MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 111405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015848	GCG	2	6	530349	530354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625457
13002	NC_015848	ACC	3	9	530402	530410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625457
13003	NC_015848	GAC	2	6	530426	530431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625457
13004	NC_015848	CTG	2	6	530432	530437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625457
13005	NC_015848	GCG	2	6	530439	530444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625457
13006	NC_015848	ATC	2	6	530456	530461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625457
13007	NC_015848	CGA	2	6	530536	530541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625457
13008	NC_015848	GAC	2	6	530542	530547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625457
13009	NC_015848	ACC	2	6	530552	530557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625457
13010	NC_015848	TGCC	2	8	530608	530615	0 %	25 %	25 %	50 %	340625458
13011	NC_015848	GCC	2	6	530625	530630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625458
13012	NC_015848	TGC	2	6	530776	530781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625458
13013	NC_015848	CCG	2	6	530821	530826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625458
13014	NC_015848	CCCG	2	8	530859	530866	0 %	0 %	25 %	75 %	340625458
13015	NC_015848	ACCC	2	8	530910	530917	25 %	0 %	0 %	75 %	340625458
13016	NC_015848	CG	3	6	530921	530926	0 %	0 %	50 %	50 %	340625458
13017	NC_015848	CGC	2	6	530953	530958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625458
13018	NC_015848	GTG	2	6	530987	530992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625458
13019	NC_015848	GCT	2	6	531074	531079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625458
13020	NC_015848	ACT	2	6	531082	531087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625458
13021	NC_015848	TCA	2	6	531114	531119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625458
13022	NC_015848	TGG	2	6	531123	531128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625458
13023	NC_015848	GAT	2	6	531164	531169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625458
13024	NC_015848	CAG	2	6	531174	531179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625458
13025	NC_015848	CCG	2	6	531187	531192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625458
13026	NC_015848	AGA	3	9	531247	531255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625458
13027	NC_015848	CAT	2	6	531260	531265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625458
13028	NC_015848	GC	3	6	531367	531372	0 %	0 %	50 %	50 %	340625458
13029	NC_015848	TCG	2	6	531397	531402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625458
13030	NC_015848	CCG	2	6	531410	531415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625458
13031	NC_015848	GCC	2	6	531480	531485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625458
13032	NC_015848	ATC	2	6	531507	531512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625458
13033	NC_015848	AACG	2	8	531528	531535	50 %	0 %	25 %	25 %	340625458
13034	NC_015848	CGA	2	6	531605	531610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625458
13035	NC_015848	CCT	2	6	531646	531651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340625458
13036	NC_015848	GCA	3	9	531674	531682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625458
13037	NC_015848	GC	3	6	531695	531700	0 %	0 %	50 %	50 %	340625458
13038	NC_015848	GCTG	2	8	531747	531754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13039	NC_015848	GAG	2	6	531776	531781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_015848	CGA	2	6	531856	531861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625459
13041	NC_015848	CGG	3	9	531973	531981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625459
13042	NC_015848	GATGT	2	10	531990	531999	20 %	40 %	40 %	0 %	340625459
13043	NC_015848	TGC	2	6	532053	532058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625459
13044	NC_015848	CGA	2	6	532102	532107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625459
13045	NC_015848	GCT	2	6	532174	532179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625459
13046	NC_015848	GCC	2	6	532223	532228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625459
13047	NC_015848	GGT	2	6	532273	532278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625459
13048	NC_015848	GGC	2	6	532360	532365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625459
13049	NC_015848	CGG	2	6	532371	532376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625459
13050	NC_015848	CGAT	2	8	532378	532385	25 %	25 %	25 %	25 %	340625459
13051	NC_015848	TGG	2	6	532425	532430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625459
13052	NC_015848	CCG	2	6	532527	532532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_015848	TCA	2	6	532617	532622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_015848	CG	3	6	532696	532701	0 %	0 %	50 %	50 %	340625460
13055	NC_015848	CG	3	6	532712	532717	0 %	0 %	50 %	50 %	340625460
13056	NC_015848	CGG	3	9	532728	532736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625460
13057	NC_015848	GGC	2	6	532744	532749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625460
13058	NC_015848	CGC	2	6	532760	532765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625460
13059	NC_015848	GCA	2	6	532788	532793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13060	NC_015848	CA	3	6	532798	532803	50 %	0 %	0 %	50 %	340625460
13061	NC_015848	CGG	2	6	532806	532811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625460
13062	NC_015848	GCC	2	6	532947	532952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625460
13063	NC_015848	GCA	2	6	532959	532964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13064	NC_015848	GAC	2	6	533008	533013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13065	NC_015848	CAG	2	6	533047	533052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13066	NC_015848	CCA	2	6	533058	533063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625460
13067	NC_015848	TCG	2	6	533123	533128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13068	NC_015848	CCG	2	6	533161	533166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625460
13069	NC_015848	GAG	2	6	533192	533197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625460
13070	NC_015848	CCCA	2	8	533198	533205	25 %	0 %	0 %	75 %	340625460
13071	NC_015848	CGGG	2	8	533295	533302	0 %	0 %	75 %	25 %	340625460
13072	NC_015848	CG	3	6	533319	533324	0 %	0 %	50 %	50 %	340625460
