MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 109517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_016768	AAC	2	6	185728	185733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294361
4503	NC_016768	GAT	2	6	185739	185744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294361
4504	NC_016768	TCG	2	6	185759	185764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4505	NC_016768	TCG	2	6	185828	185833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4506	NC_016768	CGG	4	12	185844	185855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294361
4507	NC_016768	GGC	3	9	185869	185877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294361
4508	NC_016768	GAC	2	6	185878	185883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4509	NC_016768	GCC	2	6	185905	185910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294361
4510	NC_016768	GTG	2	6	185950	185955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294361
4511	NC_016768	GCA	2	6	185985	185990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4512	NC_016768	GGA	2	6	186018	186023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294361
4513	NC_016768	GCCG	2	8	186061	186068	0 %	0 %	50 %	50 %	375294361
4514	NC_016768	TGC	2	6	186089	186094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4515	NC_016768	GGCCGA	2	12	186096	186107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375294361
4516	NC_016768	ACG	2	6	186116	186121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4517	NC_016768	GAC	2	6	186136	186141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4518	NC_016768	ACG	2	6	186146	186151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4519	NC_016768	ACG	2	6	186191	186196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294361
4520	NC_016768	CGG	2	6	186206	186211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294361
4521	NC_016768	CAC	2	6	186348	186353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294361
4522	NC_016768	TGT	2	6	186356	186361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294361
4523	NC_016768	GAA	2	6	186372	186377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294361
4524	NC_016768	GC	3	6	186417	186422	0 %	0 %	50 %	50 %	375294361
4525	NC_016768	CGG	3	9	186451	186459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_016768	GAA	3	9	186508	186516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016768	TCG	2	6	186524	186529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_016768	CGT	2	6	186534	186539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_016768	CGC	2	6	186632	186637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_016768	AAC	2	6	186651	186656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_016768	TTGA	2	8	186660	186667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016768	CGA	2	6	186705	186710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_016768	GCC	2	6	186754	186759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294362
4534	NC_016768	GAG	2	6	186762	186767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375294362
4535	NC_016768	GCTG	2	8	186770	186777	0 %	25 %	50 %	25 %	375294362
4536	NC_016768	CCA	2	6	186781	186786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375294362
4537	NC_016768	GC	3	6	186798	186803	0 %	0 %	50 %	50 %	375294362
4538	NC_016768	GAC	2	6	186825	186830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294362
4539	NC_016768	CAA	2	6	186851	186856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375294362
4540	NC_016768	ACT	2	6	186871	186876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294362
4541	NC_016768	GGC	2	6	186917	186922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294362
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4543	NC_016768	ACG	2	6	186946	186951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294362
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4545	NC_016768	GCC	2	6	187032	187037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294362
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4547	NC_016768	AGC	2	6	187111	187116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294362
4548	NC_016768	GCG	2	6	187162	187167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294362
4549	NC_016768	TGG	2	6	187192	187197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294362
4550	NC_016768	GCTG	2	8	187234	187241	0 %	25 %	50 %	25 %	375294362
4551	NC_016768	CGG	2	6	187276	187281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294362
4552	NC_016768	CTG	2	6	187296	187301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294362
4553	NC_016768	CGA	2	6	187316	187321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294362
4554	NC_016768	GGAA	2	8	187354	187361	50 %	0 %	50 %	0 %	375294362
4555	NC_016768	AATC	2	8	187386	187393	50 %	25 %	0 %	25 %	375294363
4556	NC_016768	GATACG	2	12	187487	187498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375294363
4557	NC_016768	GGC	2	6	187542	187547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294363
4558	NC_016768	GGGT	2	8	187625	187632	0 %	25 %	75 %	0 %	375294363
4559	NC_016768	CGTAGC	2	12	187640	187651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375294363
4560	NC_016768	GTA	2	6	187770	187775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375294363
4561	NC_016768	ACGGC	2	10	187811	187820	20 %	0 %	40 %	40 %	375294363
4562	NC_016768	CGT	2	6	187934	187939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294363
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4564	NC_016768	AGCC	2	8	188085	188092	25 %	0 %	25 %	50 %	375294363
4565	NC_016768	GGT	2	6	188116	188121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375294363
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4580	NC_016768	CGA	2	6	188631	188636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294363
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4586	NC_016768	TCA	2	6	188922	188927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375294364
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4588	NC_016768	CAAT	2	8	189024	189031	50 %	25 %	0 %	25 %	375294364
4589	NC_016768	CCGG	2	8	189134	189141	0 %	0 %	50 %	50 %	375294364
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4591	NC_016768	CGA	2	6	189195	189200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294364
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4594	NC_016768	CGT	2	6	189468	189473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294364
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4596	NC_016768	GC	3	6	189568	189573	0 %	0 %	50 %	50 %	375294364
4597	NC_016768	CAG	2	6	189574	189579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294364
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4602	NC_016768	TTG	2	6	189716	189721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375294364
4603	NC_016768	GTTG	2	8	189732	189739	0 %	50 %	50 %	0 %	375294364
4604	NC_016768	CGG	2	6	189744	189749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294364
4605	NC_016768	CAG	2	6	189754	189759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294364
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4608	NC_016768	GCC	2	6	189934	189939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294364
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4930	NC_016768	CTG	2	6	204345	204350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294377
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4943	NC_016768	GACCT	2	10	204990	204999	20 %	20 %	20 %	40 %	375294377
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4954	NC_016768	TCG	2	6	205716	205721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294378
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4965	NC_016768	GCG	2	6	206288	206293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294378
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4967	NC_016768	CCG	2	6	206469	206474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294378
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4969	NC_016768	GCA	2	6	206551	206556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294378
4970	NC_016768	CGG	2	6	206595	206600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294378
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4972	NC_016768	GAC	2	6	206678	206683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375294378
4973	NC_016768	GTC	3	9	206736	206744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4977	NC_016768	CGG	2	6	206825	206830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294379
4978	NC_016768	TCG	2	6	206879	206884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294379
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4980	NC_016768	GCG	2	6	206904	206909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294379
4981	NC_016768	GGCT	2	8	206911	206918	0 %	25 %	50 %	25 %	375294379
4982	NC_016768	GCG	2	6	206929	206934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375294379
4983	NC_016768	GCT	2	6	206937	206942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294379
4984	NC_016768	TTGCG	2	10	206978	206987	0 %	40 %	40 %	20 %	375294379
4985	NC_016768	CAAT	2	8	207004	207011	50 %	25 %	0 %	25 %	375294379
4986	NC_016768	CG	4	8	207012	207019	0 %	0 %	50 %	50 %	375294379
4987	NC_016768	TTGCG	2	10	207051	207060	0 %	40 %	40 %	20 %	375294379
4988	NC_016768	AGA	2	6	207104	207109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375294379
4989	NC_016768	CGT	2	6	207146	207151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294379
4990	NC_016768	TCG	2	6	207167	207172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375294379
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5000	NC_016768	GCC	2	6	207542	207547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375294380

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