MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_017026	GCC	2	6	4377774	4377779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383309621
109002	NC_017026	CCT	2	6	4377793	4377798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383309621
109003	NC_017026	CCT	4	12	4377808	4377819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383309621
109004	NC_017026	TGC	3	9	4377843	4377851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309621
109005	NC_017026	GAT	2	6	4377887	4377892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383309621
109006	NC_017026	CCG	2	6	4377912	4377917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383309621
109007	NC_017026	TCA	2	6	4377958	4377963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383309621
109008	NC_017026	GCC	2	6	4377984	4377989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383309621
109009	NC_017026	CG	3	6	4378002	4378007	0 %	0 %	50 %	50 %	383309621
109010	NC_017026	CG	3	6	4378013	4378018	0 %	0 %	50 %	50 %	383309621
109011	NC_017026	ATC	2	6	4378050	4378055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383309621
109012	NC_017026	CACC	2	8	4378063	4378070	25 %	0 %	0 %	75 %	383309621
109013	NC_017026	CGA	2	6	4378096	4378101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309621
109014	NC_017026	CAGT	2	8	4378207	4378214	25 %	25 %	25 %	25 %	383309621
109015	NC_017026	TGG	2	6	4378456	4378461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383309621
109016	NC_017026	CAG	2	6	4378490	4378495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309621
109017	NC_017026	CGCA	2	8	4378496	4378503	25 %	0 %	25 %	50 %	383309621
109018	NC_017026	GAA	2	6	4378541	4378546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309621
109019	NC_017026	GTA	2	6	4378610	4378615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383309621
109020	NC_017026	GAA	2	6	4378631	4378636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309621
109021	NC_017026	CAAA	2	8	4378639	4378646	75 %	0 %	0 %	25 %	383309621
109022	NC_017026	GTC	2	6	4378683	4378688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309622
109023	NC_017026	GTCT	2	8	4378704	4378711	0 %	50 %	25 %	25 %	383309622
109024	NC_017026	TCC	2	6	4378755	4378760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383309622
109025	NC_017026	ACG	2	6	4378877	4378882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309622
109026	NC_017026	GCG	2	6	4378892	4378897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383309622
109027	NC_017026	AGAC	2	8	4378989	4378996	50 %	0 %	25 %	25 %	383309622
109028	NC_017026	TGC	2	6	4379049	4379054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309623
109029	NC_017026	CCGAG	2	10	4379060	4379069	20 %	0 %	40 %	40 %	383309623
109030	NC_017026	GCT	2	6	4379081	4379086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309623
109031	NC_017026	GC	3	6	4379092	4379097	0 %	0 %	50 %	50 %	383309623
109032	NC_017026	CAC	2	6	4379102	4379107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383309623
109033	NC_017026	CG	3	6	4379221	4379226	0 %	0 %	50 %	50 %	383309623
109034	NC_017026	CCA	2	6	4379246	4379251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383309623
109035	NC_017026	GTT	2	6	4379298	4379303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383309623
109036	NC_017026	CGC	2	6	4379471	4379476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383309624
109037	NC_017026	GTT	2	6	4379479	4379484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383309624
109038	NC_017026	TCC	2	6	4379522	4379527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109039	NC_017026	CT	3	6	4379530	4379535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109040	NC_017026	CACT	2	8	4379557	4379564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109041	NC_017026	GGT	2	6	4379600	4379605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109042	NC_017026	GCT	2	6	4379610	4379615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109043	NC_017026	GCT	2	6	4379754	4379759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109044	NC_017026	CAC	2	6	4379801	4379806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109045	NC_017026	AAC	2	6	4379814	4379819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109046	NC_017026	CAA	2	6	4380054	4380059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.