MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 109420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017522	TCG	2	6	726213	726218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990118
18002	NC_017522	CCG	2	6	726225	726230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990118
18003	NC_017522	GCCG	2	8	726283	726290	0 %	0 %	50 %	50 %	385990118
18004	NC_017522	ACTG	2	8	726304	726311	25 %	25 %	25 %	25 %	385990118
18005	NC_017522	GT	3	6	726328	726333	0 %	50 %	50 %	0 %	385990118
18006	NC_017522	GCA	2	6	726334	726339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990118
18007	NC_017522	TCGATG	2	12	726342	726353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385990118
18008	NC_017522	CAG	2	6	726476	726481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990118
18009	NC_017522	CAT	2	6	726509	726514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990118
18010	NC_017522	GCC	2	6	726518	726523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990118
18011	NC_017522	GAT	2	6	726535	726540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385990118
18012	NC_017522	TCG	2	6	726573	726578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990118
18013	NC_017522	ACC	2	6	726624	726629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385990118
18014	NC_017522	CGC	2	6	726782	726787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18015	NC_017522	TGA	2	6	726902	726907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_017522	CGG	2	6	726930	726935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_017522	GC	3	6	726951	726956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18018	NC_017522	ACG	2	6	727030	727035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_017522	CGG	2	6	727065	727070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_017522	GAC	2	6	727104	727109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18021	NC_017522	GGT	2	6	727137	727142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_017522	TGG	2	6	727144	727149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_017522	GC	3	6	727154	727159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18024	NC_017522	CGG	2	6	727291	727296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_017522	ACA	2	6	727400	727405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_017522	AG	3	6	727423	727428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_017522	CCG	2	6	727519	727524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18028	NC_017522	GAA	2	6	727549	727554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_017522	CCG	2	6	727604	727609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18030	NC_017522	GACT	2	8	727629	727636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18031	NC_017522	AGGT	2	8	727637	727644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_017522	CGCCGT	2	12	727737	727748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385990119
18033	NC_017522	ACG	3	9	727754	727762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990119
18034	NC_017522	GAG	2	6	727774	727779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385990119
18035	NC_017522	GCC	2	6	727786	727791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990119
18036	NC_017522	TG	3	6	727834	727839	0 %	50 %	50 %	0 %	385990119
18037	NC_017522	GGC	2	6	727857	727862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990119
18038	NC_017522	TTC	2	6	727864	727869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385990119
18039	NC_017522	GGCG	2	8	727947	727954	0 %	0 %	75 %	25 %	385990119
18040	NC_017522	ATC	2	6	728011	728016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990119
18041	NC_017522	GAC	2	6	728243	728248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990120
18042	NC_017522	GTC	2	6	728261	728266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990120
18043	NC_017522	CGG	2	6	728311	728316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990120
18044	NC_017522	GGT	2	6	728383	728388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990120
18045	NC_017522	CTA	2	6	728487	728492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990120
18046	NC_017522	CGG	2	6	728494	728499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990120
18047	NC_017522	AAG	2	6	728501	728506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385990120
18048	NC_017522	CGGG	2	8	728512	728519	0 %	0 %	75 %	25 %	385990120
18049	NC_017522	GAT	2	6	728575	728580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385990121
18050	NC_017522	ACT	2	6	728595	728600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990121
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18052	NC_017522	GCC	2	6	728681	728686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990121
18053	NC_017522	ACG	2	6	728697	728702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990121
18054	NC_017522	CTT	2	6	728758	728763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385990121
18055	NC_017522	TCG	2	6	728907	728912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990121
18056	NC_017522	ACG	3	9	728934	728942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990121
18057	NC_017522	CAG	2	6	728981	728986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990121
18058	NC_017522	TCA	2	6	729033	729038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990121
18059	NC_017522	GC	3	6	729107	729112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18060	NC_017522	GTC	2	6	729138	729143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_017522	GC	3	6	729176	729181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18062	NC_017522	CTGGT	2	10	729220	729229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18063	NC_017522	TGCC	2	8	729232	729239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18064	NC_017522	AGC	2	6	729270	729275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_017522	CTG	2	6	729318	729323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_017522	CGA	3	9	729336	729344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_017522	TGG	2	6	729389	729394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_017522	CCA	2	6	729410	729415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18069	NC_017522	CGA	2	6	729466	729471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990122
18070	NC_017522	CGA	2	6	729484	729489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990122
18071	NC_017522	GGT	2	6	729562	729567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990122
18072	NC_017522	GCGGTC	2	12	729592	729603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385990122
18073	NC_017522	GACGTC	2	12	729626	729637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385990122
18074	NC_017522	ACC	2	6	729692	729697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385990122
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18076	NC_017522	CGGT	2	8	729749	729756	0 %	25 %	50 %	25 %	385990122
18077	NC_017522	CAAA	2	8	729832	729839	75 %	0 %	0 %	25 %	385990122
18078	NC_017522	GGT	2	6	729856	729861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990122
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18080	NC_017522	AG	3	6	729961	729966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18081	NC_017522	GCC	2	6	730080	730085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990123
18082	NC_017522	GCA	2	6	730105	730110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990123
18083	NC_017522	CGT	2	6	730127	730132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990123
18084	NC_017522	TGC	2	6	730288	730293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990123
18085	NC_017522	CGA	2	6	730325	730330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990123
18086	NC_017522	CGA	2	6	730409	730414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990123
18087	NC_017522	GTG	2	6	730416	730421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990123
18088	NC_017522	CGA	2	6	730444	730449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990123
18089	NC_017522	GCC	3	9	730482	730490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990123
18090	NC_017522	GGCG	2	8	730493	730500	0 %	0 %	75 %	25 %	385990123
18091	NC_017522	GTC	2	6	730515	730520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990123
18092	NC_017522	CAG	2	6	730611	730616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990123
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18094	NC_017522	CA	3	6	730710	730715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18095	NC_017522	AAGG	2	8	730725	730732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_017522	GAA	3	9	730754	730762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385990124
18097	NC_017522	GGCCA	2	10	730797	730806	20 %	0 %	40 %	40 %	385990124
18098	NC_017522	CAT	2	6	730853	730858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990124
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18102	NC_017522	GCT	3	9	730982	730990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990124
18103	NC_017522	CGG	2	6	731017	731022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990124
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18105	NC_017522	ACG	2	6	731107	731112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990124
18106	NC_017522	ATC	2	6	731130	731135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990124
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18108	NC_017522	GGC	2	6	731315	731320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990125
18109	NC_017522	TCG	2	6	731340	731345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990125
18110	NC_017522	TGC	2	6	731495	731500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990125
18111	NC_017522	TGT	2	6	731519	731524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385990125
18112	NC_017522	GGCT	2	8	731559	731566	0 %	25 %	50 %	25 %	385990125
18113	NC_017522	GTCG	2	8	731610	731617	0 %	25 %	50 %	25 %	385990125
18114	NC_017522	CG	3	6	731638	731643	0 %	0 %	50 %	50 %	385990125
18115	NC_017522	CCG	2	6	731677	731682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990125
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18117	NC_017522	CGT	2	6	731773	731778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990125
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18121	NC_017522	CGA	2	6	731819	731824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990125
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18229	NC_017522	GGACC	2	10	736607	736616	20 %	0 %	40 %	40 %	385990130
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18472	NC_017522	CAT	2	6	745103	745108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385990136
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