MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017026	GCT	2	6	650040	650045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306468
16002	NC_017026	CGC	2	6	650119	650124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306469
16003	NC_017026	TGACC	2	10	650182	650191	20 %	20 %	20 %	40 %	383306469
16004	NC_017026	GGC	2	6	650226	650231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306469
16005	NC_017026	TCGG	2	8	650239	650246	0 %	25 %	50 %	25 %	383306469
16006	NC_017026	CCG	2	6	650295	650300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306469
16007	NC_017026	GTG	2	6	650332	650337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306469
16008	NC_017026	TG	3	6	650336	650341	0 %	50 %	50 %	0 %	383306469
16009	NC_017026	TCGG	2	8	650354	650361	0 %	25 %	50 %	25 %	383306469
16010	NC_017026	GCG	2	6	650369	650374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306469
16011	NC_017026	GC	3	6	650381	650386	0 %	0 %	50 %	50 %	383306469
16012	NC_017026	GAC	2	6	650432	650437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306469
16013	NC_017026	GCG	2	6	650492	650497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306469
16014	NC_017026	CGGG	2	8	650526	650533	0 %	0 %	75 %	25 %	383306469
16015	NC_017026	CTA	2	6	650537	650542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306469
16016	NC_017026	CCA	2	6	650562	650567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306469
16017	NC_017026	GTT	2	6	650572	650577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306469
16018	NC_017026	GCGG	2	8	650626	650633	0 %	0 %	75 %	25 %	383306469
16019	NC_017026	GGT	2	6	650727	650732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306469
16020	NC_017026	CGG	2	6	650758	650763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306469
16021	NC_017026	CAAA	2	8	650797	650804	75 %	0 %	0 %	25 %	383306469
16022	NC_017026	AGT	2	6	650873	650878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_017026	GATC	2	8	650879	650886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16024	NC_017026	GCG	2	6	650887	650892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_017026	CG	3	6	650927	650932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16026	NC_017026	GTTGC	2	10	650937	650946	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16027	NC_017026	CAAGC	2	10	651015	651024	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16028	NC_017026	GTT	2	6	651067	651072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_017026	CGT	2	6	651081	651086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_017026	GTC	2	6	651088	651093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_017026	GCCG	2	8	651101	651108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16032	NC_017026	CGA	2	6	651140	651145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_017026	CAGC	2	8	651149	651156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16034	NC_017026	CGT	2	6	651186	651191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_017026	AGC	2	6	651223	651228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306470
16036	NC_017026	GCCG	2	8	651297	651304	0 %	0 %	50 %	50 %	383306470
16037	NC_017026	CG	3	6	651322	651327	0 %	0 %	50 %	50 %	383306470
16038	NC_017026	GAT	2	6	651342	651347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306470
16039	NC_017026	CCG	2	6	651362	651367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306470
16040	NC_017026	CG	3	6	651366	651371	0 %	0 %	50 %	50 %	383306470
16041	NC_017026	CGC	2	6	651414	651419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306470
16042	NC_017026	AGG	2	6	651443	651448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306470
16043	NC_017026	GCC	2	6	651457	651462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306470
16044	NC_017026	GCAC	2	8	651463	651470	25 %	0 %	25 %	50 %	383306470
16045	NC_017026	CGA	2	6	651530	651535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306470
16046	NC_017026	GCT	2	6	651616	651621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306470
16047	NC_017026	CGG	3	9	651641	651649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306470
16048	NC_017026	GTG	2	6	651670	651675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306470
16049	NC_017026	CGC	2	6	651737	651742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306470
16050	NC_017026	GGC	2	6	651765	651770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306470
16051	NC_017026	CTCC	2	8	651812	651819	0 %	25 %	0 %	75 %	383306470
16052	NC_017026	AT	4	8	651888	651895	50 %	50 %	0 %	0 %	383306470
16053	NC_017026	AT	3	6	651907	651912	50 %	50 %	0 %	0 %	383306470
16054	NC_017026	GCCG	2	8	651946	651953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16055	NC_017026	CGG	2	6	651963	651968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306471
16056	NC_017026	TCG	2	6	651969	651974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306471
16057	NC_017026	CGA	2	6	651977	651982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306471
16058	NC_017026	GTC	3	9	652032	652040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306471
