MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015572	CCG	2	6	55930	55935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_015572	CCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015572	GTT	2	6	55964	55969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015572	T	6	6	56055	56060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015572	GATT	2	8	56093	56100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015572	TAA	2	6	56102	56107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015572	TCA	2	6	56119	56124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015572	TGAAA	2	10	56163	56172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015572	GGT	2	6	56200	56205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015572	AC	3	6	56229	56234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_015572	GT	3	6	56249	56254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015572	CCGA	2	8	56317	56324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_015572	CTC	2	6	56404	56409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015572	CCTG	2	8	56465	56472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_015572	TCC	2	6	56552	56557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_015572	TCGTT	2	10	56562	56571	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1017	NC_015572	AAG	2	6	56714	56719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015572	ATTC	2	8	56768	56775	25 %	50 %	0 %	25 %	333981798
1019	NC_015572	CTT	2	6	56901	56906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981798
1020	NC_015572	GAG	2	6	56970	56975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981798
1021	NC_015572	ACG	2	6	56984	56989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981798
1022	NC_015572	CT	3	6	57042	57047	0 %	50 %	0 %	50 %	333981798
1023	NC_015572	CG	3	6	57058	57063	0 %	0 %	50 %	50 %	333981798
1024	NC_015572	ATG	2	6	57151	57156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981798
1025	NC_015572	GCC	2	6	57198	57203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981798
1026	NC_015572	ATC	2	6	57297	57302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981798
1027	NC_015572	T	6	6	57320	57325	0 %	100 %	0 %	0 %	333981799
1028	NC_015572	AC	3	6	57329	57334	50 %	0 %	0 %	50 %	333981799
1029	NC_015572	GTT	2	6	57341	57346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981799
1030	NC_015572	TTTCA	2	10	57357	57366	20 %	60 %	0 %	20 %	333981799
1031	NC_015572	GGC	2	6	57376	57381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981799
1032	NC_015572	GGC	2	6	57401	57406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981799
1033	NC_015572	TGT	2	6	57413	57418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981799
1034	NC_015572	GGC	2	6	57476	57481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981799
1035	NC_015572	AAG	2	6	57511	57516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981799
1036	NC_015572	CAA	2	6	57538	57543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981799
1037	NC_015572	CCG	2	6	57701	57706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981799
1038	NC_015572	CGA	2	6	57731	57736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981799
1039	NC_015572	CAC	2	6	57759	57764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981799
1040	NC_015572	GGT	2	6	57894	57899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981799
1041	NC_015572	TCA	2	6	57944	57949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981799
1042	NC_015572	CAGC	2	8	57989	57996	25 %	0 %	25 %	50 %	333981799
1043	NC_015572	AC	3	6	58043	58048	50 %	0 %	0 %	50 %	333981799
1044	NC_015572	CTG	2	6	58149	58154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981799
1045	NC_015572	AAG	2	6	58221	58226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981799
1046	NC_015572	T	6	6	58236	58241	0 %	100 %	0 %	0 %	333981799
1047	NC_015572	CGCA	2	8	58256	58263	25 %	0 %	25 %	50 %	333981799
1048	NC_015572	GCT	2	6	58297	58302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981799
1049	NC_015572	ACG	2	6	58370	58375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981799
1050	NC_015572	CAC	2	6	58448	58453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981799
1051	NC_015572	CGC	2	6	58466	58471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981799
1052	NC_015572	TTA	2	6	58550	58555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015572	TGC	2	6	58584	58589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015572	CG	3	6	58597	58602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_015572	AGC	2	6	58612	58617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015572	GGGA	2	8	58623	58630	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015572	AG	3	6	58642	58647	50 %	0 %	50 %	0 %	333981800
1058	NC_015572	CGACA	2	10	58716	58725	40 %	0 %	20 %	40 %	333981800
1059	NC_015572	GGA	2	6	58758	58763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981800
1060	NC_015572	TTTC	2	8	58779	58786	0 %	75 %	0 %	25 %	333981800
1061	NC_015572	GAT	2	6	58864	58869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981800
1062	NC_015572	GTC	2	6	58894	58899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981800
1063	NC_015572	GTTG	2	8	58917	58924	0 %	50 %	50 %	0 %	333981800
1064	NC_015572	GAC	2	6	58955	58960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981800
