MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 109517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016768	GTC	2	6	572281	572286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294692
14002	NC_016768	ACGAC	2	10	572342	572351	40 %	0 %	20 %	40 %	375294692
14003	NC_016768	CAC	2	6	572415	572420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294692
14004	NC_016768	ATT	2	6	572497	572502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375294692
14005	NC_016768	GCC	2	6	572530	572535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294692
14006	NC_016768	ACC	2	6	572557	572562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294692
14007	NC_016768	GGC	2	6	572578	572583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294692
14008	NC_016768	CGA	2	6	572598	572603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294692
14009	NC_016768	TAC	2	6	572641	572646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294692
14010	NC_016768	CGG	2	6	572648	572653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294692
14011	NC_016768	ACC	2	6	572656	572661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294692
14012	NC_016768	GTCGAC	2	12	572662	572673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375294692
14013	NC_016768	GC	3	6	572714	572719	0 %	0 %	50 %	50 %	375294692
14014	NC_016768	AT	3	6	572723	572728	50 %	50 %	0 %	0 %	375294692
14015	NC_016768	GTC	3	9	572747	572755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294692
14016	NC_016768	GGT	2	6	572757	572762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294692
14017	NC_016768	TCG	2	6	572776	572781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294692
14018	NC_016768	GTC	2	6	572794	572799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294692
14019	NC_016768	TCA	2	6	572813	572818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294692
14020	NC_016768	GC	3	6	572854	572859	0 %	0 %	50 %	50 %	375294692
14021	NC_016768	CGT	2	6	572883	572888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294692
14022	NC_016768	GCC	2	6	572926	572931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294692
14023	NC_016768	CAA	2	6	572973	572978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294692
14024	NC_016768	TAC	2	6	573079	573084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294692
14025	NC_016768	CGG	2	6	573215	573220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294692
14026	NC_016768	CGG	2	6	573227	573232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294692
14027	NC_016768	ACT	2	6	573301	573306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294692
14028	NC_016768	GGGT	2	8	573315	573322	0 %	25 %	75 %	0 %	375294692
14029	NC_016768	CGG	2	6	573427	573432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294693
14030	NC_016768	CTA	2	6	573433	573438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294693
14031	NC_016768	CG	3	6	573467	573472	0 %	0 %	50 %	50 %	375294693
14032	NC_016768	CAG	2	6	573557	573562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294693
14033	NC_016768	CGC	2	6	573565	573570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294693
14034	NC_016768	GC	3	6	573586	573591	0 %	0 %	50 %	50 %	375294693
14035	NC_016768	GCC	2	6	573623	573628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294693
14036	NC_016768	GGTGAC	2	12	573656	573667	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375294693
14037	NC_016768	GCA	2	6	573700	573705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294693
14038	NC_016768	GC	3	6	573706	573711	0 %	0 %	50 %	50 %	375294693
14039	NC_016768	CATC	2	8	573749	573756	25 %	25 %	0 %	50 %	375294693
14040	NC_016768	ATCGGC	2	12	573770	573781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375294693
14041	NC_016768	GTT	2	6	573812	573817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294693
14042	NC_016768	GC	3	6	573841	573846	0 %	0 %	50 %	50 %	375294693
14043	NC_016768	CGG	2	6	573862	573867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294693
14044	NC_016768	CGT	2	6	573868	573873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294693
14045	NC_016768	CCG	2	6	573900	573905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294693
14046	NC_016768	GTC	2	6	574053	574058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294693
14047	NC_016768	TAA	2	6	574072	574077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_016768	GT	3	6	574094	574099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_016768	ACG	2	6	574120	574125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_016768	GTT	2	6	574151	574156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_016768	GCC	2	6	574157	574162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14052	NC_016768	CAG	2	6	574191	574196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_016768	GAA	2	6	574232	574237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_016768	GCC	2	6	574326	574331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294694
14055	NC_016768	CGTC	2	8	574361	574368	0 %	25 %	25 %	50 %	375294694
14056	NC_016768	CGGT	2	8	574394	574401	0 %	25 %	50 %	25 %	375294694
14057	NC_016768	CTG	2	6	574465	574470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14058	NC_016768	CCT	2	6	574479	574484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375294694
14059	NC_016768	GCGG	2	8	574491	574498	0 %	0 %	75 %	25 %	375294694
14060	NC_016768	ACC	2	6	574594	574599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294694
