MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017026	ATGCCG	2	12	449996	450007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11002	NC_017026	CGA	2	6	450009	450014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11003	NC_017026	GCC	2	6	450016	450021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306294
11004	NC_017026	GAT	2	6	450037	450042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306294
11005	NC_017026	ATC	2	6	450067	450072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306294
11006	NC_017026	CAC	2	6	450097	450102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306294
11007	NC_017026	CA	3	6	450127	450132	50 %	0 %	0 %	50 %	383306294
11008	NC_017026	GCCC	2	8	450192	450199	0 %	0 %	25 %	75 %	383306294
11009	NC_017026	GC	4	8	450231	450238	0 %	0 %	50 %	50 %	383306294
11010	NC_017026	GAT	2	6	450346	450351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306294
11011	NC_017026	CAC	2	6	450393	450398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306294
11012	NC_017026	CAC	2	6	450466	450471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306294
11013	NC_017026	GTC	2	6	450478	450483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11014	NC_017026	CTC	2	6	450499	450504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306294
11015	NC_017026	CGA	2	6	450507	450512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11016	NC_017026	CGT	2	6	450523	450528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11017	NC_017026	TGGCCC	2	12	450533	450544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383306294
11018	NC_017026	GCA	2	6	450564	450569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11019	NC_017026	ATGTCC	2	12	450629	450640	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383306294
11020	NC_017026	CGC	2	6	450699	450704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306294
11021	NC_017026	GC	3	6	450703	450708	0 %	0 %	50 %	50 %	383306294
11022	NC_017026	CGC	2	6	450710	450715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306294
11023	NC_017026	CCA	2	6	450900	450905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306294
11024	NC_017026	CGA	2	6	450912	450917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11025	NC_017026	GAAC	2	8	450940	450947	50 %	0 %	25 %	25 %	383306294
11026	NC_017026	CCG	2	6	450962	450967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306294
11027	NC_017026	TTG	2	6	450974	450979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306294
11028	NC_017026	GGC	2	6	451006	451011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306294
11029	NC_017026	GAA	2	6	451042	451047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306294
11030	NC_017026	GGC	2	6	451144	451149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306294
11031	NC_017026	ATG	2	6	451163	451168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306294
11032	NC_017026	TCC	2	6	451211	451216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306294
11033	NC_017026	CAG	3	9	451237	451245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11034	NC_017026	TTG	2	6	451289	451294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306294
11035	NC_017026	GCC	3	9	451300	451308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306294
11036	NC_017026	CCA	2	6	451353	451358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306294
11037	NC_017026	GCG	2	6	451383	451388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306294
11038	NC_017026	CTGG	2	8	451390	451397	0 %	25 %	50 %	25 %	383306294
11039	NC_017026	CTG	2	6	451495	451500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11040	NC_017026	ACG	2	6	451505	451510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11041	NC_017026	CGC	3	9	451537	451545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306294
11042	NC_017026	ACG	2	6	451643	451648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11043	NC_017026	GTCGAC	2	12	451666	451677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11044	NC_017026	GCAT	2	8	451684	451691	25 %	25 %	25 %	25 %	383306294
11045	NC_017026	CGT	2	6	451779	451784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11046	NC_017026	GGC	2	6	451816	451821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306294
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11048	NC_017026	CGT	2	6	451953	451958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306294
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11050	NC_017026	GCT	2	6	452028	452033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306294
11051	NC_017026	GCC	2	6	452116	452121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306295
11052	NC_017026	GTG	2	6	452143	452148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306295
11053	NC_017026	TCG	2	6	452200	452205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306295
11054	NC_017026	CAG	2	6	452223	452228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306295
11055	NC_017026	GC	4	8	452230	452237	0 %	0 %	50 %	50 %	383306295
11056	NC_017026	CCA	2	6	452417	452422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306295
11057	NC_017026	CAG	2	6	452499	452504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306295
11058	NC_017026	CGG	2	6	452522	452527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306295
11059	NC_017026	TGGT	2	8	452564	452571	0 %	50 %	50 %	0 %	383306295
11060	NC_017026	GCC	2	6	452592	452597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306296
11061	NC_017026	GC	3	6	452599	452604	0 %	0 %	50 %	50 %	383306296
11062	NC_017026	CGG	3	9	452617	452625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306296
11063	NC_017026	GCGCG	2	10	452713	452722	0 %	0 %	60 %	40 %	383306296
11064	NC_017026	ACCC	2	8	452822	452829	25 %	0 %	0 %	75 %	383306296
11065	NC_017026	GCG	2	6	452832	452837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306296
11066	NC_017026	CCG	2	6	452900	452905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306296
11067	NC_017026	GTC	2	6	453011	453016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306296
