MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 111405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015848	TCG	2	6	487358	487363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625427
12002	NC_015848	TGC	3	9	487388	487396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625427
12003	NC_015848	GCC	2	6	487408	487413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625427
12004	NC_015848	GCACC	2	10	487426	487435	20 %	0 %	20 %	60 %	340625427
12005	NC_015848	ACGG	2	8	487438	487445	25 %	0 %	50 %	25 %	340625427
12006	NC_015848	GTC	2	6	487461	487466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_015848	CAAC	2	8	487554	487561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12008	NC_015848	GCA	2	6	487649	487654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625428
12009	NC_015848	GTG	2	6	487681	487686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625428
12010	NC_015848	CGA	2	6	487687	487692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625428
12011	NC_015848	CCA	2	6	487740	487745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625428
12012	NC_015848	GTG	2	6	487831	487836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625428
12013	NC_015848	CGA	2	6	487847	487852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625428
12014	NC_015848	CCA	2	6	487868	487873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625428
12015	NC_015848	GGCC	2	8	487961	487968	0 %	0 %	50 %	50 %	340625428
12016	NC_015848	TCT	2	6	487975	487980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625428
12017	NC_015848	GAT	2	6	488034	488039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625428
12018	NC_015848	GCA	2	6	488048	488053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625428
12019	NC_015848	CAGTG	2	10	488059	488068	20 %	20 %	40 %	20 %	340625428
12020	NC_015848	TGC	2	6	488083	488088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625428
12021	NC_015848	CGA	2	6	488141	488146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625428
12022	NC_015848	CGG	2	6	488150	488155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625428
12023	NC_015848	ATG	3	9	488185	488193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625428
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12025	NC_015848	AGAT	2	8	488284	488291	50 %	25 %	25 %	0 %	340625428
12026	NC_015848	TCG	2	6	488326	488331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625428
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12029	NC_015848	TGA	2	6	488396	488401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625428
12030	NC_015848	GTC	2	6	488496	488501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625428
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12033	NC_015848	TGG	2	6	488624	488629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625428
12034	NC_015848	AGT	2	6	488653	488658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625428
12035	NC_015848	TG	3	6	488665	488670	0 %	50 %	50 %	0 %	340625428
12036	NC_015848	GTC	2	6	488688	488693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625428
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12039	NC_015848	GTC	2	6	488829	488834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625428
12040	NC_015848	CGA	2	6	489069	489074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625428
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12042	NC_015848	GTCG	2	8	489174	489181	0 %	25 %	50 %	25 %	340625428
12043	NC_015848	GTA	2	6	489297	489302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625428
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12054	NC_015848	GAT	2	6	489813	489818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625428
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12087	NC_015848	CGG	2	6	491216	491221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12102	NC_015848	AAT	2	6	492150	492155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625430
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12118	NC_015848	TGATT	2	10	493238	493247	20 %	60 %	20 %	0 %	340625431
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12120	NC_015848	GCA	2	6	493327	493332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625431
12121	NC_015848	GAA	2	6	493421	493426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625431
12122	NC_015848	ATA	2	6	493519	493524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625431
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12223	NC_015848	TGT	2	6	497768	497773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625431
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12225	NC_015848	ATC	2	6	497815	497820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625431
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12228	NC_015848	GGT	2	6	497873	497878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625431
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12231	NC_015848	TGGGTA	2	12	497971	497982	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340625431
12232	NC_015848	TGC	2	6	497993	497998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625431
12233	NC_015848	TGG	2	6	498031	498036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625431
12234	NC_015848	ACC	2	6	498108	498113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625431
12235	NC_015848	GCT	2	6	498161	498166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625431
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12237	NC_015848	GCG	2	6	498261	498266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625431
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12241	NC_015848	CGG	2	6	498385	498390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625431
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12357	NC_015848	TGC	2	6	503615	503620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625433
