MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 109449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017523	CGACGG	2	12	532666	532677	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385993543
13003	NC_017523	CGA	2	6	532678	532683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993543
13004	NC_017523	CGA	2	6	532705	532710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993543
13005	NC_017523	GCG	2	6	532727	532732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993543
13006	NC_017523	CAC	2	6	532757	532762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993543
13007	NC_017523	ACG	2	6	532794	532799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993543
13008	NC_017523	G	6	6	532808	532813	0 %	0 %	100 %	0 %	385993544
13009	NC_017523	TCG	2	6	532913	532918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13010	NC_017523	CGC	2	6	532943	532948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993544
13011	NC_017523	CGA	2	6	533013	533018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13012	NC_017523	GT	3	6	533030	533035	0 %	50 %	50 %	0 %	385993544
13013	NC_017523	GAT	2	6	533050	533055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993544
13014	NC_017523	GGT	2	6	533136	533141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993544
13015	NC_017523	GCG	2	6	533201	533206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993544
13016	NC_017523	ATC	2	6	533243	533248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993544
13017	NC_017523	ACT	2	6	533258	533263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993544
13018	NC_017523	GCCG	2	8	533326	533333	0 %	0 %	50 %	50 %	385993544
13019	NC_017523	AGCC	2	8	533350	533357	25 %	0 %	25 %	50 %	385993544
13020	NC_017523	TGC	2	6	533360	533365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13021	NC_017523	C	6	6	533397	533402	0 %	0 %	0 %	100 %	385993544
13022	NC_017523	CG	3	6	533410	533415	0 %	0 %	50 %	50 %	385993544
13023	NC_017523	CTG	2	6	533464	533469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13024	NC_017523	AGC	2	6	533486	533491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13025	NC_017523	GCG	2	6	533503	533508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993544
13026	NC_017523	CAG	2	6	533551	533556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13027	NC_017523	TCG	2	6	533591	533596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13028	NC_017523	AGCG	2	8	533720	533727	25 %	0 %	50 %	25 %	385993544
13029	NC_017523	CGA	2	6	533785	533790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13030	NC_017523	GATG	2	8	533868	533875	25 %	25 %	50 %	0 %	385993544
13031	NC_017523	GC	3	6	533888	533893	0 %	0 %	50 %	50 %	385993544
13032	NC_017523	CGG	2	6	533898	533903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993544
13033	NC_017523	AGTG	2	8	533946	533953	25 %	25 %	50 %	0 %	385993544
13034	NC_017523	AGC	2	6	533966	533971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13035	NC_017523	GCC	2	6	533984	533989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993544
13036	NC_017523	CG	3	6	534009	534014	0 %	0 %	50 %	50 %	385993544
13037	NC_017523	TGC	2	6	534052	534057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993544
13038	NC_017523	CTGG	2	8	534067	534074	0 %	25 %	50 %	25 %	385993544
13039	NC_017523	CAC	2	6	534093	534098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993544
13040	NC_017523	GC	3	6	534141	534146	0 %	0 %	50 %	50 %	385993545
13041	NC_017523	CCA	3	9	534149	534157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993545
13042	NC_017523	CAT	2	6	534183	534188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993545
13043	NC_017523	CGC	2	6	534214	534219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993545
13044	NC_017523	CGG	2	6	534259	534264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993545
13045	NC_017523	GTG	2	6	534308	534313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993545
13046	NC_017523	GTA	2	6	534324	534329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993545
13047	NC_017523	TGA	2	6	534340	534345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993545
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13049	NC_017523	CGGC	2	8	534389	534396	0 %	0 %	50 %	50 %	385993545
13050	NC_017523	CCG	2	6	534418	534423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993545
13051	NC_017523	AGA	2	6	534482	534487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993545
13052	NC_017523	GCA	2	6	534527	534532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993545
13053	NC_017523	AAG	2	6	534577	534582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993545
13054	NC_017523	GCG	2	6	534611	534616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993545
13055	NC_017523	GTC	2	6	534642	534647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993545
13056	NC_017523	CCA	2	6	534675	534680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993545
13057	NC_017523	GTG	2	6	534741	534746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993545
13058	NC_017523	GTG	2	6	534775	534780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993545
13059	NC_017523	CCT	2	6	534826	534831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993546
13060	NC_017523	GCC	2	6	534870	534875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993546
13061	NC_017523	GGC	2	6	534887	534892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993546
13062	NC_017523	ACC	2	6	534936	534941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993546
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13064	NC_017523	GCC	2	6	535055	535060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993546
13065	NC_017523	CGG	2	6	535077	535082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993546
13066	NC_017523	CTG	2	6	535104	535109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993546
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13072	NC_017523	TCG	2	6	535275	535280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993546
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13082	NC_017523	GTG	2	6	535628	535633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993546
