MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 109449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017523	TGC	2	6	125807	125812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3002	NC_017523	GCG	2	6	125905	125910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993219
3003	NC_017523	GTC	2	6	125933	125938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3004	NC_017523	GCC	2	6	125947	125952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3005	NC_017523	GCC	2	6	125990	125995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3006	NC_017523	GGGGT	2	10	126054	126063	0 %	20 %	80 %	0 %	385993219
3007	NC_017523	GCA	2	6	126073	126078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3008	NC_017523	GGC	2	6	126083	126088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993219
3009	NC_017523	GCGGCA	2	12	126117	126128	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385993219
3010	NC_017523	GCTG	2	8	126155	126162	0 %	25 %	50 %	25 %	385993219
3011	NC_017523	TGG	2	6	126166	126171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993219
3012	NC_017523	CAA	2	6	126194	126199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993219
3013	NC_017523	GGT	2	6	126212	126217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993219
3014	NC_017523	CCG	2	6	126289	126294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3015	NC_017523	TCG	2	6	126351	126356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3016	NC_017523	CG	3	6	126455	126460	0 %	0 %	50 %	50 %	385993219
3017	NC_017523	ACC	2	6	126555	126560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3018	NC_017523	GCA	2	6	126586	126591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3019	NC_017523	CCCAC	2	10	126616	126625	20 %	0 %	0 %	80 %	385993219
3020	NC_017523	ACC	2	6	126654	126659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3021	NC_017523	TCGGGT	2	12	126756	126767	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385993219
3022	NC_017523	GTC	3	9	126812	126820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3023	NC_017523	TGCA	2	8	126842	126849	25 %	25 %	25 %	25 %	385993219
3024	NC_017523	ACC	2	6	126894	126899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3025	NC_017523	GGC	2	6	126913	126918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993219
3026	NC_017523	CCG	2	6	126976	126981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3027	NC_017523	GCCG	2	8	127034	127041	0 %	0 %	50 %	50 %	385993219
3028	NC_017523	ACC	2	6	127052	127057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3029	NC_017523	CCA	2	6	127063	127068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3030	NC_017523	CCGGC	2	10	127126	127135	0 %	0 %	40 %	60 %	385993219
3031	NC_017523	CCG	2	6	127176	127181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3032	NC_017523	ACG	2	6	127185	127190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3033	NC_017523	GCC	2	6	127206	127211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3034	NC_017523	GCC	2	6	127215	127220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3035	NC_017523	CGA	2	6	127256	127261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3036	NC_017523	GAT	2	6	127262	127267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993219
3037	NC_017523	CAC	2	6	127271	127276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3038	NC_017523	GCC	2	6	127341	127346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3039	NC_017523	AGC	2	6	127383	127388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3040	NC_017523	GCC	3	9	127419	127427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3041	NC_017523	GCG	2	6	127434	127439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993219
3042	NC_017523	TGG	2	6	127528	127533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993219
3043	NC_017523	TGCGG	2	10	127536	127545	0 %	20 %	60 %	20 %	385993219
3044	NC_017523	CGA	2	6	127670	127675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993219
3045	NC_017523	CCAG	2	8	127683	127690	25 %	0 %	25 %	50 %	385993219
3046	NC_017523	ACC	2	6	127773	127778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3047	NC_017523	CTC	2	6	127838	127843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993219
3048	NC_017523	GGC	2	6	127850	127855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993219
3049	NC_017523	CGG	2	6	127931	127936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993219
3050	NC_017523	CAC	2	6	128000	128005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3051	NC_017523	CAC	2	6	128012	128017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3052	NC_017523	CCG	2	6	128059	128064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993219
3053	NC_017523	CTGT	2	8	128101	128108	0 %	50 %	25 %	25 %	385993219
3054	NC_017523	CAC	2	6	128125	128130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993219
3055	NC_017523	GCGA	2	8	128287	128294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_017523	CGGG	2	8	128330	128337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_017523	ACG	2	6	128387	128392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017523	G	6	6	128495	128500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017523	CGA	2	6	128502	128507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017523	GGT	2	6	128526	128531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017523	CCG	2	6	128553	128558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_017523	TGG	2	6	128585	128590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017523	CAC	2	6	128614	128619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_017523	CGG	2	6	128836	128841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017523	GCTC	2	8	128842	128849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_017523	GGT	2	6	128853	128858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017523	CCA	2	6	128965	128970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_017523	ATCAC	2	10	129015	129024	40 %	20 %	0 %	40 %	385993220