12358	NC_015848	CAC	2	6	503624	503629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625433
12359	NC_015848	ATC	2	6	503658	503663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625433
12360	NC_015848	ATC	2	6	503748	503753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625433
12361	NC_015848	AGC	2	6	503770	503775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625433
12362	NC_015848	GCAC	2	8	503799	503806	25 %	0 %	25 %	50 %	340625433
12363	NC_015848	CGC	2	6	503807	503812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625433
12364	NC_015848	GC	3	6	503915	503920	0 %	0 %	50 %	50 %	340625433
12365	NC_015848	ACG	2	6	503959	503964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625433
12366	NC_015848	GTCG	2	8	503978	503985	0 %	25 %	50 %	25 %	340625433
12367	NC_015848	CCA	2	6	503989	503994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625433
12368	NC_015848	GGCC	2	8	504014	504021	0 %	0 %	50 %	50 %	340625433
12369	NC_015848	CAA	2	6	504059	504064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625433
12370	NC_015848	GCGATC	2	12	504096	504107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340625433
12371	NC_015848	TGC	2	6	504115	504120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625433
12372	NC_015848	CGA	2	6	504167	504172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625433
12373	NC_015848	TCG	3	9	504253	504261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625434
12374	NC_015848	TCG	2	6	504275	504280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625434
12375	NC_015848	GCC	2	6	504304	504309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625434
12376	NC_015848	TGG	2	6	504425	504430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625434
12377	NC_015848	GGT	2	6	504444	504449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625434
12378	NC_015848	CGG	2	6	504453	504458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625434
12379	NC_015848	GCT	2	6	504480	504485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625434
12380	NC_015848	GAG	2	6	504511	504516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625434
12381	NC_015848	CGG	2	6	504548	504553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625434
12382	NC_015848	CGG	2	6	504641	504646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625434
12383	NC_015848	CCG	2	6	504693	504698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625434
12384	NC_015848	AGCG	2	8	504733	504740	25 %	0 %	50 %	25 %	340625434
12385	NC_015848	GCC	3	9	504742	504750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625434
12386	NC_015848	GCC	2	6	504758	504763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625434
12387	NC_015848	TGC	2	6	504788	504793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625434
12388	NC_015848	CGGC	2	8	504831	504838	0 %	0 %	50 %	50 %	340625434
12389	NC_015848	TCA	2	6	504917	504922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625434
12390	NC_015848	ATCGA	2	10	504961	504970	40 %	20 %	20 %	20 %	340625434
12391	NC_015848	CCG	2	6	505154	505159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625434
12392	NC_015848	GCG	2	6	505177	505182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625434
12393	NC_015848	GCG	2	6	505185	505190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625434
12394	NC_015848	TGGC	2	8	505199	505206	0 %	25 %	50 %	25 %	340625434
12395	NC_015848	CGG	2	6	505267	505272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625434
12396	NC_015848	TGG	2	6	505304	505309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625434
12397	NC_015848	GAA	2	6	505321	505326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625434
12398	NC_015848	CCG	2	6	505391	505396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12399	NC_015848	CGT	2	6	505405	505410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12400	NC_015848	GGC	2	6	505425	505430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12401	NC_015848	TGG	2	6	505442	505447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625435
12402	NC_015848	TTG	2	6	505456	505461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625435
12403	NC_015848	CCA	2	6	505469	505474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625435
12404	NC_015848	TGGT	2	8	505579	505586	0 %	50 %	50 %	0 %	340625435
12405	NC_015848	TTG	2	6	505594	505599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625435
12406	NC_015848	GC	3	6	505616	505621	0 %	0 %	50 %	50 %	340625435
12407	NC_015848	GCA	2	6	505646	505651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12408	NC_015848	TCGG	2	8	505660	505667	0 %	25 %	50 %	25 %	340625435
12409	NC_015848	GCG	2	6	505690	505695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625435
12410	NC_015848	CCGG	2	8	505731	505738	0 %	0 %	50 %	50 %	340625435
12411	NC_015848	ACA	2	6	505739	505744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625435
12412	NC_015848	GCCGT	2	10	505763	505772	0 %	20 %	40 %	40 %	340625435
12413	NC_015848	TCG	2	6	505801	505806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12414	NC_015848	GCC	2	6	505867	505872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625435
12415	NC_015848	CGT	2	6	505883	505888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12416	NC_015848	TCG	2	6	505921	505926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12417	NC_015848	GGC	2	6	505950	505955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625435
12418	NC_015848	TGG	2	6	506015	506020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625435
12419	NC_015848	AGC	2	6	506041	506046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12420	NC_015848	ATCGCC	2	12	506072	506083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340625435
12421	NC_015848	TCG	2	6	506104	506109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12422	NC_015848	CAG	2	6	506145	506150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12423	NC_015848	CG	3	6	506229	506234	0 %	0 %	50 %	50 %	340625435