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1066	NC_015572	GCG	2	6	59075	59080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981800
1067	NC_015572	GC	3	6	59152	59157	0 %	0 %	50 %	50 %	333981800
1068	NC_015572	TGGC	2	8	59230	59237	0 %	25 %	50 %	25 %	333981800
1069	NC_015572	CGT	2	6	59278	59283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981800
1070	NC_015572	TGCC	2	8	59295	59302	0 %	25 %	25 %	50 %	333981800
1071	NC_015572	CGA	2	6	59420	59425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981800
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1075	NC_015572	CTG	2	6	59688	59693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981800
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1078	NC_015572	AG	3	6	59843	59848	50 %	0 %	50 %	0 %	333981800
1079	NC_015572	AAG	2	6	59906	59911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981800
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1081	NC_015572	TGA	2	6	60018	60023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981800
1082	NC_015572	TGA	3	9	60091	60099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981800
1083	NC_015572	CGA	2	6	60157	60162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981800
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1087	NC_015572	CGTCTA	2	12	60314	60325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333981800
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1095	NC_015572	GGT	2	6	60679	60684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981801
1096	NC_015572	CGA	2	6	60749	60754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981801
1097	NC_015572	GAT	2	6	60784	60789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981801
1098	NC_015572	GA	3	6	60801	60806	50 %	0 %	50 %	0 %	333981801
1099	NC_015572	TGT	2	6	61046	61051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981801
1100	NC_015572	TGA	2	6	61068	61073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981801
1101	NC_015572	TGA	2	6	61233	61238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981801
1102	NC_015572	CTTC	2	8	61259	61266	0 %	50 %	0 %	50 %	333981801
1103	NC_015572	AAG	2	6	61291	61296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981801
1104	NC_015572	CTGA	2	8	61357	61364	25 %	25 %	25 %	25 %	333981801
1105	NC_015572	GCGGA	2	10	61396	61405	20 %	0 %	60 %	20 %	333981801
1106	NC_015572	AGC	2	6	61422	61427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981801
1107	NC_015572	TTGC	2	8	61435	61442	0 %	50 %	25 %	25 %	333981801
1108	NC_015572	TTC	2	6	61455	61460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981801
1109	NC_015572	GGA	2	6	61548	61553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981801
1110	NC_015572	TGG	2	6	61561	61566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981801
1111	NC_015572	GTC	2	6	61576	61581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981801
1112	NC_015572	C	6	6	61590	61595	0 %	0 %	0 %	100 %	333981801
1113	NC_015572	AG	3	6	61687	61692	50 %	0 %	50 %	0 %	333981801
1114	NC_015572	CGA	2	6	61746	61751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981801
1115	NC_015572	CATA	2	8	61764	61771	50 %	25 %	0 %	25 %	333981801
1116	NC_015572	A	6	6	61776	61781	100 %	0 %	0 %	0 %	333981801
1117	NC_015572	AGC	2	6	61792	61797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981801
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1120	NC_015572	GCTG	2	8	62079	62086	0 %	25 %	50 %	25 %	333981801
1121	NC_015572	A	7	7	62111	62117	100 %	0 %	0 %	0 %	333981801
1122	NC_015572	GGCG	2	8	62133	62140	0 %	0 %	75 %	25 %	333981801
1123	NC_015572	CAG	2	6	62160	62165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981802
1124	NC_015572	GGC	2	6	62308	62313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981802
1125	NC_015572	CCG	2	6	62377	62382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981802
1126	NC_015572	C	6	6	62397	62402	0 %	0 %	0 %	100 %	333981802
1127	NC_015572	CGA	2	6	62455	62460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981802
1128	NC_015572	GCC	2	6	62478	62483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981802
1129	NC_015572	CCG	2	6	62498	62503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981802
1130	NC_015572	CTA	2	6	62618	62623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981802
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1143	NC_015572	GTT	2	6	63725	63730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1156	NC_015572	ATT	2	6	64364	64369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1247	NC_015572	CGCCA	2	10	69270	69279	20 %	0 %	20 %	60 %	333981804
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1251	NC_015572	CA	3	6	69591	69596	50 %	0 %	0 %	50 %	333981804
1252	NC_015572	TTG	2	6	69650	69655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981804
1253	NC_015572	CAA	2	6	69803	69808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_015572	TGAT	2	8	69860	69867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_015572	TTG	2	6	70012	70017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_015572	CGCT	2	8	70028	70035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1258	NC_015572	GCTA	2	8	70057	70064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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