MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017026	CGGC	2	8	534170	534177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13002	NC_017026	CCG	2	6	534263	534268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306360
13003	NC_017026	GTA	2	6	534296	534301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306360
13004	NC_017026	TCA	2	6	534369	534374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306360
13005	NC_017026	CGA	2	6	534394	534399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306360
13006	NC_017026	GC	3	6	534483	534488	0 %	0 %	50 %	50 %	383306360
13007	NC_017026	AGAT	2	8	534567	534574	50 %	25 %	25 %	0 %	383306360
13008	NC_017026	GGT	2	6	534581	534586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306360
13009	NC_017026	TTC	2	6	534587	534592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306360
13010	NC_017026	GCA	2	6	534610	534615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306360
13011	NC_017026	GCT	2	6	534719	534724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306360
13012	NC_017026	CGGTC	2	10	534734	534743	0 %	20 %	40 %	40 %	383306360
13013	NC_017026	TCA	2	6	534791	534796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306361
13014	NC_017026	TC	3	6	534881	534886	0 %	50 %	0 %	50 %	383306361
13015	NC_017026	CCA	2	6	534910	534915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306361
13016	NC_017026	AGGT	2	8	534918	534925	25 %	25 %	50 %	0 %	383306361
13017	NC_017026	CAG	2	6	534929	534934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306361
13018	NC_017026	GCG	2	6	534955	534960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306361
13019	NC_017026	CCA	2	6	534992	534997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13020	NC_017026	AGT	2	6	535015	535020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017026	ATG	2	6	535056	535061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306362
13022	NC_017026	AAC	2	6	535227	535232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306362
13023	NC_017026	AGG	2	6	535236	535241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306362
13024	NC_017026	GCA	2	6	535291	535296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306362
13025	NC_017026	TCC	2	6	535314	535319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306362
13026	NC_017026	TAG	2	6	535385	535390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306362
13027	NC_017026	CGG	2	6	535429	535434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306362
13028	NC_017026	CGACGG	2	12	535435	535446	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383306362
13029	NC_017026	CGA	2	6	535447	535452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306362
13030	NC_017026	CGA	2	6	535474	535479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306362
13031	NC_017026	GCG	2	6	535496	535501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306362
13032	NC_017026	CAC	2	6	535526	535531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306362
13033	NC_017026	ACG	2	6	535563	535568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306362
13034	NC_017026	G	6	6	535577	535582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_017026	TCG	2	6	535682	535687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_017026	CGC	2	6	535712	535717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13037	NC_017026	CGA	2	6	535782	535787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_017026	GT	3	6	535799	535804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_017026	GAT	2	6	535819	535824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_017026	GGT	2	6	535905	535910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_017026	GCG	2	6	535970	535975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_017026	ATC	2	6	536012	536017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_017026	ACT	2	6	536027	536032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_017026	GCCG	2	8	536095	536102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_017026	AGCC	2	8	536119	536126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_017026	TGC	2	6	536129	536134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_017026	C	6	6	536166	536171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13048	NC_017026	CG	3	6	536179	536184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13049	NC_017026	CTG	2	6	536234	536239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_017026	AGC	2	6	536256	536261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_017026	GCG	2	6	536273	536278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_017026	CAG	2	6	536321	536326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_017026	TCG	2	6	536361	536366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_017026	AGCG	2	8	536490	536497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13055	NC_017026	CGA	2	6	536555	536560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_017026	GATG	2	8	536638	536645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017026	GC	3	6	536658	536663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_017026	CGG	2	6	536668	536673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_017026	AGTG	2	8	536716	536723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_017026	AGC	2	6	536736	536741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_017026	GCC	2	6	536754	536759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13062	NC_017026	CG	3	6	536779	536784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_017026	TGC	2	6	536822	536827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_017026	CTGG	2	8	536837	536844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13065	NC_017026	CAC	2	6	536863	536868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306363
13066	NC_017026	GC	3	6	536911	536916	0 %	0 %	50 %	50 %	383306363
13067	NC_017026	CCA	3	9	536919	536927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306363
13068	NC_017026	CAT	2	6	536953	536958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306363
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13070	NC_017026	CGG	2	6	537029	537034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306363
13071	NC_017026	GTG	2	6	537078	537083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306363
13072	NC_017026	GTA	2	6	537094	537099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306363
13073	NC_017026	TGA	2	6	537110	537115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306363
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13075	NC_017026	CGGC	2	8	537159	537166	0 %	0 %	50 %	50 %	383306363
13076	NC_017026	CCG	2	6	537188	537193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306363
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13081	NC_017026	GTC	2	6	537412	537417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306363
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13084	NC_017026	GTG	2	6	537545	537550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_017026	CCT	2	6	537596	537601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306364
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13088	NC_017026	ACC	2	6	537706	537711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306364
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13090	NC_017026	GCC	2	6	537825	537830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306364
