MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 109517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016768	GCGTGC	2	12	127341	127352	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375294309
3002	NC_016768	CG	5	10	127379	127388	0 %	0 %	50 %	50 %	375294309
3003	NC_016768	GCA	2	6	127396	127401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3004	NC_016768	CGG	2	6	127405	127410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3005	NC_016768	GGT	2	6	127421	127426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294309
3006	NC_016768	TGC	2	6	127456	127461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3007	NC_016768	GC	3	6	127468	127473	0 %	0 %	50 %	50 %	375294309
3008	NC_016768	ACC	2	6	127476	127481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3009	NC_016768	GCGAG	2	10	127556	127565	20 %	0 %	60 %	20 %	375294309
3010	NC_016768	GCG	2	6	127599	127604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3011	NC_016768	CCA	2	6	127624	127629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3012	NC_016768	GCA	2	6	127705	127710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3013	NC_016768	GCC	2	6	127733	127738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3014	NC_016768	GCA	2	6	127753	127758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3015	NC_016768	GCC	2	6	127797	127802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3016	NC_016768	CCG	2	6	127819	127824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3017	NC_016768	CG	3	6	127829	127834	0 %	0 %	50 %	50 %	375294309
3018	NC_016768	GCG	2	6	127839	127844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3019	NC_016768	CG	3	6	127871	127876	0 %	0 %	50 %	50 %	375294309
3020	NC_016768	CGA	2	6	127888	127893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3021	NC_016768	TGC	2	6	127897	127902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3022	NC_016768	TCG	2	6	127995	128000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3023	NC_016768	CCA	2	6	128017	128022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3024	NC_016768	GC	3	6	128027	128032	0 %	0 %	50 %	50 %	375294309
3025	NC_016768	CCG	2	6	128035	128040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3026	NC_016768	ACC	2	6	128043	128048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3027	NC_016768	GCC	2	6	128127	128132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3028	NC_016768	CCG	2	6	128158	128163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3029	NC_016768	CAC	3	9	128165	128173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3030	NC_016768	CGG	2	6	128209	128214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3031	NC_016768	CCG	2	6	128215	128220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3032	NC_016768	TCA	2	6	128266	128271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294309
3033	NC_016768	TGC	2	6	128299	128304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3034	NC_016768	TGC	2	6	128318	128323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3035	NC_016768	GCG	2	6	128416	128421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3036	NC_016768	GTC	2	6	128444	128449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3037	NC_016768	GCC	2	6	128458	128463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3038	NC_016768	GCC	2	6	128501	128506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3039	NC_016768	GGGGT	2	10	128565	128574	0 %	20 %	80 %	0 %	375294309
3040	NC_016768	GCA	2	6	128584	128589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3041	NC_016768	GGC	2	6	128594	128599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3042	NC_016768	GCGGCA	2	12	128628	128639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375294309
3043	NC_016768	GCTG	2	8	128666	128673	0 %	25 %	50 %	25 %	375294309
3044	NC_016768	TGG	2	6	128677	128682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294309
3045	NC_016768	CAA	2	6	128705	128710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294309
3046	NC_016768	GGT	2	6	128723	128728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294309
3047	NC_016768	CCG	2	6	128800	128805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3048	NC_016768	TCG	2	6	128862	128867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3049	NC_016768	CG	3	6	128966	128971	0 %	0 %	50 %	50 %	375294309
3050	NC_016768	ACC	2	6	129066	129071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3051	NC_016768	GCA	2	6	129097	129102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3052	NC_016768	CCCAC	2	10	129127	129136	20 %	0 %	0 %	80 %	375294309
3053	NC_016768	ACC	2	6	129165	129170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3054	NC_016768	TCGGGT	2	12	129267	129278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375294309
3055	NC_016768	GTC	3	9	129323	129331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3056	NC_016768	TGCA	2	8	129353	129360	25 %	25 %	25 %	25 %	375294309
3057	NC_016768	ACC	2	6	129405	129410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3058	NC_016768	GGC	2	6	129424	129429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3059	NC_016768	CCG	2	6	129487	129492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3060	NC_016768	GCCG	2	8	129545	129552	0 %	0 %	50 %	50 %	375294309
3061	NC_016768	ACC	2	6	129563	129568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3062	NC_016768	CCA	2	6	129574	129579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3063	NC_016768	CCGGC	2	10	129637	129646	0 %	0 %	40 %	60 %	375294309