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13084	NC_017523	CGCGG	2	10	535706	535715	0 %	0 %	60 %	40 %	385993546
13085	NC_017523	CG	3	6	535786	535791	0 %	0 %	50 %	50 %	385993546
13086	NC_017523	GTC	2	6	535823	535828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993546
13087	NC_017523	GC	3	6	535830	535835	0 %	0 %	50 %	50 %	385993546
13088	NC_017523	CGACAT	2	12	535838	535849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385993546
13089	NC_017523	CGA	2	6	535945	535950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993546
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13091	NC_017523	GCCG	2	8	536012	536019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13092	NC_017523	GGC	2	6	536064	536069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_017523	ACA	2	6	536095	536100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_017523	TCG	2	6	536109	536114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_017523	TGC	2	6	536122	536127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_017523	CGGC	2	8	536145	536152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_017523	GACG	2	8	536155	536162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13098	NC_017523	GCT	2	6	536184	536189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13099	NC_017523	GGCC	2	8	536200	536207	0 %	0 %	50 %	50 %	385993547
13100	NC_017523	CGGG	2	8	536242	536249	0 %	0 %	75 %	25 %	385993547
13101	NC_017523	CCA	2	6	536271	536276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993547
13102	NC_017523	AGT	2	6	536290	536295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993547
13103	NC_017523	GCG	2	6	536296	536301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993547
13104	NC_017523	ATGG	2	8	536302	536309	25 %	25 %	50 %	0 %	385993547
13105	NC_017523	TGG	2	6	536360	536365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993547
13106	NC_017523	GCC	2	6	536460	536465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993547
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13108	NC_017523	TGC	2	6	536614	536619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13109	NC_017523	AGC	2	6	536623	536628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13110	NC_017523	CGG	3	9	536681	536689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993547
13111	NC_017523	TGA	2	6	536705	536710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993547
13112	NC_017523	ATG	2	6	536716	536721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993547
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13117	NC_017523	GAT	2	6	536928	536933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993547
13118	NC_017523	GTCC	2	8	536948	536955	0 %	25 %	25 %	50 %	385993547
13119	NC_017523	GC	3	6	536977	536982	0 %	0 %	50 %	50 %	385993547
13120	NC_017523	GTC	2	6	537027	537032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13121	NC_017523	GGC	2	6	537039	537044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993547
13122	NC_017523	GCG	2	6	537167	537172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993547
13123	NC_017523	ATC	2	6	537360	537365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993547
13124	NC_017523	TTC	2	6	537390	537395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993547
13125	NC_017523	GTA	2	6	537439	537444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993547
13126	NC_017523	TCG	2	6	537491	537496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13127	NC_017523	TCG	2	6	537505	537510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13128	NC_017523	TCG	2	6	537614	537619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13129	NC_017523	TTGC	2	8	537638	537645	0 %	50 %	25 %	25 %	385993547
13130	NC_017523	GA	3	6	537770	537775	50 %	0 %	50 %	0 %	385993547
13131	NC_017523	TTGG	2	8	537801	537808	0 %	50 %	50 %	0 %	385993547
13132	NC_017523	GGTA	2	8	537823	537830	25 %	25 %	50 %	0 %	385993547
13133	NC_017523	CAGG	2	8	537860	537867	25 %	0 %	50 %	25 %	385993547
13134	NC_017523	CGA	2	6	537902	537907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993547
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13137	NC_017523	GCC	2	6	537947	537952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993547
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13139	NC_017523	GTA	2	6	538185	538190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993547
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13142	NC_017523	GGT	2	6	538305	538310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993547
13143	NC_017523	CG	3	6	538352	538357	0 %	0 %	50 %	50 %	385993547
13144	NC_017523	CAG	2	6	538386	538391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993547
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13146	NC_017523	ATA	2	6	538432	538437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385993547
13147	NC_017523	CGG	2	6	538545	538550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993547
13148	NC_017523	CGA	2	6	538565	538570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13149	NC_017523	TGC	2	6	538571	538576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
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13152	NC_017523	CGT	2	6	538655	538660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13153	NC_017523	CGG	2	6	538676	538681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993547
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13155	NC_017523	CTT	2	6	538722	538727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993547
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13157	NC_017523	GGTT	2	8	538786	538793	0 %	50 %	50 %	0 %	385993547
13158	NC_017523	TAT	2	6	538800	538805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385993547
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13160	NC_017523	ACG	2	6	538871	538876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13161	NC_017523	ACG	2	6	538951	538956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993547
13162	NC_017523	GCCA	3	12	538963	538974	25 %	0 %	25 %	50 %	385993547
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13165	NC_017523	AGTA	2	8	539089	539096	50 %	25 %	25 %	0 %	385993548
