MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017524	GTA	2	6	22198	22203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996790
502	NC_017524	TGC	2	6	22206	22211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996790
503	NC_017524	GAT	2	6	22213	22218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996790
504	NC_017524	CG	3	6	22219	22224	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
505	NC_017524	TCA	2	6	22245	22250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996790
506	NC_017524	ACC	2	6	22293	22298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996790
507	NC_017524	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	385996790
508	NC_017524	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
509	NC_017524	GTC	3	9	22405	22413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996790
510	NC_017524	CGTAGT	2	12	22452	22463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385996790
511	NC_017524	CGA	2	6	22464	22469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996790
512	NC_017524	CGA	3	9	22476	22484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996790
513	NC_017524	GCC	3	9	22501	22509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996790
514	NC_017524	CAG	2	6	22618	22623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996790
515	NC_017524	CCT	2	6	22725	22730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996790
516	NC_017524	TCG	2	6	22748	22753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996790
517	NC_017524	GTC	2	6	22774	22779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996790
518	NC_017524	GCA	2	6	22809	22814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996790
519	NC_017524	CG	3	6	22821	22826	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
520	NC_017524	GC	3	6	22946	22951	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
521	NC_017524	CAG	2	6	22972	22977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996790
522	NC_017524	TCG	2	6	22991	22996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996790
523	NC_017524	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
524	NC_017524	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	385996790
525	NC_017524	GTT	2	6	23113	23118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996790
526	NC_017524	GC	3	6	23143	23148	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
527	NC_017524	CG	3	6	23172	23177	0 %	0 %	50 %	50 %	385996790
528	NC_017524	C	6	6	23207	23212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
529	NC_017524	GC	3	6	23223	23228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_017524	TCG	2	6	23254	23259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017524	GTC	2	6	23337	23342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996791
532	NC_017524	GTC	2	6	23444	23449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996791
533	NC_017524	GTC	2	6	23468	23473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996791
534	NC_017524	GC	3	6	23475	23480	0 %	0 %	50 %	50 %	385996791
535	NC_017524	CG	3	6	23514	23519	0 %	0 %	50 %	50 %	385996791
536	NC_017524	CAC	2	6	23540	23545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996791
537	NC_017524	CG	3	6	23574	23579	0 %	0 %	50 %	50 %	385996791
538	NC_017524	CAT	2	6	23615	23620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996791
539	NC_017524	CAA	2	6	23687	23692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996791
540	NC_017524	GGT	2	6	23816	23821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017524	GAT	2	6	23876	23881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996792
542	NC_017524	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	385996792
543	NC_017524	GTG	2	6	23952	23957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996792
544	NC_017524	TGG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996792
545	NC_017524	AC	3	6	24028	24033	50 %	0 %	0 %	50 %	385996792
546	NC_017524	GAT	2	6	24074	24079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996792
547	NC_017524	CGT	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996792
548	NC_017524	CGG	2	6	24148	24153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996792
549	NC_017524	GCC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
550	NC_017524	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	385996792
551	NC_017524	CGTAGT	2	12	24229	24240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385996792
552	NC_017524	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
553	NC_017524	GAG	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996792
554	NC_017524	GCC	3	9	24326	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
555	NC_017524	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
556	NC_017524	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	385996792
557	NC_017524	CTC	2	6	24455	24460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996792
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559	NC_017524	GCC	2	6	24512	24517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
560	NC_017524	GCC	2	6	24536	24541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
561	NC_017524	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	385996792
562	NC_017524	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996792
563	NC_017524	GCG	2	6	24625	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996792
564	NC_017524	C	6	6	24636	24641	0 %	0 %	0 %	100 %	385996792
565	NC_017524	CCTGGT	2	12	24667	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996792
566	NC_017524	GCC	2	6	24821	24826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
567	NC_017524	C	6	6	24842	24847	0 %	0 %	0 %	100 %	385996792
568	NC_017524	CCA	2	6	24879	24884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996792
569	NC_017524	GTC	2	6	24914	24919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996792
570	NC_017524	TCG	2	6	24927	24932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996792
571	NC_017524	GCCCCT	2	12	24937	24948	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385996792
572	NC_017524	CGG	2	6	25043	25048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996792
573	NC_017524	CGA	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996792
574	NC_017524	GAC	2	6	25127	25132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996792
575	NC_017524	ATG	2	6	25254	25259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996792
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577	NC_017524	GCA	2	6	25324	25329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996792
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579	NC_017524	TCAA	2	8	25514	25521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_017524	GAGC	2	8	25542	25549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_017524	GGCC	2	8	25556	25563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_017524	CCG	2	6	25577	25582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_017524	CTA	2	6	25612	25617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017524	TCC	2	6	25629	25634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_017524	GTT	2	6	25636	25641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017524	TCG	3	9	25756	25764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017524	GCC	2	6	25770	25775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_017524	GC	3	6	25920	25925	0 %	0 %	50 %	50 %	385996793
589	NC_017524	CGC	2	6	25943	25948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996793
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610	NC_017524	GCG	2	6	26700	26705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
611	NC_017524	CCAA	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	385996793
612	NC_017524	GCC	2	6	26744	26749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996793
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619	NC_017524	CGAGC	2	10	26968	26977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_017524	CAC	2	6	27065	27070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996794
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627	NC_017524	CGT	2	6	27385	27390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996794
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629	NC_017524	TA	3	6	27526	27531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017524	GTA	2	6	27565	27570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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754	NC_017524	GCC	3	9	32534	32542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996801
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