13073	NC_015848	TGC	2	6	533360	533365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13074	NC_015848	TCG	2	6	533423	533428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13075	NC_015848	CGTCA	2	10	533431	533440	20 %	20 %	20 %	40 %	340625460
13076	NC_015848	TCG	2	6	533453	533458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13077	NC_015848	GAG	2	6	533500	533505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625460
13078	NC_015848	GTC	2	6	533506	533511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625460
13079	NC_015848	GCA	2	6	533517	533522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625460
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13085	NC_015848	CAG	2	6	533677	533682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625460
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13090	NC_015848	CGG	2	6	533958	533963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625460
13091	NC_015848	CG	3	6	534019	534024	0 %	0 %	50 %	50 %	340625460
13092	NC_015848	CCGG	2	8	534047	534054	0 %	0 %	50 %	50 %	340625460
13093	NC_015848	GTA	2	6	534099	534104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625460
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13101	NC_015848	ACG	2	6	534734	534739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625460
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13103	NC_015848	CGG	2	6	534877	534882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625461
13104	NC_015848	CG	3	6	534885	534890	0 %	0 %	50 %	50 %	340625461
13105	NC_015848	CG	3	6	534897	534902	0 %	0 %	50 %	50 %	340625461
13106	NC_015848	GTC	2	6	534918	534923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625461
13107	NC_015848	GCTG	2	8	534953	534960	0 %	25 %	50 %	25 %	340625461
13108	NC_015848	GAT	3	9	534993	535001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625461
13109	NC_015848	CAA	2	6	535011	535016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625461
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13111	NC_015848	CAG	2	6	535062	535067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625461
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13113	NC_015848	GGT	2	6	535084	535089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625461
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13115	NC_015848	CGCC	2	8	535238	535245	0 %	0 %	25 %	75 %	340625461
13116	NC_015848	CGA	2	6	535259	535264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625461
13117	NC_015848	CGT	2	6	535295	535300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625461
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13119	NC_015848	ACC	2	6	535360	535365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625461
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13121	NC_015848	ACA	2	6	535385	535390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625461
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13232	NC_015848	CGA	2	6	540183	540188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625465
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13238	NC_015848	GAG	2	6	540534	540539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13239	NC_015848	CTC	2	6	540563	540568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13240	NC_015848	GCA	2	6	540656	540661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625466
13241	NC_015848	GC	3	6	540662	540667	0 %	0 %	50 %	50 %	340625466
13242	NC_015848	GCGG	2	8	540687	540694	0 %	0 %	75 %	25 %	340625466
13243	NC_015848	GTC	2	6	540696	540701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625466
13244	NC_015848	CGA	2	6	540737	540742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625466
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13250	NC_015848	CACG	2	8	541144	541151	25 %	0 %	25 %	50 %	340625467
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13291	NC_015848	GCC	2	6	543281	543286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13292	NC_015848	TCG	2	6	543306	543311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13317	NC_015848	CCG	2	6	544197	544202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625470
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13345	NC_015848	CGA	2	6	545408	545413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625471
13346	NC_015848	GCG	2	6	545430	545435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625471
13347	NC_015848	CAC	2	6	545460	545465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625471
13348	NC_015848	ACG	2	6	545497	545502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625471
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13350	NC_015848	TCG	2	6	545616	545621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625472
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13352	NC_015848	CGA	2	6	545716	545721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625472
13353	NC_015848	GT	3	6	545733	545738	0 %	50 %	50 %	0 %	340625472
13354	NC_015848	GAT	2	6	545753	545758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625472
13355	NC_015848	GGT	2	6	545839	545844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625472
13356	NC_015848	GCG	2	6	545904	545909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625472
13357	NC_015848	ATC	2	6	545946	545951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625472
13358	NC_015848	ACT	2	6	545961	545966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625472
13359	NC_015848	GCCG	2	8	546029	546036	0 %	0 %	50 %	50 %	340625472
13360	NC_015848	CGC	2	6	546045	546050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625472
13361	NC_015848	AGCC	2	8	546053	546060	25 %	0 %	25 %	50 %	340625472
13362	NC_015848	TGC	2	6	546063	546068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625472
13363	NC_015848	C	6	6	546100	546105	0 %	0 %	0 %	100 %	340625472
13364	NC_015848	CG	3	6	546113	546118	0 %	0 %	50 %	50 %	340625472
13365	NC_015848	CTG	2	6	546167	546172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625472
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13368	NC_015848	CAG	2	6	546254	546259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625472
13369	NC_015848	TCG	2	6	546294	546299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625472
13370	NC_015848	AGCG	2	8	546423	546430	25 %	0 %	50 %	25 %	340625472
13371	NC_015848	CGA	2	6	546488	546493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625472
13372	NC_015848	GATG	2	8	546571	546578	25 %	25 %	50 %	0 %	340625472
13373	NC_015848	GC	3	6	546591	546596	0 %	0 %	50 %	50 %	340625472
13374	NC_015848	CGG	2	6	546601	546606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625472
13375	NC_015848	AGTG	2	8	546649	546656	25 %	25 %	50 %	0 %	340625472