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13093	NC_017026	TGC	2	6	537904	537909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306364
13094	NC_017026	TGG	2	6	537949	537954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306364
13095	NC_017026	TCG	2	6	537970	537975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306364
13096	NC_017026	TGG	2	6	537995	538000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306364
13097	NC_017026	CG	3	6	538023	538028	0 %	0 %	50 %	50 %	383306364
13098	NC_017026	TCG	2	6	538045	538050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306364
13099	NC_017026	CAG	2	6	538056	538061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306364
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13102	NC_017026	CCA	2	6	538127	538132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306364
13103	NC_017026	AGCTG	2	10	538192	538201	20 %	20 %	40 %	20 %	383306364
13104	NC_017026	CGC	2	6	538334	538339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306364
13105	NC_017026	CGG	2	6	538349	538354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306364
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13107	NC_017026	CGA	2	6	538379	538384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306364
13108	NC_017026	GTG	2	6	538398	538403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306364
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13110	NC_017026	CGCGG	2	10	538476	538485	0 %	0 %	60 %	40 %	383306364
13111	NC_017026	CG	3	6	538556	538561	0 %	0 %	50 %	50 %	383306364
13112	NC_017026	GTC	2	6	538593	538598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306364
13113	NC_017026	GC	3	6	538600	538605	0 %	0 %	50 %	50 %	383306364
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13118	NC_017026	GGC	2	6	538833	538838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306364
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13122	NC_017026	CGGC	2	8	538914	538921	0 %	0 %	50 %	50 %	383306365
13123	NC_017026	GACG	2	8	538924	538931	25 %	0 %	50 %	25 %	383306365
13124	NC_017026	GCT	2	6	538953	538958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306365
13125	NC_017026	GGCC	2	8	538969	538976	0 %	0 %	50 %	50 %	383306365
13126	NC_017026	CGGG	2	8	539011	539018	0 %	0 %	75 %	25 %	383306365
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13131	NC_017026	TGG	2	6	539129	539134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306365
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13143	NC_017026	GAT	2	6	539698	539703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306365
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13154	NC_017026	TCG	2	6	540384	540389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306365
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13157	NC_017026	TTGG	2	8	540571	540578	0 %	50 %	50 %	0 %	383306365
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13195	NC_017026	ACG	2	6	542153	542158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306366
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13200	NC_017026	AGCCT	2	10	542362	542371	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13201	NC_017026	GC	3	6	542531	542536	0 %	0 %	50 %	50 %	383306367
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13221	NC_017026	CTT	2	6	543273	543278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13222	NC_017026	ATAGTC	2	12	543324	543335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13223	NC_017026	TTG	2	6	543338	543343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13224	NC_017026	GC	4	8	543440	543447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13225	NC_017026	TG	3	6	543476	543481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13226	NC_017026	ATGG	2	8	543543	543550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13227	NC_017026	CCG	2	6	543556	543561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13228	NC_017026	TTG	2	6	543577	543582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13229	NC_017026	AGT	2	6	543583	543588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13230	NC_017026	GGGCCG	3	18	543589	543606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13231	NC_017026	GCC	3	9	543613	543621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13232	NC_017026	CGC	2	6	543632	543637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13233	NC_017026	CGC	2	6	543653	543658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13234	NC_017026	GCTG	2	8	543683	543690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13235	NC_017026	TGC	2	6	543735	543740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13236	NC_017026	TGCC	2	8	543745	543752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13237	NC_017026	CGG	2	6	543794	543799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13238	NC_017026	CCG	2	6	543821	543826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13239	NC_017026	CGC	2	6	543831	543836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13240	NC_017026	TGG	2	6	543842	543847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13241	NC_017026	GGC	2	6	543870	543875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13242	NC_017026	TGG	2	6	543899	543904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_017026	TTC	2	6	543913	543918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13244	NC_017026	GGC	2	6	543978	543983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13245	NC_017026	CAC	2	6	543984	543989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13246	NC_017026	CGG	2	6	544019	544024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13247	NC_017026	CCG	2	6	544051	544056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13248	NC_017026	AAT	2	6	544099	544104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_017026	GAC	2	6	544126	544131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13252	NC_017026	TGG	2	6	544246	544251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_017026	CTT	2	6	544270	544275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13254	NC_017026	GCT	2	6	544299	544304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13256	NC_017026	TGC	2	6	544373	544378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13258	NC_017026	TGG	2	6	544415	544420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13259	NC_017026	C	6	6	544495	544500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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13261	NC_017026	GCG	2	6	544603	544608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13263	NC_017026	CGG	2	6	544666	544671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13265	NC_017026	CGC	2	6	544753	544758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13270	NC_017026	CGA	2	6	544852	544857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13273	NC_017026	CCG	2	6	544889	544894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13274	NC_017026	GGGC	2	8	544933	544940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13275	NC_017026	GCAA	2	8	544958	544965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13276	NC_017026	GCCG	2	8	544981	544988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13277	NC_017026	CGA	2	6	545005	545010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13278	NC_017026	TGC	2	6	545040	545045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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