MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 109517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016768	GTT	3	9	207617	207625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294380
5003	NC_016768	CGA	2	6	207628	207633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294380
5004	NC_016768	GGT	2	6	207674	207679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294380
5005	NC_016768	TGG	2	6	207739	207744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294380
5006	NC_016768	TGT	2	6	207814	207819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294380
5007	NC_016768	CGG	3	9	207880	207888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294380
5008	NC_016768	GGC	3	9	207896	207904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294380
5009	NC_016768	GGT	2	6	207941	207946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294380
5010	NC_016768	AATG	2	8	207954	207961	50 %	25 %	25 %	0 %	375294380
5011	NC_016768	CG	3	6	207978	207983	0 %	0 %	50 %	50 %	375294380
5012	NC_016768	CCGC	2	8	208091	208098	0 %	0 %	25 %	75 %	375294380
5013	NC_016768	TGT	2	6	208207	208212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294380
5014	NC_016768	ACC	2	6	208235	208240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294380
5015	NC_016768	CG	3	6	208288	208293	0 %	0 %	50 %	50 %	375294380
5016	NC_016768	CGA	2	6	208307	208312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294380
5017	NC_016768	TGA	2	6	208324	208329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294380
5018	NC_016768	CGT	2	6	208364	208369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294381
5019	NC_016768	GCT	2	6	208393	208398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294381
5020	NC_016768	AGC	2	6	208528	208533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294381
5021	NC_016768	CCACG	2	10	208636	208645	20 %	0 %	20 %	60 %	375294381
5022	NC_016768	TGG	2	6	208779	208784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294381
5023	NC_016768	GGT	2	6	208822	208827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294381
5024	NC_016768	CAG	2	6	208885	208890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294381
5025	NC_016768	CGC	2	6	208986	208991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294382
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5027	NC_016768	GAT	2	6	209044	209049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294382
5028	NC_016768	GGC	2	6	209071	209076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294382
5029	NC_016768	GTT	2	6	209139	209144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294382
5030	NC_016768	GC	3	6	209196	209201	0 %	0 %	50 %	50 %	375294382
5031	NC_016768	GTG	2	6	209203	209208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294382
5032	NC_016768	CCA	2	6	209210	209215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294382
5033	NC_016768	CG	3	6	209226	209231	0 %	0 %	50 %	50 %	375294382
5034	NC_016768	CCG	2	6	209234	209239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294382
5035	NC_016768	ACG	2	6	209251	209256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294382
5036	NC_016768	TCG	2	6	209348	209353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294382
5037	NC_016768	CGC	2	6	209361	209366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294382
5038	NC_016768	CAAA	2	8	209369	209376	75 %	0 %	0 %	25 %	375294382
5039	NC_016768	TGC	2	6	209412	209417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294382
5040	NC_016768	ACACCA	2	12	209459	209470	50 %	0 %	0 %	50 %	375294382
5041	NC_016768	ACC	2	6	209473	209478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294382
5042	NC_016768	CG	3	6	209547	209552	0 %	0 %	50 %	50 %	375294382
5043	NC_016768	GAC	2	6	209571	209576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294382
5044	NC_016768	CGC	2	6	209597	209602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294382
5045	NC_016768	CCG	2	6	209622	209627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_016768	GCCA	2	8	209651	209658	25 %	0 %	25 %	50 %	375294383
5047	NC_016768	C	6	6	209779	209784	0 %	0 %	0 %	100 %	375294383
5048	NC_016768	TGT	2	6	209838	209843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294383
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5051	NC_016768	CCG	2	6	209927	209932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294383
5052	NC_016768	CGA	2	6	209985	209990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294383
5053	NC_016768	TTG	2	6	210002	210007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294383
5054	NC_016768	CAC	2	6	210078	210083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294383
5055	NC_016768	ATC	2	6	210095	210100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294383
5056	NC_016768	GTC	2	6	210101	210106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294383
5057	NC_016768	TCC	2	6	210127	210132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375294383
5058	NC_016768	TTGG	2	8	210178	210185	0 %	50 %	50 %	0 %	375294383
5059	NC_016768	C	6	6	210257	210262	0 %	0 %	0 %	100 %	375294383
5060	NC_016768	GAA	2	6	210280	210285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294383
5061	NC_016768	TGG	2	6	210303	210308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294383
5062	NC_016768	GCG	2	6	210336	210341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294383
5063	NC_016768	GC	3	6	210403	210408	0 %	0 %	50 %	50 %	375294383
5064	NC_016768	TGA	2	6	210468	210473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294383
5065	NC_016768	TCA	2	6	210474	210479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294383
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5074	NC_016768	GGT	2	6	210640	210645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294383
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5080	NC_016768	GAT	2	6	210983	210988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294384
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5087	NC_016768	CCA	2	6	211468	211473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294384
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5095	NC_016768	ACC	2	6	211695	211700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294384
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5104	NC_016768	GCG	2	6	212160	212165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294384
