGA	2	6	4054661	4054666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101006	NC_017524	CGCGC	2	10	4054689	4054698	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101007	NC_017524	CTA	2	6	4054719	4054724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101008	NC_017524	GCC	2	6	4054763	4054768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000416
101009	NC_017524	CTC	2	6	4054807	4054812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000416
101010	NC_017524	GGC	2	6	4054909	4054914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000416
101011	NC_017524	GCC	2	6	4054985	4054990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000416
101012	NC_017524	CTG	2	6	4054997	4055002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000416
101013	NC_017524	ACC	2	6	4055009	4055014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000416
101014	NC_017524	CGCT	2	8	4055024	4055031	0 %	25 %	25 %	50 %	386000416
101015	NC_017524	GCC	2	6	4055058	4055063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000416
101016	NC_017524	GCGG	2	8	4055142	4055149	0 %	0 %	75 %	25 %	386000416
101017	NC_017524	GC	3	6	4055162	4055167	0 %	0 %	50 %	50 %	386000416
101018	NC_017524	GCTG	2	8	4055197	4055204	0 %	25 %	50 %	25 %	386000416
101019	NC_017524	CTG	2	6	4055225	4055230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000416
101020	NC_017524	GC	3	6	4055268	4055273	0 %	0 %	50 %	50 %	386000416
101021	NC_017524	TGG	2	6	4055277	4055282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000416
101022	NC_017524	GTG	2	6	4055300	4055305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000416
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101024	NC_017524	TGA	2	6	4055394	4055399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000416
101025	NC_017524	CG	3	6	4055414	4055419	0 %	0 %	50 %	50 %	386000416
101026	NC_017524	GCC	2	6	4055420	4055425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000416
101027	NC_017524	TGA	2	6	4055430	4055435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000416
101028	NC_017524	GCC	2	6	4055468	4055473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000416
101029	NC_017524	ATC	2	6	4055480	4055485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000416
101030	NC_017524	GC	3	6	4055556	4055561	0 %	0 %	50 %	50 %	386000416
101031	NC_017524	CTG	2	6	4055606	4055611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000416
101032	NC_017524	TCG	2	6	4055652	4055657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000416
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101040	NC_017524	GCTGG	2	10	4055899	4055908	0 %	20 %	60 %	20 %	386000416
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101042	NC_017524	CTG	3	9	4055939	4055947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000416
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101081	NC_017524	ATC	2	6	4057313	4057318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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101084	NC_017524	CTG	2	6	4057353	4057358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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101089	NC_017524	CGGCC	2	10	4057547	4057556	0 %	0 %	40 %	60 %	386000419
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101114	NC_017524	TGG	2	6	4058578	4058583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000420
101115	NC_017524	AGC	2	6	4058595	4058600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000420
101116	NC_017524	CGG	2	6	4058798	4058803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000420
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101120	NC_017524	CGG	2	6	4058934	4058939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000420
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101227	NC_017524	GGCC	2	8	4062913	4062920	0 %	0 %	50 %	50 %	386000424
101228	NC_017524	GCC	3	9	4062965	4062973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000424
101229	NC_017524	CAC	2	6	4062974	4062979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000424
101230	NC_017524	GCT	2	6	4063024	4063029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000424
101231	NC_017524	GTC	2	6	4063031	4063036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000424
101232	NC_017524	GCC	2	6	4063070	4063075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000424
101233	NC_017524	TTC	2	6	4063082	4063087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000424
101234	NC_017524	GTC	2	6	4063096	4063101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000424
101235	NC_017524	CGTCA	2	10	4063126	4063135	20 %	20 %	20 %	40 %	386000424
101236	NC_017524	CGA	2	6	4063171	4063176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000424
101237	NC_017524	CGT	2	6	4063177	4063182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000424
101238	NC_017524	CGAC	2	8	4063198	4063205	25 %	0 %	25 %	50 %	386000424
101239	NC_017524	CAC	2	6	4063211	4063216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000424
101240	NC_017524	CGA	2	6	4063294	4063299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000424
101241	NC_017524	CT	3	6	4063463	4063468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101242	NC_017524	CGG	2	6	4063485	4063490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000425
101243	NC_017524	GTA	2	6	4063510	4063515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000425
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101248	NC_017524	CCGA	2	8	4063715	4063722	25 %	0 %	25 %	50 %	386000425
