MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 109449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017523	GTT	2	6	552469	552474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993561
13502	NC_017523	TGC	2	6	552496	552501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13503	NC_017523	TCG	2	6	552507	552512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13504	NC_017523	GCCC	2	8	552522	552529	0 %	0 %	25 %	75 %	385993561
13505	NC_017523	CAGCC	2	10	552672	552681	20 %	0 %	20 %	60 %	385993561
13506	NC_017523	GGC	2	6	552716	552721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993561
13507	NC_017523	CCAC	2	8	552742	552749	25 %	0 %	0 %	75 %	385993561
13508	NC_017523	GCC	2	6	552842	552847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993561
13509	NC_017523	GGA	2	6	552851	552856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993561
13510	NC_017523	CGT	2	6	553018	553023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13511	NC_017523	CGT	2	6	553042	553047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13512	NC_017523	GCA	2	6	553063	553068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13513	NC_017523	CGG	2	6	553192	553197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993561
13514	NC_017523	CTG	2	6	553211	553216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13515	NC_017523	CTG	2	6	553233	553238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13516	NC_017523	GCA	2	6	553273	553278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13517	NC_017523	TTG	2	6	553302	553307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993561
13518	NC_017523	CGG	2	6	553335	553340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993561
13519	NC_017523	GTG	2	6	553364	553369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993561
13520	NC_017523	AGT	2	6	553441	553446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993561
13521	NC_017523	CTC	2	6	553505	553510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993561
13522	NC_017523	CGG	2	6	553516	553521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993561
13523	NC_017523	GGT	2	6	553532	553537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993561
13524	NC_017523	ACC	2	6	553563	553568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993561
13525	NC_017523	GTC	2	6	553682	553687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13526	NC_017523	GCA	3	9	553735	553743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13527	NC_017523	CGT	2	6	553765	553770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993561
13528	NC_017523	TGC	2	6	553942	553947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_017523	GAG	2	6	554017	554022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_017523	A	6	6	554052	554057	100 %	0 %	0 %	0 %	385993562
13531	NC_017523	TGCCCG	2	12	554062	554073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385993562
13532	NC_017523	CG	3	6	554130	554135	0 %	0 %	50 %	50 %	385993562
13533	NC_017523	CGGCTG	2	12	554139	554150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385993562
13534	NC_017523	GAG	2	6	554211	554216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993562
13535	NC_017523	ACCC	2	8	554217	554224	25 %	0 %	0 %	75 %	385993562
13536	NC_017523	TGG	2	6	554248	554253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993562
13537	NC_017523	TGC	2	6	554284	554289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993562
13538	NC_017523	GGT	2	6	554323	554328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993562
13539	NC_017523	GGC	2	6	554361	554366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993562
13540	NC_017523	CGA	2	6	554432	554437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993562
13541	NC_017523	GAT	2	6	554514	554519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993562
13542	NC_017523	AAC	2	6	554580	554585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993562
13543	NC_017523	GCT	2	6	554633	554638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993562
13544	NC_017523	ATC	2	6	554703	554708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993562
13545	NC_017523	CGA	2	6	554795	554800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993562
13546	NC_017523	GAC	2	6	555054	555059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_017523	TGTC	2	8	555110	555117	0 %	50 %	25 %	25 %	385993563
13548	NC_017523	CAG	2	6	555148	555153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13549	NC_017523	CCG	2	6	555200	555205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993563
13550	NC_017523	CGT	2	6	555210	555215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13551	NC_017523	GAG	2	6	555238	555243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993563
13552	NC_017523	CGC	2	6	555256	555261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993563
13553	NC_017523	AGC	2	6	555281	555286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13554	NC_017523	GC	3	6	555317	555322	0 %	0 %	50 %	50 %	385993563
13555	NC_017523	CAG	2	6	555343	555348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13556	NC_017523	GC	3	6	555351	555356	0 %	0 %	50 %	50 %	385993563
13557	NC_017523	GGT	2	6	555465	555470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993563
13558	NC_017523	CCG	2	6	555471	555476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993563
13559	NC_017523	CAA	2	6	555480	555485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993563
13560	NC_017523	GC	3	6	555495	555500	0 %	0 %	50 %	50 %	385993563
13561	NC_017523	CTGG	2	8	555543	555550	0 %	25 %	50 %	25 %	385993563
