MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 109517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016768	GCG	2	6	530376	530381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294645
13002	NC_016768	ACC	2	6	530403	530408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294645
13003	NC_016768	CGT	2	6	530414	530419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294645
13004	NC_016768	GGC	2	6	530460	530465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294645
13005	NC_016768	GAG	2	6	530510	530515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016768	CTC	2	6	530539	530544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13007	NC_016768	GCA	2	6	530632	530637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294646
13008	NC_016768	GC	3	6	530638	530643	0 %	0 %	50 %	50 %	375294646
13009	NC_016768	GCGG	2	8	530663	530670	0 %	0 %	75 %	25 %	375294646
13010	NC_016768	GTC	2	6	530672	530677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294646
13011	NC_016768	CGA	2	6	530713	530718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294646
13012	NC_016768	GGC	2	6	530745	530750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294646
13013	NC_016768	GCA	2	6	530860	530865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294646
13014	NC_016768	CAT	2	6	530899	530904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294646
13015	NC_016768	GGC	3	9	530942	530950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294646
13016	NC_016768	ACCG	2	8	531019	531026	25 %	0 %	25 %	50 %	375294647
13017	NC_016768	CACG	2	8	531120	531127	25 %	0 %	25 %	50 %	375294647
13018	NC_016768	TGC	2	6	531153	531158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294647
13019	NC_016768	AGCC	2	8	531219	531226	25 %	0 %	25 %	50 %	375294647
13020	NC_016768	GCC	2	6	531268	531273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13021	NC_016768	GCG	2	6	531293	531298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294647
13022	NC_016768	GCC	2	6	531398	531403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13023	NC_016768	GCC	2	6	531412	531417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13024	NC_016768	CGG	2	6	531429	531434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294647
13025	NC_016768	GCC	2	6	531446	531451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13026	NC_016768	AGCC	2	8	531456	531463	25 %	0 %	25 %	50 %	375294647
13027	NC_016768	GGC	2	6	531475	531480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294647
13028	NC_016768	CTGC	2	8	531518	531525	0 %	25 %	25 %	50 %	375294647
13029	NC_016768	CCGATG	2	12	531590	531601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375294647
13030	NC_016768	GCC	2	6	531682	531687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13031	NC_016768	TGCCGG	2	12	531819	531830	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375294647
13032	NC_016768	TGT	3	9	531846	531854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294647
13033	NC_016768	TGT	3	9	531861	531869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294647
13034	NC_016768	CTG	2	6	531955	531960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294647
13035	NC_016768	CGC	2	6	532015	532020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13036	NC_016768	GCC	2	6	532049	532054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13037	NC_016768	CAG	2	6	532105	532110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294647
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13039	NC_016768	GCC	2	6	532166	532171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13040	NC_016768	GCC	2	6	532226	532231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13041	NC_016768	CAT	2	6	532267	532272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294647
13042	NC_016768	CGC	3	9	532273	532281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294647
13043	NC_016768	GGAC	2	8	532282	532289	25 %	0 %	50 %	25 %	375294647
13044	NC_016768	CCAG	2	8	532290	532297	25 %	0 %	25 %	50 %	375294647
13045	NC_016768	TTC	2	6	532354	532359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375294647
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13048	NC_016768	GGC	2	6	532603	532608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_016768	CGC	2	6	532669	532674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294648
13050	NC_016768	CGA	2	6	532723	532728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294648
13051	NC_016768	GCT	2	6	532798	532803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294648
13052	NC_016768	CTG	2	6	532973	532978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294648
13053	NC_016768	TAC	2	6	532985	532990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294648
13054	NC_016768	GTG	2	6	533054	533059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294648
13055	NC_016768	CCG	2	6	533075	533080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294648
13056	NC_016768	TCG	2	6	533109	533114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294648
13057	NC_016768	GCC	2	6	533141	533146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294648
13058	NC_016768	CCG	2	6	533180	533185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_016768	GCC	2	6	533257	533262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_016768	TCG	2	6	533282	533287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_016768	CGT	2	6	533461	533466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294649
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13063	NC_016768	CCG	2	6	533499	533504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294649
13064	NC_016768	CAG	2	6	533527	533532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294649
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13071	NC_016768	G	6	6	533695	533700	0 %	0 %	100 %	0 %	375294649
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13081	NC_016768	TCG	2	6	533978	533983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294649
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13089	NC_016768	GC	3	6	534393	534398	0 %	0 %	50 %	50 %	375294650
13090	NC_016768	AGAT	2	8	534477	534484	50 %	25 %	25 %	0 %	375294650
