MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017026	CAG	2	6	406864	406869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_017026	GT	3	6	406889	406894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_017026	GGC	2	6	406921	406926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_017026	GCA	2	6	406950	406955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017026	CGC	2	6	406996	407001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_017026	GTGC	2	8	407095	407102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10007	NC_017026	GCC	2	6	407111	407116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_017026	AGC	2	6	407174	407179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_017026	GCACG	2	10	407217	407226	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10010	NC_017026	CAG	3	9	407386	407394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_017026	GC	4	8	407410	407417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_017026	TCG	2	6	407430	407435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_017026	GGC	2	6	407509	407514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_017026	CAGC	2	8	407545	407552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_017026	AAC	2	6	407555	407560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_017026	CGT	2	6	407583	407588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_017026	TCG	2	6	407657	407662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_017026	CGCGG	2	10	407749	407758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10019	NC_017026	TCG	2	6	407831	407836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_017026	CCG	2	6	407871	407876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_017026	GTG	3	9	407926	407934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_017026	CGA	2	6	407943	407948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_017026	CAT	2	6	407961	407966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_017026	GACT	2	8	407968	407975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10025	NC_017026	CGC	2	6	407983	407988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_017026	GT	3	6	407990	407995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10030	NC_017026	TCG	2	6	408137	408142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_017026	GGC	2	6	408144	408149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_017026	ATGA	2	8	408214	408221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_017026	CGAG	2	8	408277	408284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_017026	GGT	2	6	408334	408339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_017026	GCC	2	6	408357	408362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_017026	ACC	2	6	408363	408368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_017026	CGT	2	6	408433	408438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10039	NC_017026	GGC	2	6	408474	408479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_017026	GCG	2	6	408506	408511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_017026	GT	3	6	408514	408519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_017026	GGC	2	6	408524	408529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_017026	GGT	2	6	408539	408544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10049	NC_017026	CGG	3	9	408717	408725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_017026	CGG	2	6	408805	408810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_017026	AGG	2	6	408883	408888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10060	NC_017026	CTT	2	6	409601	409606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_017026	CGC	2	6	409673	409678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_017026	TCGT	2	8	409683	409690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10063	NC_017026	CGC	2	6	409738	409743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_017026	GGC	2	6	409760	409765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_017026	CGC	2	6	409829	409834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10090	NC_017026	CGG	2	6	410674	410679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10099	NC_017026	GCC	2	6	410992	410997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10102	NC_017026	CCG	2	6	411111	411116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10103	NC_017026	CGAG	2	8	411149	411156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_017026	GTCGG	2	10	411195	411204	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10105	NC_017026	TCG	2	6	411210	411215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_017026	GATC	2	8	411220	411227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10107	NC_017026	ATCGCC	2	12	411233	411244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_017026	GTG	2	6	411258	411263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_017026	GTG	2	6	411320	411325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_017026	GCT	2	6	411334	411339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_017026	GTG	2	6	411416	411421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017026	CGT	2	6	411427	411432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_017026	GCC	2	6	411470	411475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_017026	GC	3	6	411585	411590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_017026	GCT	2	6	411598	411603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_017026	GCGGG	2	10	411604	411613	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10117	NC_017026	GGC	2	6	411641	411646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_017026	GCT	2	6	411679	411684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_017026	TGG	2	6	411705	411710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_017026	CCAG	2	8	411720	411727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_017026	CCA	2	6	411766	411771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_017026	CCA	2	6	411798	411803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10123	NC_017026	GACC	2	8	411805	411812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_017026	CAATGC	2	12	411838	411849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_017026	ATC	2	6	411884	411889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_017026	TCA	2	6	411896	411901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_017026	CG	3	6	412001	412006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10129	NC_017026	GGT	2	6	412090	412095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_017026	GCG	2	6	412138	412143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_017026	CAG	2	6	412157	412162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_017026	ACAG	2	8	412171	412178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10133	NC_017026	GCA	2	6	412186	412191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_017026	CTG	2	6	412221	412226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10137	NC_017026	TCGC	2	8	412413	412420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10138	NC_017026	CAG	2	6	412455	412460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10140	NC_017026	GGC	2	6	412577	412582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10141	NC_017026	GTC	2	6	412603	412608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10142	NC_017026	GGT	2	6	412609	412614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_017026	GTT	2	6	412624	412629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10145	NC_017026	ACAA	2	8	412689	412696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10146	NC_017026	TGC	2	6	412704	412709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10151	NC_017026	CTG	2	6	412812	412817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306267
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10253	NC_017026	TCG	2	6	417210	417215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306271
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10256	NC_017026	CG	3	6	417266	417271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10371	NC_017026	AGTC	2	8	422571	422578	25 %	25 %	25 %	25 %	383306276
10372	NC_017026	GAC	2	6	422579	422584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306276
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10495	NC_017026	CCG	2	6	429188	429193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306279
10496	NC_017026	GA	3	6	429194	429199	50 %	0 %	50 %	0 %	383306279
10497	NC_017026	CCG	2	6	429269	429274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306279
10498	NC_017026	GAA	2	6	429334	429339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306279
10499	NC_017026	TGC	2	6	429351	429356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306279
10500	NC_017026	CGGTAC	2	12	429378	429389	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383306279

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