13562	NC_017523	GGC	2	6	555583	555588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993563
13563	NC_017523	GC	3	6	555587	555592	0 %	0 %	50 %	50 %	385993563
13564	NC_017523	CGC	2	6	555624	555629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993563
13565	NC_017523	GGA	2	6	555651	555656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993563
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13567	NC_017523	GGC	2	6	555691	555696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993563
13568	NC_017523	CAG	2	6	555715	555720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13569	NC_017523	GCTCG	2	10	555742	555751	0 %	20 %	40 %	40 %	385993563
13570	NC_017523	GGT	2	6	555777	555782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993563
13571	NC_017523	GGC	2	6	555804	555809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993563
13572	NC_017523	CGA	2	6	555831	555836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13573	NC_017523	TCA	2	6	555851	555856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993563
13574	NC_017523	TGGA	2	8	555955	555962	25 %	25 %	50 %	0 %	385993563
13575	NC_017523	GCC	2	6	555985	555990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993563
13576	NC_017523	CGA	2	6	556080	556085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13577	NC_017523	CCA	2	6	556088	556093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993563
13578	NC_017523	TCA	2	6	556142	556147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993563
13579	NC_017523	ACT	2	6	556172	556177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993563
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13582	NC_017523	CCA	2	6	556325	556330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993563
13583	NC_017523	TCG	2	6	556345	556350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993563
13584	NC_017523	ACC	2	6	556351	556356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993563
13585	NC_017523	GCG	2	6	556426	556431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_017523	GAG	2	6	556466	556471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_017523	GCGAT	2	10	556481	556490	20 %	20 %	40 %	20 %	385993564
13588	NC_017523	GCCG	2	8	556581	556588	0 %	0 %	50 %	50 %	385993564
13589	NC_017523	CGAGCG	2	12	556662	556673	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385993564
13590	NC_017523	CAC	2	6	556701	556706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993564
13591	NC_017523	GTC	2	6	556801	556806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993564
13592	NC_017523	CGC	2	6	556863	556868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993564
13593	NC_017523	CCA	2	6	556871	556876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993564
13594	NC_017523	AGC	2	6	556877	556882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993564
13595	NC_017523	TTC	2	6	556906	556911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993564
13596	NC_017523	TGC	2	6	556925	556930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993564
13597	NC_017523	CGA	2	6	556962	556967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993564
13598	NC_017523	GCC	3	9	556969	556977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993564
13599	NC_017523	GC	3	6	556978	556983	0 %	0 %	50 %	50 %	385993564
13600	NC_017523	GGA	2	6	556986	556991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993564
13601	NC_017523	GTT	2	6	557140	557145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993564
13602	NC_017523	GAA	2	6	557233	557238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993564
13603	NC_017523	TGC	2	6	557273	557278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993564
13604	NC_017523	GAAA	2	8	557303	557310	75 %	0 %	25 %	0 %	385993564
13605	NC_017523	GTA	2	6	557430	557435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_017523	CGGC	2	8	557462	557469	0 %	0 %	50 %	50 %	385993565
13607	NC_017523	ACG	2	6	557513	557518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993565
13608	NC_017523	CGA	2	6	557523	557528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993565
13609	NC_017523	GAA	2	6	557602	557607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993565
13610	NC_017523	GCT	2	6	557667	557672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993565
13611	NC_017523	GTG	2	6	557693	557698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993565
13612	NC_017523	TGC	3	9	557957	557965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993565
13613	NC_017523	GAA	2	6	558055	558060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993565
13614	NC_017523	GGC	2	6	558114	558119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993565
13615	NC_017523	TGC	2	6	558146	558151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993565
13616	NC_017523	AGC	2	6	558152	558157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993565
13617	NC_017523	GCG	2	6	558184	558189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993565
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13619	NC_017523	ACA	2	6	558242	558247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993565
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13987	NC_017523	TAC	2	6	573374	573379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993580
13988	NC_017523	ACT	2	6	573396	573401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993580
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13990	NC_017523	GC	3	6	573428	573433	0 %	0 %	50 %	50 %	385993580
13991	NC_017523	CA	3	6	573465	573470	50 %	0 %	0 %	50 %	385993580
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