16059	NC_017026	TCA	2	6	652076	652081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306471
16060	NC_017026	AAC	2	6	652141	652146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306471
16061	NC_017026	GC	3	6	652155	652160	0 %	0 %	50 %	50 %	383306471
16062	NC_017026	CAG	2	6	652191	652196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306471
16063	NC_017026	CAG	2	6	652230	652235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306471
16064	NC_017026	CGG	2	6	652238	652243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306471
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16073	NC_017026	GTC	2	6	652857	652862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306471
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16077	NC_017026	CGC	2	6	653039	653044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306471
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16079	NC_017026	GGC	2	6	653112	653117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306471
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16081	NC_017026	ACC	2	6	653149	653154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306471
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16084	NC_017026	CG	3	6	653273	653278	0 %	0 %	50 %	50 %	383306472
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16087	NC_017026	GCT	2	6	653336	653341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306472
16088	NC_017026	CGG	2	6	653357	653362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306472
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16092	NC_017026	AAC	2	6	653547	653552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306472
16093	NC_017026	CTGG	2	8	653562	653569	0 %	25 %	50 %	25 %	383306472
16094	NC_017026	CTAC	2	8	653573	653580	25 %	25 %	0 %	50 %	383306472
16095	NC_017026	TGG	2	6	653599	653604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306472
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16098	NC_017026	GGT	2	6	653726	653731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306472
16099	NC_017026	CGGC	3	12	653761	653772	0 %	0 %	50 %	50 %	383306472
16100	NC_017026	TGGG	2	8	653773	653780	0 %	25 %	75 %	0 %	383306472
16101	NC_017026	CGA	2	6	653798	653803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306472
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16104	NC_017026	GTG	2	6	653835	653840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306472
16105	NC_017026	CGA	2	6	653861	653866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306472
16106	NC_017026	ATCGAC	2	12	653871	653882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383306472
16107	NC_017026	AC	3	6	653936	653941	50 %	0 %	0 %	50 %	383306472
16108	NC_017026	GC	3	6	653993	653998	0 %	0 %	50 %	50 %	383306472
16109	NC_017026	CTG	2	6	654000	654005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306472
16110	NC_017026	CGA	3	9	654017	654025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306472
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16114	NC_017026	AGG	2	6	654288	654293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_017026	TGA	2	6	654302	654307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_017026	CTG	2	6	654343	654348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_017026	GTT	2	6	654387	654392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306473
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16119	NC_017026	ACGTCT	2	12	654441	654452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383306473
16120	NC_017026	ATGC	2	8	654485	654492	25 %	25 %	25 %	25 %	383306473
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16122	NC_017026	GT	3	6	654644	654649	0 %	50 %	50 %	0 %	383306473
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16241	NC_017026	CGTT	2	8	659708	659715	0 %	50 %	25 %	25 %	383306476
16242	NC_017026	CGG	2	6	659734	659739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306476
16243	NC_017026	GCG	2	6	659747	659752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306476
16244	NC_017026	TGG	2	6	659780	659785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16245	NC_017026	CAA	2	6	659848	659853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16246	NC_017026	TCG	2	6	659889	659894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16248	NC_017026	T	6	6	659966	659971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16249	NC_017026	GCC	2	6	660054	660059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16495	NC_017026	GCA	2	6	670401	670406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306484
16496	NC_017026	CCGC	2	8	670439	670446	0 %	0 %	25 %	75 %	383306484
16497	NC_017026	TAC	2	6	670465	670470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306484
16498	NC_017026	TGC	2	6	670490	670495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306484
16499	NC_017026	CGA	2	6	670527	670532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306484
16500	NC_017026	GCC	2	6	670555	670560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306484

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