MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 109517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016768	GAG	2	6	228163	228168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294398
5502	NC_016768	GC	3	6	228211	228216	0 %	0 %	50 %	50 %	375294398
5503	NC_016768	CGG	2	6	228231	228236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294398
5504	NC_016768	CAACGC	2	12	228238	228249	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	375294398
5505	NC_016768	GTT	2	6	228285	228290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294398
5506	NC_016768	GAC	2	6	228298	228303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5507	NC_016768	AGG	2	6	228344	228349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294398
5508	NC_016768	TGC	2	6	228350	228355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5509	NC_016768	CGC	2	6	228394	228399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294398
5510	NC_016768	CGA	2	6	228471	228476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5511	NC_016768	GT	3	6	228565	228570	0 %	50 %	50 %	0 %	375294398
5512	NC_016768	GCA	2	6	228603	228608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5513	NC_016768	CACC	2	8	228640	228647	25 %	0 %	0 %	75 %	375294398
5514	NC_016768	CGC	2	6	228664	228669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294398
5515	NC_016768	CTG	2	6	228670	228675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5516	NC_016768	CTG	2	6	228706	228711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5517	NC_016768	TGG	2	6	228713	228718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
5518	NC_016768	CTG	2	6	228739	228744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5519	NC_016768	CGC	2	6	228784	228789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294398
5520	NC_016768	TGG	2	6	228808	228813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
5521	NC_016768	CGT	2	6	228921	228926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5522	NC_016768	GCCTGG	2	12	228944	228955	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375294398
5523	NC_016768	GAC	2	6	228967	228972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5524	NC_016768	CCG	2	6	229001	229006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294398
5525	NC_016768	GTG	2	6	229063	229068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
5526	NC_016768	TGG	2	6	229085	229090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
5527	NC_016768	GCT	2	6	229092	229097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5528	NC_016768	CAC	2	6	229131	229136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294398
5529	NC_016768	CGG	2	6	229195	229200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294398
5530	NC_016768	CGG	2	6	229247	229252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294398
5531	NC_016768	GAC	2	6	229318	229323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5532	NC_016768	GCT	2	6	229353	229358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5533	NC_016768	TAC	2	6	229366	229371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294398
5534	NC_016768	ACC	2	6	229402	229407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294398
5535	NC_016768	TCGG	2	8	229453	229460	0 %	25 %	50 %	25 %	375294398
5536	NC_016768	TGT	2	6	229493	229498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294398
5537	NC_016768	CGA	2	6	229530	229535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
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5539	NC_016768	GGC	2	6	229554	229559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294398
5540	NC_016768	GCT	2	6	229575	229580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5541	NC_016768	CGT	2	6	229595	229600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5542	NC_016768	CGG	2	6	229604	229609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294398
5543	NC_016768	GTG	2	6	229631	229636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
5544	NC_016768	CCGG	2	8	229714	229721	0 %	0 %	50 %	50 %	375294398
5545	NC_016768	GGT	2	6	229728	229733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
5546	NC_016768	TCG	2	6	229736	229741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5547	NC_016768	TGG	2	6	229778	229783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
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5549	NC_016768	GAT	2	6	229995	230000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294398
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5551	NC_016768	CTG	3	9	230116	230124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5552	NC_016768	GTG	2	6	230164	230169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294398
5553	NC_016768	CACCCT	2	12	230178	230189	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	375294398
5554	NC_016768	GAC	2	6	230202	230207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5555	NC_016768	GCT	2	6	230311	230316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5556	NC_016768	GGC	2	6	230340	230345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294398
5557	NC_016768	AACT	2	8	230563	230570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_016768	TGT	2	6	230703	230708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_016768	GGAA	2	8	230738	230745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016768	CAC	2	6	230746	230751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_016768	G	6	6	230753	230758	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_016768	GAG	2	6	230804	230809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294399
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5565	NC_016768	GCGA	2	8	230873	230880	25 %	0 %	50 %	25 %	375294399
5566	NC_016768	GC	3	6	230938	230943	0 %	0 %	50 %	50 %	375294399
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5580	NC_016768	CGCA	2	8	231428	231435	25 %	0 %	25 %	50 %	375294399
5581	NC_016768	TGCGC	2	10	231448	231457	0 %	20 %	40 %	40 %	375294399
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5583	NC_016768	ACGT	2	8	231490	231497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_016768	GGCCG	2	10	231500	231509	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_016768	GTG	2	6	231521	231526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_016768	ACAT	2	8	231557	231564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_016768	GCG	2	6	231579	231584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_016768	TGG	2	6	231607	231612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294400
5589	NC_016768	TGC	2	6	231670	231675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294400
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5593	NC_016768	G	6	6	231797	231802	0 %	0 %	100 %	0 %	375294400
5594	NC_016768	GCT	2	6	231809	231814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294400
5595	NC_016768	CAG	2	6	231840	231845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294400
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5598	NC_016768	CG	3	6	231941	231946	0 %	0 %	50 %	50 %	375294400
5599	NC_016768	GCG	2	6	231951	231956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294400
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5602	NC_016768	CGC	2	6	232099	232104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294400
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5605	NC_016768	TCG	2	6	232227	232232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294401
5606	NC_016768	CGA	2	6	232240	232245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294401
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5609	NC_016768	GCC	2	6	232368	232373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294401
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5611	NC_016768	CGG	2	6	232459	232464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294401
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5613	NC_016768	CGG	4	12	232483	232494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294401
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5616	NC_016768	CGG	2	6	232618	232623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294401
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5618	NC_016768	TCG	2	6	232665	232670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294401
5619	NC_016768	GAA	2	6	232672	232677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294401
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5621	NC_016768	GATC	2	8	232759	232766	25 %	25 %	25 %	25 %	375294401
5622	NC_016768	CGT	2	6	232768	232773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294401
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5861	NC_016768	CAG	2	6	242597	242602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294408
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5987	NC_016768	GCG	2	6	247592	247597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294411
5988	NC_016768	TCG	2	6	247616	247621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294411
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5999	NC_016768	GCCG	2	8	248226	248233	0 %	0 %	50 %	50 %	375294412
6000	NC_016768	GGTC	2	8	248261	248268	0 %	25 %	50 %	25 %	375294412

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