MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 109046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017026	CAACGC	2	12	228439	228450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_017026	GTT	2	6	228486	228491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017026	GAC	2	6	228499	228504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017026	AGG	2	6	228545	228550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017026	TGC	2	6	228551	228556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017026	CGC	2	6	228595	228600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_017026	CGA	2	6	228672	228677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_017026	GT	3	6	228766	228771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017026	GCA	2	6	228804	228809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017026	CACC	2	8	228841	228848	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5511	NC_017026	CGC	2	6	228865	228870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_017026	CTG	2	6	228871	228876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_017026	CTG	2	6	228907	228912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017026	TGG	2	6	228914	228919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017026	CTG	2	6	228940	228945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017026	CGC	2	6	228985	228990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_017026	TGG	2	6	229009	229014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017026	CGT	2	6	229122	229127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017026	GCCTGG	2	12	229145	229156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_017026	GAC	2	6	229168	229173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_017026	CCG	2	6	229202	229207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_017026	GTG	2	6	229264	229269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017026	TGG	2	6	229286	229291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017026	GCT	2	6	229293	229298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017026	CAC	2	6	229332	229337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_017026	CGG	2	6	229396	229401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_017026	CGG	2	6	229448	229453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_017026	GAC	2	6	229519	229524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_017026	GCT	2	6	229554	229559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017026	TAC	2	6	229567	229572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_017026	ACC	2	6	229603	229608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_017026	TCGG	2	8	229654	229661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_017026	TGT	2	6	229694	229699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017026	CGA	2	6	229731	229736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017026	GCG	2	6	229747	229752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017026	GGC	2	6	229755	229760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_017026	GCT	2	6	229776	229781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017026	CGT	2	6	229796	229801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017026	CGG	2	6	229805	229810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_017026	GTG	2	6	229832	229837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017026	CCGG	2	8	229915	229922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_017026	GGT	2	6	229929	229934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017026	TCG	2	6	229937	229942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017026	TGG	2	6	229979	229984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017026	ACGG	2	8	230132	230139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_017026	GAT	2	6	230196	230201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017026	CCG	2	6	230258	230263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_017026	CTG	3	9	230317	230325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017026	GTG	2	6	230365	230370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017026	CACCCT	2	12	230379	230390	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_017026	GAC	2	6	230403	230408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_017026	GCT	2	6	230512	230517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_017026	GGC	2	6	230541	230546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017026	AACT	2	8	230764	230771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_017026	TGT	2	6	230904	230909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017026	GGAA	2	8	230939	230946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017026	CAC	2	6	230947	230952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_017026	G	6	6	230954	230959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017026	GAG	2	6	231005	231010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017026	TCC	2	6	231015	231020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_017026	GGT	2	6	231067	231072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306128
5562	NC_017026	GCGA	2	8	231074	231081	25 %	0 %	50 %	25 %	383306128
5563	NC_017026	GC	3	6	231139	231144	0 %	0 %	50 %	50 %	383306128
5564	NC_017026	CCA	2	6	231186	231191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306128
5565	NC_017026	GTC	3	9	231263	231271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306128
5566	NC_017026	CGA	2	6	231274	231279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306128
5567	NC_017026	GAT	2	6	231304	231309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306128
5568	NC_017026	GTT	2	6	231328	231333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306128
5569	NC_017026	TCG	2	6	231363	231368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306128
5570	NC_017026	CCG	2	6	231384	231389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306128
5571	NC_017026	GCC	2	6	231393	231398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306128
5572	NC_017026	CCG	2	6	231456	231461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306128
5573	NC_017026	AC	3	6	231468	231473	50 %	0 %	0 %	50 %	383306128
5574	NC_017026	GCC	2	6	231479	231484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306128
5575	NC_017026	TGC	2	6	231510	231515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306128
5576	NC_017026	GCAC	2	8	231537	231544	25 %	0 %	25 %	50 %	383306128
5577	NC_017026	CGCA	2	8	231629	231636	25 %	0 %	25 %	50 %	383306128
5578	NC_017026	TGCGC	2	10	231649	231658	0 %	20 %	40 %	40 %	383306128
5579	NC_017026	TGAT	2	8	231671	231678	25 %	50 %	25 %	0 %	383306128
