MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 111405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015848	CCTT	2	8	551533	551540	0 %	50 %	0 %	50 %	340625475
13502	NC_015848	ACG	2	6	551573	551578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13503	NC_015848	ACG	2	6	551653	551658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13504	NC_015848	GCCA	3	12	551665	551676	25 %	0 %	25 %	50 %	340625475
13505	NC_015848	ATC	2	6	551704	551709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625475
13506	NC_015848	AGTA	2	8	551791	551798	50 %	25 %	25 %	0 %	340625476
13507	NC_015848	CCG	2	6	551905	551910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625476
13508	NC_015848	CGT	2	6	551911	551916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625476
13509	NC_015848	G	6	6	552011	552016	0 %	0 %	100 %	0 %	340625476
13510	NC_015848	ACG	2	6	552085	552090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625476
13511	NC_015848	GAA	2	6	552107	552112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625476
13512	NC_015848	CGA	2	6	552142	552147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625476
13513	NC_015848	ACC	3	9	552150	552158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625476
13514	NC_015848	CGG	2	6	552234	552239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_015848	AGCCT	2	10	552294	552303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13516	NC_015848	GC	3	6	552463	552468	0 %	0 %	50 %	50 %	340625477
13517	NC_015848	GCG	3	9	552497	552505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625477
13518	NC_015848	TGG	2	6	552507	552512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625477
13519	NC_015848	CG	3	6	552517	552522	0 %	0 %	50 %	50 %	340625477
13520	NC_015848	CGCTGG	2	12	552525	552536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340625477
13521	NC_015848	ACT	2	6	552591	552596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625477
13522	NC_015848	TGC	3	9	552633	552641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625477
13523	NC_015848	CGC	2	6	552646	552651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625477
13524	NC_015848	GGT	2	6	552666	552671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625477
13525	NC_015848	AGC	2	6	552687	552692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625477
13526	NC_015848	GCC	2	6	552752	552757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625477
13527	NC_015848	ATCTGC	2	12	552786	552797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340625477
13528	NC_015848	AGG	2	6	552807	552812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625477
13529	NC_015848	TCG	2	6	552870	552875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625477
13530	NC_015848	CTG	2	6	552929	552934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625477
13531	NC_015848	GGC	2	6	552949	552954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625477
13532	NC_015848	CCG	2	6	552977	552982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625477
13533	NC_015848	GAG	2	6	553007	553012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625477
13534	NC_015848	TGC	2	6	553048	553053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625477
13535	NC_015848	GGC	2	6	553178	553183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_015848	CTT	2	6	553204	553209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_015848	ATAGTC	2	12	553255	553266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13538	NC_015848	TTG	2	6	553269	553274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_015848	GC	4	8	553371	553378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13540	NC_015848	TG	3	6	553407	553412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_015848	ATGG	2	8	553474	553481	25 %	25 %	50 %	0 %	340625478
13542	NC_015848	TTG	2	6	553508	553513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625478
13543	NC_015848	AGT	2	6	553514	553519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625478
13544	NC_015848	CCGGGG	2	12	553523	553534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625478
13545	NC_015848	GCC	3	9	553544	553552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625478
13546	NC_015848	GTC	2	6	553561	553566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625478
13547	NC_015848	CGC	2	6	553582	553587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625478
13548	NC_015848	GCTG	2	8	553612	553619	0 %	25 %	50 %	25 %	340625478
13549	NC_015848	TGC	2	6	553663	553668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625478
13550	NC_015848	TGCC	2	8	553673	553680	0 %	25 %	25 %	50 %	340625478
13551	NC_015848	CGG	2	6	553722	553727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625478
13552	NC_015848	CCG	2	6	553749	553754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625478
13553	NC_015848	CGC	2	6	553759	553764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625478
13554	NC_015848	TGG	2	6	553770	553775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625478
13555	NC_015848	GGC	2	6	553798	553803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625478
13556	NC_015848	TGG	2	6	553827	553832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625478
13557	NC_015848	TTC	2	6	553841	553846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625478
13558	NC_015848	GGC	2	6	553906	553911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625478
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13560	NC_015848	CGG	2	6	553947	553952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625478
13561	NC_015848	CCG	2	6	553979	553984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625478
13562	NC_015848	AAT	2	6	554027	554032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625478
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13568	NC_015848	CA	4	8	554293	554300	50 %	0 %	0 %	50 %	340625478
13569	NC_015848	TGC	2	6	554301	554306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625478
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13582	NC_015848	CGA	2	6	554779	554784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625478
13583	NC_015848	TCG	2	6	554787	554792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625478
13584	NC_015848	CCGGC	2	10	554802	554811	0 %	0 %	40 %	60 %	340625478
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13587	NC_015848	GCAA	2	8	554885	554892	50 %	0 %	25 %	25 %	340625478
13588	NC_015848	GCCG	2	8	554908	554915	0 %	0 %	50 %	50 %	340625478
13589	NC_015848	CGA	2	6	554932	554937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625478
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13592	NC_015848	CCGA	2	8	555109	555116	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_015848	CAC	2	6	555232	555237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625479
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13598	NC_015848	AATC	2	8	555537	555544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13599	NC_015848	CGG	2	6	555552	555557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_015848	TGG	2	6	555587	555592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_015848	ACA	2	6	555593	555598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_015848	CGA	2	6	555720	555725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625480
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13605	NC_015848	AGT	2	6	555804	555809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625480
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13608	NC_015848	TTG	2	6	555851	555856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625480
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13616	NC_015848	GAC	2	6	556143	556148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_015848	GTCT	2	8	556159	556166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13618	NC_015848	TGA	2	6	556189	556194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625481
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13741	NC_015848	CAA	2	6	561136	561141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625484
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13744	NC_015848	CGT	2	6	561189	561194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625484
13745	NC_015848	ACG	3	9	561204	561212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625484
13746	NC_015848	GT	3	6	561255	561260	0 %	50 %	50 %	0 %	340625484
13747	NC_015848	CGGGC	2	10	561287	561296	0 %	0 %	60 %	40 %	340625484
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13749	NC_015848	ACC	2	6	561333	561338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625484
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13754	NC_015848	CTG	2	6	561437	561442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625484
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13789	NC_015848	TAGGG	2	10	562881	562890	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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13813	NC_015848	ACG	2	6	564134	564139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625488
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13855	NC_015848	CTG	2	6	565931	565936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625491
13856	NC_015848	GCA	2	6	565971	565976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625491
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13859	NC_015848	GTG	2	6	566062	566067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625491
13860	NC_015848	AGT	2	6	566139	566144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625491
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13862	NC_015848	CGG	2	6	566214	566219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625491
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13870	NC_015848	A	6	6	566750	566755	100 %	0 %	0 %	0 %	340625492
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13873	NC_015848	CGGCTG	2	12	566837	566848	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340625492
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13927	NC_015848	GCGAT	2	10	569179	569188	20 %	20 %	40 %	20 %	340625494
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13962	NC_015848	CCGG	2	8	571095	571102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13963	NC_015848	GC	3	6	571113	571118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13974	NC_015848	CGT	2	6	571730	571735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625496
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13976	NC_015848	CAGCCG	2	12	571768	571779	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340625496
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