MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140010059 chromosome

Total Repeats: 111405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015848	GCA	2	6	227662	227667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625226
5502	NC_015848	CGA	2	6	227671	227676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625226
5503	NC_015848	CG	3	6	227694	227699	0 %	0 %	50 %	50 %	340625226
5504	NC_015848	CGG	2	6	227712	227717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625226
5505	NC_015848	CGG	2	6	227726	227731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625226
5506	NC_015848	CGG	2	6	227767	227772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625226
5507	NC_015848	GCC	2	6	227801	227806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625226
5508	NC_015848	TCA	2	6	227863	227868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625226
5509	NC_015848	ATG	2	6	227907	227912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625226
5510	NC_015848	CCGG	2	8	227948	227955	0 %	0 %	50 %	50 %	340625226
5511	NC_015848	CCG	2	6	227983	227988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625226
5512	NC_015848	GCG	2	6	228003	228008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625226
5513	NC_015848	CAG	2	6	228047	228052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625226
5514	NC_015848	GCC	2	6	228197	228202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625226
5515	NC_015848	CCT	2	6	228217	228222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340625226
5516	NC_015848	GA	3	6	228249	228254	50 %	0 %	50 %	0 %	340625226
5517	NC_015848	ACG	2	6	228277	228282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625226
5518	NC_015848	TCG	2	6	228315	228320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625226
5519	NC_015848	TCG	2	6	228429	228434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625226
5520	NC_015848	CGC	2	6	228478	228483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_015848	ATG	2	6	228532	228537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_015848	CAG	2	6	228600	228605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625227
5523	NC_015848	GCA	2	6	228619	228624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625227
5524	NC_015848	GCGTC	2	10	228649	228658	0 %	20 %	40 %	40 %	340625227
5525	NC_015848	CG	3	6	228679	228684	0 %	0 %	50 %	50 %	340625227
5526	NC_015848	CGGT	2	8	228752	228759	0 %	25 %	50 %	25 %	340625227
5527	NC_015848	CTG	2	6	228770	228775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625227
5528	NC_015848	CCGTG	2	10	228802	228811	0 %	20 %	40 %	40 %	340625227
5529	NC_015848	GCA	2	6	228857	228862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625227
5530	NC_015848	CG	3	6	228865	228870	0 %	0 %	50 %	50 %	340625227
5531	NC_015848	GTTC	2	8	228875	228882	0 %	50 %	25 %	25 %	340625227
5532	NC_015848	CGC	2	6	228888	228893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_015848	CAC	2	6	228915	228920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_015848	GGTGC	2	10	228926	228935	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5535	NC_015848	ACC	2	6	228977	228982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_015848	ACG	2	6	229044	229049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625228
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5538	NC_015848	GC	3	6	229138	229143	0 %	0 %	50 %	50 %	340625228
5539	NC_015848	GCCGC	2	10	229262	229271	0 %	0 %	40 %	60 %	340625228
5540	NC_015848	TGG	2	6	229279	229284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625228
5541	NC_015848	GCC	2	6	229350	229355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625228
5542	NC_015848	CTG	2	6	229386	229391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625228
5543	NC_015848	GCC	2	6	229427	229432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625228
5544	NC_015848	GC	3	6	229445	229450	0 %	0 %	50 %	50 %	340625228
5545	NC_015848	ACG	2	6	229452	229457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625228
5546	NC_015848	GTC	2	6	229488	229493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625228
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5548	NC_015848	GGC	2	6	229541	229546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625228
5549	NC_015848	CGGCG	2	10	229559	229568	0 %	0 %	60 %	40 %	340625228
5550	NC_015848	GCC	2	6	229584	229589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625228
5551	NC_015848	TGC	2	6	229612	229617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625228
5552	NC_015848	GC	3	6	229616	229621	0 %	0 %	50 %	50 %	340625228
5553	NC_015848	CAC	2	6	229656	229661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625228
5554	NC_015848	GAT	2	6	229697	229702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625228
5555	NC_015848	CCTACA	2	12	229726	229737	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340625228
5556	NC_015848	GTG	2	6	229740	229745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625228
5557	NC_015848	ATC	2	6	229746	229751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625228
5558	NC_015848	CGT	2	6	229757	229762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625228
5559	NC_015848	CTGGC	2	10	229782	229791	0 %	20 %	40 %	40 %	340625228
5560	NC_015848	CGC	2	6	229796	229801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625228
5561	NC_015848	TGG	2	6	229834	229839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625228
5562	NC_015848	TCG	2	6	229876	229881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625228
5563	NC_015848	CGG	2	6	229897	229902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625228
5564	NC_015848	CTG	2	6	229959	229964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625228
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5569	NC_015848	CAT	2	6	230099	230104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625228
