MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015572	TGC	2	6	542703	542708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982241
10502	NC_015572	TTGT	2	8	542867	542874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_015572	AAATC	2	10	542914	542923	60 %	20 %	0 %	20 %	333982242
10504	NC_015572	AGC	2	6	543083	543088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982242
10505	NC_015572	GCC	2	6	543098	543103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982242
10506	NC_015572	GCG	2	6	543152	543157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982242
10507	NC_015572	ATG	2	6	543161	543166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982242
10508	NC_015572	CGT	2	6	543253	543258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982242
10509	NC_015572	GCC	2	6	543369	543374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982242
10510	NC_015572	TGAT	2	8	543444	543451	25 %	50 %	25 %	0 %	333982242
10511	NC_015572	CGG	2	6	543467	543472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982242
10512	NC_015572	GCGG	2	8	543557	543564	0 %	0 %	75 %	25 %	333982242
10513	NC_015572	T	7	7	543571	543577	0 %	100 %	0 %	0 %	333982242
10514	NC_015572	ATA	2	6	543615	543620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_015572	AAAAT	2	10	543662	543671	80 %	20 %	0 %	0 %	333982243
10516	NC_015572	GCC	2	6	543702	543707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982243
10517	NC_015572	CGA	2	6	543736	543741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982243
10518	NC_015572	AGC	2	6	543747	543752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982243
10519	NC_015572	GCC	2	6	543822	543827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982243
10520	NC_015572	CAA	2	6	543857	543862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982243
10521	NC_015572	CGG	2	6	543945	543950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982243
10522	NC_015572	TCG	2	6	543975	543980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982243
10523	NC_015572	CAG	2	6	543981	543986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982243
10524	NC_015572	CCG	2	6	544054	544059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982244
10525	NC_015572	AGCAC	2	10	544160	544169	40 %	0 %	20 %	40 %	333982244
10526	NC_015572	A	7	7	544225	544231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_015572	A	6	6	544270	544275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_015572	AAC	2	6	544432	544437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982245
10529	NC_015572	CGGC	2	8	544483	544490	0 %	0 %	50 %	50 %	333982245
10530	NC_015572	CGGC	2	8	544504	544511	0 %	0 %	50 %	50 %	333982245
10531	NC_015572	T	6	6	544521	544526	0 %	100 %	0 %	0 %	333982245
10532	NC_015572	TCA	2	6	544577	544582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982245
10533	NC_015572	CGC	2	6	544614	544619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982245
10534	NC_015572	CGA	2	6	544673	544678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982245
10535	NC_015572	GGC	2	6	544776	544781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982245
10536	NC_015572	GTC	2	6	544788	544793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982245
10537	NC_015572	AGC	2	6	544973	544978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982245
10538	NC_015572	CGG	2	6	544979	544984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982245
10539	NC_015572	CGG	2	6	545065	545070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982245
10540	NC_015572	CGC	2	6	545093	545098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982245
10541	NC_015572	TTC	2	6	545121	545126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333982245
10542	NC_015572	CGA	2	6	545150	545155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982245
10543	NC_015572	AAT	2	6	545192	545197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333982245
10544	NC_015572	CCG	3	9	545206	545214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982245
10545	NC_015572	CGT	2	6	545243	545248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982245
10546	NC_015572	GGCT	2	8	545254	545261	0 %	25 %	50 %	25 %	333982245
10547	NC_015572	GCG	2	6	545429	545434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982246
10548	NC_015572	GTC	2	6	545477	545482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982246
10549	NC_015572	CAGG	2	8	545489	545496	25 %	0 %	50 %	25 %	333982246
10550	NC_015572	GGC	2	6	545548	545553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982246
10551	NC_015572	CCA	2	6	545557	545562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982246
10552	NC_015572	CCA	2	6	545572	545577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982246
10553	NC_015572	CTGA	2	8	545603	545610	25 %	25 %	25 %	25 %	333982246
10554	NC_015572	T	6	6	545654	545659	0 %	100 %	0 %	0 %	333982246
10555	NC_015572	TCG	2	6	545748	545753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982246
10556	NC_015572	GCC	2	6	545771	545776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982246
10557	NC_015572	GGC	2	6	545870	545875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982246
10558	NC_015572	CGC	2	6	545902	545907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982246
10559	NC_015572	GGT	2	6	545978	545983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982246
10560	NC_015572	GCG	2	6	546028	546033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982246
10561	NC_015572	CAA	2	6	546086	546091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982246
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10563	NC_015572	GGT	2	6	546176	546181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982246
10564	NC_015572	GTC	2	6	546323	546328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982246