5105	NC_016768	CTGT	2	8	212197	212204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_016768	ACCGC	2	10	212310	212319	20 %	0 %	20 %	60 %	375294385
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5110	NC_016768	GCAGG	2	10	212395	212404	20 %	0 %	60 %	20 %	375294385
5111	NC_016768	CG	3	6	212429	212434	0 %	0 %	50 %	50 %	375294385
5112	NC_016768	GCT	2	6	212449	212454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294385
5113	NC_016768	GC	3	6	212516	212521	0 %	0 %	50 %	50 %	375294385
5114	NC_016768	TCG	2	6	212528	212533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294385
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5116	NC_016768	GCCG	2	8	212653	212660	0 %	0 %	50 %	50 %	375294385
5117	NC_016768	CGG	2	6	212703	212708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294385
5118	NC_016768	GCA	2	6	212733	212738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294385
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5120	NC_016768	GTT	2	6	212809	212814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294385
5121	NC_016768	GTG	2	6	212830	212835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294385
5122	NC_016768	CGT	2	6	212896	212901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294385
5123	NC_016768	GGT	2	6	213002	213007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294386
5124	NC_016768	CCA	2	6	213019	213024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294386
5125	NC_016768	CGG	2	6	213040	213045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294386
5126	NC_016768	CGG	2	6	213109	213114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294386
5127	NC_016768	CGG	2	6	213227	213232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294386
5128	NC_016768	CGG	2	6	213250	213255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294386
5129	NC_016768	CGG	2	6	213358	213363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294386
5130	NC_016768	GCA	2	6	213403	213408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294386
5131	NC_016768	GCA	2	6	213469	213474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294386
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5142	NC_016768	CGGC	2	8	213689	213696	0 %	0 %	50 %	50 %	375294386
5143	NC_016768	CAGG	2	8	213719	213726	25 %	0 %	50 %	25 %	375294386
5144	NC_016768	TGG	2	6	213730	213735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294386
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5155	NC_016768	ACC	2	6	214216	214221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294387
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5163	NC_016768	GGT	2	6	214553	214558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294387
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5167	NC_016768	CG	3	6	214617	214622	0 %	0 %	50 %	50 %	375294387
5168	NC_016768	CTG	2	6	214623	214628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294387
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5174	NC_016768	CTG	2	6	214943	214948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294388
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5182	NC_016768	CCTCG	2	10	215302	215311	0 %	20 %	20 %	60 %	375294388
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5188	NC_016768	AGCC	2	8	215533	215540	25 %	0 %	25 %	50 %	375294388
5189	NC_016768	TCG	2	6	215558	215563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294388
5190	NC_016768	GC	3	6	215572	215577	0 %	0 %	50 %	50 %	375294388
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5193	NC_016768	TCGGT	3	15	215802	215816	0 %	40 %	40 %	20 %	375294389
5194	NC_016768	GAC	2	6	215839	215844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294389
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5197	NC_016768	GGC	2	6	215913	215918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294389
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5201	NC_016768	CGT	2	6	216132	216137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294389
5202	NC_016768	AGG	2	6	216146	216151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294389
5203	NC_016768	CGA	3	9	216212	216220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294390
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5205	NC_016768	TTG	2	6	216351	216356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294390
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5207	NC_016768	GC	3	6	216498	216503	0 %	0 %	50 %	50 %	375294390
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5209	NC_016768	GC	3	6	216546	216551	0 %	0 %	50 %	50 %	375294390
5210	NC_016768	GTT	2	6	216596	216601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294390
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5213	NC_016768	CGA	3	9	216658	216666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294390
5214	NC_016768	CTGG	2	8	216704	216711	0 %	25 %	50 %	25 %	375294390
5215	NC_016768	TTG	2	6	216750	216755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294390
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5220	NC_016768	GGCC	2	8	216938	216945	0 %	0 %	50 %	50 %	375294390
5221	NC_016768	GTGCG	2	10	216956	216965	0 %	20 %	60 %	20 %	375294390
5222	NC_016768	ACCG	2	8	217002	217009	25 %	0 %	25 %	50 %	375294390
5223	NC_016768	GCC	2	6	217017	217022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294390
5224	NC_016768	CGG	2	6	217068	217073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294390
5225	NC_016768	GCGCCG	2	12	217119	217130	0 %	0 %	50 %	50 %	375294390
5226	NC_016768	TGC	3	9	217183	217191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294390
5227	NC_016768	GCT	2	6	217202	217207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294390
5228	NC_016768	CGCT	2	8	217210	217217	0 %	25 %	25 %	50 %	375294390
5229	NC_016768	CGG	2	6	217247	217252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294390
5230	NC_016768	G	6	6	217307	217312	0 %	0 %	100 %	0 %	375294390
5231	NC_016768	CTG	2	6	217374	217379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294390
5232	NC_016768	TGAG	2	8	217393	217400	25 %	25 %	50 %	0 %	375294390
5233	NC_016768	AGTTCG	2	12	217426	217437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375294390
5234	NC_016768	CGG	2	6	217453	217458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294390
