MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017026	GGC	2	6	43262	43267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305979
1003	NC_017026	GCA	2	6	43272	43277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305979
1004	NC_017026	CGG	2	6	43299	43304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305979
1005	NC_017026	CAC	2	6	43312	43317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305979
1006	NC_017026	GCC	2	6	43339	43344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305979
1007	NC_017026	GC	3	6	43363	43368	0 %	0 %	50 %	50 %	383305979
1008	NC_017026	CGT	2	6	43418	43423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017026	GTG	2	6	43495	43500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017026	GGC	2	6	43604	43609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305980
1011	NC_017026	CGA	2	6	43621	43626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1012	NC_017026	GAC	2	6	43778	43783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1013	NC_017026	CGAC	2	8	43860	43867	25 %	0 %	25 %	50 %	383305980
1014	NC_017026	TGG	2	6	43890	43895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305980
1015	NC_017026	TGC	2	6	43905	43910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1016	NC_017026	CCG	2	6	43941	43946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305980
1017	NC_017026	CGT	2	6	43999	44004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1018	NC_017026	CGC	2	6	44012	44017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305980
1019	NC_017026	CGA	2	6	44051	44056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1020	NC_017026	ACC	2	6	44066	44071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305980
1021	NC_017026	CAA	2	6	44143	44148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305980
1022	NC_017026	GC	3	6	44150	44155	0 %	0 %	50 %	50 %	383305980
1023	NC_017026	GGC	2	6	44207	44212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305980
1024	NC_017026	GAGC	2	8	44240	44247	25 %	0 %	50 %	25 %	383305980
1025	NC_017026	CGA	2	6	44257	44262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
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1027	NC_017026	GAT	2	6	44404	44409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305980
1028	NC_017026	GCT	2	6	44434	44439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1029	NC_017026	CGA	2	6	44440	44445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1030	NC_017026	CAC	2	6	44581	44586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305980
1031	NC_017026	CGA	2	6	44647	44652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1032	NC_017026	CGC	2	6	44659	44664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305980
1033	NC_017026	CGG	3	9	44701	44709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305980
1034	NC_017026	CGC	2	6	44728	44733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305980
1035	NC_017026	CGC	2	6	44749	44754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305980
1036	NC_017026	TCT	2	6	44799	44804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383305980
1037	NC_017026	GGTAC	2	10	44877	44886	20 %	20 %	40 %	20 %	383305980
1038	NC_017026	GGGACT	2	12	44922	44933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383305980
1039	NC_017026	CGG	2	6	44974	44979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305980
1040	NC_017026	CAG	2	6	45054	45059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1041	NC_017026	TCG	2	6	45072	45077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1042	NC_017026	TCGAA	2	10	45109	45118	40 %	20 %	20 %	20 %	383305980
1043	NC_017026	CGA	2	6	45211	45216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1044	NC_017026	ACT	2	6	45252	45257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305980
1045	NC_017026	CGA	2	6	45277	45282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1046	NC_017026	GGGC	2	8	45399	45406	0 %	0 %	75 %	25 %	383305980
1047	NC_017026	CGGC	2	8	45494	45501	0 %	0 %	50 %	50 %	383305980
1048	NC_017026	GAC	2	6	45515	45520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
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1050	NC_017026	CTG	2	6	45572	45577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1051	NC_017026	GCTTAC	2	12	45671	45682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383305980
1052	NC_017026	GC	3	6	45689	45694	0 %	0 %	50 %	50 %	383305980
1053	NC_017026	GAA	2	6	45808	45813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305980
1054	NC_017026	TGT	2	6	45922	45927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305980
1055	NC_017026	GTC	2	6	45965	45970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1056	NC_017026	GCACC	2	10	46039	46048	20 %	0 %	20 %	60 %	383305980
1057	NC_017026	TCG	2	6	46050	46055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
1058	NC_017026	AGA	2	6	46063	46068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305980
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1062	NC_017026	GAG	2	6	46214	46219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383305980
1063	NC_017026	ACC	2	6	46241	46246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305980
1064	NC_017026	GCC	2	6	46280	46285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305980
1065	NC_017026	TCG	2	6	46290	46295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305980