10565	NC_015572	GCC	2	6	546354	546359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982246
10566	NC_015572	CCG	2	6	546379	546384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982246
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10568	NC_015572	CCA	2	6	546427	546432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982246
10569	NC_015572	ATC	2	6	546458	546463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982246
10570	NC_015572	TGGCA	2	10	546479	546488	20 %	20 %	40 %	20 %	333982246
10571	NC_015572	TTA	2	6	546503	546508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_015572	AAT	2	6	546597	546602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333982247
10573	NC_015572	TCG	2	6	546715	546720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982247
10574	NC_015572	GTT	2	6	546733	546738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982247
10575	NC_015572	CGG	2	6	546739	546744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982247
10576	NC_015572	GTG	3	9	546759	546767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982247
10577	NC_015572	CTG	2	6	546813	546818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982247
10578	NC_015572	CAA	2	6	546827	546832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982247
10579	NC_015572	GTT	2	6	546938	546943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982247
10580	NC_015572	GCC	2	6	546981	546986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982247
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10582	NC_015572	GC	3	6	547044	547049	0 %	0 %	50 %	50 %	333982247
10583	NC_015572	ATC	2	6	547056	547061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982247
10584	NC_015572	ATT	2	6	547122	547127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982247
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10587	NC_015572	CGA	2	6	547286	547291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982247
10588	NC_015572	ATT	3	9	547326	547334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982247
10589	NC_015572	TGG	2	6	547366	547371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333982247
10590	NC_015572	TGA	2	6	547383	547388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333982247
10591	NC_015572	TCG	2	6	547496	547501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_015572	CGA	2	6	547513	547518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_015572	TCA	2	6	547571	547576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982248
10594	NC_015572	TTG	2	6	547662	547667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982248
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10596	NC_015572	CGT	2	6	547903	547908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982248
10597	NC_015572	CAG	2	6	547945	547950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982248
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10599	NC_015572	AAAG	2	8	548042	548049	75 %	0 %	25 %	0 %	333982248
10600	NC_015572	CA	3	6	548167	548172	50 %	0 %	0 %	50 %	333982248
10601	NC_015572	TTG	2	6	548291	548296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333982248
10602	NC_015572	A	6	6	548438	548443	100 %	0 %	0 %	0 %	333982248
10603	NC_015572	CAA	2	6	548498	548503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982248
10604	NC_015572	CCA	2	6	548590	548595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982248
10605	NC_015572	CAG	2	6	548620	548625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982248
10606	NC_015572	GCA	2	6	548636	548641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982248
10607	NC_015572	ATT	2	6	548665	548670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982248
10608	NC_015572	T	6	6	548686	548691	0 %	100 %	0 %	0 %	333982248
10609	NC_015572	CCG	2	6	548765	548770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982248
10610	NC_015572	CGC	2	6	548818	548823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982248
10611	NC_015572	TCG	2	6	548912	548917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982248
10612	NC_015572	ACT	2	6	549080	549085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333982248
10613	NC_015572	AAT	2	6	549104	549109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333982248
10614	NC_015572	AATCGC	2	12	549148	549159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333982248
10615	NC_015572	GCC	2	6	549160	549165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333982248
10616	NC_015572	ATT	2	6	549203	549208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333982248
10617	NC_015572	CTC	2	6	549210	549215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10618	NC_015572	GCAA	2	8	549286	549293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10619	NC_015572	TGA	3	9	549295	549303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_015572	ACAA	2	8	549333	549340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10622	NC_015572	AG	3	6	549394	549399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10984	NC_015572	GAC	2	6	566122	566127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333982260
10985	NC_015572	GCG	2	6	566187	566192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982260
10986	NC_015572	CAA	2	6	566205	566210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333982260
10987	NC_015572	CG	3	6	566214	566219	0 %	0 %	50 %	50 %	333982260
10988	NC_015572	CAC	3	9	566259	566267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333982260
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10991	NC_015572	GCCG	2	8	566331	566338	0 %	0 %	50 %	50 %	333982260
10992	NC_015572	CGG	2	6	566354	566359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333982260
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10996	NC_015572	CTG	2	6	566496	566501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333982260
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