MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 109420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14622	NC_017522	CGT	2	6	601714	601719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990009
14623	NC_017522	GCGG	2	8	601731	601738	0 %	0 %	75 %	25 %	385990009
14624	NC_017522	GAC	2	6	601804	601809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990009
14625	NC_017522	CCGGG	2	10	601838	601847	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14626	NC_017522	GCG	2	6	601887	601892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_017522	GGT	2	6	601961	601966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_017522	CTG	3	9	601995	602003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14629	NC_017522	CGA	2	6	602005	602010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14630	NC_017522	GGT	2	6	602027	602032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14631	NC_017522	GCG	2	6	602048	602053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14632	NC_017522	CG	4	8	602052	602059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14633	NC_017522	CGG	2	6	602105	602110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14634	NC_017522	GCT	3	9	602146	602154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14635	NC_017522	GTA	2	6	602188	602193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14636	NC_017522	TGA	2	6	602255	602260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385990010
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14638	NC_017522	ATCG	2	8	602310	602317	25 %	25 %	25 %	25 %	385990010
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14642	NC_017522	GGT	2	6	602395	602400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990010
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14655	NC_017522	GT	3	6	602889	602894	0 %	50 %	50 %	0 %	385990010
14656	NC_017522	AGC	2	6	602917	602922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990010
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14659	NC_017522	GGCTG	2	10	602965	602974	0 %	20 %	60 %	20 %	385990010
14660	NC_017522	GC	3	6	602984	602989	0 %	0 %	50 %	50 %	385990010
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14693	NC_017522	GCC	2	6	604302	604307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14694	NC_017522	AAG	2	6	604322	604327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14695	NC_017522	TGA	2	6	604414	604419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14698	NC_017522	CAG	2	6	604472	604477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14862	NC_017522	GCT	2	6	610970	610975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990019
14863	NC_017522	GAC	2	6	611041	611046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990019
14864	NC_017522	CGC	2	6	611063	611068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990019
14865	NC_017522	TCC	2	6	611095	611100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385990019
14866	NC_017522	CAG	2	6	611167	611172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990019
14867	NC_017522	CGC	2	6	611199	611204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990019
14868	NC_017522	GTC	2	6	611239	611244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990019
14869	NC_017522	GCCCGG	2	12	611247	611258	0 %	0 %	50 %	50 %	385990019
14870	NC_017522	GC	3	6	611274	611279	0 %	0 %	50 %	50 %	385990019
14871	NC_017522	CCG	2	6	611285	611290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990019
14872	NC_017522	CGA	2	6	611313	611318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990019
14873	NC_017522	TGA	2	6	611321	611326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385990019
14874	NC_017522	TGGT	2	8	611349	611356	0 %	50 %	50 %	0 %	385990019
14875	NC_017522	TGA	2	6	611402	611407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385990019
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14880	NC_017522	GCC	2	6	611521	611526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990019
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14882	NC_017522	GAC	2	6	611551	611556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990019
14883	NC_017522	GGCC	2	8	611595	611602	0 %	0 %	50 %	50 %	385990019
14884	NC_017522	GGCA	2	8	611652	611659	25 %	0 %	50 %	25 %	385990019
14885	NC_017522	GT	3	6	611669	611674	0 %	50 %	50 %	0 %	385990019
14886	NC_017522	CG	3	6	611709	611714	0 %	0 %	50 %	50 %	385990019
14887	NC_017522	GCCA	2	8	611716	611723	25 %	0 %	25 %	50 %	385990019
14888	NC_017522	CATGC	2	10	611749	611758	20 %	20 %	20 %	40 %	385990019
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14891	NC_017522	GCG	2	6	611827	611832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990019
14892	NC_017522	CGC	2	6	611859	611864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990019
14893	NC_017522	GCG	2	6	611872	611877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990019
14894	NC_017522	GTG	2	6	611922	611927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990020
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14896	NC_017522	CGGCG	2	10	611999	612008	0 %	0 %	60 %	40 %	385990020
14897	NC_017522	GCC	3	9	612012	612020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990020
14898	NC_017522	TCG	2	6	612049	612054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990020
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14902	NC_017522	CTT	2	6	612161	612166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385990020
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14904	NC_017522	GTG	2	6	612218	612223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990020
14905	NC_017522	CGT	2	6	612247	612252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990020
14906	NC_017522	GAC	2	6	612287	612292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990020
14907	NC_017522	GGT	2	6	612332	612337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990020
14908	NC_017522	CGT	2	6	612442	612447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990020
14909	NC_017522	ACG	2	6	612454	612459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990020
14910	NC_017522	GTG	2	6	612477	612482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385990020
14911	NC_017522	CGG	2	6	612493	612498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990020