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5572	NC_015848	GAT	2	6	230150	230155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625228
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5579	NC_015848	GCC	2	6	230529	230534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625229
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5590	NC_015848	CGGC	2	8	230915	230922	0 %	0 %	50 %	50 %	340625229
5591	NC_015848	TGG	2	6	230954	230959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625229
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5601	NC_015848	GTC	2	6	231325	231330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625229
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5605	NC_015848	CG	3	6	231395	231400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_015848	AGC	2	6	231490	231495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625230
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5610	NC_015848	CGCAG	2	10	231605	231614	20 %	0 %	40 %	40 %	340625230
5611	NC_015848	GC	3	6	231654	231659	0 %	0 %	50 %	50 %	340625230
5612	NC_015848	CGG	2	6	231701	231706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625230
5613	NC_015848	GGTCTT	2	12	231710	231721	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340625230
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5615	NC_015848	AGCC	2	8	231817	231824	25 %	0 %	25 %	50 %	340625230
5616	NC_015848	CTG	2	6	231848	231853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625230
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5621	NC_015848	CG	3	6	232078	232083	0 %	0 %	50 %	50 %	340625230
5622	NC_015848	TTC	2	6	232135	232140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625230
5623	NC_015848	GAG	2	6	232146	232151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340625230
5624	NC_015848	GCG	3	9	232171	232179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625230
5625	NC_015848	TAA	2	6	232190	232195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625230
5626	NC_015848	GCT	2	6	232199	232204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5627	NC_015848	TCG	2	6	232213	232218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5628	NC_015848	GCTC	2	8	232238	232245	0 %	25 %	25 %	50 %	340625230
5629	NC_015848	ATG	2	6	232321	232326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625230
5630	NC_015848	GCG	2	6	232381	232386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625230
5631	NC_015848	GGT	2	6	232436	232441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625230
5632	NC_015848	GTG	2	6	232495	232500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625230
5633	NC_015848	CGC	2	6	232624	232629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625230
5634	NC_015848	TCG	2	6	232651	232656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5635	NC_015848	GCA	2	6	232679	232684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5636	NC_015848	TGT	2	6	232685	232690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625230
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5640	NC_015848	CCG	2	6	232811	232816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625230
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5642	NC_015848	TGAA	2	8	232861	232868	50 %	25 %	25 %	0 %	340625230
5643	NC_015848	TCG	2	6	232897	232902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5644	NC_015848	GTC	2	6	232926	232931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5645	NC_015848	CGA	2	6	232937	232942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5646	NC_015848	GAC	2	6	232953	232958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5647	NC_015848	GCC	2	6	233035	233040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625230
5648	NC_015848	GCA	2	6	233060	233065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625230
5649	NC_015848	GGC	2	6	233121	233126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625230
5650	NC_015848	GGT	2	6	233164	233169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625230
5651	NC_015848	CGG	2	6	233195	233200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625230
5652	NC_015848	GGT	2	6	233247	233252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625230
5653	NC_015848	GGC	2	6	233371	233376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5654	NC_015848	ACC	2	6	233561	233566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5655	NC_015848	TGG	2	6	233619	233624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625231
5656	NC_015848	CTG	2	6	233661	233666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625231
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5658	NC_015848	GAC	2	6	233739	233744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625231
5659	NC_015848	CGC	3	9	233795	233803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625231
5660	NC_015848	ACGT	2	8	233823	233830	25 %	25 %	25 %	25 %	340625231
5661	NC_015848	TAC	2	6	233838	233843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625231
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5671	NC_015848	GTC	2	6	234192	234197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625231
5672	NC_015848	GCG	2	6	234201	234206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625231
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5676	NC_015848	GCT	2	6	234335	234340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625231
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5679	NC_015848	GCA	2	6	234406	234411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625231
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5682	NC_015848	GCA	2	6	234500	234505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625231
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5684	NC_015848	CCGG	2	8	234674	234681	0 %	0 %	50 %	50 %	340625231
5685	NC_015848	GGT	2	6	234695	234700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625231
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5696	NC_015848	CGG	2	6	235019	235024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625231
