MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_015572	GGCC	2	8	566690	566697	0 %	0 %	50 %	50 %	333982260
11003	NC_015572	CTG	2	6	566790	566795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982260
11004	NC_015572	CCG	2	6	566815	566820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982260
11005	NC_015572	GTT	2	6	566850	566855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982260
11006	NC_015572	T	7	7	566854	566860	0 %	100 %	0 %	0 %	333982260
11007	NC_015572	TTTGGC	2	12	566978	566989	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333982260
11008	NC_015572	AGT	2	6	566999	567004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982260
11009	NC_015572	GCC	2	6	567017	567022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982260
11010	NC_015572	GCCC	2	8	567075	567082	0 %	0 %	25 %	75 %	333982260
11011	NC_015572	GTT	2	6	567113	567118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982260
11012	NC_015572	GCT	2	6	567136	567141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982260
11013	NC_015572	GCC	2	6	567218	567223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982260
11014	NC_015572	GCC	2	6	567268	567273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982260
11015	NC_015572	CAG	2	6	567354	567359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982260
11016	NC_015572	GC	3	6	567432	567437	0 %	0 %	50 %	50 %	333982260
11017	NC_015572	CAG	2	6	567498	567503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982260
11018	NC_015572	GTT	2	6	567578	567583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982260
11019	NC_015572	CAA	2	6	567585	567590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982260
11020	NC_015572	GCG	2	6	567632	567637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982260
11021	NC_015572	GCG	2	6	567745	567750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982260
11022	NC_015572	GGC	2	6	568043	568048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982261
11023	NC_015572	CCA	2	6	568099	568104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982261
11024	NC_015572	CAG	2	6	568181	568186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11025	NC_015572	GCC	2	6	568268	568273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982261
11026	NC_015572	GCC	2	6	568326	568331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982261
11027	NC_015572	GTG	2	6	568344	568349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982261
11028	NC_015572	TGCG	2	8	568410	568417	0 %	25 %	50 %	25 %	333982261
11029	NC_015572	CCA	2	6	568432	568437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982261
11030	NC_015572	GC	3	6	568447	568452	0 %	0 %	50 %	50 %	333982261
11031	NC_015572	CAC	2	6	568532	568537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982261
11032	NC_015572	CCA	2	6	568564	568569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982261
11033	NC_015572	GCCAG	2	10	568591	568600	20 %	0 %	40 %	40 %	333982261
11034	NC_015572	CCG	2	6	568605	568610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982261
11035	NC_015572	CAA	2	6	568652	568657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982261
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11037	NC_015572	GCA	2	6	568672	568677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11038	NC_015572	ACT	2	6	568680	568685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982261
11039	NC_015572	GCA	2	6	568690	568695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11040	NC_015572	CAGC	2	8	568775	568782	25 %	0 %	25 %	50 %	333982261
11041	NC_015572	CAG	2	6	568832	568837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11042	NC_015572	CAG	2	6	568934	568939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11043	NC_015572	AGC	2	6	568944	568949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11044	NC_015572	GCC	2	6	569012	569017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982261
11045	NC_015572	A	8	8	569031	569038	100 %	0 %	0 %	0 %	333982261
11046	NC_015572	CAG	3	9	569120	569128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11047	NC_015572	AAG	2	6	569346	569351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333982261
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11049	NC_015572	CAG	3	9	569417	569425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982261
11050	NC_015572	GATT	2	8	569561	569568	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_015572	GCG	2	6	569624	569629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_015572	GCA	2	6	569826	569831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982262
11053	NC_015572	CG	3	6	569861	569866	0 %	0 %	50 %	50 %	333982262
11054	NC_015572	CGC	2	6	569905	569910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982262
11055	NC_015572	GGC	2	6	569911	569916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982262
11056	NC_015572	GCC	2	6	569967	569972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982262
11057	NC_015572	GTC	2	6	569983	569988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982262
11058	NC_015572	GAC	2	6	570015	570020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982262
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11060	NC_015572	TGG	2	6	570080	570085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982262
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11063	NC_015572	TCG	2	6	570179	570184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982262
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11093	NC_015572	A	6	6	571405	571410	100 %	0 %	0 %	0 %	333982264
11094	NC_015572	TA	3	6	571472	571477	50 %	50 %	0 %	0 %	333982264
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11109	NC_015572	TA	3	6	572277	572282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_015572	CG	3	6	572364	572369	0 %	0 %	50 %	50 %	333982265
11111	NC_015572	CGA	2	6	572388	572393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982265
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11120	NC_015572	ACG	2	6	573188	573193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982265
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11234	NC_015572	GAC	2	6	579467	579472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11235	NC_015572	ATGCC	2	10	579510	579519	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11236	NC_015572	GTCC	2	8	579570	579577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11237	NC_015572	GTT	2	6	579784	579789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982273
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11242	NC_015572	TTG	2	6	580022	580027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982273
11243	NC_015572	GGC	2	6	580046	580051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982273
11244	NC_015572	CGG	2	6	580066	580071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982273
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11261	NC_015572	CCG	2	6	580870	580875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982274