14912	NC_017522	CGA	2	6	612516	612521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14913	NC_017522	GCAGA	2	10	612523	612532	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14914	NC_017522	GCG	2	6	612546	612551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14915	NC_017522	CGC	2	6	612577	612582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990021
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14917	NC_017522	GGC	2	6	612638	612643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990021
14918	NC_017522	CGG	2	6	612664	612669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990021
14919	NC_017522	TCT	2	6	612681	612686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385990021
14920	NC_017522	GCC	2	6	612708	612713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990021
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14922	NC_017522	GT	3	6	612756	612761	0 %	50 %	50 %	0 %	385990021
14923	NC_017522	GAC	2	6	612767	612772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990021
14924	NC_017522	GTC	4	12	612785	612796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990021
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14926	NC_017522	ACA	2	6	612909	612914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385990021
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14932	NC_017522	GAG	3	9	613130	613138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385990021
14933	NC_017522	GTCGG	2	10	613141	613150	0 %	20 %	60 %	20 %	385990021
14934	NC_017522	CTG	2	6	613204	613209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990022
14935	NC_017522	CTG	2	6	613228	613233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990022
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14937	NC_017522	TG	3	6	613261	613266	0 %	50 %	50 %	0 %	385990022
14938	NC_017522	GGC	2	6	613299	613304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990022
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14941	NC_017522	GCCG	2	8	613329	613336	0 %	0 %	50 %	50 %	385990022
14942	NC_017522	CGT	2	6	613338	613343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990022
14943	NC_017522	CGG	2	6	613382	613387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990022
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14951	NC_017522	GCTG	2	8	613799	613806	0 %	25 %	50 %	25 %	385990022
14952	NC_017522	CGG	2	6	613836	613841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990022
14953	NC_017522	GCT	2	6	613845	613850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990022
14954	NC_017522	CGGT	2	8	613856	613863	0 %	25 %	50 %	25 %	385990022
14955	NC_017522	ACG	2	6	613889	613894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990022
14956	NC_017522	TCGTG	2	10	613895	613904	0 %	40 %	40 %	20 %	385990022
14957	NC_017522	GC	3	6	613971	613976	0 %	0 %	50 %	50 %	385990023
14958	NC_017522	TGC	2	6	614017	614022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14959	NC_017522	GCTG	2	8	614036	614043	0 %	25 %	50 %	25 %	385990023
14960	NC_017522	CTG	2	6	614058	614063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14961	NC_017522	CGC	2	6	614081	614086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990023
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14963	NC_017522	TGC	2	6	614191	614196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14964	NC_017522	TCG	2	6	614209	614214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14965	NC_017522	CGC	2	6	614270	614275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990023
14966	NC_017522	CACGCC	2	12	614304	614315	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385990023
14967	NC_017522	CGC	2	6	614333	614338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990023
14968	NC_017522	GCC	2	6	614343	614348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990023
14969	NC_017522	GCA	2	6	614377	614382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14970	NC_017522	CAA	2	6	614391	614396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385990023
14971	NC_017522	CCG	2	6	614416	614421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990023
14972	NC_017522	GCT	2	6	614468	614473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14973	NC_017522	CTG	2	6	614478	614483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14974	NC_017522	CGTGAT	2	12	614525	614536	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385990023
14975	NC_017522	CGG	2	6	614543	614548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990023
14976	NC_017522	GCCG	2	8	614570	614577	0 %	0 %	50 %	50 %	385990023
14977	NC_017522	CGT	2	6	614617	614622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14978	NC_017522	TG	3	6	614634	614639	0 %	50 %	50 %	0 %	385990023
14979	NC_017522	CAA	2	6	614645	614650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385990023
14980	NC_017522	CGC	2	6	614693	614698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385990023
14981	NC_017522	CTG	2	6	614728	614733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14982	NC_017522	GGC	2	6	614752	614757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990023
14983	NC_017522	CGG	2	6	614792	614797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990023
14984	NC_017522	CTG	2	6	614910	614915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14985	NC_017522	CGG	2	6	614917	614922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990023
14986	NC_017522	CGT	2	6	614924	614929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14987	NC_017522	GCCG	2	8	614942	614949	0 %	0 %	50 %	50 %	385990023
14988	NC_017522	CGA	2	6	614966	614971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14989	NC_017522	CTG	2	6	615003	615008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
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14991	NC_017522	CTG	2	6	615036	615041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14992	NC_017522	TCG	2	6	615042	615047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385990023
14993	NC_017522	CGG	2	6	615070	615075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990023
14994	NC_017522	GCGG	2	8	615115	615122	0 %	0 %	75 %	25 %	385990023
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14998	NC_017522	CGG	2	6	615232	615237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385990023
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15000	NC_017522	GAT	2	6	615335	615340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385990023

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