3064	NC_016768	CCG	2	6	129687	129692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3065	NC_016768	ACG	2	6	129696	129701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
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3068	NC_016768	CGA	2	6	129767	129772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3069	NC_016768	GAT	2	6	129773	129778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294309
3070	NC_016768	CAC	2	6	129782	129787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3071	NC_016768	GCC	2	6	129852	129857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3072	NC_016768	AGC	2	6	129894	129899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3073	NC_016768	GCC	3	9	129930	129938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3074	NC_016768	GCG	2	6	129945	129950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3075	NC_016768	TGG	2	6	130039	130044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294309
3076	NC_016768	TGCGG	2	10	130047	130056	0 %	20 %	60 %	20 %	375294309
3077	NC_016768	CGA	2	6	130181	130186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294309
3078	NC_016768	CCAG	2	8	130194	130201	25 %	0 %	25 %	50 %	375294309
3079	NC_016768	ACC	2	6	130284	130289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3080	NC_016768	CTC	2	6	130349	130354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375294309
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3082	NC_016768	CGG	2	6	130442	130447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294309
3083	NC_016768	CAC	2	6	130511	130516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3084	NC_016768	CAC	2	6	130523	130528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3085	NC_016768	CCG	2	6	130570	130575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294309
3086	NC_016768	CTGT	2	8	130612	130619	0 %	50 %	25 %	25 %	375294309
3087	NC_016768	CAC	2	6	130636	130641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294309
3088	NC_016768	GCGA	2	8	130798	130805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_016768	CGGG	2	8	130841	130848	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_016768	ACG	2	6	130898	130903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_016768	G	6	6	131006	131011	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016768	CGA	2	6	131013	131018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_016768	GGT	2	6	131037	131042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294310
3094	NC_016768	CCG	2	6	131064	131069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294310
3095	NC_016768	TGG	2	6	131096	131101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294310
3096	NC_016768	CAC	2	6	131125	131130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294310
3097	NC_016768	CGG	2	6	131347	131352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_016768	GCTC	2	8	131353	131360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_016768	GGT	2	6	131364	131369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_016768	CCA	2	6	131476	131481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294311
3101	NC_016768	ATCAC	2	10	131526	131535	40 %	20 %	0 %	40 %	375294311
3102	NC_016768	GCG	2	6	131550	131555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3103	NC_016768	ATCGG	2	10	131574	131583	20 %	20 %	40 %	20 %	375294311
3104	NC_016768	CGA	2	6	131617	131622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294311
3105	NC_016768	GCA	2	6	131825	131830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294311
3106	NC_016768	CCCA	2	8	131856	131863	25 %	0 %	0 %	75 %	375294311
3107	NC_016768	ATC	2	6	131883	131888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294311
3108	NC_016768	CGG	2	6	131936	131941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3109	NC_016768	CGG	2	6	131966	131971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3110	NC_016768	CGG	2	6	131975	131980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3111	NC_016768	GGT	2	6	131994	131999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294311
3112	NC_016768	CGG	2	6	132002	132007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3113	NC_016768	CGG	2	6	132029	132034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3114	NC_016768	CGG	2	6	132038	132043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3115	NC_016768	CGG	2	6	132047	132052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3116	NC_016768	GCGG	2	8	132072	132079	0 %	0 %	75 %	25 %	375294311
3117	NC_016768	GGCG	2	8	132080	132087	0 %	0 %	75 %	25 %	375294311
3118	NC_016768	GCT	2	6	132098	132103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294311
3119	NC_016768	CGG	2	6	132113	132118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3120	NC_016768	CGG	2	6	132122	132127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3121	NC_016768	CAC	2	6	132143	132148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294311
3122	NC_016768	CGG	2	6	132173	132178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3123	NC_016768	CGG	2	6	132212	132217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3124	NC_016768	GCG	2	6	132223	132228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3125	NC_016768	CGG	2	6	132230	132235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3126	NC_016768	CGG	2	6	132254	132259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3127	NC_016768	CGG	2	6	132272	132277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3128	NC_016768	CCG	2	6	132280	132285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294311
