MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 111405

< Previous12...2627282930313233343536...222223Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015848	TGC	2	6	612302	612307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625537
15002	NC_015848	GAG	2	6	612349	612354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625537
15003	NC_015848	CGTAC	2	10	612361	612370	20 %	20 %	20 %	40 %	340625537
15004	NC_015848	AGC	2	6	612416	612421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625537
15005	NC_015848	CGG	2	6	612435	612440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625537
15006	NC_015848	CCG	2	6	612488	612493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625537
15007	NC_015848	GGT	2	6	612525	612530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625537
15008	NC_015848	CGC	2	6	612556	612561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625537
15009	NC_015848	AGC	2	6	612580	612585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625537
15010	NC_015848	CCA	2	6	612653	612658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625538
15011	NC_015848	GCC	2	6	612664	612669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625538
15012	NC_015848	TGG	2	6	612693	612698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625538
15013	NC_015848	CAC	2	6	612780	612785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625538
15014	NC_015848	AGGC	2	8	612806	612813	25 %	0 %	50 %	25 %	340625538
15015	NC_015848	TCG	2	6	612815	612820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625538
15016	NC_015848	GCG	2	6	612823	612828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625538
15017	NC_015848	CGA	2	6	612858	612863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625538
15018	NC_015848	GCG	2	6	612880	612885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625538
15019	NC_015848	CCG	2	6	612889	612894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625538
15020	NC_015848	GGT	2	6	612915	612920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625538
15021	NC_015848	TGG	2	6	612965	612970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625538
15022	NC_015848	CGC	2	6	612980	612985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625538
15023	NC_015848	GCG	2	6	613076	613081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625538
15024	NC_015848	GTG	2	6	613096	613101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625538
15025	NC_015848	GCC	2	6	613127	613132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625538
15026	NC_015848	GC	3	6	613190	613195	0 %	0 %	50 %	50 %	340625538
15027	NC_015848	TGG	2	6	613229	613234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625538
15028	NC_015848	GCG	2	6	613270	613275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625538
15029	NC_015848	CCG	2	6	613280	613285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625538
15030	NC_015848	GAG	2	6	613384	613389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625538
15031	NC_015848	GGC	2	6	613410	613415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625538
15032	NC_015848	CG	3	6	613438	613443	0 %	0 %	50 %	50 %	340625538
15033	NC_015848	CGC	2	6	613491	613496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625538
15034	NC_015848	GAA	2	6	613556	613561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_015848	TCCGG	2	10	613629	613638	0 %	20 %	40 %	40 %	340625539
15036	NC_015848	GCTT	2	8	613648	613655	0 %	50 %	25 %	25 %	340625539
15037	NC_015848	CGC	2	6	613685	613690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15038	NC_015848	C	6	6	613752	613757	0 %	0 %	0 %	100 %	340625539
15039	NC_015848	CCGGC	2	10	613762	613771	0 %	0 %	40 %	60 %	340625539
15040	NC_015848	CCG	2	6	613774	613779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15041	NC_015848	CGGC	2	8	613804	613811	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15042	NC_015848	GGA	2	6	613812	613817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625539
15043	NC_015848	GGCCG	2	10	613833	613842	0 %	0 %	60 %	40 %	340625539
15044	NC_015848	GGT	2	6	613860	613865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625539
15045	NC_015848	CCG	2	6	613894	613899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15046	NC_015848	CCG	2	6	613918	613923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15047	NC_015848	GTG	2	6	613944	613949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625539
15048	NC_015848	TGG	2	6	613954	613959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625539
15049	NC_015848	CGCA	2	8	614009	614016	25 %	0 %	25 %	50 %	340625539
15050	NC_015848	GCC	2	6	614049	614054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15051	NC_015848	AGC	2	6	614055	614060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625539
15052	NC_015848	TCG	2	6	614094	614099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625539