13091	NC_016768	GGT	2	6	534491	534496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294650
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13100	NC_016768	CAG	2	6	534839	534844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294651
13101	NC_016768	GCG	2	6	534865	534870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294651
13102	NC_016768	CCA	2	6	534902	534907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_016768	AGT	2	6	534925	534930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_016768	ATG	2	6	534966	534971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294652
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13106	NC_016768	AGG	2	6	535146	535151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294652
13107	NC_016768	GCA	2	6	535201	535206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294652
13108	NC_016768	TCC	2	6	535224	535229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375294652
13109	NC_016768	TAG	2	6	535295	535300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294652
13110	NC_016768	CGG	2	6	535339	535344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294652
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13112	NC_016768	CGA	2	6	535357	535362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294652
13113	NC_016768	CGA	2	6	535384	535389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294652
13114	NC_016768	GCG	2	6	535406	535411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294652
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13117	NC_016768	G	6	6	535487	535492	0 %	0 %	100 %	0 %	375294653
13118	NC_016768	TCG	2	6	535592	535597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294653
13119	NC_016768	CGC	2	6	535622	535627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294653
13120	NC_016768	CGA	2	6	535692	535697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294653
13121	NC_016768	GT	3	6	535709	535714	0 %	50 %	50 %	0 %	375294653
13122	NC_016768	GAT	2	6	535729	535734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294653
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13124	NC_016768	GCG	2	6	535880	535885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294653
13125	NC_016768	ATC	2	6	535922	535927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294653
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13128	NC_016768	AGCC	2	8	536029	536036	25 %	0 %	25 %	50 %	375294653
13129	NC_016768	TGC	2	6	536039	536044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294653
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13132	NC_016768	CTG	2	6	536143	536148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294653
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13143	NC_016768	AGC	2	6	536645	536650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294653
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13167	NC_016768	GTG	2	6	537454	537459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13201	NC_016768	GGC	2	6	538742	538747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294655
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13206	NC_016768	GACG	2	8	538833	538840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13207	NC_016768	GCT	2	6	538862	538867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
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13211	NC_016768	AGT	2	6	538968	538973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294656
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13214	NC_016768	TGG	2	6	539038	539043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294656
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13218	NC_016768	AGC	2	6	539301	539306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294656
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13220	NC_016768	TGA	2	6	539383	539388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294656
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13226	NC_016768	GAT	2	6	539606	539611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294656
13227	NC_016768	GTCC	2	8	539626	539633	0 %	25 %	25 %	50 %	375294656
13228	NC_016768	GC	3	6	539655	539660	0 %	0 %	50 %	50 %	375294656
13229	NC_016768	GTC	2	6	539705	539710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
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13234	NC_016768	GTA	2	6	540117	540122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294656
13235	NC_016768	TCG	2	6	540169	540174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13236	NC_016768	TCG	2	6	540183	540188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13237	NC_016768	TCG	2	6	540292	540297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13238	NC_016768	TTGC	2	8	540316	540323	0 %	50 %	25 %	25 %	375294656
13239	NC_016768	GA	3	6	540448	540453	50 %	0 %	50 %	0 %	375294656
13240	NC_016768	TTGG	2	8	540479	540486	0 %	50 %	50 %	0 %	375294656
13241	NC_016768	GGTA	2	8	540501	540508	25 %	25 %	50 %	0 %	375294656
13242	NC_016768	CAGG	2	8	540538	540545	25 %	0 %	50 %	25 %	375294656
13243	NC_016768	CGA	2	6	540580	540585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13244	NC_016768	ACC	2	6	540606	540611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294656
13245	NC_016768	ACCC	2	8	540617	540624	25 %	0 %	0 %	75 %	375294656
13246	NC_016768	GCC	2	6	540625	540630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294656
13247	NC_016768	GAG	2	6	540644	540649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294656
13248	NC_016768	GTA	2	6	540863	540868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294656
13249	NC_016768	GGC	2	6	540869	540874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294656
13250	NC_016768	GAT	2	6	540917	540922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294656
13251	NC_016768	GGT	2	6	540983	540988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294656
13252	NC_016768	CG	3	6	541030	541035	0 %	0 %	50 %	50 %	375294656
13253	NC_016768	CAG	2	6	541064	541069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13254	NC_016768	CAA	2	6	541103	541108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294656