3069	NC_017523	GCG	2	6	129039	129044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3070	NC_017523	ATCGG	2	10	129063	129072	20 %	20 %	40 %	20 %	385993220
3071	NC_017523	CGA	2	6	129106	129111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993220
3072	NC_017523	GCA	2	6	129314	129319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993220
3073	NC_017523	CCCA	2	8	129345	129352	25 %	0 %	0 %	75 %	385993220
3074	NC_017523	ATC	2	6	129372	129377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993220
3075	NC_017523	CGG	2	6	129425	129430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
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3081	NC_017523	CGG	2	6	129527	129532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3082	NC_017523	CGG	2	6	129536	129541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3083	NC_017523	GCGG	2	8	129561	129568	0 %	0 %	75 %	25 %	385993220
3084	NC_017523	GGCG	2	8	129569	129576	0 %	0 %	75 %	25 %	385993220
3085	NC_017523	GCT	2	6	129587	129592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993220
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3087	NC_017523	CGG	2	6	129611	129616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
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3089	NC_017523	CGG	2	6	129662	129667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3090	NC_017523	CGG	2	6	129701	129706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3091	NC_017523	GCG	2	6	129712	129717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3092	NC_017523	CGG	2	6	129719	129724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3093	NC_017523	CGG	2	6	129743	129748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3094	NC_017523	CGG	2	6	129761	129766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
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3122	NC_017523	CGG	2	6	130235	130240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3123	NC_017523	CGG	2	6	130283	130288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3124	NC_017523	GCG	2	6	130291	130296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3125	NC_017523	CGG	2	6	130310	130315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3126	NC_017523	GCT	2	6	130344	130349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993220
3127	NC_017523	GGT	2	6	130359	130364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993220
3128	NC_017523	GGT	2	6	130368	130373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993220
3129	NC_017523	CGG	2	6	130394	130399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3130	NC_017523	CGG	2	6	130421	130426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3131	NC_017523	CGG	2	6	130430	130435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3132	NC_017523	GGC	2	6	130440	130445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3133	NC_017523	GCG	2	6	130447	130452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993220
3134	NC_017523	CAA	2	6	130523	130528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_017523	CCA	2	6	130661	130666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3136	NC_017523	GT	3	6	130676	130681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_017523	CGG	2	6	130724	130729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_017523	GGT	2	6	130751	130756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993221
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3140	NC_017523	CTG	2	6	130914	130919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993221
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3144	NC_017523	GC	3	6	131005	131010	0 %	0 %	50 %	50 %	385993221
3145	NC_017523	ACGGCG	2	12	131052	131063	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385993221
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3151	NC_017523	TCG	2	6	131320	131325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993221
3152	NC_017523	AGG	2	6	131473	131478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_017523	GCA	2	6	131494	131499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3154	NC_017523	GAC	2	6	131512	131517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_017523	GC	3	6	131530	131535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3156	NC_017523	CGGG	2	8	131554	131561	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3157	NC_017523	GTCG	2	8	131622	131629	0 %	25 %	50 %	25 %	385993222
3158	NC_017523	GCG	2	6	131654	131659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993222
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3160	NC_017523	GGC	2	6	131724	131729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993222
3161	NC_017523	GCG	2	6	131743	131748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993222
3162	NC_017523	CTT	2	6	131768	131773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993222
3163	NC_017523	TCA	2	6	131791	131796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993222
3164	NC_017523	GCT	3	9	131801	131809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993222
3165	NC_017523	CGA	2	6	131810	131815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993222
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3167	NC_017523	GCT	2	6	131873	131878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993222
3168	NC_017523	GCGAT	2	10	131959	131968	20 %	20 %	40 %	20 %	385993222
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3198	NC_017523	CGACC	2	10	133262	133271	20 %	0 %	20 %	60 %	385993222