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1070	NC_017026	CGA	2	6	46399	46404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305980
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1072	NC_017026	CGG	2	6	46494	46499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017026	CGC	2	6	46549	46554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_017026	CGG	2	6	46561	46566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017026	TTGC	2	8	46621	46628	0 %	50 %	25 %	25 %	383305981
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1085	NC_017026	GCA	2	6	47012	47017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305981
1086	NC_017026	CGGTG	2	10	47073	47082	0 %	20 %	60 %	20 %	383305981
1087	NC_017026	ACA	2	6	47212	47217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305981
1088	NC_017026	TCATG	2	10	47219	47228	20 %	40 %	20 %	20 %	383305981
1089	NC_017026	CTAC	2	8	47234	47241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1091	NC_017026	ATCGG	2	10	47366	47375	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1094	NC_017026	CGG	3	9	47478	47486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305982
1095	NC_017026	GCAG	2	8	47534	47541	25 %	0 %	50 %	25 %	383305982
1096	NC_017026	GCG	2	6	47574	47579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305982
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1105	NC_017026	CGC	2	6	48373	48378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017026	CGG	2	6	48388	48393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017026	GTGC	2	8	48434	48441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_017026	CGG	2	6	48475	48480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017026	CCG	4	12	48537	48548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017026	CGG	3	9	48572	48580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017026	GCAGC	2	10	48614	48623	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_017026	GTC	2	6	48630	48635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017026	GGC	2	6	48638	48643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017026	TCG	2	6	48673	48678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017026	CCCGA	2	10	48697	48706	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1116	NC_017026	GCCG	2	8	48719	48726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_017026	AGC	2	6	48763	48768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017026	AAG	2	6	48895	48900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017026	CGG	2	6	48943	48948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017026	G	6	6	48974	48979	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017026	TGC	2	6	48982	48987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017026	GT	3	6	49064	49069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017026	GC	3	6	49099	49104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_017026	CGA	2	6	49139	49144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305983
1125	NC_017026	CGG	2	6	49185	49190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305983
1126	NC_017026	CGA	2	6	49213	49218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305983
1127	NC_017026	GCC	2	6	49219	49224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305983
1128	NC_017026	CGT	2	6	49260	49265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305983
1129	NC_017026	CGG	2	6	49337	49342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305983
1130	NC_017026	CGC	2	6	49356	49361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305983
1131	NC_017026	GCT	2	6	49470	49475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305983
1132	NC_017026	CGG	2	6	49476	49481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305983
1133	NC_017026	CGA	2	6	49521	49526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305983
1134	NC_017026	GCG	2	6	49665	49670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305983
1135	NC_017026	TCC	2	6	49682	49687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383305983
1136	NC_017026	CGA	2	6	49746	49751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305983
1137	NC_017026	CCG	3	9	49781	49789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305983
1138	NC_017026	GCC	2	6	49816	49821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305983
1139	NC_017026	CAGCG	2	10	49823	49832	20 %	0 %	40 %	40 %	383305983
1140	NC_017026	CAGC	2	8	49905	49912	25 %	0 %	25 %	50 %	383305983
1141	NC_017026	TCG	2	6	49940	49945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305983
1142	NC_017026	GTG	2	6	50017	50022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_017026	GAT	2	6	50044	50049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305984
1144	NC_017026	GC	5	10	50064	50073	0 %	0 %	50 %	50 %	383305984
1145	NC_017026	GTC	2	6	50077	50082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305984
1146	NC_017026	GCT	2	6	50088	50093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305984
1147	NC_017026	CGGG	2	8	50094	50101	0 %	0 %	75 %	25 %	383305984
1148	NC_017026	TCA	2	6	50106	50111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305984
1149	NC_017026	CCG	2	6	50138	50143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305984
1150	NC_017026	GCC	2	6	50168	50173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305984
1151	NC_017026	GAT	2	6	50185	50190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305984