11068	NC_017026	ACC	2	6	453147	453152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306297
11069	NC_017026	CCG	2	6	453197	453202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306297
11070	NC_017026	TC	3	6	453224	453229	0 %	50 %	0 %	50 %	383306297
11071	NC_017026	TTG	2	6	453268	453273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306297
11072	NC_017026	CCG	2	6	453277	453282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306297
11073	NC_017026	ACG	2	6	453286	453291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306297
11074	NC_017026	TCA	2	6	453356	453361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306297
11075	NC_017026	GCA	2	6	453365	453370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306297
11076	NC_017026	CCG	2	6	453379	453384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306297
11077	NC_017026	ACC	2	6	453388	453393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306297
11078	NC_017026	CTCC	2	8	453398	453405	0 %	25 %	0 %	75 %	383306297
11079	NC_017026	CAA	2	6	453417	453422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306297
11080	NC_017026	TGG	2	6	453443	453448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306297
11081	NC_017026	GCC	2	6	453497	453502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11082	NC_017026	CAT	2	6	453560	453565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306298
11083	NC_017026	TCCG	2	8	453572	453579	0 %	25 %	25 %	50 %	383306298
11084	NC_017026	GAT	2	6	453624	453629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306298
11085	NC_017026	CGC	2	6	453729	453734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306298
11086	NC_017026	ATCC	2	8	453744	453751	25 %	25 %	0 %	50 %	383306298
11087	NC_017026	GTC	2	6	453753	453758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306298
11088	NC_017026	TCG	2	6	453874	453879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306298
11089	NC_017026	ACC	2	6	453882	453887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306298
11090	NC_017026	CGA	3	9	453926	453934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306298
11091	NC_017026	GC	3	6	453954	453959	0 %	0 %	50 %	50 %	383306298
11092	NC_017026	TGGCG	2	10	453960	453969	0 %	20 %	60 %	20 %	383306298
11093	NC_017026	CG	3	6	453975	453980	0 %	0 %	50 %	50 %	383306298
11094	NC_017026	GAAC	2	8	454011	454018	50 %	0 %	25 %	25 %	383306298
11095	NC_017026	GCG	3	9	454033	454041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306298
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11097	NC_017026	CGC	2	6	454117	454122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306298
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11100	NC_017026	ACCC	2	8	454269	454276	25 %	0 %	0 %	75 %	383306298
11101	NC_017026	GC	3	6	454325	454330	0 %	0 %	50 %	50 %	383306298
11102	NC_017026	GTC	2	6	454335	454340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306298
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11105	NC_017026	GCC	2	6	454404	454409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306298
11106	NC_017026	TCG	2	6	454438	454443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306298
11107	NC_017026	CGG	2	6	454490	454495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306298
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11111	NC_017026	CGG	2	6	454640	454645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306298
11112	NC_017026	CACG	2	8	454676	454683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11113	NC_017026	CGG	2	6	454735	454740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306299
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11117	NC_017026	CG	3	6	454905	454910	0 %	0 %	50 %	50 %	383306299
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11119	NC_017026	GCC	2	6	454959	454964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306299
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11234	NC_017026	CTG	2	6	459508	459513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306305
11235	NC_017026	TCGA	2	8	459525	459532	25 %	25 %	25 %	25 %	383306305
11236	NC_017026	CGA	2	6	459560	459565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306305
11237	NC_017026	GGC	2	6	459623	459628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11238	NC_017026	CGT	2	6	459799	459804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11239	NC_017026	GGCC	2	8	459811	459818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11240	NC_017026	CTG	2	6	459851	459856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11243	NC_017026	CGA	2	6	459994	459999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11244	NC_017026	CGT	2	6	460042	460047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11253	NC_017026	TCG	3	9	460407	460415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11357	NC_017026	GGCG	2	8	464490	464497	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11358	NC_017026	ACG	2	6	464530	464535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11360	NC_017026	GGCG	2	8	464557	464564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11361	NC_017026	TGG	2	6	464573	464578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11362	NC_017026	CTG	2	6	464599	464604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11365	NC_017026	GTGAG	2	10	464696	464705	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11366	NC_017026	CCGG	2	8	464775	464782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11367	NC_017026	CGA	2	6	464796	464801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11368	NC_017026	CCG	2	6	464807	464812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11372	NC_017026	GC	3	6	464947	464952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11373	NC_017026	GCA	2	6	464967	464972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11497	NC_017026	CAGC	2	8	469580	469587	25 %	0 %	25 %	50 %	383306308
11498	NC_017026	TGA	2	6	469645	469650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306308
11499	NC_017026	CG	3	6	469664	469669	0 %	0 %	50 %	50 %	383306308
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