13376	NC_015848	AGC	2	6	546669	546674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625472
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13379	NC_015848	CTG	2	6	546730	546735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625472
13380	NC_015848	TGC	2	6	546755	546760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625472
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13383	NC_015848	CCA	3	9	546852	546860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625473
13384	NC_015848	CAT	2	6	546886	546891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625473
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13386	NC_015848	CGG	2	6	546962	546967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625473
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13389	NC_015848	TGA	2	6	547043	547048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625473
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13391	NC_015848	CGG	2	6	547096	547101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625473
13392	NC_015848	CCG	2	6	547121	547126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625473
13393	NC_015848	AGA	2	6	547185	547190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625473
13394	NC_015848	GCA	2	6	547230	547235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625473
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13396	NC_015848	GCG	2	6	547314	547319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625473
13397	NC_015848	GTC	2	6	547345	547350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625473
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13400	NC_015848	GTG	2	6	547478	547483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13401	NC_015848	CCT	2	6	547529	547534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340625474
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13428	NC_015848	GTC	2	6	548526	548531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625474
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13430	NC_015848	CGACAT	2	12	548541	548552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340625474
13431	NC_015848	CGA	2	6	548648	548653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625474
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13433	NC_015848	GCCG	2	8	548714	548721	0 %	0 %	50 %	50 %	340625474
13434	NC_015848	GGC	2	6	548766	548771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625474
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13436	NC_015848	TCG	2	6	548811	548816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625474
13437	NC_015848	TGC	2	6	548824	548829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625474
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13439	NC_015848	GACG	2	8	548857	548864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13440	NC_015848	GCT	2	6	548886	548891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625475
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13442	NC_015848	CGGG	2	8	548944	548951	0 %	0 %	75 %	25 %	340625475
13443	NC_015848	CCA	2	6	548973	548978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625475
13444	NC_015848	AGT	2	6	548992	548997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625475
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13447	NC_015848	TGG	2	6	549062	549067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625475
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13449	NC_015848	GAT	2	6	549177	549182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625475
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13453	NC_015848	TGA	2	6	549407	549412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625475
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13459	NC_015848	GAT	2	6	549630	549635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625475
13460	NC_015848	GTCC	2	8	549650	549657	0 %	25 %	25 %	50 %	340625475
13461	NC_015848	GC	3	6	549679	549684	0 %	0 %	50 %	50 %	340625475
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13465	NC_015848	ATC	2	6	550062	550067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625475
13466	NC_015848	TTC	2	6	550092	550097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625475
13467	NC_015848	GTA	2	6	550141	550146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625475
13468	NC_015848	TCG	2	6	550193	550198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13469	NC_015848	TCG	2	6	550207	550212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13470	NC_015848	TCG	2	6	550316	550321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13471	NC_015848	TTGC	2	8	550340	550347	0 %	50 %	25 %	25 %	340625475
13472	NC_015848	GA	3	6	550472	550477	50 %	0 %	50 %	0 %	340625475
13473	NC_015848	TTGG	2	8	550503	550510	0 %	50 %	50 %	0 %	340625475
13474	NC_015848	GGTA	2	8	550525	550532	25 %	25 %	50 %	0 %	340625475
13475	NC_015848	CAGG	2	8	550562	550569	25 %	0 %	50 %	25 %	340625475
13476	NC_015848	CGA	2	6	550604	550609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13477	NC_015848	ACC	2	6	550630	550635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625475
13478	NC_015848	ACCC	2	8	550641	550648	25 %	0 %	0 %	75 %	340625475
13479	NC_015848	GCC	2	6	550649	550654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625475
13480	NC_015848	GAG	2	6	550668	550673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625475
13481	NC_015848	GTA	2	6	550887	550892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625475
13482	NC_015848	GCC	2	6	550894	550899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625475
13483	NC_015848	GAT	2	6	550941	550946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625475
13484	NC_015848	GGT	2	6	551007	551012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625475
13485	NC_015848	CG	3	6	551054	551059	0 %	0 %	50 %	50 %	340625475
13486	NC_015848	CAG	2	6	551088	551093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625475
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13491	NC_015848	CGA	2	6	551267	551272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13492	NC_015848	TGC	2	6	551273	551278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625475
13493	NC_015848	GCG	2	6	551306	551311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625475
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13498	NC_015848	CGT	2	6	551456	551461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625475
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13500	NC_015848	TAT	2	6	551502	551507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340625475

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