MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 53626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_015873	CTT	2	6	89284	89289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025315
2004	NC_015873	GAG	2	6	89359	89364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025315
2005	NC_015873	TAATT	2	10	89378	89387	40 %	60 %	0 %	0 %	348025315
2006	NC_015873	GCC	2	6	89495	89500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025315
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2122	NC_015873	TA	3	6	94248	94253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_015873	A	6	6	94282	94287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2250	NC_015873	GGC	2	6	99122	99127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025327
2251	NC_015873	ATGG	2	8	99134	99141	25 %	25 %	50 %	0 %	348025327
2252	NC_015873	CCG	2	6	99181	99186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025327
2253	NC_015873	CGA	2	6	99202	99207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025327
2254	NC_015873	CGT	3	9	99218	99226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025327
2255	NC_015873	AGG	2	6	99249	99254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025327
2256	NC_015873	ACGATG	2	12	99384	99395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	348025328
2257	NC_015873	TTGG	2	8	99545	99552	0 %	50 %	50 %	0 %	348025328
2258	NC_015873	CGA	2	6	99559	99564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025328
2259	NC_015873	CTG	2	6	99571	99576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025328
2260	NC_015873	GTA	2	6	99713	99718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025328
2261	NC_015873	TCG	2	6	99747	99752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025328
2262	NC_015873	CGC	2	6	99757	99762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025328
2263	NC_015873	ACG	2	6	99780	99785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025328
2264	NC_015873	GAC	2	6	99932	99937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025328
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2266	NC_015873	AGG	2	6	100065	100070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025328
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2268	NC_015873	CAT	2	6	100103	100108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025328
2269	NC_015873	GCT	2	6	100162	100167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025329
2270	NC_015873	GAC	2	6	100219	100224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025329
2271	NC_015873	GCC	2	6	100228	100233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025329
2272	NC_015873	AC	3	6	100263	100268	50 %	0 %	0 %	50 %	348025329
2273	NC_015873	CGG	2	6	100315	100320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025329
2274	NC_015873	CGA	2	6	100350	100355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025329
2275	NC_015873	CTT	2	6	100495	100500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025329
2276	NC_015873	TTC	2	6	100501	100506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025329
2277	NC_015873	CGA	2	6	100527	100532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025329
2278	NC_015873	TCT	2	6	100563	100568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025329
2279	NC_015873	GAC	3	9	100609	100617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025329
2280	NC_015873	GGC	2	6	100618	100623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025329
2281	NC_015873	ATG	2	6	100625	100630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025329
2282	NC_015873	ATC	2	6	100661	100666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025329
2283	NC_015873	CTG	2	6	100685	100690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025330
2284	NC_015873	TTC	2	6	100703	100708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025330
2285	NC_015873	TGA	2	6	100762	100767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025330
2286	NC_015873	TCT	3	9	100812	100820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025330
2287	NC_015873	ATC	2	6	100857	100862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025330
2288	NC_015873	GGAAT	2	10	100913	100922	40 %	20 %	40 %	0 %	348025330
2289	NC_015873	GGCC	2	8	100937	100944	0 %	0 %	50 %	50 %	348025330
2290	NC_015873	GCC	2	6	100997	101002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025330
2291	NC_015873	CTT	2	6	101030	101035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025330
2292	NC_015873	GAT	2	6	101057	101062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025330
2293	NC_015873	GCC	2	6	101072	101077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025330
2294	NC_015873	CGT	2	6	101137	101142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025330
2295	NC_015873	CCCTT	2	10	101241	101250	0 %	40 %	0 %	60 %	348025330
2296	NC_015873	ATG	2	6	101379	101384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025330
2297	NC_015873	CTT	2	6	101392	101397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025330
2298	NC_015873	GCT	2	6	101446	101451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025330
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2302	NC_015873	GCC	2	6	101702	101707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025331
2303	NC_015873	CGAAA	2	10	101717	101726	60 %	0 %	20 %	20 %	348025331
2304	NC_015873	CCG	2	6	101735	101740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025331
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2306	NC_015873	GTC	2	6	101810	101815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025331
2307	NC_015873	TCG	2	6	101832	101837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025331
2308	NC_015873	CTG	2	6	101864	101869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025331
2309	NC_015873	GAT	2	6	102062	102067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025331
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2312	NC_015873	CGA	2	6	102195	102200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025332
