MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017026	CGA	2	6	513808	513813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12503	NC_017026	CAG	2	6	513824	513829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12504	NC_017026	GCC	2	6	513849	513854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306341
12505	NC_017026	GGT	2	6	513860	513865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306341
12506	NC_017026	CCGGG	2	10	513868	513877	0 %	0 %	60 %	40 %	383306341
12507	NC_017026	GCA	2	6	513898	513903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12508	NC_017026	CAC	2	6	513928	513933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306341
12509	NC_017026	GCC	2	6	513969	513974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306341
12510	NC_017026	GCA	2	6	513985	513990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12511	NC_017026	GGC	2	6	513998	514003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306341
12512	NC_017026	GCA	2	6	514015	514020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12513	NC_017026	GGT	2	6	514056	514061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306341
12514	NC_017026	GCA	2	6	514063	514068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12515	NC_017026	GCTT	2	8	514098	514105	0 %	50 %	25 %	25 %	383306341
12516	NC_017026	ACA	2	6	514117	514122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306341
12517	NC_017026	TCG	2	6	514176	514181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12518	NC_017026	CGT	2	6	514198	514203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12519	NC_017026	GTC	2	6	514217	514222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12520	NC_017026	ACC	2	6	514299	514304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306341
12521	NC_017026	GC	3	6	514478	514483	0 %	0 %	50 %	50 %	383306341
12522	NC_017026	GGCT	2	8	514639	514646	0 %	25 %	50 %	25 %	383306341
12523	NC_017026	CCA	2	6	514657	514662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306341
12524	NC_017026	GTCGCG	2	12	514665	514676	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383306341
12525	NC_017026	CG	3	6	514743	514748	0 %	0 %	50 %	50 %	383306341
12526	NC_017026	TCG	2	6	514818	514823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306341
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12528	NC_017026	CGC	2	6	514922	514927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306341
12529	NC_017026	GT	3	6	514944	514949	0 %	50 %	50 %	0 %	383306341
12530	NC_017026	GCG	2	6	514950	514955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306341
12531	NC_017026	GGC	2	6	515014	515019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306341
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12533	NC_017026	TGG	2	6	515031	515036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306341
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12535	NC_017026	CAGCG	2	10	515082	515091	20 %	0 %	40 %	40 %	383306341
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12537	NC_017026	AGCCC	2	10	515110	515119	20 %	0 %	20 %	60 %	383306341
12538	NC_017026	GGC	2	6	515129	515134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306341
12539	NC_017026	CAG	2	6	515156	515161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
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12541	NC_017026	TCG	2	6	515292	515297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306341
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12544	NC_017026	ACG	2	6	515376	515381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12545	NC_017026	TCG	3	9	515391	515399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306341
12546	NC_017026	CGCCA	2	10	515443	515452	20 %	0 %	20 %	60 %	383306341
12547	NC_017026	GC	3	6	515508	515513	0 %	0 %	50 %	50 %	383306341
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12550	NC_017026	GATG	2	8	515663	515670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_017026	CGC	2	6	515695	515700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12552	NC_017026	TGC	2	6	515713	515718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306342
12553	NC_017026	TGT	2	6	515762	515767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306342
12554	NC_017026	TGGC	2	8	515779	515786	0 %	25 %	50 %	25 %	383306342
12555	NC_017026	CGG	2	6	515840	515845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306342
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12558	NC_017026	TGC	2	6	515980	515985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306342
12559	NC_017026	GCT	2	6	515987	515992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306342
12560	NC_017026	GGC	2	6	516014	516019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306342
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12562	NC_017026	CGG	2	6	516049	516054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306342
12563	NC_017026	CCAC	2	8	516057	516064	25 %	0 %	0 %	75 %	383306342
12564	NC_017026	TGC	2	6	516092	516097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306342
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12567	NC_017026	CGC	2	6	516280	516285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12568	NC_017026	CTGA	2	8	516287	516294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12569	NC_017026	GCG	2	6	516316	516321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_017026	CCG	2	6	516335	516340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12571	NC_017026	CGC	2	6	516343	516348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12572	NC_017026	CGA	2	6	516366	516371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306343
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12588	NC_017026	CGT	2	6	516930	516935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306344
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12590	NC_017026	CGAAT	2	10	517122	517131	40 %	20 %	20 %	20 %	383306344
12591	NC_017026	GCA	2	6	517153	517158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306344
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12597	NC_017026	GGC	2	6	517395	517400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_017026	TCG	2	6	517424	517429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12600	NC_017026	TGG	2	6	517574	517579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_017026	GTC	2	6	517597	517602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_017026	GGT	2	6	517605	517610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017026	GACC	2	8	517621	517628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_017026	GCA	2	6	517704	517709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_017026	GCCA	2	8	517724	517731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12606	NC_017026	GT	3	6	517784	517789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12609	NC_017026	CCAG	2	8	517863	517870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12610	NC_017026	GTTC	2	8	517871	517878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12611	NC_017026	GCC	2	6	517892	517897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12618	NC_017026	CGG	2	6	518087	518092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_017026	TGC	2	6	518287	518292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12621	NC_017026	CG	3	6	518375	518380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12622	NC_017026	GACA	2	8	518409	518416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12623	NC_017026	TCG	3	9	518421	518429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_017026	TGA	2	6	518482	518487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12626	NC_017026	GGC	2	6	518592	518597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12627	NC_017026	TGG	2	6	518615	518620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_017026	CCG	2	6	518639	518644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12629	NC_017026	CGG	2	6	518657	518662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12630	NC_017026	GT	3	6	518686	518691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12631	NC_017026	TGG	2	6	518732	518737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12632	NC_017026	GC	3	6	518748	518753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12633	NC_017026	CGA	2	6	518754	518759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12642	NC_017026	GC	3	6	518903	518908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12643	NC_017026	GCAA	2	8	518927	518934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12644	NC_017026	GAA	2	6	518999	519004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12744	NC_017026	CGG	2	6	522864	522869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306349
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12747	NC_017026	GAC	2	6	523066	523071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306349
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12883	NC_017026	GGA	2	6	528937	528942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12977	NC_017026	TCG	2	6	533371	533376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12985	NC_017026	ACC	2	6	533705	533710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12986	NC_017026	GA	3	6	533736	533741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12987	NC_017026	CCGT	2	8	533742	533749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12988	NC_017026	G	6	6	533785	533790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12989	NC_017026	CGC	2	6	533845	533850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12990	NC_017026	GGC	2	6	533939	533944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12991	NC_017026	CGG	2	6	533946	533951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12992	NC_017026	TGG	2	6	533952	533957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12993	NC_017026	CCG	2	6	533958	533963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12994	NC_017026	GAC	2	6	533965	533970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12995	NC_017026	TCG	2	6	533999	534004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12997	NC_017026	GTCG	2	8	534045	534052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12999	NC_017026	AGC	2	6	534110	534115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13000	NC_017026	TCGCT	2	10	534160	534169	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

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