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11270	NC_015572	CTTG	2	8	581194	581201	0 %	50 %	25 %	25 %	333982274
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11273	NC_015572	TGC	2	6	581269	581274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982274
11274	NC_015572	GCG	2	6	581284	581289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982274
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11278	NC_015572	GCC	2	6	581483	581488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982274
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11280	NC_015572	CGA	2	6	581629	581634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982274
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11285	NC_015572	GTT	2	6	581800	581805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982274
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11288	NC_015572	GT	3	6	581952	581957	0 %	50 %	50 %	0 %	333982274
11289	NC_015572	CGG	2	6	581962	581967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982274
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11297	NC_015572	GTGCCG	2	12	582451	582462	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333982275
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11310	NC_015572	CGG	2	6	582999	583004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982275
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11312	NC_015572	GCC	2	6	583089	583094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982275
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11323	NC_015572	TCG	2	6	583731	583736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982276
11324	NC_015572	GATT	2	8	583792	583799	25 %	50 %	25 %	0 %	333982276
11325	NC_015572	ATG	2	6	583848	583853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982276
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11328	NC_015572	T	6	6	583960	583965	0 %	100 %	0 %	0 %	333982276
11329	NC_015572	CCG	2	6	583975	583980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982276
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11331	NC_015572	AATA	2	8	584018	584025	75 %	25 %	0 %	0 %	333982276
11332	NC_015572	CGCT	2	8	584031	584038	0 %	25 %	25 %	50 %	333982276
11333	NC_015572	TCC	2	6	584091	584096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333982276
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11336	NC_015572	CG	4	8	584227	584234	0 %	0 %	50 %	50 %	333982276
11337	NC_015572	GAC	2	6	584255	584260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982276
11338	NC_015572	CGC	2	6	584320	584325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982276
11339	NC_015572	ATC	2	6	584439	584444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11340	NC_015572	A	6	6	584463	584468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11341	NC_015572	GCC	2	6	584478	584483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982277
11342	NC_015572	CCCG	2	8	584536	584543	0 %	0 %	25 %	75 %	333982277
11343	NC_015572	GTT	3	9	584553	584561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982277
11344	NC_015572	TCA	2	6	584585	584590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982277
11345	NC_015572	GTTT	2	8	584597	584604	0 %	75 %	25 %	0 %	333982277
11346	NC_015572	TGT	2	6	584609	584614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982277
11347	NC_015572	TTTC	2	8	584616	584623	0 %	75 %	0 %	25 %	333982277
11348	NC_015572	ATG	2	6	584651	584656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982277
11349	NC_015572	GGC	2	6	584726	584731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982277
11350	NC_015572	GCG	3	9	584807	584815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982277
11351	NC_015572	CGG	2	6	584829	584834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982277
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11353	NC_015572	CGG	2	6	584874	584879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982277
11354	NC_015572	TTG	2	6	584890	584895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982277
11355	NC_015572	GCC	2	6	584899	584904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982277
11356	NC_015572	TTTAA	2	10	584959	584968	40 %	60 %	0 %	0 %	333982277
11357	NC_015572	ATT	2	6	584978	584983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982277
11358	NC_015572	T	6	6	585004	585009	0 %	100 %	0 %	0 %	333982277
11359	NC_015572	GGA	2	6	585099	585104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333982277
11360	NC_015572	CAT	2	6	585117	585122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982277
11361	NC_015572	CAT	2	6	585141	585146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982277
11362	NC_015572	TGC	2	6	585248	585253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982277
11363	NC_015572	T	6	6	585261	585266	0 %	100 %	0 %	0 %	333982277
11364	NC_015572	TTG	2	6	585346	585351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982277
11365	NC_015572	CAA	2	6	585418	585423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982277
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11371	NC_015572	GGAAC	2	10	585684	585693	40 %	0 %	40 %	20 %	333982277
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11375	NC_015572	GGGGCT	2	12	585969	585980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333982277
11376	NC_015572	TCAA	2	8	586007	586014	50 %	25 %	0 %	25 %	333982277
11377	NC_015572	TGA	2	6	586099	586104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982277
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11399	NC_015572	ATT	2	6	587308	587313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982278
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11405	NC_015572	CGG	2	6	587453	587458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11448	NC_015572	ACAG	2	8	589272	589279	50 %	0 %	25 %	25 %	333982280
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11473	NC_015572	CAA	3	9	591126	591134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11474	NC_015572	ATTT	2	8	591146	591153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11475	NC_015572	TGTT	2	8	591357	591364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11476	NC_015572	A	6	6	591377	591382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11477	NC_015572	GCA	2	6	591497	591502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982282
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11479	NC_015572	A	6	6	591702	591707	100 %	0 %	0 %	0 %	333982282
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11482	NC_015572	CAT	2	6	591775	591780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982282
11483	NC_015572	GAC	2	6	591792	591797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982282
11484	NC_015572	CCG	2	6	591985	591990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982282
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