MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015572	GCG	2	6	136182	136187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981872
2502	NC_015572	CGC	2	6	136268	136273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981872
2503	NC_015572	CGT	2	6	136351	136356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981872
2504	NC_015572	CGG	2	6	136380	136385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981872
2505	NC_015572	CAT	2	6	136411	136416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981872
2506	NC_015572	GCA	2	6	136449	136454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981872
2507	NC_015572	TGC	2	6	136479	136484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981872
2508	NC_015572	GCG	2	6	136518	136523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981872
2509	NC_015572	CAT	2	6	136597	136602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981872
2510	NC_015572	A	6	6	136659	136664	100 %	0 %	0 %	0 %	333981872
2511	NC_015572	GGT	2	6	136765	136770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981872
2512	NC_015572	TTA	2	6	136787	136792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981872
2513	NC_015572	T	6	6	136819	136824	0 %	100 %	0 %	0 %	333981872
2514	NC_015572	GTA	2	6	136826	136831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981872
2515	NC_015572	CGGC	2	8	136866	136873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_015572	TGG	2	6	136898	136903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015572	TCC	2	6	137021	137026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333981873
2518	NC_015572	AACGCT	2	12	137097	137108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333981873
2519	NC_015572	GCC	2	6	137113	137118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981873
2520	NC_015572	TGC	2	6	137152	137157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981873
2521	NC_015572	GCC	2	6	137327	137332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981873
2522	NC_015572	TCA	2	6	137334	137339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981873
2523	NC_015572	CCT	2	6	137356	137361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333981873
2524	NC_015572	AGC	2	6	137364	137369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981873
2525	NC_015572	ATT	2	6	137484	137489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981873
2526	NC_015572	AATGA	2	10	137492	137501	60 %	20 %	20 %	0 %	333981873
2527	NC_015572	AAT	2	6	137744	137749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981873
2528	NC_015572	GAT	2	6	137762	137767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981873
2529	NC_015572	GGC	2	6	137780	137785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981873
2530	NC_015572	TTGG	2	8	137894	137901	0 %	50 %	50 %	0 %	333981873
2531	NC_015572	GCA	2	6	137905	137910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981873
2532	NC_015572	CAGTTG	2	12	137915	137926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333981873
2533	NC_015572	AGC	2	6	137979	137984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981873
2534	NC_015572	TCA	2	6	137989	137994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981873
2535	NC_015572	CAG	2	6	138299	138304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981873
2536	NC_015572	TGC	2	6	138307	138312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981873
2537	NC_015572	AAT	2	6	138367	138372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981873
2538	NC_015572	GCCGC	2	10	138386	138395	0 %	0 %	40 %	60 %	333981873
2539	NC_015572	G	6	6	138484	138489	0 %	0 %	100 %	0 %	333981873
2540	NC_015572	TAA	2	6	138534	138539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981873
2541	NC_015572	GTT	2	6	138590	138595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981873
2542	NC_015572	TGGT	2	8	138747	138754	0 %	50 %	50 %	0 %	333981873
2543	NC_015572	AAAT	2	8	138914	138921	75 %	25 %	0 %	0 %	333981873
2544	NC_015572	AGG	2	6	139008	139013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015572	CCA	2	6	139091	139096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_015572	TTC	2	6	139235	139240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981874
2547	NC_015572	GTT	2	6	139249	139254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981874
2548	NC_015572	T	6	6	139253	139258	0 %	100 %	0 %	0 %	333981874
2549	NC_015572	TCT	2	6	139275	139280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981874
2550	NC_015572	T	6	6	139369	139374	0 %	100 %	0 %	0 %	333981874
2551	NC_015572	GGC	2	6	139402	139407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981874
2552	NC_015572	TCC	2	6	139410	139415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333981874
2553	NC_015572	GCA	2	6	139450	139455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981874
2554	NC_015572	TTC	2	6	139460	139465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981874
2555	NC_015572	GGC	2	6	139505	139510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981874
2556	NC_015572	CCT	2	6	139543	139548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333981874
2557	NC_015572	CAA	2	6	139574	139579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981874
2558	NC_015572	CGG	3	9	139687	139695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981874
2559	NC_015572	TGA	2	6	139752	139757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981874
2560	NC_015572	T	6	6	139786	139791	0 %	100 %	0 %	0 %	333981874
2561	NC_015572	TGC	2	6	139857	139862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981874
2562	NC_015572	CGTT	2	8	139902	139909	0 %	50 %	25 %	25 %	333981874
2563	NC_015572	GTG	2	6	139935	139940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981874
2564	NC_015572	TGA	2	6	139966	139971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981874
2565	NC_015572	GGC	2	6	139982	139987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981874
2566	NC_015572	TCG	2	6	139989	139994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981874