5580	NC_017026	ACGT	2	8	231691	231698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_017026	GGCCG	2	10	231701	231710	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5582	NC_017026	GTG	2	6	231722	231727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017026	ACAT	2	8	231758	231765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_017026	GCG	2	6	231780	231785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_017026	TGG	2	6	231808	231813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306129
5586	NC_017026	TGC	2	6	231871	231876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306129
5587	NC_017026	GCG	2	6	231883	231888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306129
5588	NC_017026	ACT	2	6	231910	231915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306129
5589	NC_017026	CGC	2	6	231974	231979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306129
5590	NC_017026	G	6	6	231998	232003	0 %	0 %	100 %	0 %	383306129
5591	NC_017026	GCT	2	6	232010	232015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306129
5592	NC_017026	CAG	2	6	232041	232046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306129
5593	NC_017026	CGC	2	6	232082	232087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306129
5594	NC_017026	GGCG	2	8	232100	232107	0 %	0 %	75 %	25 %	383306129
5595	NC_017026	CG	3	6	232142	232147	0 %	0 %	50 %	50 %	383306129
5596	NC_017026	GCG	2	6	232152	232157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306129
5597	NC_017026	CCG	2	6	232212	232217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306129
5598	NC_017026	GCG	2	6	232286	232291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306129
5599	NC_017026	CGC	2	6	232300	232305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306129
5600	NC_017026	CTG	3	9	232335	232343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306129
5601	NC_017026	GAT	2	6	232366	232371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306129
5602	NC_017026	TCG	2	6	232428	232433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306130
5603	NC_017026	CGA	2	6	232441	232446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306130
5604	NC_017026	CAA	2	6	232507	232512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306130
5605	NC_017026	AAC	2	6	232538	232543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306130
5606	NC_017026	GCC	2	6	232569	232574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306130
5607	NC_017026	GAG	2	6	232592	232597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306130
5608	NC_017026	CGG	2	6	232660	232665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306130
5609	NC_017026	TCT	2	6	232674	232679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306130
5610	NC_017026	CGG	4	12	232684	232695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306130
5611	NC_017026	CGG	2	6	232711	232716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306130
5612	NC_017026	GCG	2	6	232725	232730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306130
5613	NC_017026	CGG	2	6	232819	232824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306130
5614	NC_017026	CG	3	6	232830	232835	0 %	0 %	50 %	50 %	383306130
5615	NC_017026	TCG	2	6	232866	232871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306130
5616	NC_017026	GAA	2	6	232873	232878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306130
5617	NC_017026	GAT	2	6	232951	232956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306130
5618	NC_017026	GATC	2	8	232960	232967	25 %	25 %	25 %	25 %	383306130
5619	NC_017026	CGT	2	6	232969	232974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306130
5620	NC_017026	GGC	2	6	233041	233046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306130
5621	NC_017026	GC	3	6	233125	233130	0 %	0 %	50 %	50 %	383306130
5622	NC_017026	GAG	2	6	233183	233188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306130
5623	NC_017026	TTG	2	6	233189	233194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306130
5624	NC_017026	CCG	2	6	233220	233225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306130
5625	NC_017026	CAG	2	6	233258	233263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306130
5626	NC_017026	GCT	2	6	233299	233304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306130
5627	NC_017026	TCG	2	6	233354	233359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306130
5628	NC_017026	TAT	2	6	233413	233418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383306130
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5631	NC_017026	GAT	2	6	233488	233493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306130
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5732	NC_017026	TGG	2	6	237482	237487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306133
5733	NC_017026	CGT	2	6	237520	237525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306133
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5737	NC_017026	GAC	2	6	237636	237641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306133
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5740	NC_017026	GAT	2	6	237762	237767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306133
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5742	NC_017026	GGC	2	6	237861	237866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306133
5743	NC_017026	GCG	2	6	237955	237960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306133
5744	NC_017026	GGCT	2	8	237997	238004	0 %	25 %	50 %	25 %	383306133
5745	NC_017026	CGCT	2	8	238029	238036	0 %	25 %	25 %	50 %	383306133
5746	NC_017026	CGG	2	6	238043	238048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306134
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5867	NC_017026	CAG	2	6	243062	243067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306137
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5991	NC_017026	TCA	3	9	248255	248263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306141
5992	NC_017026	AAC	2	6	248307	248312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306141
5993	NC_017026	GCC	2	6	248324	248329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306141
5994	NC_017026	GAC	2	6	248369	248374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306141
5995	NC_017026	GCA	2	6	248383	248388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306141
5996	NC_017026	GCCG	2	8	248432	248439	0 %	0 %	50 %	50 %	383306141
5997	NC_017026	GGTC	2	8	248467	248474	0 %	25 %	50 %	25 %	383306141
5998	NC_017026	GCG	2	6	248475	248480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306141
5999	NC_017026	GCA	2	6	248482	248487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306141
6000	NC_017026	CAC	2	6	248488	248493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306141

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