15053	NC_015848	GCG	2	6	614119	614124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625539
15054	NC_015848	GCTG	2	8	614141	614148	0 %	25 %	50 %	25 %	340625539
15055	NC_015848	CGCAT	2	10	614180	614189	20 %	20 %	20 %	40 %	340625539
15056	NC_015848	GATC	2	8	614213	614220	25 %	25 %	25 %	25 %	340625539
15057	NC_015848	CGTG	2	8	614242	614249	0 %	25 %	50 %	25 %	340625539
15058	NC_015848	CAC	2	6	614264	614269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625539
15059	NC_015848	CAG	2	6	614274	614279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625539
15060	NC_015848	GACC	2	8	614309	614316	25 %	0 %	25 %	50 %	340625539
15061	NC_015848	GGGA	2	8	614358	614365	25 %	0 %	75 %	0 %	340625539
15062	NC_015848	TGG	2	6	614430	614435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625539
15063	NC_015848	CT	3	6	614446	614451	0 %	50 %	0 %	50 %	340625539
15064	NC_015848	GAGC	2	8	614501	614508	25 %	0 %	50 %	25 %	340625539
15065	NC_015848	CGT	2	6	614515	614520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625539
15066	NC_015848	GC	3	6	614524	614529	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15067	NC_015848	GCC	2	6	614561	614566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15068	NC_015848	GC	3	6	614588	614593	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15069	NC_015848	CCA	2	6	614641	614646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625539
15070	NC_015848	GTGC	2	8	614652	614659	0 %	25 %	50 %	25 %	340625539
15071	NC_015848	CG	3	6	614697	614702	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15072	NC_015848	GC	3	6	614753	614758	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15073	NC_015848	GCTTG	2	10	614804	614813	0 %	40 %	40 %	20 %	340625539
15074	NC_015848	GAC	2	6	614817	614822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625539
15075	NC_015848	TGC	2	6	614866	614871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625539
15076	NC_015848	CG	3	6	614872	614877	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15077	NC_015848	GCCGC	2	10	614964	614973	0 %	0 %	40 %	60 %	340625539
15078	NC_015848	CGGG	2	8	615004	615011	0 %	0 %	75 %	25 %	340625539
15079	NC_015848	CG	3	6	615080	615085	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15080	NC_015848	ATC	2	6	615090	615095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625539
15081	NC_015848	CCG	2	6	615115	615120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15082	NC_015848	CCG	2	6	615166	615171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15083	NC_015848	GCC	2	6	615207	615212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15084	NC_015848	GC	3	6	615218	615223	0 %	0 %	50 %	50 %	340625539
15085	NC_015848	CGC	2	6	615241	615246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625539
15086	NC_015848	AAG	2	6	615249	615254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625539
15087	NC_015848	GCGT	2	8	615291	615298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15088	NC_015848	CCGA	2	8	615316	615323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15089	NC_015848	TGC	2	6	615458	615463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625540
15090	NC_015848	GCC	2	6	615571	615576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625540
15091	NC_015848	GTGG	2	8	615580	615587	0 %	25 %	75 %	0 %	340625540
15092	NC_015848	CG	3	6	615608	615613	0 %	0 %	50 %	50 %	340625540
15093	NC_015848	CGG	2	6	615638	615643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625540
15094	NC_015848	ACG	2	6	615794	615799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625540
15095	NC_015848	GAT	2	6	615873	615878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625540
15096	NC_015848	CGC	2	6	615915	615920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625540
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15099	NC_015848	CGC	2	6	616050	616055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625540
15100	NC_015848	CGA	2	6	616086	616091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625540
15101	NC_015848	TGG	2	6	616139	616144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625540
15102	NC_015848	CGG	2	6	616151	616156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625540
15103	NC_015848	GCC	2	6	616177	616182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625540
15104	NC_015848	GAT	2	6	616206	616211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625540
15105	NC_015848	GCG	3	9	616216	616224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625540
15106	NC_015848	AAT	2	6	616228	616233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625540
15107	NC_015848	CGG	2	6	616325	616330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625540
15108	NC_015848	TGACA	2	10	616353	616362	40 %	20 %	20 %	20 %	340625541
15109	NC_015848	GTT	3	9	616386	616394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625541
15110	NC_015848	GCG	2	6	616441	616446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625541