12424	NC_015848	GTCG	2	8	506298	506305	0 %	25 %	50 %	25 %	340625435
12425	NC_015848	CCA	2	6	506399	506404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625435
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12427	NC_015848	ACC	2	6	506485	506490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625435
12428	NC_015848	CGG	2	6	506528	506533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625435
12429	NC_015848	GCA	2	6	506573	506578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12430	NC_015848	GTC	2	6	506613	506618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12431	NC_015848	GCGT	2	8	506681	506688	0 %	25 %	50 %	25 %	340625435
12432	NC_015848	ATG	2	6	506836	506841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625435
12433	NC_015848	CAG	2	6	506910	506915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12434	NC_015848	TGC	2	6	506954	506959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625435
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12437	NC_015848	CAC	2	6	507147	507152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625435
12438	NC_015848	CCG	2	6	507202	507207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625435
12439	NC_015848	CGA	2	6	507242	507247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625435
12440	NC_015848	CAG	2	6	507364	507369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625435
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12442	NC_015848	TCA	2	6	507401	507406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625435
12443	NC_015848	CCA	2	6	507446	507451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625435
12444	NC_015848	GCC	3	9	507453	507461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625435
12445	NC_015848	CGG	2	6	507474	507479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625435
12446	NC_015848	TGG	3	9	507491	507499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625435
12447	NC_015848	CCG	2	6	507632	507637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625435
12448	NC_015848	GGGCG	2	10	507704	507713	0 %	0 %	80 %	20 %	340625436
12449	NC_015848	CGA	2	6	507868	507873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625436
12450	NC_015848	GTC	2	6	507917	507922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625436
12451	NC_015848	GCT	2	6	507946	507951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625436
12452	NC_015848	CCA	2	6	507958	507963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625436
12453	NC_015848	CAC	2	6	507980	507985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625436
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12455	NC_015848	CA	3	6	508049	508054	50 %	0 %	0 %	50 %	340625436
12456	NC_015848	GTTG	2	8	508117	508124	0 %	50 %	50 %	0 %	340625436
12457	NC_015848	GAC	2	6	508190	508195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625436
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12459	NC_015848	CGA	2	6	508381	508386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625436
12460	NC_015848	CG	5	10	508396	508405	0 %	0 %	50 %	50 %	340625436
12461	NC_015848	TCGGCC	2	12	508425	508436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340625436
12462	NC_015848	CGG	2	6	508493	508498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625436
12463	NC_015848	GCAGCG	2	12	508543	508554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340625436
12464	NC_015848	GCG	2	6	508621	508626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625436
12465	NC_015848	GCC	2	6	508638	508643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625436
12466	NC_015848	AGG	2	6	508650	508655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625436
12467	NC_015848	TCA	2	6	508666	508671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625436
12468	NC_015848	GGC	2	6	508717	508722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625437
12469	NC_015848	CAC	2	6	508735	508740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625437
12470	NC_015848	GCC	2	6	508741	508746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625437
12471	NC_015848	GC	3	6	508752	508757	0 %	0 %	50 %	50 %	340625437
12472	NC_015848	TCG	2	6	508835	508840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625437
12473	NC_015848	CGT	2	6	508863	508868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625437
12474	NC_015848	GGC	2	6	508897	508902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625437
12475	NC_015848	GCC	2	6	508950	508955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625437
12476	NC_015848	GGC	2	6	509007	509012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625437
12477	NC_015848	TCG	2	6	509084	509089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625437
12478	NC_015848	TCG	2	6	509114	509119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625437
12479	NC_015848	CCCA	2	8	509228	509235	25 %	0 %	0 %	75 %	340625437
12480	NC_015848	CAC	2	6	509236	509241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625437
12481	NC_015848	GC	3	6	509259	509264	0 %	0 %	50 %	50 %	340625437
12482	NC_015848	GCCA	2	8	509306	509313	25 %	0 %	25 %	50 %	340625437
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12490	NC_015848	TCG	2	6	509597	509602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625437
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12495	NC_015848	CTG	2	6	509800	509805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625437
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12497	NC_015848	GCC	2	6	509855	509860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625437
12498	NC_015848	GTC	2	6	509894	509899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625437
12499	NC_015848	ACC	2	6	509907	509912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625437
12500	NC_015848	CGG	2	6	509931	509936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625437

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