2567	NC_015572	A	6	6	140051	140056	100 %	0 %	0 %	0 %	333981874
2568	NC_015572	TGA	2	6	140071	140076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981874
2569	NC_015572	GCC	2	6	140165	140170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981874
2570	NC_015572	GTT	2	6	140303	140308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981874
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2572	NC_015572	CGGC	2	8	140340	140347	0 %	0 %	50 %	50 %	333981874
2573	NC_015572	GGC	2	6	140383	140388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981874
2574	NC_015572	ACTG	2	8	140404	140411	25 %	25 %	25 %	25 %	333981874
2575	NC_015572	GC	3	6	140425	140430	0 %	0 %	50 %	50 %	333981874
2576	NC_015572	AT	3	6	140441	140446	50 %	50 %	0 %	0 %	333981874
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2582	NC_015572	GTC	2	6	140630	140635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981874
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2584	NC_015572	GGC	2	6	140723	140728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981874
2585	NC_015572	TCG	2	6	140856	140861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981874
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2591	NC_015572	CGGG	2	8	141042	141049	0 %	0 %	75 %	25 %	333981874
2592	NC_015572	GCCGGC	2	12	141107	141118	0 %	0 %	50 %	50 %	333981874
2593	NC_015572	GAT	2	6	141140	141145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981874
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2595	NC_015572	TTG	3	9	141158	141166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981874
2596	NC_015572	TGC	2	6	141202	141207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_015572	ACC	2	6	141326	141331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981875
2598	NC_015572	T	6	6	141337	141342	0 %	100 %	0 %	0 %	333981875
2599	NC_015572	TGT	2	6	141372	141377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981875
2600	NC_015572	TGG	2	6	141381	141386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981875
2601	NC_015572	GGC	2	6	141417	141422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981875
2602	NC_015572	CGCC	2	8	141432	141439	0 %	0 %	25 %	75 %	333981875
2603	NC_015572	GGCC	2	8	141549	141556	0 %	0 %	50 %	50 %	333981876
2604	NC_015572	CGAT	2	8	141613	141620	25 %	25 %	25 %	25 %	333981876
2605	NC_015572	CGC	2	6	141635	141640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981876
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2607	NC_015572	GAT	2	6	141708	141713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981876
2608	NC_015572	GCT	2	6	141714	141719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981876
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2610	NC_015572	CAGC	2	8	141744	141751	25 %	0 %	25 %	50 %	333981876
2611	NC_015572	CCG	2	6	141760	141765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981876
2612	NC_015572	TAT	2	6	141797	141802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981876
2613	NC_015572	ACAGCC	2	12	141911	141922	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333981876
2614	NC_015572	CAA	2	6	142028	142033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981877
2615	NC_015572	CGCA	2	8	142034	142041	25 %	0 %	25 %	50 %	333981877
2616	NC_015572	CGT	2	6	142101	142106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981877
2617	NC_015572	GCCA	2	8	142123	142130	25 %	0 %	25 %	50 %	333981877
2618	NC_015572	TGA	2	6	142146	142151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981877
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2620	NC_015572	CG	3	6	142320	142325	0 %	0 %	50 %	50 %	333981877
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2622	NC_015572	TCG	2	6	142421	142426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981877
2623	NC_015572	GCCA	2	8	142448	142455	25 %	0 %	25 %	50 %	333981877
2624	NC_015572	CGC	2	6	142502	142507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981877
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2747	NC_015572	A	6	6	149925	149930	100 %	0 %	0 %	0 %	333981882
2748	NC_015572	GATGAA	2	12	149934	149945	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333981882
2749	NC_015572	TCCA	2	8	150013	150020	25 %	25 %	0 %	50 %	333981882
2750	NC_015572	ACA	2	6	150023	150028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981882
2751	NC_015572	AGC	2	6	150064	150069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981882
2752	NC_015572	GCAATG	2	12	150208	150219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333981882
2753	NC_015572	ACA	2	6	150235	150240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981882
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2755	NC_015572	CGGG	2	8	150326	150333	0 %	0 %	75 %	25 %	333981882
2756	NC_015572	CACCG	2	10	150399	150408	20 %	0 %	20 %	60 %	333981882
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2762	NC_015572	GCA	2	6	151065	151070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981883
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2991	NC_015572	TCG	2	6	162755	162760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2992	NC_015572	CTGTTC	2	12	162803	162814	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333981892
2993	NC_015572	CAA	2	6	162908	162913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981892
2994	NC_015572	TG	3	6	163074	163079	0 %	50 %	50 %	0 %	333981892
2995	NC_015572	CTCG	2	8	163264	163271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2996	NC_015572	GTC	2	6	163280	163285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_015572	GAT	2	6	163298	163303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_015572	ACC	2	6	163322	163327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2999	NC_015572	T	6	6	163332	163337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_015572	AGGT	2	8	163348	163355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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