1152	NC_017026	GCCG	2	8	50194	50201	0 %	0 %	50 %	50 %	383305984
1153	NC_017026	TCG	2	6	50297	50302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305984
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1173	NC_017026	CGG	2	6	51213	51218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305985
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1176	NC_017026	CTG	2	6	51329	51334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305985
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1186	NC_017026	CCT	2	6	51752	51757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1187	NC_017026	ACG	2	6	51783	51788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1188	NC_017026	AT	3	6	51820	51825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1189	NC_017026	ACA	2	6	51831	51836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1190	NC_017026	CCG	2	6	51903	51908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305986
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1207	NC_017026	TAG	2	6	52725	52730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1209	NC_017026	CCG	2	6	52759	52764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1210	NC_017026	CAA	2	6	52773	52778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1239	NC_017026	GCCG	2	8	53592	53599	0 %	0 %	50 %	50 %	383305988
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1243	NC_017026	CG	3	6	53942	53947	0 %	0 %	50 %	50 %	383305988
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1247	NC_017026	CAG	2	6	54003	54008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305988
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1249	NC_017026	TGC	2	6	54124	54129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305988
1250	NC_017026	CAT	2	6	54143	54148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305988
1251	NC_017026	CGG	2	6	54178	54183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305988
1252	NC_017026	AGC	2	6	54214	54219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305988
1253	NC_017026	GTT	2	6	54239	54244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305988
1254	NC_017026	CGG	2	6	54258	54263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305988
1255	NC_017026	CGG	2	6	54280	54285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305988
1256	NC_017026	TGG	2	6	54334	54339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305988
1257	NC_017026	CT	3	6	54349	54354	0 %	50 %	0 %	50 %	383305988
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1260	NC_017026	CGA	2	6	54491	54496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305988
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1262	NC_017026	CAC	3	9	54527	54535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305988
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1283	NC_017026	ACCG	2	8	55528	55535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1284	NC_017026	GGT	2	6	55541	55546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305989
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1293	NC_017026	GTC	2	6	55843	55848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305989
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1312	NC_017026	CGG	2	6	56632	56637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1313	NC_017026	GTT	2	6	56645	56650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1320	NC_017026	TGT	2	6	56850	56855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1321	NC_017026	CG	3	6	56896	56901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1329	NC_017026	CGG	2	6	57212	57217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1330	NC_017026	CGA	2	6	57248	57253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1331	NC_017026	CGC	2	6	57278	57283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1332	NC_017026	CGT	2	6	57307	57312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1333	NC_017026	CGA	2	6	57332	57337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1335	NC_017026	GGTCGC	2	12	57366	57377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1363	NC_017026	CGG	2	6	58319	58324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1364	NC_017026	GTG	2	6	58402	58407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1365	NC_017026	GCC	2	6	58420	58425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1366	NC_017026	GAA	3	9	58566	58574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1367	NC_017026	GCC	2	6	58583	58588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1368	NC_017026	AGG	2	6	58605	58610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1369	NC_017026	ACC	2	6	58628	58633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305991
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1372	NC_017026	G	6	6	58834	58839	0 %	0 %	100 %	0 %	383305991
1373	NC_017026	GCGG	2	8	58855	58862	0 %	0 %	75 %	25 %	383305991
1374	NC_017026	AGC	2	6	58867	58872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305991
1375	NC_017026	TCGAGG	2	12	58912	58923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383305991
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1377	NC_017026	CAA	2	6	58967	58972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305991
1378	NC_017026	GCG	2	6	58984	58989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305991
1379	NC_017026	CCGGCG	2	12	59010	59021	0 %	0 %	50 %	50 %	383305991
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