MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 109420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017522	CGC	2	6	409166	409171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989851
10003	NC_017522	GCT	2	6	409181	409186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989851
10004	NC_017522	CGG	2	6	409208	409213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989851
10005	NC_017522	CAT	2	6	409232	409237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989851
10006	NC_017522	CG	3	6	409251	409256	0 %	0 %	50 %	50 %	385989851
10007	NC_017522	ACG	2	6	409300	409305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989851
10008	NC_017522	GGT	2	6	409355	409360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989851
10009	NC_017522	CTT	2	6	409374	409379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989851
10010	NC_017522	CG	3	6	409388	409393	0 %	0 %	50 %	50 %	385989851
10011	NC_017522	CTG	2	6	409467	409472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989851
10012	NC_017522	GGC	2	6	409586	409591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989851
10013	NC_017522	GCC	2	6	409617	409622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989851
10014	NC_017522	CTG	2	6	409626	409631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989851
10015	NC_017522	TGG	2	6	409645	409650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989851
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10017	NC_017522	GAA	2	6	409815	409820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989851
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10021	NC_017522	GCC	2	6	409917	409922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989851
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10028	NC_017522	TGG	2	6	410141	410146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_017522	CAACG	2	10	410150	410159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10030	NC_017522	GTT	2	6	410296	410301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_017522	GGT	2	6	410320	410325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_017522	GCC	2	6	410419	410424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_017522	GCCG	2	8	410587	410594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_017522	GTC	2	6	410615	410620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10037	NC_017522	TGG	2	6	410727	410732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10040	NC_017522	CG	3	6	410846	410851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_017522	GTT	2	6	410913	410918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989852
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10050	NC_017522	CCG	2	6	411377	411382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989853
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10062	NC_017522	ACG	2	6	411922	411927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989853
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10091	NC_017522	CG	3	6	412860	412865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_017522	ATCG	2	8	412948	412955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_017522	TGT	2	6	412969	412974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_017522	GCCA	2	8	413039	413046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_017522	GTCC	2	8	413065	413072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_017522	ACGG	2	8	413151	413158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10097	NC_017522	GC	4	8	413175	413182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10101	NC_017522	TCG	2	6	413266	413271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_017522	GC	3	6	413286	413291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_017522	TGT	2	6	413347	413352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989854
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10112	NC_017522	GC	3	6	413906	413911	0 %	0 %	50 %	50 %	385989854
10113	NC_017522	TTC	2	6	413975	413980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989854
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10116	NC_017522	TGC	2	6	414129	414134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989854
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10118	NC_017522	TGACCA	2	12	414152	414163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385989854
10119	NC_017522	GAC	2	6	414190	414195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989855
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10121	NC_017522	AC	3	6	414320	414325	50 %	0 %	0 %	50 %	385989855
10122	NC_017522	CATG	2	8	414387	414394	25 %	25 %	25 %	25 %	385989855
10123	NC_017522	AGC	2	6	414401	414406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989855
10124	NC_017522	CCT	2	6	414578	414583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385989855
10125	NC_017522	CCT	2	6	414630	414635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385989855
10126	NC_017522	ACGGT	2	10	414689	414698	20 %	20 %	40 %	20 %	385989855
10127	NC_017522	GA	3	6	414734	414739	50 %	0 %	50 %	0 %	385989855
10128	NC_017522	CGA	2	6	414833	414838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_017522	TGA	2	6	414934	414939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_017522	TCC	2	6	414940	414945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_017522	GC	3	6	414955	414960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10132	NC_017522	CTG	2	6	414990	414995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_017522	CGG	2	6	415093	415098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989856
10134	NC_017522	TCA	2	6	415102	415107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989856
10135	NC_017522	GGTG	2	8	415195	415202	0 %	25 %	75 %	0 %	385989856
10136	NC_017522	GAG	2	6	415284	415289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989856
10137	NC_017522	CGA	2	6	415307	415312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989856
10138	NC_017522	GGC	2	6	415328	415333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989856
10139	NC_017522	CCT	2	6	415348	415353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385989856
10140	NC_017522	GCT	2	6	415391	415396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989856
10141	NC_017522	CCG	2	6	415620	415625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10142	NC_017522	TCA	2	6	415652	415657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10143	NC_017522	AAG	2	6	415668	415673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_017522	AGG	2	6	415686	415691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_017522	ACC	2	6	415729	415734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989857
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10147	NC_017522	GTC	3	9	415771	415779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989857
10148	NC_017522	ACC	2	6	415801	415806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989857
10149	NC_017522	TGA	2	6	415985	415990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989857
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10152	NC_017522	TGC	2	6	416120	416125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989857
10153	NC_017522	AGC	2	6	416186	416191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989857
10154	NC_017522	GTG	2	6	416213	416218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989857
10155	NC_017522	CTG	2	6	416236	416241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989857
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10158	NC_017522	CGA	2	6	416301	416306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989857
10159	NC_017522	GTC	2	6	416320	416325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989857
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10161	NC_017522	GCC	2	6	416407	416412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989857
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10166	NC_017522	CTG	2	6	416551	416556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989857
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10169	NC_017522	CGG	2	6	416688	416693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989857
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10194	NC_017522	GGGA	2	8	417692	417699	25 %	0 %	75 %	0 %	385989858
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10230	NC_017522	TCACCG	2	12	419202	419213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385989859
10231	NC_017522	GCG	2	6	419364	419369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989859
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10236	NC_017522	GCAT	2	8	419570	419577	25 %	25 %	25 %	25 %	385989860
10237	NC_017522	GGCG	2	8	419638	419645	0 %	0 %	75 %	25 %	385989860
10238	NC_017522	TGC	2	6	419672	419677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989860
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10243	NC_017522	GTC	2	6	419860	419865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989860
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10246	NC_017522	GAGC	2	8	419933	419940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10247	NC_017522	GC	3	6	419939	419944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10249	NC_017522	GC	3	6	419990	419995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10250	NC_017522	GAGC	2	8	420035	420042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10251	NC_017522	GC	3	6	420041	420046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10475	NC_017522	GCGCCG	2	12	431663	431674	0 %	0 %	50 %	50 %	385989864
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10477	NC_017522	TCG	2	6	431727	431732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10478	NC_017522	GTG	2	6	431769	431774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989864
10479	NC_017522	CCG	2	6	431845	431850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989864
10480	NC_017522	CGA	2	6	431858	431863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10481	NC_017522	CAG	2	6	431921	431926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10482	NC_017522	GCA	2	6	431949	431954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10483	NC_017522	AGC	2	6	431961	431966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10484	NC_017522	GCGAT	2	10	431976	431985	20 %	20 %	40 %	20 %	385989864
10485	NC_017522	CAG	2	6	432008	432013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10486	NC_017522	ACC	2	6	432021	432026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989864
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10489	NC_017522	TGC	2	6	432211	432216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10490	NC_017522	CAG	2	6	432263	432268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10491	NC_017522	CGG	2	6	432277	432282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989864
10492	NC_017522	CGC	2	6	432307	432312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989864
10493	NC_017522	GATC	2	8	432352	432359	25 %	25 %	25 %	25 %	385989864
10494	NC_017522	GAC	2	6	432449	432454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10495	NC_017522	GTT	2	6	432467	432472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989864
10496	NC_017522	C	6	6	432474	432479	0 %	0 %	0 %	100 %	385989864
10497	NC_017522	CAC	2	6	432488	432493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989864
10498	NC_017522	TCG	2	6	432540	432545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989864
10499	NC_017522	CCTAC	2	10	432638	432647	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10500	NC_017522	CAG	2	6	432649	432654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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