13255	NC_016768	ATA	2	6	541110	541115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375294656
13256	NC_016768	CGG	2	6	541223	541228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294656
13257	NC_016768	CGA	2	6	541243	541248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13258	NC_016768	TGC	2	6	541249	541254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13259	NC_016768	GCG	2	6	541282	541287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294656
13260	NC_016768	GGC	2	6	541322	541327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294656
13261	NC_016768	CGT	2	6	541333	541338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13262	NC_016768	CGG	2	6	541354	541359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294656
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13264	NC_016768	CTT	2	6	541400	541405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375294656
13265	NC_016768	CGT	2	6	541432	541437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13266	NC_016768	GGTT	2	8	541464	541471	0 %	50 %	50 %	0 %	375294656
13267	NC_016768	TAT	2	6	541478	541483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375294656
13268	NC_016768	CCTT	2	8	541509	541516	0 %	50 %	0 %	50 %	375294656
13269	NC_016768	ACG	2	6	541549	541554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13270	NC_016768	ACG	2	6	541629	541634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294656
13271	NC_016768	GCCA	3	12	541641	541652	25 %	0 %	25 %	50 %	375294656
13272	NC_016768	GAT	2	6	541655	541660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294656
13273	NC_016768	ATC	2	6	541680	541685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294656
13274	NC_016768	AGTA	2	8	541767	541774	50 %	25 %	25 %	0 %	375294657
13275	NC_016768	CCG	2	6	541881	541886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294657
13276	NC_016768	CGT	2	6	541887	541892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294657
13277	NC_016768	G	6	6	541987	541992	0 %	0 %	100 %	0 %	375294657
13278	NC_016768	ACG	2	6	542061	542066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294657
13279	NC_016768	GAA	2	6	542083	542088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294657
13280	NC_016768	CGA	2	6	542118	542123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294657
13281	NC_016768	ACC	3	9	542126	542134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294657
13282	NC_016768	CGG	2	6	542210	542215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13283	NC_016768	AGCCT	2	10	542270	542279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13284	NC_016768	GC	3	6	542439	542444	0 %	0 %	50 %	50 %	375294658
13285	NC_016768	GCG	3	9	542473	542481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294658
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13287	NC_016768	CG	3	6	542493	542498	0 %	0 %	50 %	50 %	375294658
13288	NC_016768	CGCTGG	2	12	542501	542512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375294658
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13303	NC_016768	GGC	2	6	543154	543159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13304	NC_016768	CTT	2	6	543180	543185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13305	NC_016768	ATAGTC	2	12	543231	543242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13306	NC_016768	TTG	2	6	543245	543250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13307	NC_016768	GC	4	8	543347	543354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13308	NC_016768	TG	3	6	543383	543388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13309	NC_016768	ATGG	2	8	543450	543457	25 %	25 %	50 %	0 %	375294659
13310	NC_016768	CCG	2	6	543463	543468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294659
13311	NC_016768	TTG	2	6	543484	543489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294659
13312	NC_016768	AGT	2	6	543490	543495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294659
13313	NC_016768	GGGCCG	3	18	543496	543513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294659
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13315	NC_016768	GTC	2	6	543537	543542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294659
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13320	NC_016768	CGG	2	6	543698	543703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294659
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13322	NC_016768	CGC	2	6	543735	543740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294659
13323	NC_016768	TGG	2	6	543746	543751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294659
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13339	NC_016768	TGC	2	6	544277	544282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294659
13340	NC_016768	CTGG	2	8	544293	544300	0 %	25 %	50 %	25 %	375294659
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13342	NC_016768	C	6	6	544399	544404	0 %	0 %	0 %	100 %	375294659
13343	NC_016768	GCC	2	6	544498	544503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294659
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13345	NC_016768	CCGG	2	8	544522	544529	0 %	0 %	50 %	50 %	375294659
13346	NC_016768	CGG	2	6	544569	544574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294659
13347	NC_016768	CGCC	2	8	544628	544635	0 %	0 %	25 %	75 %	375294659
13348	NC_016768	CGC	2	6	544656	544661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294659
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13350	NC_016768	TCA	2	6	544704	544709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294659
13351	NC_016768	CGA	2	6	544723	544728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294659
13352	NC_016768	GCG	3	9	544729	544737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294659
13353	NC_016768	CGA	2	6	544755	544760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294659
13354	NC_016768	TCG	2	6	544763	544768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294659
13355	NC_016768	CCGGC	2	10	544778	544787	0 %	0 %	40 %	60 %	375294659
13356	NC_016768	CCG	2	6	544792	544797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294659
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