MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_017026	GCG	2	6	764738	764743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_017026	CCG	2	6	764801	764806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19003	NC_017026	CGG	2	6	764833	764838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_017026	CAA	2	6	764890	764895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_017026	GATC	2	8	764911	764918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19006	NC_017026	ATC	2	6	764933	764938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19007	NC_017026	CAA	2	6	764941	764946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_017026	TGC	2	6	764958	764963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19009	NC_017026	GCC	2	6	764994	764999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19010	NC_017026	CGGC	2	8	765001	765008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19011	NC_017026	CCGGG	2	10	765015	765024	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19012	NC_017026	ACT	2	6	765108	765113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_017026	CGGT	2	8	765119	765126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19014	NC_017026	TGA	2	6	765207	765212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_017026	TGG	2	6	765219	765224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_017026	TGG	2	6	765264	765269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_017026	AGCGCC	2	12	765270	765281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19018	NC_017026	CACC	2	8	765342	765349	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19019	NC_017026	TGG	2	6	765387	765392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_017026	AAGGC	2	10	765393	765402	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19021	NC_017026	GT	3	6	765422	765427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_017026	TGT	2	6	765516	765521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_017026	CAA	2	6	765526	765531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19024	NC_017026	TAC	2	6	765596	765601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19025	NC_017026	ACC	2	6	765605	765610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19026	NC_017026	CGGC	2	8	765681	765688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19027	NC_017026	GGC	2	6	765701	765706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_017026	GCC	2	6	765764	765769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19029	NC_017026	GCT	2	6	765866	765871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_017026	CAA	2	6	765893	765898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19031	NC_017026	AAG	2	6	765909	765914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_017026	GCC	2	6	765921	765926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19033	NC_017026	ATC	2	6	765927	765932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19035	NC_017026	GCG	2	6	766021	766026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_017026	GCC	2	6	766055	766060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19037	NC_017026	AAG	2	6	766065	766070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_017026	GAG	2	6	766089	766094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_017026	CG	3	6	766095	766100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19041	NC_017026	TGG	2	6	766163	766168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19042	NC_017026	GGAA	2	8	766175	766182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_017026	CGA	2	6	766188	766193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19044	NC_017026	GGTC	2	8	766194	766201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19045	NC_017026	CGA	2	6	766224	766229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19049	NC_017026	TCA	2	6	766391	766396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19050	NC_017026	CCG	2	6	766442	766447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19051	NC_017026	TGG	2	6	766472	766477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_017026	TCG	3	9	766532	766540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_017026	CG	3	6	766605	766610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19054	NC_017026	CGA	2	6	766632	766637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_017026	TCG	2	6	766652	766657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_017026	GCT	2	6	766702	766707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_017026	CCA	2	6	766748	766753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19058	NC_017026	GCC	2	6	766837	766842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19059	NC_017026	CCA	2	6	766887	766892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19060	NC_017026	GGT	2	6	766918	766923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_017026	CCGG	2	8	766991	766998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19062	NC_017026	GAC	2	6	767047	767052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19067	NC_017026	GT	3	6	767279	767284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_017026	TGC	2	6	767324	767329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19069	NC_017026	CAT	2	6	767340	767345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19071	NC_017026	CCG	2	6	767412	767417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19074	NC_017026	CGG	2	6	767507	767512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19075	NC_017026	CGT	2	6	767513	767518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19081	NC_017026	CGT	2	6	767699	767704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19085	NC_017026	GCGAT	2	10	767833	767842	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19086	NC_017026	GTG	2	6	767859	767864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19091	NC_017026	CTGC	3	12	767987	767998	0 %	25 %	25 %	50 %	383306573
19092	NC_017026	CGT	2	6	768007	768012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306573
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19099	NC_017026	GTG	2	6	768229	768234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306574
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19101	NC_017026	CGT	2	6	768345	768350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306574
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19108	NC_017026	CGG	2	6	768519	768524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306574
19109	NC_017026	GC	3	6	768525	768530	0 %	0 %	50 %	50 %	383306574
19110	NC_017026	CAGCT	2	10	768539	768548	20 %	20 %	20 %	40 %	383306574
19111	NC_017026	CGGC	2	8	768562	768569	0 %	0 %	50 %	50 %	383306574
19112	NC_017026	AAC	2	6	768656	768661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306574
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19120	NC_017026	GCG	2	6	769090	769095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306574
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19122	NC_017026	CGC	2	6	769119	769124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306574
19123	NC_017026	CGCTC	2	10	769189	769198	0 %	20 %	20 %	60 %	383306574
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19231	NC_017026	ATC	2	6	773706	773711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19232	NC_017026	TGG	2	6	773740	773745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19238	NC_017026	ATGC	2	8	773992	773999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19239	NC_017026	GGT	2	6	774012	774017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19241	NC_017026	CGC	3	9	774081	774089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19242	NC_017026	G	6	6	774125	774130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19243	NC_017026	CGG	3	9	774134	774142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19244	NC_017026	GCT	2	6	774185	774190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19245	NC_017026	GC	3	6	774214	774219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19246	NC_017026	GCC	2	6	774222	774227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19247	NC_017026	CGA	2	6	774269	774274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19248	NC_017026	TGG	2	6	774289	774294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19249	NC_017026	CGC	2	6	774302	774307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19250	NC_017026	TCAA	2	8	774316	774323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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19496	NC_017026	GTT	2	6	784908	784913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19497	NC_017026	ACT	2	6	784987	784992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19498	NC_017026	ATC	2	6	785043	785048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19499	NC_017026	GAGT	2	8	785064	785071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_017026	CG	3	6	785079	785084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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