5235	NC_016768	GCTG	2	8	217466	217473	0 %	25 %	50 %	25 %	375294390
5236	NC_016768	CGC	2	6	217574	217579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294390
5237	NC_016768	CAT	2	6	217664	217669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294390
5238	NC_016768	TGG	2	6	217951	217956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294390
5239	NC_016768	GGC	2	6	217962	217967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294390
5240	NC_016768	CGGTTG	2	12	218064	218075	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375294390
5241	NC_016768	CGG	2	6	218115	218120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294390
5242	NC_016768	ACG	2	6	218158	218163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294390
5243	NC_016768	CGGTGG	2	12	218203	218214	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	375294390
5244	NC_016768	CGG	2	6	218221	218226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294390
5245	NC_016768	GGCC	2	8	218258	218265	0 %	0 %	50 %	50 %	375294390
5246	NC_016768	GGCC	2	8	218285	218292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5247	NC_016768	TCG	2	6	218347	218352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_016768	ACAGCC	2	12	218418	218429	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5249	NC_016768	GGT	2	6	218518	218523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_016768	AT	3	6	218555	218560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_016768	CTG	2	6	218607	218612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_016768	GC	3	6	218613	218618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_016768	CGGT	2	8	218621	218628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5254	NC_016768	CAACC	2	10	218658	218667	40 %	0 %	0 %	60 %	375294391
5255	NC_016768	CGA	2	6	218708	218713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294391
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5260	NC_016768	TGGC	2	8	218871	218878	0 %	25 %	50 %	25 %	375294391
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5263	NC_016768	GGT	2	6	218987	218992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294391
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5266	NC_016768	CGGCG	2	10	219111	219120	0 %	0 %	60 %	40 %	375294391
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5272	NC_016768	GATG	2	8	219368	219375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_016768	TGC	2	6	219399	219404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NC_016768	TCA	2	6	219439	219444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294392
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5277	NC_016768	CGA	2	6	219503	219508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294392
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5281	NC_016768	CA	3	6	219672	219677	50 %	0 %	0 %	50 %	375294392
5282	NC_016768	GT	3	6	219707	219712	0 %	50 %	50 %	0 %	375294392
5283	NC_016768	ATG	2	6	219763	219768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294392
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5330	NC_016768	ATG	2	6	221745	221750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5335	NC_016768	CGGT	2	8	221965	221972	0 %	25 %	50 %	25 %	375294394
5336	NC_016768	CTG	2	6	221983	221988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294394
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5344	NC_016768	ACG	2	6	222257	222262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294395
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5351	NC_016768	GCC	2	6	222640	222645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294395
5352	NC_016768	GC	3	6	222658	222663	0 %	0 %	50 %	50 %	375294395
5353	NC_016768	ACG	2	6	222665	222670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294395
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5357	NC_016768	CGGCG	2	10	222772	222781	0 %	0 %	60 %	40 %	375294395
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5360	NC_016768	GC	3	6	222829	222834	0 %	0 %	50 %	50 %	375294395
5361	NC_016768	CAC	2	6	222869	222874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294395
5362	NC_016768	GAT	2	6	222910	222915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294395
5363	NC_016768	CCTACA	2	12	222939	222950	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	375294395
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5365	NC_016768	ATC	2	6	222959	222964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294395
5366	NC_016768	CGT	2	6	222970	222975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294395
5367	NC_016768	CTGGC	2	10	222995	223004	0 %	20 %	40 %	40 %	375294395
5368	NC_016768	CGC	2	6	223009	223014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294395
5369	NC_016768	TGG	2	6	223047	223052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294395
5370	NC_016768	TCG	2	6	223089	223094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294395
5371	NC_016768	CGG	2	6	223110	223115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294395
5372	NC_016768	CTG	2	6	223172	223177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294395
5373	NC_016768	TGC	2	6	223230	223235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294395
5374	NC_016768	CGG	2	6	223239	223244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294395
5375	NC_016768	GCG	3	9	223254	223262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294395
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5422	NC_016768	GCT	2	6	225012	225017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294397
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5485	NC_016768	ATGG	2	8	227601	227608	25 %	25 %	50 %	0 %	375294398
5486	NC_016768	GCA	2	6	227618	227623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5487	NC_016768	TTG	2	6	227639	227644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294398
5488	NC_016768	GCCT	2	8	227653	227660	0 %	25 %	25 %	50 %	375294398
5489	NC_016768	CGGC	2	8	227674	227681	0 %	0 %	50 %	50 %	375294398
5490	NC_016768	CAG	2	6	227713	227718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294398
5491	NC_016768	GC	4	8	227719	227726	0 %	0 %	50 %	50 %	375294398
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5493	NC_016768	CCGGG	2	10	227886	227895	0 %	0 %	60 %	40 %	375294398
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