3129	NC_016768	CGG	2	6	132299	132304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
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3137	NC_016768	CGG	2	6	132443	132448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
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3140	NC_016768	CGG	2	6	132488	132493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3141	NC_016768	CGG	2	6	132509	132514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294311
3142	NC_016768	TCG	2	6	132544	132549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294311
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3190	NC_016768	CGGG	2	8	134065	134072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3191	NC_016768	GTCG	2	8	134133	134140	0 %	25 %	50 %	25 %	375294313
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3198	NC_016768	GCT	3	9	134312	134320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294313
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3202	NC_016768	GCGAT	2	10	134470	134479	20 %	20 %	40 %	20 %	375294313
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3213	NC_016768	GGCT	2	8	134938	134945	0 %	25 %	50 %	25 %	375294313
3214	NC_016768	GAC	2	6	134957	134962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294313
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3219	NC_016768	GGCCC	2	10	135189	135198	0 %	0 %	40 %	60 %	375294313
3220	NC_016768	GGT	2	6	135224	135229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294313
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3224	NC_016768	GTT	2	6	135351	135356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294313
3225	NC_016768	CGG	2	6	135409	135414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294313
3226	NC_016768	CGC	2	6	135416	135421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294313
3227	NC_016768	TCGCCG	2	12	135426	135437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375294313
3228	NC_016768	GCC	2	6	135539	135544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294313
3229	NC_016768	GGCC	2	8	135658	135665	0 %	0 %	50 %	50 %	375294313
3230	NC_016768	CGTTG	2	10	135701	135710	0 %	40 %	40 %	20 %	375294313
3231	NC_016768	TCG	2	6	135715	135720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294313
3232	NC_016768	CGACC	2	10	135773	135782	20 %	0 %	20 %	60 %	375294313
3233	NC_016768	AGCG	2	8	135811	135818	25 %	0 %	50 %	25 %	375294313
3234	NC_016768	CAC	2	6	135857	135862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294313
3235	NC_016768	CGG	2	6	135878	135883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294313
3236	NC_016768	GGA	2	6	135911	135916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294313
3237	NC_016768	CAA	2	6	135998	136003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294313
3238	NC_016768	CCG	2	6	136141	136146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3239	NC_016768	TG	3	6	136187	136192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_016768	TGA	2	6	136208	136213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_016768	GTG	2	6	136224	136229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_016768	GC	4	8	136322	136329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3243	NC_016768	ATG	2	6	136451	136456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294314
3244	NC_016768	GCC	2	6	136484	136489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294314
3245	NC_016768	CTAC	2	8	136506	136513	25 %	25 %	0 %	50 %	375294314
3246	NC_016768	CGG	2	6	136650	136655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294314
3247	NC_016768	CCGG	2	8	136666	136673	0 %	0 %	50 %	50 %	375294314
3248	NC_016768	ACC	2	6	136685	136690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294314
3249	NC_016768	CGCA	2	8	136740	136747	25 %	0 %	25 %	50 %	375294314
3250	NC_016768	ATT	2	6	136751	136756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375294314
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3257	NC_016768	TGATGC	2	12	137085	137096	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375294314
3258	NC_016768	CTT	2	6	137225	137230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375294314
3259	NC_016768	CGA	2	6	137239	137244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294314
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3265	NC_016768	GAG	2	6	137403	137408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_016768	CTG	2	6	137467	137472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294315
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3273	NC_016768	TACG	2	8	138154	138161	25 %	25 %	25 %	25 %	375294316
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3352	NC_016768	ACG	2	6	141638	141643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294319
3353	NC_016768	GGCT	2	8	141708	141715	0 %	25 %	50 %	25 %	375294319
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3361	NC_016768	CG	3	6	142109	142114	0 %	0 %	50 %	50 %	375294319
3362	NC_016768	GC	3	6	142209	142214	0 %	0 %	50 %	50 %	375294319
3363	NC_016768	GGCGCT	2	12	142216	142227	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375294319
3364	NC_016768	CGC	2	6	142268	142273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294319
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3368	NC_016768	TCG	2	6	142546	142551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294320
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