MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 109420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017522	GGC	2	6	536421	536426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989950
13002	NC_017522	GAT	2	6	536469	536474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989950
13003	NC_017522	GGT	2	6	536535	536540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989950
13004	NC_017522	CG	3	6	536582	536587	0 %	0 %	50 %	50 %	385989950
13005	NC_017522	CAG	2	6	536616	536621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989950
13006	NC_017522	CAA	2	6	536655	536660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989950
13007	NC_017522	ATA	2	6	536662	536667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385989950
13008	NC_017522	CGG	2	6	536775	536780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989950
13009	NC_017522	CGA	2	6	536795	536800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989950
13010	NC_017522	TGC	2	6	536801	536806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989950
13011	NC_017522	GCG	2	6	536834	536839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989950
13012	NC_017522	GGC	2	6	536874	536879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989950
13013	NC_017522	CGT	2	6	536885	536890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989950
13014	NC_017522	CGG	2	6	536906	536911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989950
13015	NC_017522	C	6	6	536921	536926	0 %	0 %	0 %	100 %	385989950
13016	NC_017522	CTT	2	6	536952	536957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989950
13017	NC_017522	CGT	2	6	536984	536989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989950
13018	NC_017522	GGTT	2	8	537016	537023	0 %	50 %	50 %	0 %	385989950
13019	NC_017522	TAT	2	6	537030	537035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385989950
13020	NC_017522	CCTT	2	8	537061	537068	0 %	50 %	0 %	50 %	385989950
13021	NC_017522	ACG	2	6	537101	537106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989950
13022	NC_017522	ACG	2	6	537181	537186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989950
13023	NC_017522	GCCA	3	12	537193	537204	25 %	0 %	25 %	50 %	385989950
13024	NC_017522	GAT	2	6	537207	537212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989950
13025	NC_017522	ATC	2	6	537232	537237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989950
13026	NC_017522	AGTA	2	8	537319	537326	50 %	25 %	25 %	0 %	385989951
13027	NC_017522	CCG	2	6	537433	537438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989951
13028	NC_017522	CGT	2	6	537439	537444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989951
13029	NC_017522	G	6	6	537539	537544	0 %	0 %	100 %	0 %	385989951
13030	NC_017522	ACG	2	6	537613	537618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989951
13031	NC_017522	GAA	2	6	537635	537640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989951
13032	NC_017522	CGA	2	6	537670	537675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989951
13033	NC_017522	ACC	3	9	537678	537686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989951
13034	NC_017522	CGG	2	6	537762	537767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_017522	GC	3	6	537991	537996	0 %	0 %	50 %	50 %	385989952
13036	NC_017522	GCG	3	9	538025	538033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989952
13037	NC_017522	TGG	2	6	538035	538040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989952
13038	NC_017522	CG	3	6	538045	538050	0 %	0 %	50 %	50 %	385989952
13039	NC_017522	CGCTGG	2	12	538053	538064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385989952
13040	NC_017522	ACT	2	6	538119	538124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989952
13041	NC_017522	TGC	3	9	538161	538169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989952
13042	NC_017522	CGC	2	6	538174	538179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989952
13043	NC_017522	GGT	2	6	538194	538199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989952
13044	NC_017522	AGC	2	6	538215	538220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989952
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13046	NC_017522	AGG	2	6	538335	538340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989952
13047	NC_017522	TCG	2	6	538398	538403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989952
13048	NC_017522	CTG	2	6	538457	538462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989952
13049	NC_017522	GGC	2	6	538477	538482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989952
13050	NC_017522	CCG	2	6	538505	538510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989952
13051	NC_017522	GAG	2	6	538535	538540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989952
13052	NC_017522	TGC	2	6	538576	538581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989952
13053	NC_017522	GGC	2	6	538706	538711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_017522	CTT	2	6	538732	538737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_017522	ATAGTC	2	12	538783	538794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13056	NC_017522	TTG	2	6	538797	538802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017522	GC	4	8	538899	538906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_017522	TG	3	6	538935	538940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_017522	ATGG	2	8	539002	539009	25 %	25 %	50 %	0 %	385989953
13060	NC_017522	CCG	2	6	539015	539020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989953
13061	NC_017522	TTG	2	6	539036	539041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989953
13062	NC_017522	AGT	2	6	539042	539047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989953
13063	NC_017522	GGGCCG	3	18	539048	539065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989953
13064	NC_017522	GCC	3	9	539072	539080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989953
13065	NC_017522	GTC	2	6	539089	539094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989953
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13067	NC_017522	GCTG	2	8	539140	539147	0 %	25 %	50 %	25 %	385989953
13068	NC_017522	TGC	2	6	539191	539196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989953
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13087	NC_017522	GCT	2	6	539755	539760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989953
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13093	NC_017522	GCC	2	6	540050	540055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989953
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13103	NC_017522	CGA	2	6	540307	540312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989953
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13105	NC_017522	CCGGC	2	10	540330	540339	0 %	0 %	40 %	60 %	385989953