2313	NC_015873	ATG	2	6	102239	102244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025332
2314	NC_015873	TCA	2	6	102297	102302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025332
2315	NC_015873	GGA	2	6	102321	102326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025332
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2317	NC_015873	CGA	2	6	102378	102383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025332
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2319	NC_015873	GAC	2	6	102472	102477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025332
2320	NC_015873	TCG	2	6	102506	102511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025332
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2322	NC_015873	CCG	2	6	102542	102547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025332
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2324	NC_015873	CGT	2	6	102634	102639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025332
2325	NC_015873	TCG	3	9	102642	102650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025332
2326	NC_015873	CTT	2	6	102672	102677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025332
2327	NC_015873	GAT	2	6	102697	102702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025332
2328	NC_015873	CGA	2	6	102738	102743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025332
2329	NC_015873	TGA	2	6	102747	102752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025332
2330	NC_015873	CAT	2	6	102834	102839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025332
2331	NC_015873	GGA	2	6	102885	102890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025332
2332	NC_015873	TTGA	2	8	103021	103028	25 %	50 %	25 %	0 %	348025332
2333	NC_015873	CTT	2	6	103083	103088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025332
2334	NC_015873	CAT	2	6	103099	103104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025332
2335	NC_015873	CTT	2	6	103116	103121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2336	NC_015873	TTAT	2	8	103130	103137	25 %	75 %	0 %	0 %	348025333
2337	NC_015873	GGA	2	6	103186	103191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025333
2338	NC_015873	CAG	2	6	103291	103296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
2339	NC_015873	CGA	2	6	103315	103320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
2340	NC_015873	GGCC	2	8	103330	103337	0 %	0 %	50 %	50 %	348025333
2341	NC_015873	CCG	2	6	103353	103358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025333
2342	NC_015873	GAC	2	6	103388	103393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
2343	NC_015873	CGA	2	6	103435	103440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
2344	NC_015873	ATG	2	6	103482	103487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025333
2345	NC_015873	CGA	2	6	103516	103521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
2346	NC_015873	TTC	2	6	103524	103529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025333
2347	NC_015873	TTGACG	2	12	103560	103571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	348025333
2348	NC_015873	TAA	2	6	103598	103603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025333
2349	NC_015873	GGC	2	6	103612	103617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025333
2350	NC_015873	GAC	2	6	103694	103699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
2351	NC_015873	TTCT	2	8	103712	103719	0 %	75 %	0 %	25 %	348025333
2352	NC_015873	ACG	2	6	103768	103773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025333
2353	NC_015873	AAG	2	6	103801	103806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025333
2354	NC_015873	GGCC	2	8	103900	103907	0 %	0 %	50 %	50 %	348025333
2355	NC_015873	CGC	2	6	103927	103932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025333
2356	NC_015873	CGG	2	6	104013	104018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025334
2357	NC_015873	TGA	2	6	104061	104066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025334
2358	NC_015873	TTA	2	6	104071	104076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025334
2359	NC_015873	AGG	2	6	104166	104171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025334
2360	NC_015873	CTT	2	6	104224	104229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025334
2361	NC_015873	GAC	2	6	104297	104302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025334
2362	NC_015873	GTC	2	6	104318	104323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025334
2363	NC_015873	GTC	2	6	104399	104404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025334
2364	NC_015873	TCG	2	6	104430	104435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025334
2365	NC_015873	GACC	2	8	104473	104480	25 %	0 %	25 %	50 %	348025334
2366	NC_015873	GCC	2	6	104537	104542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025334
2367	NC_015873	GAC	2	6	104549	104554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025334
2368	NC_015873	ACG	2	6	104586	104591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025334
2369	NC_015873	GAT	2	6	104708	104713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025334
2370	NC_015873	TCC	2	6	104735	104740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025335
2371	NC_015873	CGT	2	6	104869	104874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2372	NC_015873	GCC	3	9	104894	104902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025335
2373	NC_015873	TCG	2	6	104924	104929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2374	NC_015873	AGG	2	6	105006	105011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025335
2375	NC_015873	GGC	2	6	105097	105102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025335
2376	NC_015873	ATGGCC	2	12	105131	105142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2377	NC_015873	ATG	2	6	105224	105229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025335