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5706	NC_015848	CGC	2	6	235452	235457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625231
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5710	NC_015848	CTG	2	6	235527	235532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625231
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5730	NC_015848	ACCT	2	8	236259	236266	25 %	25 %	0 %	50 %	340625231
5731	NC_015848	TGT	2	6	236281	236286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625231
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5735	NC_015848	GCT	2	6	236363	236368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625231
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5740	NC_015848	GTG	2	6	236517	236522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625231
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5742	NC_015848	TGG	2	6	236566	236571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625231
5743	NC_015848	ACGG	2	8	236719	236726	25 %	0 %	50 %	25 %	340625231
5744	NC_015848	GAT	2	6	236783	236788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625231
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5746	NC_015848	CTG	3	9	236904	236912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625231
5747	NC_015848	GTG	2	6	236952	236957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625231
5748	NC_015848	CACCCT	2	12	236966	236977	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	340625231
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5753	NC_015848	TGT	2	6	237492	237497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5755	NC_015848	CAC	2	6	237535	237540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5778	NC_015848	ACGT	2	8	238279	238286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5780	NC_015848	GTG	2	6	238310	238315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5782	NC_015848	TGGA	2	8	238360	238367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5862	NC_015848	CG	3	6	241613	241618	0 %	0 %	50 %	50 %	340625235
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5864	NC_015848	CCA	2	6	241689	241694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625235
5865	NC_015848	CGT	2	6	241715	241720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625235
5866	NC_015848	TCG	2	6	241735	241740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625235
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5869	NC_015848	TCG	2	6	241798	241803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625235
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5871	NC_015848	TGC	2	6	241836	241841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625235
5872	NC_015848	GTA	2	6	241872	241877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625235
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5883	NC_015848	CCA	2	6	242240	242245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625235
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5965	NC_015848	C	7	7	245537	245543	0 %	0 %	0 %	100 %	340625239
5966	NC_015848	GGT	2	6	245553	245558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625239
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5971	NC_015848	CGAC	2	8	245882	245889	25 %	0 %	25 %	50 %	340625239
5972	NC_015848	GCCA	2	8	245902	245909	25 %	0 %	25 %	50 %	340625239
5973	NC_015848	ACC	2	6	245918	245923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340625239
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5975	NC_015848	ACG	2	6	245974	245979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625239
5976	NC_015848	CACGC	2	10	246007	246016	20 %	0 %	20 %	60 %	340625239
5977	NC_015848	GCGAAC	2	12	246043	246054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625239
5978	NC_015848	CGTG	2	8	246096	246103	0 %	25 %	50 %	25 %	340625239
5979	NC_015848	TCGA	2	8	246247	246254	25 %	25 %	25 %	25 %	340625239
5980	NC_015848	GGC	3	9	246321	246329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625239
5981	NC_015848	CAG	2	6	246336	246341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625239
5982	NC_015848	TCA	2	6	246344	246349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340625239
5983	NC_015848	CAA	2	6	246390	246395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625239
5984	NC_015848	ACCAGC	2	12	246424	246435	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340625239
5985	NC_015848	GTC	2	6	246456	246461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625239
5986	NC_015848	CCG	2	6	246487	246492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625239
5987	NC_015848	GTC	2	6	246615	246620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625239
5988	NC_015848	ACG	2	6	246646	246651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625239
5989	NC_015848	GCG	2	6	246682	246687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340625239
5990	NC_015848	CCG	2	6	246718	246723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625239
5991	NC_015848	GC	3	6	246758	246763	0 %	0 %	50 %	50 %	340625239
5992	NC_015848	GGCCGC	2	12	246780	246791	0 %	0 %	50 %	50 %	340625239
5993	NC_015848	CAA	2	6	246831	246836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625239
5994	NC_015848	GCC	2	6	246868	246873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625239
5995	NC_015848	AGC	2	6	246880	246885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625239
5996	NC_015848	GCC	2	6	246895	246900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625239
5997	NC_015848	CACC	2	8	246927	246934	25 %	0 %	0 %	75 %	340625239
5998	NC_015848	GCCG	2	8	246970	246977	0 %	0 %	50 %	50 %	340625239
5999	NC_015848	GCC	2	6	247009	247014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340625239
6000	NC_015848	ACCGCG	2	12	247072	247083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340625239

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