15111	NC_015848	CTC	3	9	616456	616464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340625541
15112	NC_015848	GCG	2	6	616475	616480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625541
15113	NC_015848	GGGTT	2	10	616484	616493	0 %	40 %	60 %	0 %	340625541
15114	NC_015848	GGC	2	6	616551	616556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625541
15115	NC_015848	GTCG	2	8	616569	616576	0 %	25 %	50 %	25 %	340625541
15116	NC_015848	ATG	2	6	616586	616591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625541
15117	NC_015848	TCG	2	6	616718	616723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625541
15118	NC_015848	CG	3	6	616730	616735	0 %	0 %	50 %	50 %	340625541
15119	NC_015848	CGT	2	6	616792	616797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625541
15120	NC_015848	GCGG	2	8	616809	616816	0 %	0 %	75 %	25 %	340625541
15121	NC_015848	GAC	2	6	616882	616887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625541
15122	NC_015848	CCGGG	2	10	616916	616925	0 %	0 %	60 %	40 %	340625542
15123	NC_015848	GCG	2	6	616965	616970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625542
15124	NC_015848	GGT	2	6	617039	617044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625542
15125	NC_015848	CTG	3	9	617073	617081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625542
15126	NC_015848	CGA	2	6	617083	617088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625542
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15129	NC_015848	CG	4	8	617130	617137	0 %	0 %	50 %	50 %	340625542
15130	NC_015848	CGG	2	6	617183	617188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625542
15131	NC_015848	GCT	3	9	617224	617232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_015848	GTA	2	6	617266	617271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_015848	TGA	2	6	617333	617338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625543
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15192	NC_015848	TGA	2	6	619528	619533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15231	NC_015848	CGA	2	6	621300	621305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625546
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15241	NC_015848	GC	3	6	621763	621768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15242	NC_015848	CGG	2	6	621807	621812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15243	NC_015848	CAG	2	6	621823	621828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15244	NC_015848	TCG	3	9	621877	621885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15245	NC_015848	GGT	2	6	621889	621894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15246	NC_015848	GTCC	2	8	621910	621917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15247	NC_015848	ACG	2	6	622008	622013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625547
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15250	NC_015848	GTTG	2	8	622059	622066	0 %	50 %	50 %	0 %	340625547
15251	NC_015848	GTC	2	6	622171	622176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625547
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15362	NC_015848	CGG	2	6	624819	624824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625548
15363	NC_015848	GGC	2	6	624877	624882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625548
15364	NC_015848	CGG	2	6	624894	624899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625548
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15379	NC_015848	GGT	2	6	625215	625220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15380	NC_015848	GAG	2	6	625297	625302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15381	NC_015848	TTC	2	6	625315	625320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15382	NC_015848	GGC	2	6	625400	625405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15383	NC_015848	ACG	2	6	625437	625442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15384	NC_015848	GCT	2	6	625491	625496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15385	NC_015848	CGGC	2	8	625522	625529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15386	NC_015848	GAT	2	6	625547	625552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15387	NC_015848	CCGC	2	8	625553	625560	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15388	NC_015848	GAC	2	6	625572	625577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15389	NC_015848	CG	3	6	625616	625621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15390	NC_015848	AAG	2	6	625695	625700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15391	NC_015848	CGA	2	6	625751	625756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15392	NC_015848	CGT	2	6	625784	625789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15393	NC_015848	CCG	2	6	625824	625829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15394	NC_015848	GAG	2	6	625840	625845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15395	NC_015848	CGG	2	6	625866	