MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017026	CGC	2	6	595201	595206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14502	NC_017026	GCATCG	2	12	595214	595225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14503	NC_017026	GTG	2	6	595231	595236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_017026	GAC	2	6	595258	595263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_017026	CTTCG	2	10	595299	595308	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14506	NC_017026	CCGTG	2	10	595323	595332	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14507	NC_017026	GCCG	2	8	595483	595490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14508	NC_017026	GTC	2	6	595574	595579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_017026	GACCGC	2	12	595583	595594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14510	NC_017026	TCT	2	6	595606	595611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_017026	CCA	2	6	595618	595623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14512	NC_017026	TGCCGC	2	12	595691	595702	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14513	NC_017026	CTC	3	9	595739	595747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14514	NC_017026	TCG	2	6	595768	595773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_017026	CTC	3	9	595797	595805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14516	NC_017026	TCG	2	6	595826	595831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_017026	GCC	2	6	595881	595886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306420
14518	NC_017026	CGC	2	6	595891	595896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306420
14519	NC_017026	GGCG	2	8	596002	596009	0 %	0 %	75 %	25 %	383306420
14520	NC_017026	CCA	2	6	596035	596040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306420
14521	NC_017026	CGT	2	6	596056	596061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306420
14522	NC_017026	TCCC	2	8	596102	596109	0 %	25 %	0 %	75 %	383306420
14523	NC_017026	ACCGC	2	10	596122	596131	20 %	0 %	20 %	60 %	383306420
14524	NC_017026	CGAC	2	8	596191	596198	25 %	0 %	25 %	50 %	383306420
14525	NC_017026	CGG	2	6	596235	596240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306420
14526	NC_017026	TGG	2	6	596245	596250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306420
14527	NC_017026	CTG	2	6	596288	596293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306420
14528	NC_017026	GAT	2	6	596351	596356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306420
14529	NC_017026	TCG	2	6	596358	596363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306420
14530	NC_017026	TCTCC	2	10	596368	596377	0 %	40 %	0 %	60 %	383306420
14531	NC_017026	CCA	2	6	596383	596388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306420
14532	NC_017026	GCG	2	6	596439	596444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306420
14533	NC_017026	CGT	2	6	596446	596451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306420
14534	NC_017026	AGT	2	6	596524	596529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306420
14535	NC_017026	CCG	2	6	596560	596565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306420
14536	NC_017026	GAA	2	6	596597	596602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306420
14537	NC_017026	GGC	2	6	596603	596608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306420
14538	NC_017026	CGG	2	6	596624	596629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306420
14539	NC_017026	CGG	3	9	596644	596652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306420
14540	NC_017026	TGGC	2	8	596682	596689	0 %	25 %	50 %	25 %	383306420
14541	NC_017026	GGC	2	6	596703	596708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306420
14542	NC_017026	CGGC	2	8	596713	596720	0 %	0 %	50 %	50 %	383306420
14543	NC_017026	GGA	2	6	596765	596770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306420
14544	NC_017026	CAT	2	6	596774	596779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306420
14545	NC_017026	TGCC	2	8	596795	596802	0 %	25 %	25 %	50 %	383306420
14546	NC_017026	TGC	2	6	596813	596818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306420
14547	NC_017026	GCG	2	6	596848	596853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306420
14548	NC_017026	TGGC	2	8	596861	596868	0 %	25 %	50 %	25 %	383306420
14549	NC_017026	TCG	2	6	596925	596930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306420
14550	NC_017026	A	6	6	596987	596992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_017026	TTC	2	6	597017	597022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14552	NC_017026	GCTA	2	8	597046	597053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14553	NC_017026	TAC	2	6	597073	597078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14554	NC_017026	AGG	2	6	597096	597101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_017026	CG	3	6	597130	597135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14556	NC_017026	GAT	2	6	597158	597163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306421
14557	NC_017026	GCG	2	6	597172	597177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306421
14558	NC_017026	TGC	2	6	597196	597201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306421
14559	NC_017026	TCG	2	6	597208	597213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306421
14560	NC_017026	TGG	2	6	597214	597219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306421
14561	NC_017026	G	6	6	597228	597233	0 %	0 %	100 %	0 %	383306421
14562	NC_017026	TATC	2	8	597239	597246	25 %	50 %	0 %	25 %	383306421
14563	NC_017026	GAC	2	6	597446	597451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306421
14564	NC_017026	ATC	2	6	597513	597518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306421
14565	NC_017026	CGC	2	6	597556	597561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306421
14566	NC_017026	CCT	2	6	597571	597576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306421
14567	NC_017026	CGC	2	6	597607	597612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14568	NC_017026	GCC	2	6	597625	597630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14569	NC_017026	CCG	2	6	597649	597654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14570	NC_017026	GGT	2	6	597661	597666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_017026	CTGG	2	8	597679	597686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14572	NC_017026	CGC	2	6	597769	597774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14573	NC_017026	CCG	2	6	597915	597920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14574	NC_017026	G	6	6	597954	597959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_017026	GCG	2	6	597971	597976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_017026	GAT	2	6	597992	597997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_017026	GCC	2	6	598001	598006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14578	NC_017026	CGT	2	6	598009	598014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14579	NC_017026	TCG	2	6	598023	598028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_017026	AAC	2	6	598031	