13166	NC_017523	CCG	2	6	539203	539208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993548
13167	NC_017523	CGT	2	6	539209	539214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993548
13168	NC_017523	G	6	6	539309	539314	0 %	0 %	100 %	0 %	385993548
13169	NC_017523	ACG	2	6	539383	539388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993548
13170	NC_017523	GAA	2	6	539405	539410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993548
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13172	NC_017523	ACC	3	9	539448	539456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993548
13173	NC_017523	CGG	2	6	539532	539537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13174	NC_017523	GC	3	6	539761	539766	0 %	0 %	50 %	50 %	385993549
13175	NC_017523	GCG	3	9	539795	539803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993549
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13178	NC_017523	CGCTGG	2	12	539823	539834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385993549
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13181	NC_017523	CGC	2	6	539944	539949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993549
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13193	NC_017523	CTT	2	6	540502	540507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13194	NC_017523	ATAGTC	2	12	540553	540564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13195	NC_017523	TTG	2	6	540567	540572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13196	NC_017523	GC	4	8	540669	540676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13197	NC_017523	TG	3	6	540705	540710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13198	NC_017523	ATGG	2	8	540772	540779	25 %	25 %	50 %	0 %	385993550
13199	NC_017523	CCG	2	6	540785	540790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993550
13200	NC_017523	TTG	2	6	540806	540811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993550
13201	NC_017523	AGT	2	6	540812	540817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993550
13202	NC_017523	GGGCCG	3	18	540818	540835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993550
13203	NC_017523	GCC	3	9	540842	540850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993550
13204	NC_017523	GTC	2	6	540859	540864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993550
13205	NC_017523	CGC	2	6	540880	540885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993550
13206	NC_017523	GCTG	2	8	540910	540917	0 %	25 %	50 %	25 %	385993550
13207	NC_017523	TGC	2	6	540961	540966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993550
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13209	NC_017523	CGG	2	6	541020	541025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993550
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13211	NC_017523	CGC	2	6	541057	541062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993550
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13215	NC_017523	TTC	2	6	541139	541144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993550
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13219	NC_017523	CCG	2	6	541277	541282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993550
13220	NC_017523	AAT	2	6	541325	541330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385993550
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13225	NC_017523	CTT	2	6	541496	541501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993550
13226	NC_017523	GCT	2	6	541525	541530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993550
13227	NC_017523	AC	3	6	541592	541597	50 %	0 %	0 %	50 %	385993550
13228	NC_017523	TGC	2	6	541599	541604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993550
13229	NC_017523	CTGG	2	8	541615	541622	0 %	25 %	50 %	25 %	385993550
13230	NC_017523	TGG	2	6	541641	541646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993550
13231	NC_017523	C	6	6	541721	541726	0 %	0 %	0 %	100 %	385993550
13232	NC_017523	GCC	2	6	541820	541825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993550
13233	NC_017523	GCG	2	6	541829	541834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993550
13234	NC_017523	CCGG	2	8	541844	541851	0 %	0 %	50 %	50 %	385993550
13235	NC_017523	CGG	2	6	541891	541896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993550
13236	NC_017523	CGCC	2	8	541950	541957	0 %	0 %	25 %	75 %	385993550
13237	NC_017523	CGC	2	6	541978	541983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993550
13238	NC_017523	GGC	2	6	542002	542007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993550
13239	NC_017523	TCA	2	6	542026	542031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993550
13240	NC_017523	CGA	2	6	542045	542050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993550
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13242	NC_017523	CGA	2	6	542077	542082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993550
13243	NC_017523	TCG	2	6	542085	542090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993550
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13479	NC_017523	ATC	2	6	551631	551636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13480	NC_017523	GGT	2	6	551649	551654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13481	NC_017523	CTGG	2	8	551675	551682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13482	NC_017523	GAC	2	6	551708	551713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13483	NC_017523	GTG	2	6	551733	551738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13484	NC_017523	TGG	2	6	551755	551760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_017523	GCG	2	6	551767	551772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13486	NC_017523	CGG	2	6	551773	551778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13487	NC_017523	TCC	2	6	551843	551848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13488	NC_017523	GTG	2	6	551850	551855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13489	NC_017523	CGG	2	6	551910	551915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993560
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