MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017026	ACG	2	6	554211	554216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306378
13502	NC_017026	GCT	2	6	554224	554229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306378
13503	NC_017026	CACC	2	8	554293	554300	25 %	0 %	0 %	75 %	383306378
13504	NC_017026	GC	3	6	554381	554386	0 %	0 %	50 %	50 %	383306379
13505	NC_017026	C	6	6	554398	554403	0 %	0 %	0 %	100 %	383306379
13506	NC_017026	ATC	2	6	554406	554411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306379
13507	NC_017026	GGT	2	6	554424	554429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306379
13508	NC_017026	CTGG	2	8	554450	554457	0 %	25 %	50 %	25 %	383306379
13509	NC_017026	GAC	2	6	554483	554488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306379
13510	NC_017026	GTG	2	6	554508	554513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306379
13511	NC_017026	TGG	2	6	554530	554535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306379
13512	NC_017026	GCG	2	6	554542	554547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306379
13513	NC_017026	CGG	2	6	554548	554553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306379
13514	NC_017026	TCC	2	6	554618	554623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306379
13515	NC_017026	GTG	2	6	554625	554630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306379
13516	NC_017026	CGG	2	6	554685	554690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306380
13517	NC_017026	GCG	2	6	554713	554718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306380
13518	NC_017026	CGT	2	6	554723	554728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306380
13519	NC_017026	AGC	2	6	554845	554850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306380
13520	NC_017026	GGCG	2	8	554858	554865	0 %	0 %	75 %	25 %	383306380
13521	NC_017026	GC	3	6	554952	554957	0 %	0 %	50 %	50 %	383306380
13522	NC_017026	GAT	2	6	554966	554971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306380
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13526	NC_017026	CCA	2	6	555164	555169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306380
13527	NC_017026	CG	3	6	555214	555219	0 %	0 %	50 %	50 %	383306380
13528	NC_017026	GTT	2	6	555244	555249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306381
13529	NC_017026	TGC	2	6	555271	555276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13530	NC_017026	TCG	2	6	555282	555287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
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13532	NC_017026	CAGCC	2	10	555447	555456	20 %	0 %	20 %	60 %	383306381
13533	NC_017026	GGC	2	6	555491	555496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306381
13534	NC_017026	CCAC	2	8	555517	555524	25 %	0 %	0 %	75 %	383306381
13535	NC_017026	GCC	2	6	555617	555622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306381
13536	NC_017026	GGA	2	6	555626	555631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306381
13537	NC_017026	CGT	2	6	555793	555798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13538	NC_017026	CGT	2	6	555817	555822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13539	NC_017026	GCA	2	6	555838	555843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13540	NC_017026	CGG	2	6	555967	555972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306381
13541	NC_017026	CTG	2	6	555986	555991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13542	NC_017026	CTG	2	6	556008	556013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13543	NC_017026	GCA	2	6	556048	556053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306381
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13545	NC_017026	CGG	2	6	556110	556115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306381
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13550	NC_017026	GGT	2	6	556307	556312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306381
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13552	NC_017026	GTC	2	6	556457	556462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13553	NC_017026	GCA	3	9	556510	556518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13554	NC_017026	CGT	2	6	556540	556545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306381
13555	NC_017026	TGC	2	6	556717	556722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_017026	GAG	2	6	556792	556797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_017026	A	6	6	556827	556832	100 %	0 %	0 %	0 %	383306382
13558	NC_017026	TGCCCG	2	12	556837	556848	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383306382
13559	NC_017026	CG	3	6	556905	556910	0 %	0 %	50 %	50 %	383306382
13560	NC_017026	CGGCTG	2	12	556914	556925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383306382
13561	NC_017026	GAG	2	6	556986	556991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306382
13562	NC_017026	ACCC	2	8	556992	556999	25 %	0 %	0 %	75 %	383306382
13563	NC_017026	TGG	2	6	557023	557028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306382
13564	NC_017026	TGC	2	6	557059	557064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306382
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13568	NC_017026	GAT	2	6	557289	557294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306382
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13570	NC_017026	GCT	2	6	557408	557413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306382
13571	NC_017026	ATC	2	6	557478	557483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306382
13572	NC_017026	CGA	2	6	557570	557575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306382
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13574	NC_017026	TGTC	2	8	557885	557892	0 %	50 %	25 %	25 %	383306383
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13577	NC_017026	CGT	2	6	557985	557990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306383
13578	NC_017026	GAG	2	6	558013	558018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306383
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13582	NC_017026	CAG	2	6	558118	558123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306383
13583	NC_017026	GC	3	6	558126	558131	0 %	0 %	50 %	50 %	383306383
13584	NC_017026	GGT	2	6	558240	558245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306383
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13587	NC_017026	GC	3	6	558270	558275	0 %	0 %	50 %	50 %	383306383
13588	NC_017026	CTGG	2	8	558318	558325	0 %	25 %	50 %	25 %	383306383
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13591	NC_017026	CGC	2	6	558399	558404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306383
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13596	NC_017026	GCTCG	2	10	558517	558526	0 %	20 %	40 %	40 %	383306383
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13601	NC_017026	TGGA	2	8	558730	558737	25 %	25 %	50 %	0 %	383306383
13602	NC_017026	GCC	2	6	558760	558765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306383
13603	NC_017026	CGA	2	6	558855	558860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306383
13604	NC_017026	CCA	2	6	558863	558868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306383
13605	NC_017026	TCA	2	6	558917	558922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306383
13606	NC_017026	ACT	2	6	558947	558952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306383
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13609	NC_017026	CCA	2	6	559100	559105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306383
13610	NC_017026	TCG	2	6	559120	559125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306383
13611	NC_017026	ACC	2	6	559126	559131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306383
13612	NC_017026	GCG	2	6	559201	559206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_017026	GAG	2	6	559241	559246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_017026	GCGAT	2	10	559256	559265	20 %	20 %	40 %	20 %	383306384
13615	NC_017026	GCCG	2	8	559356	559363	0 %	0 %	50 %	50 %	383306384
13616	NC_017026	CGAGCG	2	12	559437	559448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383306384
13617	NC_017026	CAC	2	6	559476	559481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306384
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13649	NC_017026	CGC	2	6	561115	561120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13651	NC_017026	GC	3	6	561194	561199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13718	NC_017026	GTC	2	6	563888	563893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13723	NC_017026	CCT	2	6	564016	564021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306389
13724	NC_017026	CGC	2	6	564035	564040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306389
13725	NC_017026	GCC	2	6	564060	564065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306389
13726	NC_017026	CGG	2	6	564066	564071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306389
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13988	NC_017026	GCT	2	6	575356	575361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306400
13989	NC_017026	GCT	2	6	575398	575403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306400
13990	NC_017026	CGA	2	6	575422	575427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306400
13991	NC_017026	GTG	3	9	575429	575437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306400
13992	NC_017026	GGC	2	6	575485	575490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306400
13993	NC_017026	AGG	2	6	575556	575561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306400
13994	NC_017026	GGCA	2	8	575566	575573	25 %	0 %	50 %	25 %	383306400
13995	NC_017026	GCG	2	6	575617	575622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306400
13996	NC_017026	GC	3	6	575628	575633	0 %	0 %	50 %	50 %	383306400
13997	NC_017026	CG	3	6	575697	575702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13998	NC_017026	GTCCG	2	10	575774	575783	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13999	NC_017026	CG	3	6	575804	575809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14000	NC_017026	GCA	2	6	575842	575847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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