598036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14581	NC_017026	TGG	2	6	598077	598082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_017026	ACACC	2	10	598083	598092	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14583	NC_017026	GCA	2	6	598130	598135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_017026	AGGCCG	2	12	598149	598160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_017026	GCG	2	6	598377	598382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_017026	GC	3	6	598570	598575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14587	NC_017026	GGC	2	6	598607	598612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_017026	CGGCC	2	10	598622	598631	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14589	NC_017026	CTT	2	6	598649	598654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14590	NC_017026	GCG	2	6	598673	598678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14591	NC_017026	CGG	2	6	598689	598694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14592	NC_017026	GGCCGG	2	12	598726	598737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_017026	GCG	2	6	598854	598859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_017026	AAC	2	6	599027	599032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14595	NC_017026	TCA	3	9	599056	599064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_017026	TAG	2	6	599081	599086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_017026	TGA	2	6	599117	599122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_017026	ACA	2	6	599203	599208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_017026	ATC	2	6	599221	599226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_017026	ATC	2	6	599266	599271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_017026	TTC	2	6	599289	599294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_017026	CTG	2	6	599348	599353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14603	NC_017026	GGATAT	2	12	599426	599437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_017026	GC	4	8	599462	599469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14605	NC_017026	GCC	2	6	599474	599479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14606	NC_017026	GAT	2	6	599480	599485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_017026	GAC	2	6	599495	599500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_017026	ATG	2	6	599511	599516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_017026	TGGCA	2	10	599523	599532	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14610	NC_017026	CGC	2	6	599603	599608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14611	NC_017026	GAT	2	6	599616	599621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_017026	GGAG	2	8	599726	599733	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_017026	TC	3	6	599755	599760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14614	NC_017026	AG	3	6	599787	599792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_017026	ATCT	2	8	599826	599833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14616	NC_017026	CTG	2	6	599886	599891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_017026	GGC	2	6	599903	599908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_017026	ATC	2	6	599925	599930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14619	NC_017026	ATG	2	6	599931	599936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_017026	ATC	2	6	599937	599942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14621	NC_017026	CGT	2	6	599981	599986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_017026	CTG	3	9	600114	600122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_017026	GTG	2	6	600198	600203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_017026	GTT	2	6	600239	600244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_017026	ATT	2	6	600264	600269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_017026	ACC	2	6	600282	600287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14627	NC_017026	TCG	2	6	600316	600321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14628	NC_017026	TGC	2	6	600347	600352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14629	NC_017026	GCT	2	6	600353	600358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14630	NC_017026	TGG	2	6	600372	600377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14631	NC_017026	GCGCCC	2	12	600389	600400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14633	NC_017026	TTG	2	6	600450	600455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14869	NC_017026	TCG	2	6	609274	609279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306431
14870	NC_017026	CGG	2	6	609280	609285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306431
14871	NC_017026	CCGA	2	8	609308	609315	25 %	0 %	25 %	50 %	383306431
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14974	NC_017026	TCG	2	6	613686	613691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
14975	NC_017026	CGG	2	6	613711	613716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306437
14976	NC_017026	TGA	5	15	613770	613784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306437
14977	NC_017026	CGA	2	6	613788	613793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306437
14978	NC_017026	GAGTTC	2	12	613820	613831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383306437
14979	NC_017026	CCA	2	6	613854	613859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306437
14980	NC_017026	TCG	2	6	613860	613865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
14981	NC_017026	GCT	2	6	613900	613905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
14982	NC_017026	CATGG	2	10	613913	613922	20 %	20 %	40 %	20 %	383306437
14983	NC_017026	GC	3	6	613938	613943	0 %	0 %	50 %	50 %	383306437
14984	NC_017026	CTT	2	6	613951	613956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306437
14985	NC_017026	TCT	2	6	614001	614006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306437
14986	NC_017026	AGT	2	6	614023	614028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306437
14987	NC_017026	CGC	2	6	614035	614040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306437
14988	NC_017026	CG	3	6	614075	614080	0 %	0 %	50 %	50 %	383306437
14989	NC_017026	GGT	2	6	614089	614094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306437
14990	NC_017026	TCT	2	6	614109	614114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306437
14991	NC_017026	TCG	2	6	614115	614120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
14992	NC_017026	GATCA	2	10	614222	614231	40 %	20 %	20 %	20 %	383306437
14993	NC_017026	CGT	2	6	614239	614244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
14994	NC_017026	CGC	2	6	614311	614316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306437
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14997	NC_017026	CATGG	2	10	614416	614425	20 %	20 %	40 %	20 %	383306437
14998	NC_017026	TCG	2	6	614462	614467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
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15000	NC_017026	GC	3	6	614639	614644	0 %	0 %	50 %	50 %	383306437

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