101249	NC_017524	TGCC	2	8	4063731	4063738	0 %	25 %	25 %	50 %	386000425
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101253	NC_017524	TGG	2	6	4064008	4064013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000425
101254	NC_017524	GCG	2	6	4064020	4064025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000425
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101260	NC_017524	GTA	2	6	4064290	4064295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000425
101261	NC_017524	TG	3	6	4064333	4064338	0 %	50 %	50 %	0 %	386000425
101262	NC_017524	TCGAC	2	10	4064343	4064352	20 %	20 %	20 %	40 %	386000425
101263	NC_017524	TGA	2	6	4064390	4064395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101264	NC_017524	GAA	2	6	4064445	4064450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000426
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101269	NC_017524	CGG	2	6	4064709	4064714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000426
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101280	NC_017524	GTG	2	6	4065422	4065427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101281	NC_017524	TCG	2	6	4065444	4065449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101282	NC_017524	GCC	2	6	4065460	4065465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000428
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101305	NC_017524	AC	3	6	4066717	4066722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101306	NC_017524	CGA	2	6	4066723	4066728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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101330	NC_017524	GGCG	2	8	4068023	4068030	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101331	NC_017524	CGT	2	6	4068081	4068086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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101339	NC_017524	GCCC	2	8	4068426	4068433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101340	NC_017524	GCG	2	6	4068440	4068445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101341	NC_017524	TGG	2	6	4068470	4068475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000432
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101343	NC_017524	CGG	2	6	4068570	4068575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000432
101344	NC_017524	GGC	2	6	4068582	4068587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000432
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101346	NC_017524	GGT	2	6	4068617	4068622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000432
101347	NC_017524	CACCC	2	10	4068630	4068639	20 %	0 %	0 %	80 %	386000432
101348	NC_017524	GATC	2	8	4068683	4068690	25 %	25 %	25 %	25 %	386000432
101349	NC_017524	CG	3	6	4068710	4068715	0 %	0 %	50 %	50 %	386000432
101350	NC_017524	CGT	2	6	4068742	4068747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000432
101351	NC_017524	CAC	2	6	4068773	4068778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000432
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101353	NC_017524	TTC	2	6	4068834	4068839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000432
101354	NC_017524	GGCCTC	2	12	4068876	4068887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386000432
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101366	NC_017524	GGC	2	6	4069242	4069247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000432
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101370	NC_017524	CCCG	2	8	4069446	4069453	0 %	0 %	25 %	75 %	386000432
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101374	NC_017524	CGC	2	6	4069547	4069552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000432
101375	NC_017524	ACG	2	6	4069575	4069580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000432
101376	NC_017524	GCC	2	6	4069582	4069587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000432
101377	NC_017524	AGC	2	6	4069600	4069605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000432
101378	NC_017524	CAT	2	6	4069653	4069658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000432
101379	NC_017524	CGTT	2	8	4069698	4069705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101380	NC_017524	TCG	2	6	4069727	4069732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101381	NC_017524	TGGA	2	8	4069738	4069745	25 %	25 %	50 %	0 %	386000433
101382	NC_017524	TCG	2	6	4069757	4069762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000433
101383	NC_017524	CGC	2	6	4069779	4069784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000433
101384	NC_017524	CGG	2	6	4069811	4069816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000433
101385	NC_017524	TGC	2	6	4069889	4069894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000433
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101413	NC_017524	TGC	2	6	4071315	4071320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000433
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101419	NC_017524	CGT	2	6	4071515	4071520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000434
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101460	NC_017524	GC	3	6	4073103	4073108	0 %	0 %	50 %	50 %	386000434
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101486	NC_017524	TCG	2	6	4074419	4074424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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101490	NC_017524	TCG	2	6	4074533	4074538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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