3199	NC_017523	AGCG	2	8	133300	133307	25 %	0 %	50 %	25 %	385993222
3200	NC_017523	CAC	2	6	133346	133351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993222
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3203	NC_017523	CAA	2	6	133487	133492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993222
3204	NC_017523	CCG	2	6	133630	133635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3205	NC_017523	TG	3	6	133675	133680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3206	NC_017523	TGA	2	6	133696	133701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3207	NC_017523	GTG	2	6	133712	133717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3208	NC_017523	GC	4	8	133810	133817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3209	NC_017523	ATG	2	6	133939	133944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993223
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3212	NC_017523	CGG	2	6	134138	134143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993223
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3214	NC_017523	ACC	2	6	134173	134178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993223
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3217	NC_017523	TCG	2	6	134254	134259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993223
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3223	NC_017523	TGATGC	2	12	134573	134584	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385993223
3224	NC_017523	CTT	2	6	134713	134718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993223
3225	NC_017523	CGA	2	6	134727	134732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993223
3226	NC_017523	ATC	2	6	134737	134742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993223
3227	NC_017523	GCA	2	6	134753	134758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993223
3228	NC_017523	GGC	2	6	134763	134768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993223
3229	NC_017523	CAA	2	6	134782	134787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993223
3230	NC_017523	ATT	2	6	134826	134831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385993223
3231	NC_017523	GAG	2	6	134892	134897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_017523	CTG	2	6	134956	134961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993224
3233	NC_017523	TG	3	6	135088	135093	0 %	50 %	50 %	0 %	385993224
3234	NC_017523	GGT	2	6	135099	135104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993224
3235	NC_017523	TCG	2	6	135198	135203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993224
3236	NC_017523	GTT	2	6	135366	135371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993224
3237	NC_017523	CGG	2	6	135389	135394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993224
3238	NC_017523	TCA	2	6	135617	135622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3239	NC_017523	TACG	2	8	135643	135650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3240	NC_017523	GGC	2	6	135656	135661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3241	NC_017523	GCG	2	6	135682	135687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_017523	GAA	2	6	135696	135701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_017523	CAG	2	6	135742	135747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3244	NC_017523	TGA	2	6	135764	135769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_017523	CAC	2	6	135859	135864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3246	NC_017523	GAC	2	6	135923	135928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_017523	CA	3	6	135992	135997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3248	NC_017523	CGC	2	6	136002	136007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3249	NC_017523	TGC	2	6	136008	136013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_017523	G	6	6	136118	136123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_017523	CGG	2	6	136175	136180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_017523	GAGAT	2	10	136282	136291	40 %	20 %	40 %	0 %	385993225
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3254	NC_017523	TCGA	2	8	136332	136339	25 %	25 %	25 %	25 %	385993225
3255	NC_017523	TC	3	6	136350	136355	0 %	50 %	0 %	50 %	385993225
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3284	NC_017523	GAG	2	6	137395	137400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3286	NC_017523	ACGC	2	8	137542	137549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3287	NC_017523	GAA	2	6	137570	137575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3292	NC_017523	GCT	2	6	137648	137653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3490	NC_017523	GCC	2	6	146131	146136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3491	NC_017523	GAC	2	6	146205	146210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3492	NC_017523	GGGTCA	2	12	146264	146275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3493	NC_017523	TCG	2	6	146315	146320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_017523	TAC	2	6	146371	146376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3495	NC_017523	GTC	2	6	146410	146415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3496	NC_017523	CGA	2	6	146427	146432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_017523	ATC	2	6	146443	146448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_017523	GAA	2	6	146483	146488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993233
3499	NC_017523	CCG	2	6	146500	146505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993233
3500	NC_017523	CGA	2	6	146519	146524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993233

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