625871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15396	NC_015848	CCGAT	2	10	625886	625895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15397	NC_015848	CGA	2	6	625902	625907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15398	NC_015848	TGC	2	6	625922	625927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15400	NC_015848	GCC	2	6	626162	626167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15401	NC_015848	TCGAC	2	10	626250	626259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15402	NC_015848	GTC	2	6	626265	626270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15403	NC_015848	CGG	2	6	626324	626329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15404	NC_015848	CGG	2	6	626430	626435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625549
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15446	NC_015848	TTC	2	6	627879	627884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625550
15447	NC_015848	CGCC	2	8	627925	627932	0 %	0 %	25 %	75 %	340625550
15448	NC_015848	GTACG	2	10	627969	627978	20 %	20 %	40 %	20 %	340625550
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15450	NC_015848	AGCC	2	8	628026	628033	25 %	0 %	25 %	50 %	340625550
15451	NC_015848	AGCC	2	8	628079	628086	25 %	0 %	25 %	50 %	340625550
15452	NC_015848	CCA	2	6	628105	628110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15453	NC_015848	GTC	2	6	628210	628215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15454	NC_015848	GCA	2	6	628220	628225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625551
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15456	NC_015848	GC	3	6	628258	628263	0 %	0 %	50 %	50 %	340625551
15457	NC_015848	CGG	2	6	628305	628310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625551
15458	NC_015848	CGG	2	6	628337	628342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625551
15459	NC_015848	GCT	2	6	628379	628384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625551
15460	NC_015848	TTGA	2	8	628387	628394	25 %	50 %	25 %	0 %	340625551
15461	NC_015848	GAT	2	6	628440	628445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625551
15462	NC_015848	CGT	2	6	628467	628472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625551
15463	NC_015848	CCG	2	6	628526	628531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
15464	NC_015848	ATC	2	6	628552	628557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625551
15465	NC_015848	CCGG	2	8	628646	628653	0 %	0 %	50 %	50 %	340625551
15466	NC_015848	GCT	2	6	628676	628681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625551
15467	NC_015848	GAC	2	6	628747	628752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625551
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15470	NC_015848	GCC	2	6	628822	628827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
15471	NC_015848	GGCA	2	8	628874	628881	25 %	0 %	50 %	25 %	340625551
15472	NC_015848	CGC	2	6	628905	628910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
15473	NC_015848	CGT	2	6	628944	628949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625551
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15475	NC_015848	CCG	2	6	628991	628996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
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15480	NC_015848	TGGT	2	8	629055	629062	0 %	50 %	50 %	0 %	340625551
15481	NC_015848	TGA	2	6	629108	629113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625551
15482	NC_015848	GCG	2	6	629114	629119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625551
15483	NC_015848	CGC	3	9	629127	629135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
15484	NC_015848	CGG	2	6	629139	629144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625551
15485	NC_015848	GC	3	6	629145	629150	0 %	0 %	50 %	50 %	340625551
15486	NC_015848	GCC	2	6	629227	629232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
15487	NC_015848	GCC	2	6	629251	629256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
15488	NC_015848	GAC	2	6	629257	629262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625551
15489	NC_015848	GGCC	2	8	629301	629308	0 %	0 %	50 %	50 %	340625551
15490	NC_015848	GGCA	2	8	629358	629365	25 %	0 %	50 %	25 %	340625551
15491	NC_015848	GT	3	6	629375	629380	0 %	50 %	50 %	0 %	340625551
15492	NC_015848	CG	3	6	629415	629420	0 %	0 %	50 %	50 %	340625551
15493	NC_015848	GCCA	2	8	629422	629429	25 %	0 %	25 %	50 %	340625551
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15495	NC_015848	CCG	2	6	629482	629487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625551
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15497	NC_015848	GCG	2	6	629533	629538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625551
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15499	NC_015848	AGC	2	6	629577	629582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625551
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