MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 chromosome

Total Repeats: 50566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015636	TAA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015636	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015636	TAAAT	2	10	49	58	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015636	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015636	TAT	2	6	86	91	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
6	NC_015636	ACAT	2	8	105	112	50 %	25 %	0 %	25 %	336121002
7	NC_015636	T	6	6	187	192	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
8	NC_015636	CAT	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
9	NC_015636	TGCCA	2	10	250	259	20 %	20 %	20 %	40 %	336121002
10	NC_015636	AT	4	8	274	281	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
11	NC_015636	CTT	3	9	327	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121002
12	NC_015636	ATT	2	6	376	381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
13	NC_015636	T	6	6	386	391	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
14	NC_015636	T	7	7	409	415	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
15	NC_015636	TGT	2	6	420	425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121002
16	NC_015636	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121002
17	NC_015636	T	6	6	473	478	0 %	100 %	0 %	0 %	336121002
18	NC_015636	TAT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
19	NC_015636	AT	3	6	538	543	50 %	50 %	0 %	0 %	336121002
20	NC_015636	TAT	2	6	558	563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121002
21	NC_015636	ATT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015636	ACC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015636	ATA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015636	TTAA	2	8	604	611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015636	ATTA	2	8	618	625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015636	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015636	AT	3	6	659	664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015636	A	6	6	672	677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015636	ACA	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121003
30	NC_015636	TA	3	6	724	729	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
31	NC_015636	AT	3	6	748	753	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
32	NC_015636	AT	3	6	755	760	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
33	NC_015636	AT	4	8	799	806	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
34	NC_015636	TTTA	2	8	810	817	25 %	75 %	0 %	0 %	336121003
35	NC_015636	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
36	NC_015636	TA	3	6	962	967	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
37	NC_015636	ATTA	2	8	985	992	50 %	50 %	0 %	0 %	336121003
38	NC_015636	TGTAT	2	10	1021	1030	20 %	60 %	20 %	0 %	336121003
39	NC_015636	CTT	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336121003
40	NC_015636	A	6	6	1150	1155	100 %	0 %	0 %	0 %	336121003
41	NC_015636	TAT	2	6	1170	1175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
42	NC_015636	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121003
43	NC_015636	TGT	3	9	1212	1220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121003
44	NC_015636	A	7	7	1264	1270	100 %	0 %	0 %	0 %	336121003
45	NC_015636	ATT	2	6	1298	1303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015636	ATT	3	9	1311	1319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015636	ATT	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015636	ATA	2	6	1343	1348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015636	TAA	2	6	1365	1370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015636	A	6	6	1369	1374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015636	TAT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
52	NC_015636	GAA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
53	NC_015636	TAT	2	6	1431	1436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
54	NC_015636	A	8	8	1452	1459	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
55	NC_015636	TGAT	2	8	1480	1487	25 %	50 %	25 %	0 %	336121004
56	NC_015636	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
57	NC_015636	C	6	6	1513	1518	0 %	0 %	0 %	100 %	336121004
58	NC_015636	AGA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
59	NC_015636	ATAA	2	8	1572	1579	75 %	25 %	0 %	0 %	336121004
60	NC_015636	GAA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
61	NC_015636	TGA	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
62	NC_015636	ATATT	2	10	1625	1634	40 %	60 %	0 %	0 %	336121004
63	NC_015636	AT	3	6	1649	1654	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
64	NC_015636	ATA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
65	NC_015636	ATA	2	6	1666	1671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
66	NC_015636	ATTA	2	8	1733	1740	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
67	NC_015636	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
68	NC_015636	A	6	6	1777	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
69	NC_015636	TA	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
70	NC_015636	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
71	NC_015636	ATT	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
72	NC_015636	CAT	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336121004
73	NC_015636	A	6	6	1913	1918	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
74	NC_015636	GAT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
75	NC_015636	A	6	6	1934	1939	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
76	NC_015636	ACA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336121004
77	NC_015636	AT	3	6	1969	1974	50 %	50 %	0 %	0 %	336121004
78	NC_015636	AGT	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
79	NC_015636	AGA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
80	NC_015636	ATTT	2	8	2068	2075	25 %	75 %	0 %	0 %	336121004
81	NC_015636	A	7	7	2130	2136	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
82	NC_015636	ACC	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336121004
83	NC_015636	A	7	7	2174	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
84	NC_015636	GAA	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
85	NC_015636	TTA	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
86	NC_015636	A	6	6	2247	2252	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
87	NC_015636	GTA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
88	NC_015636	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
89	NC_015636	TAAA	2	8	2431	2438	75 %	25 %	0 %	0 %	336121004
90	NC_015636	ATT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
91	NC_015636	A	6	6	2544	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
92	NC_015636	TC	3	6	2601	2606	0 %	50 %	0 %	50 %	336121004
93	NC_015636	A	7	7	2616	2622	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
94	NC_015636	ATA	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
95	NC_015636	TAA	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
96	NC_015636	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
97	NC_015636	ATA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
98	NC_015636	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121004
99	NC_015636	GTT	2	6	2843	2848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336121004
100	NC_015636	ATG	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
101	NC_015636	A	6	6	2916	2921	100 %	0 %	0 %	0 %	336121004
102	NC_015636	ATT	2	6	2927	2932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121004
103	NC_015636	TGA	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
104	NC_015636	ATG	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
105	NC_015636	TAA	2	6	2986	2991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121004
106	NC_015636	ATG	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
107	NC_015636	GTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336121004
108	NC_015636	TGA	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121004
109	NC_015636	ATA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015636	ATA	2	6	3117	3122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015636	TAA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015636	A	6	6	3137	3142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015636	TAA	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015636	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015636	CTT	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015636	TAT	2	6	3182	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015636	ATT	3	9	3188	3196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015636	TAT	3	9	3197	3205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015636	ATT	4	12	3215	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015636	AT	4	8	3233	3240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015636	TGGA	2	8	3268	3275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015636	TAA	2	6	3288	3293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
123	NC_015636	A	6	6	3357	3362	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
124	NC_015636	A	7	7	3369	3375	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
125	NC_015636	AAT	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
126	NC_015636	AGA	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121005
127	NC_015636	AAT	3	9	3433	3441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
128	NC_015636	AAAC	2	8	3510	3517	75 %	0 %	0 %	25 %	336121005
129	NC_015636	ATA	2	6	3542	3547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
130	NC_015636	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
131	NC_015636	A	7	7	3595	3601	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
132	NC_015636	GA	3	6	3603	3608	50 %	0 %	50 %	0 %	336121005
133	NC_015636	TAT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336121005
134	NC_015636	TGA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121005
135	NC_015636	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
136	NC_015636	TAA	2	6	3707	3712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336121005
137	NC_015636	ACAATA	2	12	3746	3757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	336121005
138	NC_015636	A	6	6	3785	3790	100 %	0 %	0 %	0 %	336121005
139	NC_015636	A	7	7	3874	3880	100 %	0 %	0 %	0 %	336121006
140	NC_015636	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
141	NC_015636	AGA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336121006
142	NC_015636	GAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336121006
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278	NC_015636	TA	3	6	8106	8111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_015636	AT	3	6	14136	14141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_015636	ATTA	2	8	14146	14153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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