14061	NC_016768	GACCCC	2	12	574647	574658	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	375294694
14062	NC_016768	GGCGCC	2	12	574724	574735	0 %	0 %	50 %	50 %	375294694
14063	NC_016768	TGG	2	6	574761	574766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294694
14064	NC_016768	GCG	2	6	574920	574925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294694
14065	NC_016768	TCG	2	6	574939	574944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14066	NC_016768	TGA	2	6	574988	574993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294694
14067	NC_016768	CGG	2	6	575067	575072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294694
14068	NC_016768	CGA	2	6	575100	575105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14069	NC_016768	GCT	2	6	575116	575121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14070	NC_016768	CCG	2	6	575124	575129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294694
14071	NC_016768	ATC	2	6	575137	575142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294694
14072	NC_016768	TGC	2	6	575198	575203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14073	NC_016768	GCT	2	6	575238	575243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14074	NC_016768	GCT	2	6	575280	575285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14075	NC_016768	CGA	2	6	575304	575309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294694
14076	NC_016768	GTG	3	9	575311	575319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294694
14077	NC_016768	GGC	2	6	575367	575372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294694
14078	NC_016768	AGG	2	6	575438	575443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294694
14079	NC_016768	GGCA	2	8	575448	575455	25 %	0 %	50 %	25 %	375294694
14080	NC_016768	GCG	2	6	575499	575504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294694
14081	NC_016768	GC	3	6	575510	575515	0 %	0 %	50 %	50 %	375294694
14082	NC_016768	CG	3	6	575579	575584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14083	NC_016768	GTCCG	2	10	575656	575665	0 %	20 %	40 %	40 %	375294695
14084	NC_016768	CG	3	6	575686	575691	0 %	0 %	50 %	50 %	375294695
14085	NC_016768	GCA	2	6	575724	575729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14086	NC_016768	GAC	2	6	575730	575735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14087	NC_016768	GCT	2	6	575750	575755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14088	NC_016768	CGG	2	6	575801	575806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294695
14089	NC_016768	TGC	2	6	575821	575826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14090	NC_016768	GGT	2	6	575903	575908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294695
14091	NC_016768	GTG	2	6	575940	575945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294695
14092	NC_016768	CCCA	2	8	575982	575989	25 %	0 %	0 %	75 %	375294695
14093	NC_016768	CGC	2	6	576002	576007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294695
14094	NC_016768	TGC	2	6	576013	576018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14095	NC_016768	GC	3	6	576017	576022	0 %	0 %	50 %	50 %	375294695
14096	NC_016768	TAC	2	6	576045	576050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294695
14097	NC_016768	ACT	2	6	576067	576072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294695
14098	NC_016768	GGCT	2	8	576090	576097	0 %	25 %	50 %	25 %	375294695
14099	NC_016768	GC	3	6	576099	576104	0 %	0 %	50 %	50 %	375294695
14100	NC_016768	CA	3	6	576136	576141	50 %	0 %	0 %	50 %	375294695
14101	NC_016768	GCC	2	6	576147	576152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294695
14102	NC_016768	GAA	2	6	576155	576160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294695
14103	NC_016768	CGACGG	2	12	576173	576184	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375294695
14104	NC_016768	GCC	2	6	576191	576196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294695
14105	NC_016768	AGC	2	6	576214	576219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14106	NC_016768	GTC	2	6	576222	576227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14107	NC_016768	CGA	2	6	576257	576262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14108	NC_016768	GC	3	6	576362	576367	0 %	0 %	50 %	50 %	375294695
14109	NC_016768	GTG	2	6	576405	576410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294695
14110	NC_016768	TCG	2	6	576415	576420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14111	NC_016768	TGC	2	6	576454	576459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14112	NC_016768	GCC	2	6	576465	576470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294695
14113	NC_016768	CAT	2	6	576488	576493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294695
14114	NC_016768	CGG	2	6	576500	576505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294695
14115	NC_016768	CGGA	2	8	576532	576539	25 %	0 %	50 %	25 %	375294695
14116	NC_016768	CGA	2	6	576554	576559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294695
14117	NC_016768	GCC	2	6	576590	576595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294695
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14119	NC_016768	GGT	2	6	576710	576715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294695
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14238	NC_016768	TGA	2	6	581042	581047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294701
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