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13108	NC_017522	GCAA	2	8	540413	540420	50 %	0 %	25 %	25 %	385989953
13109	NC_017522	GCCG	2	8	540436	540443	0 %	0 %	50 %	50 %	385989953
13110	NC_017522	CGA	2	6	540460	540465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989953
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13117	NC_017522	GGT	2	6	540953	540958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017522	GTC	2	6	541016	541021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13120	NC_017522	CGG	2	6	541083	541088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_017522	TGG	2	6	541118	541123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_017522	ACA	2	6	541124	541129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_017522	CGA	2	6	541251	541256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989955
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13151	NC_017522	CGGTC	2	10	542306	542315	0 %	20 %	40 %	40 %	385989956
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13241	NC_017522	CGA	2	6	545914	545919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989958
13242	NC_017522	GTG	2	6	545957	545962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989958
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13342	NC_017522	CTGG	2	8	549904	549911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13343	NC_017522	GAC	2	6	549937	549942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13345	NC_017522	TGG	2	6	549984	549989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13346	NC_017522	GCG	2	6	549996	550001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13347	NC_017522	CGG	2	6	550002	550007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13348	NC_017522	TCC	2	6	550072	550077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13349	NC_017522	GTG	2	6	550079	550084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13350	NC_017522	CGG	2	6	550139	550144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989962
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13352	NC_017522	CGT	2	6	550177	550182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989962
13353	NC_017522	AGC	2	6	550299	550304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989962
13354	NC_017522	GGCG	2	8	550312	550319	0 %	0 %	75 %	25 %	385989962
13355	NC_017522	GC	3	6	550406	550411	0 %	0 %	50 %	50 %	385989962
13356	NC_017522	GAT	2	6	550420	550425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989962
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13359	NC_017522	GTG	2	6	550566	550571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989962
13360	NC_017522	CCA	2	6	550618	550623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989962
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13362	NC_017522	GTT	2	6	550698	550703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989963
13363	NC_017522	TGC	2	6	550725	550730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989963
13364	NC_017522	TCG	2	6	550736	550741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989963
13365	NC_017522	GCCC	2	8	550751	550758	0 %	0 %	25 %	75 %	385989963
13366	NC_017522	CAGCC	2	10	550901	550910	20 %	0 %	20 %	60 %	385989963
13367	NC_017522	GGC	2	6	550945	550950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989963
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13371	NC_017522	CGT	2	6	551247	551252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989963
13372	NC_017522	CGT	2	6	551271	551276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989963
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13375	NC_017522	CTG	2	6	551440	551445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989963
13376	NC_017522	CTG	2	6	551462	551467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989963
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13389	NC_017522	TGC	2	6	552171	552176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13390	NC_017522	GAG	2	6	552246	552251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13391	NC_017522	A	6	6	552281	552286	100 %	0 %	0 %	0 %	385989964
13392	NC_017522	TGCCCG	2	12	552291	552302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385989964
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13394	NC_017522	CGGCTG	2	12	552368	552379	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385989964
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13399	NC_017522	GGT	2	6	552552	552557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989964
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13422	NC_017522	CTGG	2	8	553772	553779	0 %	25 %	50 %	25 %	385989965
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13447	NC_017522	GAG	2	6	554695	554700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13448	NC_017522	GCGAT	2	10	554710	554719	20 %	20 %	40 %	20 %	385989966
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13465	NC_017522	GAAA	2	8	555532	555539	75 %	0 %	25 %	0 %	385989966
13466	NC_017522	GTA	2	6	555659	555664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13467	NC_017522	CGGC	2	8	555691	555698	0 %	0 %	50 %	50 %	385989967
13468	NC_017522	ACG	2	6	555742	555747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989967
13469	NC_017522	CGA	2	6	555752	555757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989967
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13473	NC_017522	TGC	3	9	556186	556194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989967
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13475	NC_017522	GGC	2	6	556343	556348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989967
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13477	NC_017522	AGC	2	6	556381	556386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989967
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13479	NC_017522	GAG	2	6	556461	556466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989967
13480	NC_017522	ACA	2	6	556471	556476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989967
13481	NC_017522	CTT	2	6	556508	556513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989967
13482	NC_017522	CGC	2	6	556565	556570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13483	NC_017522	CCGG	2	8	556626	556633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13484	NC_017522	GC	3	6	556644	556649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13485	NC_017522	TTG	2	6	556783	556788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989968
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13491	NC_017522	GAA	2	6	557070	557075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989968
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