MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 109291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017524	CGA	2	6	228287	228292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5502	NC_017524	GT	3	6	228381	228386	0 %	50 %	50 %	0 %	385996966
5503	NC_017524	GCA	2	6	228419	228424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5504	NC_017524	CACC	2	8	228456	228463	25 %	0 %	0 %	75 %	385996966
5505	NC_017524	CGC	2	6	228480	228485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5506	NC_017524	CTG	2	6	228486	228491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5507	NC_017524	CTG	2	6	228522	228527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5508	NC_017524	TGG	2	6	228529	228534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5509	NC_017524	CTG	2	6	228555	228560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5510	NC_017524	CGC	2	6	228600	228605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5511	NC_017524	TGG	2	6	228624	228629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5512	NC_017524	CGT	2	6	228737	228742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5513	NC_017524	GCCTGG	2	12	228760	228771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996966
5514	NC_017524	GAC	2	6	228783	228788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5515	NC_017524	CCG	2	6	228817	228822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5516	NC_017524	GTG	2	6	228879	228884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5517	NC_017524	TGG	2	6	228901	228906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5518	NC_017524	GCT	2	6	228908	228913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5519	NC_017524	CAC	2	6	228947	228952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996966
5520	NC_017524	CGG	2	6	229011	229016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5521	NC_017524	CGG	2	6	229063	229068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5522	NC_017524	GAC	2	6	229134	229139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5523	NC_017524	GCT	2	6	229169	229174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5524	NC_017524	TAC	2	6	229182	229187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996966
5525	NC_017524	ACC	2	6	229218	229223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996966
5526	NC_017524	TCGG	2	8	229269	229276	0 %	25 %	50 %	25 %	385996966
5527	NC_017524	TGT	2	6	229309	229314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996966
5528	NC_017524	CGA	2	6	229346	229351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
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5530	NC_017524	GGC	2	6	229370	229375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5531	NC_017524	GCT	2	6	229391	229396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5532	NC_017524	CGT	2	6	229411	229416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5533	NC_017524	CGG	2	6	229420	229425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5534	NC_017524	GTG	2	6	229447	229452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5535	NC_017524	CCGG	2	8	229530	229537	0 %	0 %	50 %	50 %	385996966
5536	NC_017524	GGT	2	6	229544	229549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5537	NC_017524	TCG	2	6	229552	229557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5538	NC_017524	TGG	2	6	229594	229599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5539	NC_017524	ACGG	2	8	229747	229754	25 %	0 %	50 %	25 %	385996966
5540	NC_017524	GAT	2	6	229811	229816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996966
5541	NC_017524	CCG	2	6	229873	229878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5542	NC_017524	CTG	3	9	229932	229940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5543	NC_017524	GTG	2	6	229980	229985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5544	NC_017524	CACCCT	2	12	229994	230005	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385996966
5545	NC_017524	GAC	2	6	230018	230023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5546	NC_017524	GCT	2	6	230127	230132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5547	NC_017524	GGC	2	6	230156	230161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5548	NC_017524	AACT	2	8	230379	230386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_017524	TGT	2	6	230519	230524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017524	GGAA	2	8	230554	230561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017524	CAC	2	6	230562	230567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_017524	G	6	6	230569	230574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017524	GAG	2	6	230620	230625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017524	TCC	2	6	230630	230635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_017524	GGT	2	6	230682	230687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996967
5556	NC_017524	GCGA	2	8	230689	230696	25 %	0 %	50 %	25 %	385996967
5557	NC_017524	GC	3	6	230754	230759	0 %	0 %	50 %	50 %	385996967
5558	NC_017524	CCA	2	6	230801	230806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996967
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5571	NC_017524	CGCA	2	8	231244	231251	25 %	0 %	25 %	50 %	385996967
5572	NC_017524	TGCGC	2	10	231264	231273	0 %	20 %	40 %	40 %	385996967
5573	NC_017524	TGAT	2	8	231286	231293	25 %	50 %	25 %	0 %	385996967
5574	NC_017524	ACGT	2	8	231306	231313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_017524	GGCCG	2	10	231316	231325	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5576	NC_017524	GTG	2	6	231337	231342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_017524	CG	3	6	231757	231762	0 %	0 %	50 %	50 %	385996968
5590	NC_017524	GCG	2	6	231767	231772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996968
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5609	NC_017524	TCG	2	6	232481	232486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996969
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5622	NC_017524	TAT	2	6	233028	233033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385996969
5623	NC_017524	GTG	2	6	233056	233061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996969
5624	NC_017524	GAG	2	6	233065	233070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996969
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5730	NC_017524	CGG	3	9	237218	237226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996972
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5736	NC_017524	GGC	2	6	237474	237479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996972
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5738	NC_017524	GGCT	2	8	237610	237617	0 %	25 %	50 %	25 %	385996972
5739	NC_017524	CGCT	2	8	237642	237649	0 %	25 %	25 %	50 %	385996972
5740	NC_017524	CGG	2	6	237656	237661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996973
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