2378	NC_015873	CGA	2	6	105318	105323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2379	NC_015873	CGT	2	6	105366	105371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2380	NC_015873	GAG	3	9	105373	105381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025335
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2382	NC_015873	GGC	2	6	105421	105426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025335
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2384	NC_015873	CGA	2	6	105438	105443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025335
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2389	NC_015873	TGC	2	6	105518	105523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2390	NC_015873	CCG	2	6	105653	105658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025335
2391	NC_015873	TGA	2	6	105678	105683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025335
2392	NC_015873	CGGC	2	8	105687	105694	0 %	0 %	50 %	50 %	348025335
2393	NC_015873	CAG	2	6	105778	105783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2394	NC_015873	CAG	2	6	105803	105808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025335
2395	NC_015873	CCG	2	6	105882	105887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025336
2396	NC_015873	CTG	2	6	105905	105910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025336
2397	NC_015873	TTC	2	6	105924	105929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025336
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2399	NC_015873	GGAT	2	8	105996	106003	25 %	25 %	50 %	0 %	348025336
2400	NC_015873	CAGG	2	8	106013	106020	25 %	0 %	50 %	25 %	348025336
2401	NC_015873	GCT	2	6	106067	106072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025336
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2404	NC_015873	GCC	2	6	106160	106165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025336
2405	NC_015873	GCC	2	6	106181	106186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025336
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2407	NC_015873	GCGCG	2	10	106361	106370	0 %	0 %	60 %	40 %	348025336
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2426	NC_015873	ATGGC	2	10	107025	107034	20 %	20 %	40 %	20 %	348025336
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2432	NC_015873	CAG	2	6	107297	107302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
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2434	NC_015873	CTT	2	6	107317	107322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025337
2435	NC_015873	CGA	2	6	107323	107328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
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2438	NC_015873	GAC	2	6	107393	107398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
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2442	NC_015873	GCGATG	2	12	107520	107531	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	348025337
2443	NC_015873	CGCTGG	2	12	107532	107543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	348025337
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2448	NC_015873	CGA	2	6	107641	107646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
2449	NC_015873	CTT	2	6	107647	107652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025337
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2451	NC_015873	CTG	2	6	107738	107743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025337
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2454	NC_015873	CGA	2	6	107866	107871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
2455	NC_015873	CGA	2	6	107875	107880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
2456	NC_015873	GGT	2	6	107923	107928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025337
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2458	NC_015873	TCTT	2	8	107997	108004	0 %	75 %	0 %	25 %	348025337
2459	NC_015873	GCG	2	6	108095	108100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025337
2460	NC_015873	TGA	2	6	108169	108174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025337
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2464	NC_015873	GTC	3	9	108261	108269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025337
2465	NC_015873	GAT	2	6	108344	108349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025337
2466	NC_015873	CTT	2	6	108367	108372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025337
2467	NC_015873	CCGGC	2	10	108417	108426	0 %	0 %	40 %	60 %	348025337
2468	NC_015873	GAA	2	6	108440	108445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025337
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2471	NC_015873	CGA	2	6	108718	108723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
2472	NC_015873	AGA	2	6	108751	108756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025337
2473	NC_015873	CGATGA	2	12	108787	108798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	348025337
2474	NC_015873	TGA	2	6	108850	108855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025337
2475	NC_015873	GAC	3	9	108863	108871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025337
2476	NC_015873	GACGGC	2	12	108902	108913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	348025337
2477	NC_015873	TGA	2	6	108934	108939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025337
2478	NC_015873	TAA	2	6	108944	108949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025337
2479	NC_015873	TATTG	2	10	108970	108979	20 %	60 %	20 %	0 %	348025337
2480	NC_015873	GCG	2	6	109059	109064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025338
2481	NC_015873	GCC	2	6	109069	109074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025338
2482	NC_015873	GC	3	6	109098	109103	0 %	0 %	50 %	50 %	348025338
2483	NC_015873	GGC	3	9	109128	109136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025338
2484	NC_015873	ATG	3	9	109192	109200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025338
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